# 0 Query: pF1KSDB1439, 2273 aa
# 1 CCDS747.1 ABCA4 gene_id:24|Hs108|chr1 (2273 aa)
# 2 CCDS12055.1 ABCA7 gene_id:10347|Hs108|chr19 (2146 aa)
# 3 CCDS43909.1 ABCA2 gene_id:20|Hs108|chr9 (2436 aa)
# 4 CCDS6762.1 ABCA1 gene_id:19|Hs108|chr9 (2261 aa)
# 5 CCDS33373.1 ABCA12 gene_id:26154|Hs108|chr2 (2277 aa)
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exp sw-scr id% from to
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3 2.5e-105 4627 37.1 88 2368
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0 ( 1) MGFVRQIQLLLWKNWTLRKRQKIRFVVELVWPLSLFLVLIWLRNANPLYSHHECHFPNKA
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2 ( 1) MAFWTQLMLLLWKNFMYRRRQPVQLLVELLWPLFLFFILVAVRHSHPPLEHHECHFPNKP
3 ( -) ............................................................
4 ( 6) .....QLRLLLWKNLTFRRRQTCQLLLEVAWPLFIFLILISVRLSYPPYEQHECHFPNKA
5 ( -) ............................................................
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0 ( 61) MPSAGMLPWLQGIFCNVNNPCFQSPTPGESPGIVSNYNNS----ILARVYRDFQELLMNA
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3 ( 88) ....................................YANSTVTQLLERLDRVVEEGNLFD
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5 ( -) ............................................................
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1 ( 117) PESQHLGRIWTELHILSQFMDTLRTHP-------ERIAGRGIRIRDILKDEETLTLFLIK
2 ( 117) --SAH-----RTLAGLGKLIATLR-------------AARS-------------------
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5 ( -) ............................................................
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2 ( 138) -------------TAQPQPTK-QSP--------------------------LEPPML--D
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5 ( -) ............................................................
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4 ( 194) L-CNGSKSEEM--------------IQL----GDQEVS-ELCGLPREK----LAAAERVL
5 ( -) ............................................................
//
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2 ( 178) -----------EPL----HSLLEAAE-------------DL--A---QELLALRSLVEL-
3 ( 288) RNQLDVAK-VSQQLGLDAPNGSDSSPQAPPPRRLQALLGDLLDAQKVLQDVDVLSALALL
4 ( 230) RSNMDILKPILRTL----NSTSPFPSKELA-EATKTLLHSL--GTLAQELFSMRSWSDMR
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 298) W-----VTR----PLMQNGGPETFT---KLMGILSDLLCGYPEGGGSRVL-SFNWYEDNN
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2 ( 204) --------R----ALLQR--PRGTS---GPLELLSEALCSV-RGPSSTVGPSLNWYEASD
3 ( 347) LPQGACTGRTPGPPASGAGGAANGTGAGAVMGPNATAEEGAPSAAA---L-ATPDTLQGQ
4 ( 283) Q-----EVM----FLTNVNSSSSST---QIYQAVSRIVCGHPEGGGLKIK-SLNWYEDNN
5 ( 434) ..........................................................NH
//
0 ( 345) YKAFLGIDSTRKDPI--YSYDRRTTSFCNALIQSLESNPLTKIAWRAAKPL--LMG---K
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2 ( 246) LMELVGQEPESALP------DSSLSPACSELIGALDSHPLSRLLWRRLKPL--ILG---K
3 ( 403) CSAFVQLWAGLQ-PI--LCGNNRTIEPEALRRGNMSSLGFTSKEQRNLGLLVHLMTSNPK
4 ( 330) YKALFGGNGTEEDAE--TFYDNSTTPYCNDLMKNLESSPLSRIIWKALKPL--LVG---K
5 ( 436) TKDFLTYKLTKEQIASKYGIPINSTPFCFSLYKDIINMPAGPVIWAFLKPM--LLG---R
//
0 ( 398) ILYTPDSPAARRILKNANSTFEELEHVRKLVKAWEEVGPQIWYFFDNSTQ-MNMIRDTLG
1 ( 398) ILYTPDSPAARRILKNANSTFEELEHVRKLVKAWEEVGPQIWYFFDNSTQ-MNMIRDTLG
2 ( 295) LLFAPDTPFTRKLMAQVNRTFEELTLLRDVREVWEMLGPRIFTFMNDSSN-VAMLQRLL-
3 ( 460) ILYAPAGSEVDRVILKANETFAFVGNVTHYAQVWLNISAEIRSFLEQGRL-QQHLR----
4 ( 383) ILYTPDTPATRQVMAEVNKTFQELAVFHDLEGMWEELSPKIWTFMENSQE-MDLVRMLLD
5 ( 491) ILYAPYNPVTKAIMEKSNVTLRQLAELREKSQEWMDKSPLFMNSFHLLNQAIPMLQNTLR
//
0 ( 457) NPTVKDFLNRQLGEEGIT-AEAILNFLYKGPRESQADDMA---NFDWRDIFNITDRTLRL
1 ( 457) NPTVKDFLNRQLGEEGIT-AEAILNFLYKGPRESQADDMA---NFDWRDIFNITDRTLRL
2 ( 353) --QMQDEGRRQPRPGGRDHMEALRSFLDPGS--------G---GYSWQDAHADVGHLVGT
3 ( 515) ------WLQQYVAELRLH-PEALNLSLDELPPALRQDNFSLPSGMALLQQLDTIDNAACG
4 ( 442) SRDNDHFWEQQLDGLDWT-AQDIVAFLAKHPEDVQSSNGS---VYTWREAFNETNQAIRT
5 ( 551) NPFVQVFVKFSVGLDAVE--------LLKQIDELDILRLK---LENNIDIIDQLNTLSSL
//
0 ( 513) VNQYLECLVLDKFESYNDETQLTQRALSL-LEENM-FWAGVVF--------PDMYPWTSS
1 ( 513) VNQYLECLVLDKFESYNDETQLTQRALSL-LEENM-FWAGVVF--------PDMYPWTSS
2 ( 400) LGRVTECLSLDKLEAAPSEAALVSRALQL-LAEHR-FWAGVVFLGPEDSSDPTEHPTPDL
3 ( 568) WIQFMSKVSVDIFKGFPDEESIVNYTLNQAYQDNVTVFASVIF--------QTRKD--GS
4 ( 498) ISRFMECVNLNKLEPIATEVWLINKSMEL-LDERK-FWAGIVF--------TGITPGSIE
5 ( 600) TVNISSCVLYDRIQAAKTIDEMEREAKRL-YKSNE-LFGSVIFKL------PSNRSWHRG
//
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2 ( 458) -------GPGHVRIKIRMDIDVVTRTNKIRDRFWDPGPAADPLTDLRYVWG-GFVYLQDL
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//
0 ( 615) VEQGITRSQV-QAEA--PVGIYLQQMPYPCFVDDSFMIILNRCFPIFMVLAWIYSVSMTV
1 ( 615) VEQGITRSQV-QAEA--PVGIYLQQMPYPCFVDDSFMIILNRCFPIFMVLAWIYSVSMTV
2 ( 510) VERAAVRVLS-GANP--RAGLYLQQMPYPCYVDDVFLRVLSRSLPLFLTLAWIYSVTLTV
3 ( 667) MERAIIDTFV-GHDVVEP-GSYVQMFPYPCYTRDDFLFVIEHMMPLCMVISWVYSVAMTI
4 ( 600) VEQAIIRVLT-GTEK--KTGVYMQQMPYPCYVDDIFLRVMSRSMPLFMTLAWIYSVAVII
5 ( 710) IERAIIELQTGRNSQ--EIAVQVQAIPYPCFMKDNFLTSVSYSLPIVLMVAWVVFIAAFV
//
0 ( 672) KSIVLEKELRLKETLKNQGVSNAVIWCTWFLDSFSIMSMSIFLLTIFIMHGRILHYSDPF
1 ( 672) KSIVLEKELRLKETLKNQGVSNAVIWCTWFLDSFSIMSMSIFLLTIFIMHGRILHYSDPF
2 ( 567) KAVVREKETRLRDTMRAMGLSRAVLWLGWFLSCLGPFLLSAALLVLVLKLGDILPYSHPG
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5 ( 768) KKLVYEKDLRLHEYMKMMGVNSCSHFFAWLIESVGFLLVTIVILIIILKFGNILPKTNGF
//
0 ( 732) ILFLFLLAFSTATIMLCFLLSTFFSKASLAAACSGVIYFTLYLPHILCFAWQ----DRMT
1 ( 732) ILFLFLLAFSTATIMLCFLLSTFFSKASLAAACSGVIYFTLYLPHILCFAWQ----DRMT
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4 ( 717) VVFVFLSVFAVVTILQCFLISTLFSRANLAAACGGIIYFTLYLPYVLCVAWQ----DYVG
5 ( 828) ILFLYFSDYSFSVIAMSYLISVFFNNTNIAALIGSLIYIIAFFPFIVLVTVE----NELS
//
0 ( 788) AELKKAVSLLSPVAFGFGTEYLVRFEEQGLGLQWSNIGNSPTEGDEFSFLLSMQMMLLDA
1 ( 788) AELKKAVSLLSPVAFGFGTEYLVRFEEQGLGLQWSNIGNSPTEGDEFSFLLSMQMMLLDA
2 ( 683) AGGRVAASLLSPVAFGFGCESLALLEEQGEGAQWHNVGTRPT-ADVFSLAQVSGLLLLDA
3 ( 845) AFEKCIASLMSTTAFGLGSKYFALYEVAGVGIQWHTFSQSPVEGDDFNLLLAVTMLMVDA
4 ( 773) FTLKIFASLLSPVAFGFGCEYFALFEEQGIGVQWDNLFESPVEEDGFNLTTSVSMMLFDT
5 ( 884) YVLKVFMSLLSPTAFSYASQYIARYEEQGIGLQWENMYTSPVQDDTTSFGWLCCLILADS
//
0 ( 848) AVYGLLAWYLDQVFPGDYGTPLPWYFLLQESYWLG-GEGCS-TREERA--LEKTEPLTEE
1 ( 848) AVYGLLAWYLDQVFPGDYGTPLPWYFLLQESYWLG-GEGCS-TREERA--LEKTEPLTEE
2 ( 742) ALYGLATWYLEAVCPGQYGIPEPWNFPFRRSYW------CG-PRPPKS-------PAPCP
3 ( 905) VVYGILTWYIEAVHPGMYGLPRPWYFPLQKSYWLGSGRTEA-WEWSWP--WARTPRLSVM
4 ( 833) FLYGVMTWYIEAVFPGQYGIPRPWYFPCTKSYWFG----------EES--DEKSHPGSNQ
5 ( 944) FIYFLIAWYVRNVFPGTYGMAAPWYFPILPSYWKE-RFGCAEVKPEKSNGLMFTNIMMQN
//
*
0 ( 904) TEDPEHPEGIHDSFFER-----EHPGWVPGV-CVKNLVKIFEPCGQPAVDRLNITFYENQ
1 ( 904) TEDPEHPEGIHDSFFER-----EHPGWVPGV-CVKNLVKIFEPCGRPAVDRLNITFYENQ
2 ( 788) T--PLDPK----VLVEE-----APPGLSPGV-SVRSLEKRFPGSPQPALRGLSLDFYQGH
3 ( 962) EED--QACAMESRRFEETRGMEEEPTHLPLVVCVDKLTKVYKDDKKLALNKLSLNLYENQ
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5 ( 1003) TNPSASPEYMFSSNIEP-----EPKDLTVGV-ALHGVTKIY--GSKVAVDNLNLNFYEGH
//
0 ( 958) ITAFLGHNGAGKTTTLSILTGLLPPTSGTVLVGGRDIETSLDAVRQSLGMCPQHNILFHH
1 ( 958) ITAFLGHNGAGKTTTLSILTGLLPPTSGTVLVGGRDIETSLDAVRQSLGMCPQHNILFHH
2 ( 836) ITAFLGHNGAGKTTTLSILSGLFPPSGGSAFILGHDVRSSMAAIRPHLGVCPQYNVLFDM
3 ( 1020) VVSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGSATIYGHDIRTEMDEIRKNLGMCPQHNVLFDR
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5 ( 1055) ITSLLGPNGAGKTTTISMLTGLFGASAGTIFVYGKDIKTDLHTVRKNMGVCMQHDVLFSY
//
0 ( 1018) LTVAEHMLFYAQLKGKSQEEAQL--EMEAMLEDTGL-HHKRNEEAQDLSGGMQRKLSVAI
1 ( 1018) LTVAEHMLFYAQLKGKSQEEAQL--EMEAMLEDTGL-HHKRNEEAQDLSGGMQRKLSVAI
2 ( 896) LTVDEHVWFYGRLKGLSAAVVGP--EQDRLLQDVGL-VSKQSVQTRHLSGGMQRKLSVAI
3 ( 1080) LTVEEHLWFYSRLKSMAQEEIRR--EMDKMIEDLEL-SNKRHSLVQTLSGGMKRKLSVAI
4 ( 988) LTVEEHIWFYARLKGLSEKHVKA--EMEQMALDVGLPSSKLKSKTSQLSGGMQRKLSVAL
5 ( 1115) LTTKEHLLLYGSIKVPHWTKKQLHEEVKRTLKDTGL-YSHRHKRVGTLSGGMKRKLSISI
//
0 ( 1075) AFVGDAKVVILDEPTSGVDPYSRRSIWDLLLKYRSGRTIIMSTHHMDEADLLGDRIAIIA
1 ( 1075) AFVGDAKVVILDEPTSGVDPYSRRSIWDLLLKYRSGRTIIMSTHHMDEADLLGDRIAIIA
2 ( 953) AFVGGSQVVILDEPTAGVDPASRRGIWELLLKYREGRTLILSTHHLDEAELLGDRVAVVA
3 ( 1137) AFVGGSRAIILDEPTAGVDPYARRAIWDLILKYKPGRTILLSTHHMDEADLLGDRIAIIS
4 ( 1046) AFVGGSKVVILDEPTAGVDPYSRRGIWELLLKYRQGRTIILSTHHMDEADVLGDRIAIIS
5 ( 1174) ALIGGSRVVILDEPSTGVDPCSRRSIWDVISKNKTARTIILSTHHLDEAEVLSDRIAFLE
//
0 ( 1135) QGRLYCSGTPLFLKNCFGTGLYLTLVRK-MKNIQSQRKGS---EGTCSCSSKGFS---TT
1 ( 1135) QGRLYCSGTPLFLKNCFGTGLYLTLVRK-MKNIQSQRKGS---EGTCSCSSKGFS---TT
2 ( 1013) GGRLCCCGSPLFLRRHLGSGYYLTLVKA-RLPLTTNEKADTDMEGSVDTRQEKKN---GS
3 ( 1197) HGKLKCCGSPLFLKGTYGDGYRLTLVKR-----PAEPGGP---Q------EPGLA---SS
4 ( 1106) HGKLCCVGSSLFLKNQLGTGYYLTLVKKDVESSLSSCRNS---SSTVSYLKKEDSVSQSS
5 ( 1234) QGGLRCCGSPFYLKEAFGDGYHLTLTKK-----KSPNLNA---NAVC-------------
//
0 ( 1188) CPAHVDDLTPEQVLDGDVNELMDVVLHHVPEAKLVECIGQELIFLLPNKNFK-HRAYASL
1 ( 1188) CPAHVDDLTPEQVLDGDVNELMDVVLHHVPEAKLVECIGQELIFLLPNKNFK-HRAYASL
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3 ( 1240) PPGRAP-LSSCSEL-----QVSQFIRKHVASCLLVSDTSTELSYILPSEAAK-KGAFERL
4 ( 1163) SDAGLGSDHESDTLTIDVSAISNLIRKHVSEARLVEDIGHELTYVLPYEAAK-EGAFVEL
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//
0 ( 1247) FRELEETLADLGLSSFGISDTPLEEIFLKVTEDSDSGPLFAGG---AQQKRENVNP--RH
1 ( 1247) FRELEETLADLGLSSFGISDTPLEEIFLKVTEDSDSGPLFAGG---AQQKRENVNP--RH
2 ( 1117) FRELDTRLAELRLTGYGISDTSLEEIFLKVVEECAADTDMEDG---SCGQ---------H
3 ( 1293) FQHLERSLDALHLSSFGLMDTTLEEVFLKVSEEDQSLENSEAD---VKESRKDVLPGAEG
4 ( 1222) FHEIDDRLSDLGISSYGISETTLEEIFLKVAEESGVDAETSDGTLPARRNRRAFGD--KQ
5 ( 1317) LRALDNGMGDLNIGCYGISDTTVEEVFLNLTKESQKN---------SAMSLEHLTQ--KK
//
0 ( 1302) PCLGP-----REKAG-QTPQDSNVCSPGAP---------AAHPEG----------QP---
1 ( 1302) PCLGP-----REKAG-QTPQDSNVCSPGAP---------AAHPEG----------QP---
2 ( 1165) LCTGIAGLDVTLRLK-MPPQETALEN-GEP---------A----G----------SA---
3 ( 1350) PASG------EGHAG-NLARCSELTQSQASLQSASSVGSARGDEGAGYTDVYGDYRPLFD
4 ( 1280) SCLRPF----TEDDA-ADPNDSDIDPESRE---------TDLLSG----------M----
5 ( 1366) --IGN-----SNANGISTPDDLSVSSSNFT-------------------------DR---
//
0 ( 1334) -PPEPEC---------------PGPQLN---TGTQLVLQHVQALLVKRFQHTIRSHKDFL
1 ( 1334) -PPEPEC---------------PGPQLN---TGTQLVLQHVQALLVKRFQHTIRSHKDFL
2 ( 1197) -PETDQG---------------SGPDAVGRVQGWALTRQQLQALLLKRFLLARRSRRGLF
3 ( 1403) NPQDPDNVSLQEVEAEALSRVGQGSRKL---DGGWLKVRQFHGLLVKRFHCARRNSKALF
4 ( 1312) -----DG---------------KGSYQV---KGWKLTQQQFVALLWKRLLIARRSRKGFF
5 ( 1391) -DDKILT---------------RGERLD----GFGLLLKKIMAILIKRFHHTRRNWKGLI
//
0 ( 1375) AQIVLPATFVFLALMLSIVIPPFGEYPALTLHPWIYG-----------------QQYTFF
1 ( 1375) AQIVLPATFVFLALMLSIVIPPFGEYPALTLHPWIYG-----------------QQYTFF
2 ( 1241) AQIVLPALFVGLALVFSLIVPPFGHYPALRLSPTMYG-----------------AQVSFF
3 ( 1460) SQILLPAFFVCVAMTVALSVPEIGDLPPLVLSPSQYHNYTQPRGNFIPYANEERREYRLR
4 ( 1349) AQIVLPAVFVCIALVFSLIVPPFGKYPSLELQPWMYN-----------------EQYTFV
5 ( 1431) AQVILPIVFVTTAMGLGTLRNSSNSYPEIQISPSLYGTS---------------EQTAFY
//
0 ( 1418) SMDEPGSEQFT--------VLADVLLNKPG----------------------FGNRCLKE
1 ( 1418) SMDEPGSEQFT--------VLADVLLNKPG----------------------FGNRCLKE
2 ( 1284) SEDAPGDPGRA--------RLLEALLQEAG------------------------------
3 ( 1520) LSPDASPQQLVSTFRLPSGVGATCVLKSPANGSLGPTLNLSSGESRLLAARFFDSMCL-E
4 ( 1392) SNDAPEDTGTL--------ELLNALTKDPG----------------------FGTRCMEG
5 ( 1476) ANYHPSTE-----------ALVSAMWDFPG----------------------IDNMCLNT
//
0 ( 1448) GWLPEYPC-GN---STP-WKTPSVSP----------NIT--QLFQKQKWTQVNPSPS---
1 ( 1448) GWLPEYPC-GN---STP-WKTPSVSP----------NIT--QLFQKQKWTQVNPSPS---
2 ( 1306) --LEEPPV-QH---SSHRFSAPEVPA----------EVA--KVLASGNWTPESPSPA---
3 ( 1579) SFTQGLPL-SNFVPPPP-SPAPSDSPASPDEDLQAWNVSLPPTAGPEMWTSAPSLPRLVR
4 ( 1422) NPIPDTPCQAG---EEE-WTTAPVPQ----------TIM--DLFQNGNWTMQNPSPA---
5 ( 1503) SDLQCLNK-DS---LEK-WNT-SGEP-----------IT--NF------------GV---
//
0 ( 1488) --CRCSTREKLTMLPECPEGAGGLPPPQRTQRSTEILQDLTDRNISDFLVKTYPALIRSS
1 ( 1488) --CRCSTREKLTMLPECPEGAGGLPPPQRTQRSTEILQDLTDRNISDFLVKTYPALIRSS
2 ( 1345) --CQCSRPGARRLLPDCPAAAGGPPPPQAVTGSGEVVQNLTGRNLSDFLVKTYPRLVRQG
3 ( 1637) EPVRCTCSAQGTGFS-CPSSVGGHPPQMRVV-TGDILTDITGHNVSEYLLFT--------
4 ( 1463) --CQCSSDKIKKMLPVCPPGAGGLPPPQRKQNTADILQDLTGRNISDYLVKTYVQIIAKS
5 ( 1529) --CSCSEN-----VQECPKF--NYSPPHRRTYSSQVIYNLTGQRVENYLISTANEFV---
//
0 ( 1546) LKSKFWVNEQRYGGISIG-GKLPVVPITGEALVGFLSDLGRIMN-VSGGPITREASKEIP
1 ( 1546) LKSKFWVNEQRYGGISIG-GKLPVVPITGEALVGFLSDLGRIMN-VSGGPITREASKEIP
2 ( 1403) LKTKKWVNEVRYGGFSLG-GRDPGLP-SGQELGRSVEELWALLSPLPGGALDR-VLKNLT
3 ( 1687) -SDRFRL--HRYGAITFG-NVLKSIP----------ASFG-----------TRA-----P
4 ( 1521) LKNKIWVNEFRYGGFSLGVSNTQALPPSQE-VNDAIKQMKKHLK-LAKDSSADRFLNSLG
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//
0 ( 1604) DFLKHLETEDNIKVWFNNKGWHALVSFLNVAHNAILRASLPKDR-SPEEYGITVISQPLN
1 ( 1604) DFLKHLETEDNIKVWFNNKGWHALVSFLNVAHNAILRASLPKDR-SPEEYGITVISQPLN
2 ( 1460) AWAHSLDAQDSLKIWFNNKGWHSMVAFVNRASNAILRAHLPPGP-ARHAHSITTLNHPLN
3 ( 1717) PMVRKIAVRRAAQVFYNNKGYHSMPTYLNSLNNAILRANLPKSKGNPAAYGITVTNHPMN
4 ( 1579) RFMTGLDTKNNVKVWFNNKGWHAISSFLNVINNAILRANLQKGE-NPSHYGITAFNHPLN
5 ( 1609) -------------VWYDPEGYHSLPAYLNSLNNFLLRVNMSK-Y-DAARHGIIMYSHPYP
//
0 ( 1663) LTKEQLSEITVLTTSVDAVVAICVIFSMSFVPASFVLYLIQERVNKSKHLQFISGVSPTT
1 ( 1663) LTKEQLSEITVLTTSVDAVVAICVIFSMSFVPASFVLYLIQERVNKSKHLQFISGVSPTT
2 ( 1519) LTKEQLSEGALMASSVDVLVSICVVFAMSFVPASFTLVLIEERVTRAKHLQLMGGLSPTL
3 ( 1777) KTSASLS-LDYLLQGTDVVIAIFIIVAMSFVPASFVVFLVAEKSTKAKHLQFVSGCNPII
4 ( 1638) LTKQQLSEVALMTTSVDVLVSICVIFAMSFVPASFVVFLIQERVSKAKHLQFISGVKPVI
5 ( 1654) GVQDQ--EQATISSLIDILVALSILMGYSVTTASFVTYVVREHQTKAKQLQHISGIGVTC
//
0 ( 1723) YWVTNFLWDIMNYSVSAGLVVGIFIGFQKKAYTSPENLPALVALLLLYGWAVIPMMYPAS
1 ( 1723) YWVTNFLWDIMNYSVSAGLVVGIFIGFQKKAYTSPENLPALVALLLLYGWAVIPMMYPAS
2 ( 1579) YWLGNFLWDMCNYLVPACIVVLIFLAFQQRAYVAPANLPALLLLLLLYGWSITPLMYPAS
3 ( 1836) YWLANYVWDMLNYLVPATCCVIILFVFDLPAYTSPTNFPAVLSLFLLYGWSITPIMYPAS
4 ( 1698) YWLSNFVWDMCNYVVPATLVIIIFICFQQKSYVSSTNLPVLALLLLLYGWSITPLMYPAS
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//
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