seq1 = pF1KA0078.tfa, 1893 bp
seq2 = pF1KA0078/gi568815590r_116747503.tfa (gi568815590r:116747503_116966729), 219227 bp

>pF1KA0078 1893
>gi568815590r:116747503_116966729 (Chr8)

(complement)

1-144  (100001-100144)   100% ->
145-274  (103471-103600)   100% ->
275-374  (104790-104889)   100% ->
375-481  (108272-108378)   100% ->
482-688  (109257-109463)   100% ->
689-814  (109959-110084)   100% ->
815-937  (110442-110564)   100% ->
938-1161  (112262-112485)   100% ->
1162-1321  (114022-114181)   100% ->
1322-1470  (114634-114782)   100% ->
1471-1620  (115963-116112)   100% ->
1621-1704  (117701-117784)   100% ->
1705-1893  (119039-119227)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCTACGCACATTTTGTTCTCAGTAAAAGAGGGCCTCTGGCCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCTACGCACATTTTGTTCTCAGTAAAAGAGGGCCTCTGGCCAAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGGCTAGCGGCCCATTGGGATAAGAAGCTAACCAAAGCCCATGTGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTGGCTAGCGGCCCATTGGGATAAGAAGCTAACCAAAGCCCATGTGTTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTGTAATTTAGAGAGCAGCGTGGAGAGTATCATCTCACCAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100101 AGTGTAATTTAGAGAGCAGCGTGGAGAGTATCATCTCACCAAAGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145    GTGAAAATGGCATTACGGACATCAGGACATCTCTTACTGGGAGTAGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103468 TAGGTGAAAATGGCATTACGGACATCAGGACATCTCTTACTGGGAGTAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCGAATCTATCACAGGAAAGCCAAATACCTTCTTGCAGACTGTAATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103518 TCGAATCTATCACAGGAAAGCCAAATACCTTCTTGCAGACTGTAATGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATTCATTAAGATAAAGATGGCTTTTCGGCCAG         GTGTGGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103568 CATTCATTAAGATAAAGATGGCTTTTCGGCCAGGTA...TAGGTGTGGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACCTGCCTGAGGAAAATCGGGAAGCAGCTTATAATGCCATTACTTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104798 GACCTGCCTGAGGAAAATCGGGAAGCAGCTTATAATGCCATTACTTTACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGAAGAATTTCATGACTTTGATCAGCCACTGCCTGACTTAGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104848 TGAAGAATTTCATGACTTTGATCAGCCACTGCCTGACTTAGAGTA...AA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    375  TGACATCGATGTGGCCCAGCAGTTCAGCTTGAATCAGAGTAGAGTGGAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108271 GTGACATCGATGTGGCCCAGCAGTTCAGCTTGAATCAGAGTAGAGTGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGATAACCATGAGAGAAGAAGTTGGGAACATCAGTATTTTACAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108321 GAGATAACCATGAGAGAAGAAGTTGGGAACATCAGTATTTTACAAGAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGATTTTG         GTGATTTTGGAATGGATGATCGTGAGATAATGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108371 TGATTTTGGTA...TAGGTGATTTTGGAATGGATGATCGTGAGATAATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAGAAGGCAGTGCTTTTGAGGATGACGACATGTTAGTAAGCACTACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109290 GAGAAGGCAGTGCTTTTGAGGATGACGACATGTTAGTAAGCACTACTACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCTAACCTCCTATTAGAGTCTGAACAGAGCACCAGCAATCTGAATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109340 TCTAACCTCCTATTAGAGTCTGAACAGAGCACCAGCAATCTGAATGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AATTAACCATTTAGAATATGAAGATCAATATAAGGATGATAATTTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109390 AATTAACCATTTAGAATATGAAGATCAATATAAGGATGATAATTTTGGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGGAAATGATGGTGGAATATTAG         ATGACAAACTTATTAGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 109440 AAGGAAATGATGGTGGAATATTAGGTA...CAGATGACAAACTTATTAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AATAATGATGGCGGTATCTTTGATGATCCCCCTGCCCTCTCTGAGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109976 AATAATGATGGCGGTATCTTTGATGATCCCCCTGCCCTCTCTGAGGCAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGTGATGTTGCCAGAGCAGCCTGCACATGACGATATGGATGAGGATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110026 GGTGATGTTGCCAGAGCAGCCTGCACATGACGATATGGATGAGGATGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGTATCAA         TGGGTGGGCCTGATAGTCCTGATTCAGTGGAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110076 ATGTATCAAGTA...CAGTGGGTGGGCCTGATAGTCCTGATTCAGTGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCCGTTGAACCAATGCCAACCATGACTGATCAAACAACACTTGTTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110474 CCCGTTGAACCAATGCCAACCATGACTGATCAAACAACACTTGTTCCAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGAGGAAGAAGCATTTGCATTGGAGCCTATTGATATAACTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 110524 TGAGGAAGAAGCATTTGCATTGGAGCCTATTGATATAACTGGTA...CAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTAAAGAAACAAAAGCCAAGAGGAAGAGGAAGCTAATTGTTGACAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112262 TTAAAGAAACAAAAGCCAAGAGGAAGAGGAAGCTAATTGTTGACAGTGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAAGAGTTGGATAGCAAGACAATTAGAGCCCAACTTAGTGATTATTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112312 AAAGAGTTGGATAGCAAGACAATTAGAGCCCAACTTAGTGATTATTCAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TATTGTTACTACTTTGGATCTGGCACCGCCCACCAAGAAATTGATGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112362 TATTGTTACTACTTTGGATCTGGCACCGCCCACCAAGAAATTGATGATGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GGAAAGAGACAGGAGGAGTAGAAAAACTGTTTTCTTTACCTGCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112412 GGAAAGAGACAGGAGGAGTAGAAAAACTGTTTTCTTTACCTGCTCAGCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 TTGTGGAATAACAGACTACTGAAG         CTCTTTACACGCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112462 TTGTGGAATAACAGACTACTGAAGGTA...TAGCTCTTTACACGCTGTCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TACACCGCTTGTACCAGAAGACCTTAGAAAAAGGAGGAAAGGAGGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114039 TACACCGCTTGTACCAGAAGACCTTAGAAAAAGGAGGAAAGGAGGAGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CAGATAATTTGGATGAATTCCTCAAAGAATTTGAAAATCCAGAGGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114089 CAGATAATTTGGATGAATTCCTCAAAGAATTTGAAAATCCAGAGGTTCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AGAGAGGACCAGCAACAGCAGCATCAGCAGCGTGATGTTATCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 114139 AGAGAGGACCAGCAACAGCAGCATCAGCAGCGTGATGTTATCGGTT...C

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1322   ATGAGCCCATTATTGAAGAGCCAAGCCGCCTCCAGGAGTCAGTGATGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114632 AGATGAGCCCATTATTGAAGAGCCAAGCCGCCTCCAGGAGTCAGTGATGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGGCCAGCAGAACAAACATAGATGAGTCAGCTATGCCTCCACCACCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114682 AGGCCAGCAGAACAAACATAGATGAGTCAGCTATGCCTCCACCACCACCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CAGGGAGTTAAGCGAAAAGCTGGACAAATTGACCCAGAGCCTGTGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114732 CAGGGAGTTAAGCGAAAAGCTGGACAAATTGACCCAGAGCCTGTGATGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 T         CCTCAGCAGGTAGAGCAGATGGAAATACCACCTGTAGAGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114782 TGTA...AAGCCTCAGCAGGTAGAGCAGATGGAAATACCACCTGTAGAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TTCCCCCAGAAGAACCTCCAAATATCTGTCAGCTAATACCAGAGTTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116003 TTCCCCCAGAAGAACCTCCAAATATCTGTCAGCTAATACCAGAGTTAGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CTTCTGCCAGAAAAAGAGAAGGAGAAAGAGAAGGAAAAAGAAGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116053 CTTCTGCCAGAAAAAGAGAAGGAGAAAGAGAAGGAAAAAGAAGATGATGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 AGAGGAAGAG         GATGAAGATGCATCAGGGGGCGATCAAGATC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 116103 AGAGGAAGAGGTA...CAGGATGAAGATGCATCAGGGGGCGATCAAGATC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AGGAAGAAAGAAGATGGAACAAAAGGACTCAGCAGATGCTTCATGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117732 AGGAAGAAAGAAGATGGAACAAAAGGACTCAGCAGATGCTTCATGGTCTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 CAG         CGTGCTCTTGCTAAAACTGGAGCTGAATCTATCAGTTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117782 CAGGTA...CAGCGTGCTCTTGCTAAAACTGGAGCTGAATCTATCAGTTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GCTTGAGTTATGTCGAAATACGAACAGAAAACAAGCTGCCGCAAAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119077 GCTTGAGTTATGTCGAAATACGAACAGAAAACAAGCTGCCGCAAAGTTCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ACAGCTTCTTGGTTCTTAAAAAGCAGCAAGCTATTGAGCTGACACAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119127 ACAGCTTCTTGGTTCTTAAAAAGCAGCAAGCTATTGAGCTGACACAGGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GAACCGTACAGTGACATCATCGCAACACCTGGACCAAGGTTCCATATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119177 GAACCGTACAGTGACATCATCGCAACACCTGGACCAAGGTTCCATATTAT

   2000 
   1893 A
        |
 119227 A