seq1 = pF1KA0003.tfa, 1494 bp
seq2 = pF1KA0003/gi568815590r_107151858.tfa (gi568815590r:107151858_107597558), 445701 bp

>pF1KA0003 1494
>gi568815590r:107151858_107597558 (Chr8)

(complement)

1-297  (100001-100297)   100% ->
298-453  (250462-250617)   100% ->
454-575  (261288-261409)   100% ->
576-808  (275431-275663)   100% ->
809-936  (294192-294319)   100% ->
937-1038  (303522-303623)   100% ->
1039-1205  (312711-312877)   100% ->
1206-1336  (333208-333338)   100% ->
1337-1494  (345544-345701)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGTTTTCCTTTCCTTTGCTTTCCTCGCTGCCATTCTGACTCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAGTTTTCCTTTCCTTTGCTTTCCTCGCTGCCATTCTGACTCACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGGTGCAGCAATCAGCGCCGAAGTCCAGAAAACAGTGGGAGAAGATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGGTGCAGCAATCAGCGCCGAAGTCCAGAAAACAGTGGGAGAAGATATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCGGATTCAACATGGGCAATGTGCCTACACTTTCATTCTTCCAGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCGGATTCAACATGGGCAATGTGCCTACACTTTCATTCTTCCAGAACAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGGCAACTGTCGTGAGAGTACGACAGACCAGTACAACACAAACGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGGCAACTGTCGTGAGAGTACGACAGACCAGTACAACACAAACGCTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGAGAGATGCTCCACACGTGGAACCGGATTTCTCTTCCCAGAAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGAGAGATGCTCCACACGTGGAACCGGATTTCTCTTCCCAGAAACTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AACATCTGGAACATGTGATGGAAAATTATACTCAGTGGCTGCAAAAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100251 AACATCTGGAACATGTGATGGAAAATTATACTCAGTGGCTGCAAAAAGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    298       CTTGAGAATTACATTGTGGAAAACATGAAGTCGGAGATGGCCCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ...CAGCTTGAGAATTACATTGTGGAAAACATGAAGTCGGAGATGGCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GATACAGCAGAATGCAGTTCAGAACCACACGGCTACCATGCTGGAGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 250506 GATACAGCAGAATGCAGTTCAGAACCACACGGCTACCATGCTGGAGATAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GAACCAGCCTCCTCTCTCAGACTGCAGAGCAGACCAGAAAGCTGACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 250556 GAACCAGCCTCCTCTCTCAGACTGCAGAGCAGACCAGAAAGCTGACAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTTGAGACCCAG         GTACTAAATCAAACTTCTCGACTTGAGAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 250606 GTTGAGACCCAGGTA...AAGGTACTAAATCAAACTTCTCGACTTGAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACAGCTGCTGGAGAATTCATTATCCACCTACAAGCTAGAGAAGCAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261317 ACAGCTGCTGGAGAATTCATTATCCACCTACAAGCTAGAGAAGCAACTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTCAACAGACAAATGAAATCTTGAAGATCCATGAAAAAAACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 261367 TTCAACAGACAAATGAAATCTTGAAGATCCATGAAAAAAACAGGTG...T

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    576   TTTATTAGAACATAAAATCTTAGAAATGGAAGGAAAACACAAGGAAGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275429 AGTTTATTAGAACATAAAATCTTAGAAATGGAAGGAAAACACAAGGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTTGGACACCTTAAAGGAAGAGAAAGAGAACCTTCAAGGCTTGGTTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275479 GTTGGACACCTTAAAGGAAGAGAAAGAGAACCTTCAAGGCTTGGTTACTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTCAAACATATATAATCCAGGAGCTGGAAAAGCAATTAAACAGAGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275529 GTCAAACATATATAATCCAGGAGCTGGAAAAGCAATTAAACAGAGCTACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACCAACAACAGTGTCCTTCAGAAGCAGCAACTGGAGCTGATGGACACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275579 ACCAACAACAGTGTCCTTCAGAAGCAGCAACTGGAGCTGATGGACACAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCACAACCTTGTCAATCTTTGCACTAAAGAAGGTG         TTTTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 275629 CCACAACCTTGTCAATCTTTGCACTAAAGAAGGTGGTA...CAGTTTTAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TAAAGGGAGGAAAAAGAGAGGAAGAGAAACCATTTAGAGACTGTGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294198 TAAAGGGAGGAAAAAGAGAGGAAGAGAAACCATTTAGAGACTGTGCAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GTATATCAAGCTGGTTTTAATAAAAGTGGAATCTACACTATTTATATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294248 GTATATCAAGCTGGTTTTAATAAAAGTGGAATCTACACTATTTATATTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TAATATGCCAGAACCCAAAAAG         GTGTTTTGCAATATGGATG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 294298 TAATATGCCAGAACCCAAAAAGGTA...CAGGTGTTTTGCAATATGGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TCAATGGGGGAGGTTGGACTGTAATACAACATCGTGAAGATGGAAGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 303541 TCAATGGGGGAGGTTGGACTGTAATACAACATCGTGAAGATGGAAGTCTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GATTTCCAAAGAGGCTGGAAGGAATATAAAATG         GGTTTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 303591 GATTTCCAAAGAGGCTGGAAGGAATATAAAATGGTA...CAGGGTTTTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AAATCCCTCCGGTGAATATTGGCTGGGGAATGAGTTTATTTTTGCCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 312719 AAATCCCTCCGGTGAATATTGGCTGGGGAATGAGTTTATTTTTGCCATTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCAGTCAGAGGCAGTACATGCTAAGAATTGAGTTAATGGACTGGGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 312769 CCAGTCAGAGGCAGTACATGCTAAGAATTGAGTTAATGGACTGGGAAGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AACCGAGCCTATTCACAGTATGACAGATTCCACATAGGAAATGAAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 312819 AACCGAGCCTATTCACAGTATGACAGATTCCACATAGGAAATGAAAAGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AAACTATAG         GTTGTATTTAAAAGGTCACACTGGGACAGCAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 312869 AAACTATAGGTA...CAGGTTGTATTTAAAAGGTCACACTGGGACAGCAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GAAAACAGAGCAGCCTGATCTTACACGGTGCTGATTTCAGCACTAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333240 GAAAACAGAGCAGCCTGATCTTACACGGTGCTGATTTCAGCACTAAAGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GCTGATAATGACAACTGTATGTGCAAATGTGCCCTCATGTTAACAGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 333290 GCTGATAATGACAACTGTATGTGCAAATGTGCCCTCATGTTAACAGGAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1337         GATGGTGGTTTGATGCTTGTGGCCCCTCCAATCTAAATGGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333340 TA...CAGGATGGTGGTTTGATGCTTGTGGCCCCTCCAATCTAAATGGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGTTCTATACTGCGGGACAAAACCATGGAAAACTGAATGGGATAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345586 TGTTCTATACTGCGGGACAAAACCATGGAAAACTGAATGGGATAAAGTGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CACTACTTCAAAGGGCCCAGTTACTCCTTACGTTCCACAACTATGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345636 CACTACTTCAAAGGGCCCAGTTACTCCTTACGTTCCACAACTATGATGAT

   1550     .    :    .
   1479 TCGACCTTTAGATTTT
        ||||||||||||||||
 345686 TCGACCTTTAGATTTT