Result of SIM4 for
pF1KA0055
seq1 = pF1KA0055.tfa, 3354 bp
seq2 = pF1KA0055/gi568815583f_50339074.tfa (gi568815583f:50339074_50599085), 260012 bp
>pF1KA0055 3354
>gi568815583f:50339074_50599085 (Chr15)
1-104 (100001-100104) 100% ->
105-249 (102276-102420) 100% ->
250-335 (110327-110412) 100% ->
336-498 (119927-120089) 100% ->
499-541 (123207-123249) 100% ->
542-686 (125974-126118) 100% ->
687-849 (132560-132722) 100% ->
850-994 (137776-137920) 100% ->
995-1218 (138203-138426) 100% ->
1219-1803 (142408-142992) 100% ->
1804-1890 (145202-145288) 100% ->
1891-1971 (150728-150808) 100% ->
1972-2234 (151190-151452) 100% ->
2235-2447 (153628-153840) 100% ->
2448-2658 (154997-155207) 100% ->
2659-2895 (156775-157011) 100% ->
2896-3038 (158016-158158) 100% ->
3039-3171 (159523-159655) 100% ->
3172-3354 (159830-160012) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCTGCTGTGGCTTCAGTTCCTAAAGAACTCTACCTCAGTTCTTCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCCTGCTGTGGCTTCAGTTCCTAAAGAACTCTACCTCAGTTCTTCACT
50 . : . : . : . : . :
51 AAAAGACCTTAATAAGAAGACAGAAGTTAAACCAGAGAAAATAAGCACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 AAAAGACCTTAATAAGAAGACAGAAGTTAAACCAGAGAAAATAAGCACTA
100 . : . : . : . : . :
101 AGAG TTATGTGCACAGTGCCCTGAAGATCTTTAAGACAGCA
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 AGAGGTA...AAGTTATGTGCACAGTGCCCTGAAGATCTTTAAGACAGCA
150 . : . : . : . : . :
142 GAAGAATGCAGATTAGATCGTGATGAGGAAAGGGCCTATGTACTATATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102313 GAAGAATGCAGATTAGATCGTGATGAGGAAAGGGCCTATGTACTATATAT
200 . : . : . : . : . :
192 GAAATACGTGACTGTTTATAATCTTATCAAAAAAAGACCTGATTTCAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102363 GAAATACGTGACTGTTTATAATCTTATCAAAAAAAGACCTGATTTCAAGC
250 . : . : . : . : . :
242 AACAGCAG GATTATTTCCATTCAATACTTGGACCTGGAAAC
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
102413 AACAGCAGGTA...TAGGATTATTTCCATTCAATACTTGGACCTGGAAAC
300 . : . : . : . : . :
283 ATCAAAAAAGCTGTCGAAGAAGCTGAAAGACTCTCTGAAAGCCTTAAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110360 ATCAAAAAAGCTGTCGAAGAAGCTGAAAGACTCTCTGAAAGCCTTAAATT
350 . : . : . : . : . :
333 AAG ATATGAAGAAGCTGAAGTCCGGAAAAAACTTGAGGAAA
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110410 AAGGTA...TAGATATGAAGAAGCTGAAGTCCGGAAAAAACTTGAGGAAA
400 . : . : . : . : . :
374 AAGACAGGCAGGAGGAAGCACAGCGGCTACAACAAAAAAGGCAGGAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119965 AAGACAGGCAGGAGGAAGCACAGCGGCTACAACAAAAAAGGCAGGAAACA
450 . : . : . : . : . :
424 GGAAGAGAGGATGGTGGCACATTGGCTAAAGGCTCTTTGGAGAATGTTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120015 GGAAGAGAGGATGGTGGCACATTGGCTAAAGGCTCTTTGGAGAATGTTTT
500 . : . : . : . : . :
474 GGATTCCAAAGACAAAACCCAAAAG AGCAATGGTGAAAAGA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
120065 GGATTCCAAAGACAAAACCCAAAAGGTA...TAGAGCAATGGTGAAAAGA
550 . : . : . : . : . :
515 ATGAAAAATGTGAGACCAAAGAGAAAG GAGCAATCACAGCA
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
123223 ATGAAAAATGTGAGACCAAAGAGAAAGGTA...AAGGAGCAATCACAGCA
600 . : . : . : . : . :
556 AAGGAACTATACACAATGATGACGGATAAAAACATCAGCTTGATTATAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125988 AAGGAACTATACACAATGATGACGGATAAAAACATCAGCTTGATTATAAT
650 . : . : . : . : . :
606 GGATGCTCGAAGAATGCAGGATTATCAGGATTCCTGTATTTTACATTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126038 GGATGCTCGAAGAATGCAGGATTATCAGGATTCCTGTATTTTACATTCTC
700 . : . : . : . : . :
656 TCAGTGTTCCTGAAGAAGCCATCAGTCCAGG AGTCACTGCT
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
126088 TCAGTGTTCCTGAAGAAGCCATCAGTCCAGGGTG...CAGAGTCACTGCT
750 . : . : . : . : . :
697 AGTTGGATTGAAGCACACCTGCCAGATGATTCTAAAGACACATGGAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132570 AGTTGGATTGAAGCACACCTGCCAGATGATTCTAAAGACACATGGAAGAA
800 . : . : . : . : . :
747 GAGGGGGAATGTGGAGTATGTGGTACTTCTTGACTGGTTTAGTTCTGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132620 GAGGGGGAATGTGGAGTATGTGGTACTTCTTGACTGGTTTAGTTCTGCCA
850 . : . : . : . : . :
797 AAGATTTACAGATTGGAACAACTCTCCGGAGTCTGAAAGATGCACTTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132670 AAGATTTACAGATTGGAACAACTCTCCGGAGTCTGAAAGATGCACTTTTC
900 . : . : . : . : . :
847 AAG TGGGAAAGTAAAACTGTCCTGCGCAATGAGCCTTTGGT
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132720 AAGGTT...TAGTGGGAAAGTAAAACTGTCCTGCGCAATGAGCCTTTGGT
950 . : . : . : . : . :
888 TTTAGAGGGAGGCTATGAAAACTGGCTCCTTTGTTATCCCCAGTATACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137814 TTTAGAGGGAGGCTATGAAAACTGGCTCCTTTGTTATCCCCAGTATACAA
1000 . : . : . : . : . :
938 CAAATGCTAAGGTCACTCCACCCCCACGACGCCAGAATGAAGAGGTGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137864 CAAATGCTAAGGTCACTCCACCCCCACGACGCCAGAATGAAGAGGTGTCT
1050 . : . : . : . : . :
988 ATCTCAT TGGATTTTACTTATCCCTCATTGGAAGAATCAAT
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
137914 ATCTCATGTA...TAGTGGATTTTACTTATCCCTCATTGGAAGAATCAAT
1100 . : . : . : . : . :
1029 TCCTTCTAAACCTGCTGCCCAGACGCCACCTGCATCTATAGAAGTAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138237 TCCTTCTAAACCTGCTGCCCAGACGCCACCTGCATCTATAGAAGTAGATG
1150 . : . : . : . : . :
1079 AAAATATAGAATTGATAAGTGGTCAAAATGAGAGAATGGGACCACTGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138287 AAAATATAGAATTGATAAGTGGTCAAAATGAGAGAATGGGACCACTGAAT
1200 . : . : . : . : . :
1129 ATATCAACTCCAGTTGAACCAGTTGCTGCTTCTAAATCTGATGTTTCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138337 ATATCAACTCCAGTTGAACCAGTTGCTGCTTCTAAATCTGATGTTTCACC
1250 . : . : . : . : . :
1179 CATAATTCAGCCAGTGCCTAGTATAAAGAATGTTCCACAG A
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
138387 CATAATTCAGCCAGTGCCTAGTATAAAGAATGTTCCACAGGTA...TAGA
1300 . : . : . : . : . :
1220 TTGATCGTACTAAAAAACCAGCAGTCAAATTGCCTGAAGAGCATAGAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142409 TTGATCGTACTAAAAAACCAGCAGTCAAATTGCCTGAAGAGCATAGAATA
1350 . : . : . : . : . :
1270 AAATCTGAAAGTACAAACCATGAGCAACAATCTCCTCAGAGTGGAAAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142459 AAATCTGAAAGTACAAACCATGAGCAACAATCTCCTCAGAGTGGAAAAGT
1400 . : . : . : . : . :
1320 TATTCCTGATCGTTCCACCAAGCCAGTAGTTTTTTCTCCAACTCTCATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142509 TATTCCTGATCGTTCCACCAAGCCAGTAGTTTTTTCTCCAACTCTCATGT
1450 . : . : . : . : . :
1370 TAACAGATGAAGAAAAGGCTCGTATTCATGCAGAAACTGCTCTTCTAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142559 TAACAGATGAAGAAAAGGCTCGTATTCATGCAGAAACTGCTCTTCTAATG
1500 . : . : . : . : . :
1420 GAAAAAAACAAACAAGAAAAAGAACTTCGGGAAAGGCAGCAAGAGGAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142609 GAAAAAAACAAACAAGAAAAAGAACTTCGGGAAAGGCAGCAAGAGGAACA
1550 . : . : . : . : . :
1470 GAAAGAGAAACTGAGGAAGGAAGAACAAGAACAAAAAGCCAAAAAGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142659 GAAAGAGAAACTGAGGAAGGAAGAACAAGAACAAAAAGCCAAAAAGAAAC
1600 . : . : . : . : . :
1520 AAGAAGCTGAAGAAAATGAAATTACAGAGAAGCAACAAAAAGCAAAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142709 AAGAAGCTGAAGAAAATGAAATTACAGAGAAGCAACAAAAAGCAAAAGAA
1650 . : . : . : . : . :
1570 GAAATGGAGAAGAAAGAAAGTGAACAGGCCAAGAAAGAAGATAAAGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142759 GAAATGGAGAAGAAAGAAAGTGAACAGGCCAAGAAAGAAGATAAAGAAAC
1700 . : . : . : . : . :
1620 CTCAGCAAAGAGGGGCAAAGAAATAACAGGAGTAAAAAGACAAAGTAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142809 CTCAGCAAAGAGGGGCAAAGAAATAACAGGAGTAAAAAGACAAAGTAAAA
1750 . : . : . : . : . :
1670 GTGAACATGAAACTTCTGATGCCAAGAAATCTGTAGAAGATAGGGGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142859 GTGAACATGAAACTTCTGATGCCAAGAAATCTGTAGAAGATAGGGGGAAA
1800 . : . : . : . : . :
1720 AGGTGTCCAACCCCAGAAATACAGAAAAAGTCAACAGGAGATGTGCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142909 AGGTGTCCAACCCCAGAAATACAGAAAAAGTCAACAGGAGATGTGCCCCA
1850 . : . : . : . : . :
1770 TACATCTGTGACAGGGGATTCAGGTTCAGGCAAG CCATTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
142959 TACATCTGTGACAGGGGATTCAGGTTCAGGCAAGGTA...CAGCCATTTA
1900 . : . : . : . : . :
1811 AGATTAAAGGACAACCAGAAAGTGGAATTCTAAGGACAGGAACTTTTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145209 AGATTAAAGGACAACCAGAAAGTGGAATTCTAAGGACAGGAACTTTTAGA
1950 . : . : . : . : . :
1861 GAGGATACAGACGATACCGAAAGAAATAAA GCTCAACGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
145259 GAGGATACAGACGATACCGAAAGAAATAAAGTA...TAGGCTCAACGAGA
2000 . : . : . : . : . :
1902 ACCTTTGACAAGAGCACGAAGTGAAGAAATGGGGAGGATCGTACCAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150739 ACCTTTGACAAGAGCACGAAGTGAAGAAATGGGGAGGATCGTACCAGGAC
2050 . : . : . : . : . :
1952 TGCCTTCAGGCTGGGCCAAG TTTCTTGACCCAATCACTGGA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
150789 TGCCTTCAGGCTGGGCCAAGGTA...AAGTTTCTTGACCCAATCACTGGA
2100 . : . : . : . : . :
1993 ACCTTTCGTTATTATCATTCACCCACCAACACTGTTCATATGTACCCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151211 ACCTTTCGTTATTATCATTCACCCACCAACACTGTTCATATGTACCCACC
2150 . : . : . : . : . :
2043 GGAAATGGCTCCTTCATCTGCACCTCCTTCCACCCCTCCAACTCATAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151261 GGAAATGGCTCCTTCATCTGCACCTCCTTCCACCCCTCCAACTCATAAAG
2200 . : . : . : . : . :
2093 CCAAGCCACAGATTCCTGCTGAGCGGGATAGGGAACCTTCCAAACTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151311 CCAAGCCACAGATTCCTGCTGAGCGGGATAGGGAACCTTCCAAACTGAAG
2250 . : . : . : . : . :
2143 CGCTCCTACTCCTCCCCAGATATAACCCAGGCTATTCAAGAGGAAGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151361 CGCTCCTACTCCTCCCCAGATATAACCCAGGCTATTCAAGAGGAAGAGAA
2300 . : . : . : . : . :
2193 GAGGAAGCCAACAGTAACTCCAACAGTTAATCGGGAAAACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
151411 GAGGAAGCCAACAGTAACTCCAACAGTTAATCGGGAAAACAAGTA...CA
2350 . : . : . : . : . :
2235 GCCAACATGTTATCCTAAAGCTGAGATCTCAAGGCTTTCTGCTTCTCAG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153627 GGCCAACATGTTATCCTAAAGCTGAGATCTCAAGGCTTTCTGCTTCTCAG
2400 . : . : . : . : . :
2284 ATTCGGAACCTCAATCCTGTTTTTGGAGGTTCTGGACCAGCTCTTACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153677 ATTCGGAACCTCAATCCTGTTTTTGGAGGTTCTGGACCAGCTCTTACTGG
2450 . : . : . : . : . :
2334 ACTTCGTAACTTAGGAAATACTTGTTATATGAACTCAATATTGCAGTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153727 ACTTCGTAACTTAGGAAATACTTGTTATATGAACTCAATATTGCAGTGCC
2500 . : . : . : . : . :
2384 TATGTAACGCTCCACATTTGGCTGATTATTTCAACCGAAACTGTTATCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153777 TATGTAACGCTCCACATTTGGCTGATTATTTCAACCGAAACTGTTATCAG
2550 . : . : . : . : . :
2434 GATGATATTAACAG GTCAAATTTGTTGGGGCATAAAGGTGA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
153827 GATGATATTAACAGGTA...CAGGTCAAATTTGTTGGGGCATAAAGGTGA
2600 . : . : . : . : . :
2475 AGTGGCAGAAGAATTTGGTATAATCATGAAAGCCCTGTGGACAGGACAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155024 AGTGGCAGAAGAATTTGGTATAATCATGAAAGCCCTGTGGACAGGACAGT
2650 . : . : . : . : . :
2525 ATAGATATATCAGTCCAAAGGACTTTAAAATCACCATTGGGAAGATCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155074 ATAGATATATCAGTCCAAAGGACTTTAAAATCACCATTGGGAAGATCAAT
2700 . : . : . : . : . :
2575 GACCAGTTTGCAGGATACAGTCAGCAAGATTCACAAGAATTGCTTCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155124 GACCAGTTTGCAGGATACAGTCAGCAAGATTCACAAGAATTGCTTCTGTT
2750 . : . : . : . : . :
2625 CCTAATGGATGGTCTCCATGAAGATCTAAATAAA GCTGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
155174 CCTAATGGATGGTCTCCATGAAGATCTAAATAAAGTA...CAGGCTGATA
2800 . : . : . : . : . :
2666 ATCGGAAGAGATATAAAGAAGAAAATAATGATCATCTCGATGACTTTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156782 ATCGGAAGAGATATAAAGAAGAAAATAATGATCATCTCGATGACTTTAAA
2850 . : . : . : . : . :
2716 GCTGCAGAACATGCCTGGCAGAAACACAAGCAGCTCAATGAGTCTATTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156832 GCTGCAGAACATGCCTGGCAGAAACACAAGCAGCTCAATGAGTCTATTAT
2900 . : . : . : . : . :
2766 TGTTGCACTTTTTCAGGGTCAATTCAAATCTACAGTACAGTGCCTCACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156882 TGTTGCACTTTTTCAGGGTCAATTCAAATCTACAGTACAGTGCCTCACAT
2950 . : . : . : . : . :
2816 GTCACAAAAAGTCTAGGACATTTGAGGCCTTCATGTATTTGTCTCTACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156932 GTCACAAAAAGTCTAGGACATTTGAGGCCTTCATGTATTTGTCTCTACCA
3000 . : . : . : . : . :
2866 CTAGCATCCACAAGTAAATGTACATTACAG GATTGCCTTAG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
156982 CTAGCATCCACAAGTAAATGTACATTACAGGTA...CAGGATTGCCTTAG
3050 . : . : . : . : . :
2907 ATTATTTTCCAAAGAAGAAAAACTCACAGATAACAACAGATTTTACTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158027 ATTATTTTCCAAAGAAGAAAAACTCACAGATAACAACAGATTTTACTGCA
3100 . : . : . : . : . :
2957 GTCATTGCAGAGCTCGACGGGATTCTCTAAAAAAGATAGAAATCTGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158077 GTCATTGCAGAGCTCGACGGGATTCTCTAAAAAAGATAGAAATCTGGAAG
3150 . : . : . : . : . :
3007 TTACCACCTGTGCTTTTAGTGCATCTGAAACG TTTTTCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
158127 TTACCACCTGTGCTTTTAGTGCATCTGAAACGGTA...CAGTTTTTCCTA
3200 . : . : . : . : . :
3048 CGATGGCAGGTGGAAACAAAAATTACAGACATCTGTGGACTTCCCGTTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159532 CGATGGCAGGTGGAAACAAAAATTACAGACATCTGTGGACTTCCCGTTAG
3250 . : . : . : . : . :
3098 AAAATCTTGACTTGTCACAGTATGTTATTGGTCCAAAGAACAATTTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159582 AAAATCTTGACTTGTCACAGTATGTTATTGGTCCAAAGAACAATTTGAAG
3300 . : . : . : . : . :
3148 AAATATAATTTGTTTTCTGTTTCA AATCACTACGGTGGGCT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
159632 AAATATAATTTGTTTTCTGTTTCAGTA...CAGAATCACTACGGTGGGCT
3350 . : . : . : . : . :
3189 GGATGGAGGCCACTACACAGCCTATTGTAAAAATGCAGCAAGACAACGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159847 GGATGGAGGCCACTACACAGCCTATTGTAAAAATGCAGCAAGACAACGGT
3400 . : . : . : . : . :
3239 GGTTTAAGTTTGATGATCATGAAGTTTCTGATATCTCCGTTTCTTCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159897 GGTTTAAGTTTGATGATCATGAAGTTTCTGATATCTCCGTTTCTTCTGTG
3450 . : . : . : . : . :
3289 AAATCTTCAGCAGCTTATATCCTCTTTTATACTTCATTGGGACCACGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159947 AAATCTTCAGCAGCTTATATCCTCTTTTATACTTCATTGGGACCACGAGT
3500 . : .
3339 AACTGATGTAGCCACA
||||||||||||||||
159997 AACTGATGTAGCCACA