seq1 = pF1KA0015.tfa, 1362 bp
seq2 = pF1KA0015/gi568815576r_21823095.tfa (gi568815576r:21823095_22046048), 222954 bp

>pF1KA0015 1362
>gi568815576r:21823095_22046048 (Chr22)

(complement)

1-206  (100001-100206)   100% ->
207-355  (106369-106517)   100% ->
356-558  (111823-112025)   100% ->
559-747  (112470-112658)   100% ->
748-891  (114758-114901)   100% ->
892-985  (120387-120480)   100% ->
986-1362  (122578-122954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTCTGGAGCCCCACAGAAGAGCAGCCCAATGGCCAGTGGAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCTCTGGAGCCCCACAGAAGAGCAGCCCAATGGCCAGTGGAGCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGACCCCAGGCTTCCTGGACACGCTCCTGCAAGACTTCCCAGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGACCCCAGGCTTCCTGGACACGCTCCTGCAAGACTTCCCAGCCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAACCCAGAGGACCCTCTGCCATGGAAGGCCCCAGGGACGGTGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAACCCAGAGGACCCTCTGCCATGGAAGGCCCCAGGGACGGTGCTCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGAGGAGGTGGAGGGCGAGCTGGCTGAGCTGGCCATGGGCTTTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGGAGGAGGTGGAGGGCGAGCTGGCTGAGCTGGCCATGGGCTTTCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCAG         GAAGGCCCCGCCACCACTTGCTGCTGCTCTGGCCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCAGGTA...TAGGAAGGCCCCGCCACCACTTGCTGCTGCTCTGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACGAAGCAGTTTCACAGCTGCTACAGACAGACCTTTCCGAATTCAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106404 ACGAAGCAGTTTCACAGCTGCTACAGACAGACCTTTCCGAATTCAGGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGCCCAGGGAGGAAGAAGAAGAGGAGGAGGACGATGACGAGGAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106454 TTGCCCAGGGAGGAAGAAGAAGAGGAGGAGGACGATGACGAGGAGGAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGCCCCTGTGACCT         TGCTGGATGCCCAAAGCCTGGCACAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 106504 GGCCCCTGTGACCTGTG...CAGTGCTGGATGCCCAAAGCCTGGCACAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTTTCTTTAACCGCCTTTGGGAAGTCGCCGGCCAGTGGCAGAAGCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111850 GTTTCTTTAACCGCCTTTGGGAAGTCGCCGGCCAGTGGCAGAAGCAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCATTGGCTGCCCGGGCCTCACAGCGGCAGTGGCTGGTCTCCATCCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111900 CCATTGGCTGCCCGGGCCTCACAGCGGCAGTGGCTGGTCTCCATCCACGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATCCGGAACACTCGCCGCAAGATGGAGGACCGGCACGTGTCCCTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111950 CATCCGGAACACTCGCCGCAAGATGGAGGACCGGCACGTGTCCCTCCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTTCAACCAGCTCTTCGGCTTGTCT         GACCCTGTGAACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112000 CCTTCAACCAGCTCTTCGGCTTGTCTGTG...CAGGACCCTGTGAACCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCTACTTTGCTGTGTTTGATGGTCACGGAGGCGTGGATGCTGCGAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112485 GCCTACTTTGCTGTGTTTGATGGTCACGGAGGCGTGGATGCTGCGAGGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGCCGCTGTCCACGTGCACACCAACGCTGCCCGCCAGCCAGAGCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112535 CGCCGCTGTCCACGTGCACACCAACGCTGCCCGCCAGCCAGAGCTGCCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAGACCCTGAGGGAGCCCTCAGAGAAGCCTTCCGGCGCACCGACCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112585 CAGACCCTGAGGGAGCCCTCAGAGAAGCCTTCCGGCGCACCGACCAGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTTCTCAGGAAAGCCAAGCGAGAG         CGGCTGCAGAGCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112635 TTTCTCAGGAAAGCCAAGCGAGAGGTG...CAGCGGCTGCAGAGCGGCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CACAGGTGTGTGTGCGCTCATTGCAGGAGCGACCCTGCACGTCGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114775 CACAGGTGTGTGTGCGCTCATTGCAGGAGCGACCCTGCACGTCGCCTGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCGGGGATTCCCAGGTCATTTTGGTACAGCAGGGACAGGTGGTGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114825 TCGGGGATTCCCAGGTCATTTTGGTACAGCAGGGACAGGTGGTGAAGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATGGAGCCACACAGACCAGAACGGCAG         GATGAGAAGGCGCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 114875 ATGGAGCCACACAGACCAGAACGGCAGGTA...CAGGATGAGAAGGCGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CATTGAAGCATTGGGTGGCTTTGTGTCTCACATGGACTGCTGGAGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120401 CATTGAAGCATTGGGTGGCTTTGTGTCTCACATGGACTGCTGGAGAGTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ACGGGACCCTGGCCGTCTCCAGAGCCATCG         GGGATGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 120451 ACGGGACCCTGGCCGTCTCCAGAGCCATCGGTG...CAGGGGATGTCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CAGAAGCCCTACGTGTCTGGGGAGGCCGATGCAGCTTCCCGGGCGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122589 CAGAAGCCCTACGTGTCTGGGGAGGCCGATGCAGCTTCCCGGGCGCTGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGGCTCCGAGGACTACCTGCTGCTTGCCTGTGATGGCTTCTTTGACGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122639 GGGCTCCGAGGACTACCTGCTGCTTGCCTGTGATGGCTTCTTTGACGTCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TACCCCACCAGGAAGTTGTTGGCCTGGTCCAGAGCCACCTGACCAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122689 TACCCCACCAGGAAGTTGTTGGCCTGGTCCAGAGCCACCTGACCAGGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CAGGGCAGCGGGCTCCGTGTCGCCGAGGAGCTGGTGGCTGCGGCCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122739 CAGGGCAGCGGGCTCCGTGTCGCCGAGGAGCTGGTGGCTGCGGCCCGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GCGGGGCTCCCACGACAACATCACGGTCATGGTGGTCTTCCTCAGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122789 GCGGGGCTCCCACGACAACATCACGGTCATGGTGGTCTTCCTCAGGGACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CCCAAGAGCTGCTGGAGGGCGGGAACCAGGGAGAAGGGGACCCCCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122839 CCCAAGAGCTGCTGGAGGGCGGGAACCAGGGAGAAGGGGACCCCCAGGCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GAAGGGAGGAGGCAGGACTTGCCCTCCAGCCTTCCAGAACCTGAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122889 GAAGGGAGGAGGCAGGACTTGCCCTCCAGCCTTCCAGAACCTGAGACCCA

   1400     .    :    .
   1347 GGCTCCACCAAGAAGC
        ||||||||||||||||
 122939 GGCTCCACCAAGAAGC