seq1 = pF1KA0059.tfa, 2154 bp
seq2 = pF1KA0059/gi568815588r_114336263.tfa (gi568815588r:114336263_114784353), 448091 bp

>pF1KA0059 2154
>gi568815588r:114336263_114784353 (Chr10)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-199  (182393-182527)   100% ->
200-383  (208755-208938)   100% ->
384-493  (212948-213057)   100% ->
494-620  (236578-236704)   99% ->
621-714  (239256-239349)   100% ->
715-802  (292476-292563)   100% ->
803-861  (296338-296396)   100% ->
862-939  (310398-310475)   100% ->
940-1095  (311222-311377)   100% ->
1096-1131  (316138-316173)   100% ->
1132-1261  (318527-318656)   100% ->
1262-1366  (330871-330975)   100% ->
1367-1414  (332683-332730)   100% ->
1415-1555  (336334-336474)   98% ->
1556-1647  (338951-339042)   100% ->
1648-1753  (340220-340325)   100% ->
1754-1818  (342568-342632)   100% ->
1819-1879  (343277-343337)   100% ->
1880-1962  (345098-345178)   96% ->
1963-2043  (346430-346510)   100% ->
2044-2154  (347981-348091)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTAATGACCTTGGAAATGACTGAGCTCACGGACCCTCATCACACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTAATGACCTTGGAAATGACTGAGCTCACGGACCCTCATCACACCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGAGACTACAAAG         TGGCCCACCCTCAGGACCCTCACCACC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGAGACTACAAAGGTT...CAGTGGCCCACCCTCAGGACCCTCACCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CATCAGAGAAGCCTGTCATTCACTGCCATAAATGTGGGGAGCCTTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182420 CATCAGAGAAGCCTGTCATTCACTGCCATAAATGTGGGGAGCCTTGCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGTGAAGTGCTTCGGGTCCAGACCAAACATTTCCACATCAAGTGTTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182470 GGTGAAGTGCTTCGGGTCCAGACCAAACATTTCCACATCAAGTGTTTCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGCAAAG         TGTGTGGCTGTGACCTGGCACAAGGGGGCTTCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 182520 CTGCAAAGGTA...CAGTGTGTGGCTGTGACCTGGCACAAGGGGGCTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCATAAAGAACGGAGAGTATCTCTGCACCCTGGACTACCAGCGGATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208788 TCATAAAGAACGGAGAGTATCTCTGCACCCTGGACTACCAGCGGATGTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGGACACGCTGCCATGGCTGTGGGGAGTTCGTGGAGGGCGAAGTGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208838 GGGACACGCTGCCATGGCTGTGGGGAGTTCGTGGAGGGCGAAGTGGTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCTCTGGGCAAGACCTACCATCCCAATTGCTTTGCTTGTACTATCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208888 TGCTCTGGGCAAGACCTACCATCCCAATTGCTTTGCTTGTACTATCTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 A         GCGCCCGTTTCCACCCGGAGACCGAGTCACATTCAATGGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208938 AGTA...CAGGCGCCCGTTTCCACCCGGAGACCGAGTCACATTCAATGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGAGACTGCCTTTGTCAACTCTGTGCACAGCCGATGTCGTCCAGTCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212988 AGAGACTGCCTTTGTCAACTCTGTGCACAGCCGATGTCGTCCAGTCCGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAAACCACCTTCTCCAGCA         ATTGTGCCGGCTGCGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 213038 AGAAACCACCTTCTCCAGCAGTA...CAGATTGTGCCGGCTGCGGAAGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATATCAAGAACGGGCAGGCGCTGCTGGCGCTGGATAAGCAGTGGCACTTG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236599 ATATCAAGAATGGGCAGGCGCTGCTGGCGCTGGATAAGCAGTGGCACTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGGTGCTTTAAATGCAAGTCCTGCGGGAAGGTCCTCACCGGGGAGTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236649 GGGTGCTTTAAATGCAAGTCCTGCGGGAAGGTCCTCACCGGGGAGTACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAGCAA         GGATGGTGCTCCGTACTGTGAAAAGGACTACCAGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236699 CAGCAAGTA...CAGGGATGGTGCTCCGTACTGTGAAAAGGACTACCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GACTCTTTGGGGTGAAATGTGAGGCGTGTCACCAGTTTATCACAGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239291 GACTCTTTGGGGTGAAATGTGAGGCGTGTCACCAGTTTATCACAGGGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTCCTGGAG         GCAGGTGACAAACATTACCACCCCAGCTGTGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 239341 GTCCTGGAGGTA...CAGGCAGGTGACAAACATTACCACCCCAGCTGTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ACGATGCAGCAGATGCAACCAGATGTTCACAGAAGGAGAGGAAATGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292508 ACGATGCAGCAGATGCAACCAGATGTTCACAGAAGGAGAGGAAATGTATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTCAAG         GCTCCACCGTTTGGCATCCCGACTGTAAGCAATCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292558 TTCAAGGTG...CAGGCTCCACCGTTTGGCATCCCGACTGTAAGCAATCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ACGAAGACCGAGGAAAAGCTGCGG         CCTACCAGGACATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 296373 ACGAAGACCGAGGAAAAGCTGCGGGTA...CAGCCTACCAGGACATCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGAAAGTATTTATTCTAGGCCAGGCTCCAGTATTCCTGGCTCACCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 310415 GGAAAGTATTTATTCTAGGCCAGGCTCCAGTATTCCTGGCTCACCAGGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATACTATCTAT         GCAAAAGTAGACAATGAGATCCTGGATTAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 310465 ATACTATCTATGTA...CAGGCAAAAGTAGACAATGAGATCCTGGATTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AAGGATTTAGCAGCCATTCCGAAGGTCAAGGCAATTTATGACATTGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311252 AAGGATTTAGCAGCCATTCCGAAGGTCAAGGCAATTTATGACATTGAACG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TCCAGATCTTATTACCTATGAGCCTTTCTACACTTCGGGCTATGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311302 TCCAGATCTTATTACCTATGAGCCTTTCTACACTTCGGGCTATGATGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AACAGGAGAGACAGAGCCTTGGAGAG         TCTCCGAGGACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 311352 AACAGGAGAGACAGAGCCTTGGAGAGGTA...TAGTCTCCGAGGACTTTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TCTCCTACTCCATCAGCAGAA         GGGTACCAGGATGTTCGGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 316153 TCTCCTACTCCATCAGCAGAAGTA...CAGGGGTACCAGGATGTTCGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TCGGATGATCCATCGGTCCACGAGCCAGGGCTCCATCAACTCCCCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318547 TCGGATGATCCATCGGTCCACGAGCCAGGGCTCCATCAACTCCCCTGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ACAGCCGCCACAGCTACACTCCAACCACGTCCCGCTCTCCCCAGCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318597 ACAGCCGCCACAGCTACACTCCAACCACGTCCCGCTCTCCCCAGCATTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CACAGACCTG         GCAATGAGCCGTCCAGCGGCCGGAACTCCCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 318647 CACAGACCTGGTA...GAGGCAATGAGCCGTCCAGCGGCCGGAACTCCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TCTCCCTTACCGGCCAGACAGCCGCCCTCTAACTCCAACTTACGCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330902 TCTCCCTTACCGGCCAGACAGCCGCCCTCTAACTCCAACTTACGCTCAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 CCCCTAAACATTTCCATGTTCCAG         ATCAAGGAATCAACATT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 330952 CCCCTAAACATTTCCATGTTCCAGGTA...CAGATCAAGGAATCAACATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 TACCGAAAGCCACCCATCTACAAACAGCATG         CTGCCTTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 332700 TACCGAAAGCCACCCATCTACAAACAGCATGGTA...CAGCTGCCTTGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 AGCCCAGAGCAAGTCCTCAGAAGATATCATCAAGTTTTCCAAGTTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 336344 AGCCCAGAGCAAGTCCTCAGAAGATATCATCAAGTTTTCCAAGTTCCCAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 CAGCCCAGGCACCAGACCCCAGCGAGACACCAGAGATTGAGACGGACCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 336394 CAGCCCAGGCACCAGACCCCAGCGAGACACCAAAGATTGAGACGGACCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 TGGCCTGGTCCCCCCTCATTTGCTGTCATAG         GACCTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||| |||>>>...>>>||||||||||
 336444 TGGCCTGGTCCCCCCTCATTTGCTGTCGTAGGTA...TAGGACCTGACAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 GAAACGCAGATCTAGTGGCAGAGAGGAAGATGATGAGGAACTTCTGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 338961 GAAACGCAGATCTAGTGGCAGAGAGGAAGATGATGAGGAACTTCTGAGAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 GTCGGCAGCTTCAAGAAGAGCAATTAATGAAG         CTTAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 339011 GTCGGCAGCTTCAAGAAGAGCAATTAATGAAGGTT...TAGCTTAACTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GGCCTGGGACAGTTGATCTTGAAAGAAGAGATGGAGAAAGAGAGCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 340229 GGCCTGGGACAGTTGATCTTGAAAGAAGAGATGGAGAAAGAGAGCCGGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 AAGGTCATCTCTGTTAGCCAGTCGCTACGATTCTCCCATCAACTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 340279 AAGGTCATCTCTGTTAGCCAGTCGCTACGATTCTCCCATCAACTCAGGTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1754       CTTCACATATTCCATCATCTAAAACTGCATCTCTCCCTGGCTAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 340329 ...CAGCTTCACATATTCCATCATCTAAAACTGCATCTCTCCCTGGCTAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 GGAAGAAATGGGCTTCACCGG         CCTGTTTCTACCGACTTCGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 342612 GGAAGAAATGGGCTTCACCGGGTA...CAGCCTGTTTCTACCGACTTCGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 TCAGTATAACAGCTATGGGGATGTCAGCGGGGGAGTGCGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 343297 TCAGTATAACAGCTATGGGGATGTCAGCGGGGGAGTGCGAGGTG...CTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 ATTACCAGACACTCCCAGATGGCCACATGCCTGCAATGAGAATGGACCGA
        -|| |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345098  TTGC AGACACTCCCAGATGGCCACATGCCTGCAATGAGAATGGACCGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 GGAGTGTCTATGCCCAACATGTTGGAACCAAAG         ATATTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 345146 GGAGTGTCTATGCCCAACATGTTGGAACCAAAGGCA...CAGATATTTCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1971 ATATGAAATGCTCATGGTGACCAACAGAGGGCGAAACAAAATCCTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 346438 ATATGAAATGCTCATGGTGACCAACAGAGGGCGAAACAAAATCCTCAGAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 AGGTGGACAGAACCAGGCTGGAG         CGCCACTTAGCCCCTGAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 346488 AGGTGGACAGAACCAGGCTGGAGGTA...CAGCGCCACTTAGCCCCTGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2062 GTGTTTCGGGAAATCTTTGGAATGTCCATACAGGAGTTTGACAGGTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 347999 GTGTTTCGGGAAATCTTTGGAATGTCCATACAGGAGTTTGACAGGTTACC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :
   2112 TCTTTGGAGACGCAACGACATGAAGAAAAAAGCAAAACTCTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 348049 TCTTTGGAGACGCAACGACATGAAGAAAAAAGCAAAACTCTTC