# 0 Query: pF1KSDB1316, 862 aa
# 1 CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 (862 aa)
# 2 CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 (738 aa)
# 3 CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 (833 aa)
# 4 CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 (837 aa)
# 5 CCDS7501.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 (843 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 5793 99.9 1 862
2 6.7e-203 3748 99.5 1 557
3 1.5e-88 1700 45.1 20 632
4 7.1e-77 1621 40.7 24 701
5 1.4e-76 1486 39.0 34 678
//
0 ( 1) MRMCTPIRGLLMALAVMFGTAMAFAPIPRITWE--HREVHLV--QFHEPDIYNYSALLLS
1 ( 1) MRMCTPIRGLLMALAVMFGTAMAFAPIPRITWE--HREVHLV--QFHEPDIYNYSALLLS
2 ( 1) MRMCTPIRGLLMALAVMFGTAMAFAPIPRITWE--HREVHLV--QFHEPDIYNYSALLLS
3 ( 20) ..................GAEVWWNLVPRKTVS--SGELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLT
4 ( 24) .....PLLLLLLLLLLLQPPPPTWALSPRISLPLGSEERPFL--RFEAEHISNYTALLLS
5 ( 34) ...........................PRMTIP--YEELSGT--RHFKGQAQNYSTLLLE
//
0 ( 57) EDKDTLYIGAREAVFAVNALNISE----KQH-EVYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNY
1 ( 57) EDKDTLYIGAREAVFAVNALNISE----KQH-EVYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNY
2 ( 57) EDKDTLYIGAREAVFAVNALNISE----KQH-EVYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNY
3 ( 60) EPTGLLYVGAREALFAFS-MEALE----LQG-AISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNF
4 ( 77) RDGRTLYVGAREALFALSS-NLSFLPGGEYQ-ELLWGADAEKKQQCSFKGKDPQRDCQNY
5 ( 63) EASARLLVGARGALFSLSANDIGD----GAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNH
//
0 ( 112) IRVLQPLSATSLYVCGTNAFQPACDHLNLTSFKFL-GKNE-------DGKGRCPFDPAHS
1 ( 112) IRVLQPLSATSLYVCGTNAFQPACDHLNLTSFKFL-GKNE-------DGKGRCPFDPAHS
2 ( 112) IRVLQPLSATSLYVCGTNAFQPACDHLNLTSFKFL-GKNE-------DGKGRCPFDPAHS
3 ( 114) IRFLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFE-------DGKGKCPYDPAKG
4 ( 135) IKILLPLSGSHLFTCGTAAFSPMCTYINMENFT-L-ARDEKGNVLLEDGKGRCPFDPNFK
5 ( 119) VRFLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLP-TSFE-------EGKEKCPYDPARG
//
0 ( 164) YTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRN-SSHSPLRTEYA-IPWLNEPSFVFADVIRKSP
1 ( 164) YTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRN-SSHSPLRTEYA-IPWLNEPSFVFADVIRKSP
2 ( 164) YTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRN-SSHSPLRTEYA-IPWLNEPSFVFADVIRKSP
3 ( 167) HAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYL-AFWLNEPHFVGSAYVPESV
4 ( 193) STALVVDGELYTGTVSSFQGNDPAISRS-QSLRPTKTESS-LNWLQDPAFVASAYIPESL
5 ( 171) FTGLIIDGGLYTATRYEFR-SIPDIRRS-RHPHSLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESK
//
0 ( 222) DSPDGEDDRVYFFFTEVSVEY---EFV-----FRVLIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTS
1 ( 222) DSPDGEDDRVYFFFTEVSVEY---EFV-----FRVLIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTS
2 ( 222) DSPDGEDDRVYFFFTEVSVEY---EFV-----FRVLIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTS
3 ( 226) GSFTGDDDKVYFFFRERAVES---DCY-----AEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTT
4 ( 251) GSLQGDDDKIYFFFSETGQEF---EFF-----ENTIVSRIARICKGDEGGERVLQQRWTS
5 ( 229) ASAVGDDDKVYYFFTERATEEGSGSFTQSRSSHRV--ARVARVCKGDLGGKKILQKKWTS
//
*
0 ( 274) FLKARLICSRPDSGLVFNVLRDVFVLR-SP-GLKVPVFYALFT--PQLN--NVGLSAVCT
1 ( 274) FLKARLICSRPDSGLVFNVLRDVFVLR-SP-GLKVPVFYALFT--PQLN--NVGLSAVCA
2 ( 274) FLKARLICSRPDSGLVFNVLRDVFVLR-SP-GLKVPVFYALFT--PQLN--NVGLSAVCA
3 ( 278) FLKARLACSAPNWQLYFNQLQAMHTLQ-DT-SWHNTTFFGVFQ--AQWG--DMYLSAICE
4 ( 303) FLKAQLLCSRPDDGFPFNVLQDVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFT--SQWHRGTTEGSAVCV
5 ( 287) FLKARLICHIP----LYETLRGVCSLD-AE-TSSRTHFYAAFTLSTQWK--TLEASAICR
//
0 ( 328) YNLSTAEEVFSHGKYMQSTTVEQSHTKWVRYNGPVPKPRPGACIDSEARAANYTSSLNLP
1 ( 328) YNLSTAEEVFSHGKYMQSTTVEQSHTKWVRYNGPVPKPRPGACIDSEARAANYTSSLNLP
2 ( 328) YNLSTAEEVFSHGKYMQSTTVEQSHTKWVRYNGPVPKPRPGACIDSEARAANYTSSLNLP
3 ( 332) YQLEEIQRVF-EGPYKEYHEEAQ---KWDRYTDPVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELP
4 ( 361) FTMKDVQRVFS-GLYKE---VNRETQQWYTVTHPVPTPRPGACITNSARERKINSSLQLP
5 ( 339) YDLAEIQAVFA-GPYME---YQDGSRRWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLP
//
0 ( 388) DKTLQFVKDHPLMDDSVTPIDNRPRLIKKDVNYTQIVVDRTQALDGTVYDVMFVSTDRGA
1 ( 388) DKTLQFVKDHPLMDDSVTPIDNRPRLIKKDVNYTQIVVDRTQALDGTVYDVMFVSTDRGA
2 ( 388) DKTLQFVKDHPLMDDSVTPIDNRPRLIKKDVNYTQIVVDRTQALDGTVYDVMFVSTDRGA
3 ( 388) DNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVKKGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGW
4 ( 417) DRVLNFLKDHFLMDGQVR---SRMLLLQPQARYQRVAVHRVPGLHHT-YDVLFLGTGDGR
5 ( 395) SLVLDFVKLHPLMARPVVPTRGRPLLLKRNIRYTHLTGTPVTTPAGPTYDLLFLGTADGW
//
0 ( 448) LHKAISLEHAVHIIEETQLFQDFEPVQTLLLSSKKGNRFVYAGSNSGVVQAPLAFCGKHG
1 ( 448) LHKAISLEHAVHIIEETQLFQDFEPVQTLLLSSKKGNRFVYAGSNSGVVQAPLAFCGKHG
2 ( 448) LHKAISLEHAVHIIEETQLFQDFEPVQTLLLSSKKGNRFVYAGSNSGVVQAPLAFCGKHG
3 ( 448) LLKAVSLGPWVHLIEELQLF-DQEPMRSLVLSQSK--KLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYR
4 ( 473) LHKAVSVGPRVHIIEELQIFSSGQPVQNLLLDTHRG--LLYAASHSGVVQVPMANCSLYR
5 ( 455) IHKAVVLGSGMHIIEETQVFRESQSVENLVISLLQHS--LYVGAPSGVIQLPLSSCSRYR
//
0 ( 508) TCEDCVLARDPYCAWSPPTATCVALHQTESPSRG----LIQE-MS-GDAS--VCPDKS--
1 ( 508) TCEDCVLARDPYCAWSPPTATCVALHQTESPSRG----LIQE-MS-GDAS--VCPDKS--
2 ( 508) TCEDCVLARDPYCAWSPPTATCVALHQTESPSRG----LIQE-MS-GDAS--VCPASS..
3 ( 505) SCADCVLARDPYCAWSVNTSRCVAVGG-HSGSL-----LIQHVMT-SDTSG-ICNLRG--
4 ( 531) SCGDCLLARDPYCAWSGSSCKHVSLYQPQLATRP----WIQD-IE-GASAKDLCSASSVV
5 ( 513) SCYDCILARDPYCGWDPGTHACAAATTIANRSQGSRTALIQD-IERGNRG--CESSRD--
//
0 ( 558) KGS---Y--------R---QHFFKHGGTAE-LKCSQKSNLARVFWKFQNGVLKAESPKYG
1 ( 558) KGS---Y--------R---QHFFKHGGTAE-LKCSQKSNLARVFWKFQNGVLKAESPKYG
2 ( -) ............................................................
3 ( 555) SKK---V--------RPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARWTFGGRDLPAEQPGSF
4 ( 585) SPS---FVPTGEKPCE---QVQFQPNTVNT-LACPLLSNLATRLW-LRNGAPVNASASCH
5 ( 568) TGPPPPL--------K---TRSVLRGDDVL-LPCDQPSNLARALW-LLNGSMGLSDGQGG
//
0 ( 603) L-MGRK--NLLIFNLSEGDSGVYQCLSEERVKNKTVFQVVAKHVLEVK-VVPKPVVAPTL
1 ( 603) L-MGRK--NLLIFNLSEGDSGVYQCLSEERVKNKTVFQVVAKHVLEVK-VVPKPVVAPTL
2 ( -) ............................................................
3 ( 604) L-YDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQ..............................
4 ( 637) V-LPTG--DLLLVGTQQ--LGEFQCWSLE----EGFQQLVASYCPEV---VEDGVADQT-
5 ( 615) YRVGVD--GLLVTDAQPEHSGNYGCYAEE----NGLRTLLASYSLTVRPATPAP--APKA
//
0 ( 659) SVVQTEGSRIATKVLVASTQGSSPPTPAVQATSSGAITLPPKPAPTGTSCEPKIVINTVP
1 ( 659) SVVQTEGSRIATKVLVASTQGSSPPTPAVQATSSGAITLPPKPAPTGTSCEPKIVINTVP
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
4 ( 684) ----DEGGSVP--VIISTSRVSAP....................................
5 ( 667) PA--TPGAQLAPDV..............................................
//
0 ( 719) QLHSEKTMYLKSSDNRLLMSLFLFFFVLFLCLFFYNCYKGYLPRQCLKFRSALLIGKKKP
1 ( 719) QLHSEKTMYLKSSDNRLLMSLFLFFFVLFLCLFFYNCYKGYLPRQCLKFRSALLIGKKKP
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 779) KSDFCDREQSLKETLVEPGSFSQQNGEHPKPALDTGYETEQDTITSKVPTDREDSQRIDD
1 ( 779) KSDFCDREQSLKETLVEPGSFSQQNGEHPKPALDTGYETEQDTITSKVPTDREDSQRIDD
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 839) LSARDKPFDVKCELKFADSDADGD
1 ( 839) LSARDKPFDVKCELKFADSDADGD
2 ( -) ........................
3 ( -) ........................
4 ( -) ........................
5 ( -) ........................
//
