# 0 Query: pF1KSDA1820, 1640 aa
# 1 CCDS11188.1 RAI1 gene_id:10743|Hs108|chr17 (1906 aa)
# 2 CCDS14032.1 TCF20 gene_id:6942|Hs108|chr22 (1938 aa)
# 3 CCDS14033.1 TCF20 gene_id:6942|Hs108|chr22 (1960 aa)
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exp sw-scr id% from to
1 0 10906 99.9 1 1598
2 6.4e-17 1072 25.6 1 1633
3 6.5e-17 1072 25.6 1 1633
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0 ( 1) MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
1 ( 1) MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
2 ( 1) MQSFREQSSYHGNQQSYPQEVHGSSRLEEF-SPRQA------QMFQNFGGTGGSSGSSGS
3 ( 1) MQSFREQSSYHGNQQSYPQEVHGSSRLEEF-SPRQA------QMFQNFGGTGGSSGSSGS
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0 ( 61) GGAGTPSGTAAAVAA----DKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEE
1 ( 61) GGAGTPSGTAAAVAA----DKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEE
2 ( 54) GSGGGRRGAAAAAAAMASETSGHQGYQGFRKEAGDFYYMAGNKDPVTTGTPQPPQRRPSG
3 ( 54) GSGGGRRGAAAAAAAMASETSGHQGYQGFRKEAGDFYYMAGNKDPVTTGTPQPPQRRPSG
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0 ( 117) SLQAWGAPQPPP-----------PQPQPLPAG---VAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGA
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2 ( 114) PVQSYGPPQGSSFGNQYGSEGHVGQFQAQHSGLGGVSHYQQDYTGPFS-PGSAQYQQQAS
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0 ( 163) ------QVPFRTHSLHVQQPPPPQQPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGT--------H
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2 ( 173) SQQQQQQVQQLRQQLYQSHQPLPQAT-GQPASSSSHLQ-PMQRPSTLPSSAAGYQLRVGQ
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0 ( 209) FPQHSQSFPTSSTYSS--SVQGGGQGAHSYK-SCTAPTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQN
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2 ( 231) FGQHYQSSASSSSSSSFPSPQRFSQSGQSYDGSYNVNAGSQYEGHNVGSNAQAYG--TQS
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0 ( 266) LHAYQSGRL-SYDQQQ--QQQQQQQQQQQALQSRHHAQETLHYQNLA-KYQHYGQQGQGY
1 ( 266) LHAYQSGRL-SYDQQQ--QQQQQQQQQQQALQSRHHAQETLHYQNLA-KYQHYGQQGQGY
2 ( 289) NYSYQPQSMKNFEQAKIPQGTQQGQQQQQPQQQQHPSQHVMQYTNAATKLPLQSQVGQ-Y
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0 ( 322) CQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTPSPLMPNLENFPYSQQPLSTGA
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2 ( 348) NQPEVPVRSPMQFHQNFSPISNPSPAASVVQSPSCSSTPSPLMQTGENLQCGQ-----GS
3 ( 348) NQPEVPVRSPMQFHQNFSPISNPSPAASVVQSPSCSSTPSPLMQTGENLQCGQ-----GS
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0 ( 382) FPAGITDHS-HFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKDKLPENLLSDLSLQSLTALTS
1 ( 382) FPAGITDHS-HFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKDKLPENLLSDLSLQSLTALTS
2 ( 403) VPMGSRNRILQLMPQLSPTPS-MMPSPNSHAAGFKGFGLEGVPEKRLTDPGLSSLSALST
3 ( 403) VPMGSRNRILQLMPQLSPTPS-MMPSPNSHAAGFKGFGLEGVPEKRLTDPGLSSLSALST
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0 ( 441) QVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQHCS-PEGSGYSAEPAGTPLSE
1 ( 441) QVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQHCS-PEGSGYSAEPAGTPLSE
2 ( 462) QVANLPNTVQHMLLSDALTPQKKTSK----RPSSSKKADSCTNSEGSSQPEEQLKSPMAE
3 ( 462) QVANLPNTVQHMLLSDALTPQKKTSK----RPSSSKKADSCTNSEGSSQPEEQLKSPMAE
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0 ( 500) P-PSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFL--YCNQARGSPARVNSNSKAKPESVSTC
1 ( 500) P-PSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFL--YCNQARGSPARVNSNSKAKPESVSTC
2 ( 518) SLDGGCSSSSEDQGERVRQLSGQSTSSDTTYKGGASEKAGSSPAQ---GAQNEPPRLNAS
3 ( 518) SLDGGCSSSSEDQGERVRQLSGQSTSSDTTYKGGASEKAGSSPAQ---GAQNEPPRLNAS
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0 ( 557) SVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLSALAQEDLASEILGLQE
1 ( 557) SVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLSALAQEDLASEILGLQE
2 ( 575) PAAREEATSPGAKD--------MPLSSDGNPKVNEKTVGVIV----SREAMTGRV----E
3 ( 575) PAAREEATSPGAKD--------MPLSSDGNPKVNEKTVGVIV----SREAMTGRV----E
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0 ( 617) AIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPRPGEPEALPDSLQLDKG
1 ( 617) AIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPRPGEPEALPDSLQLDKG
2 ( 619) KPGGQDKGSQEDDPAA---TQRPP---SNGGAKETSHASLPQPEPPGGGGSKGNKNGDNN
3 ( 619) KPGGQDKGSQEDDPAA---TQRPP---SNGGAKETSHASLPQPEPPGGGGSKGNKNGDNN
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0 ( 677) GNAKDFSPGLFEDPSVA--FAT-PDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPDPTTAAFDCFPDTT
1 ( 677) GNAKDFSPGLFEDPSVA--FAT-PDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPDPTTAAFDCFPDTT
2 ( 673) SNHNGEGNGQSGHSAAGPGFTSRTEPSKSPGSLRYSYKDSFGSAVPR-NVSGFPQYP--T
3 ( 673) SNHNGEGNGQSGHSAAGPGFTSRTEPSKSPGSLRYSYKDSFGSAVPR-NVSGFPQYP--T
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0 ( 734) AASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGISKGDTHEASACLGF
1 ( 734) AASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGISKGDTHEASACLGF
2 ( 730) GQEKGD----FTGHGERKG----RNEKFPSLLQEVLQGYHHHPDRRYSRSTQEHQGMAGS
3 ( 730) GQEKGD----FTGHGERKG----RNEKFPSLLQEVLQGYHHHPDRRYSRSTQEHQGMAGS
//
0 ( 794) QEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLEDSRHCCSTA-DFGD
1 ( 794) QEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLEDSRHCCSTA-DFGD
2 ( 782) LEGTTRPNVLVSQTNELASR--GLLNKSIGSLLENPH------WGPWERKSSSTAPEMKQ
3 ( 782) LEGTTRPNVLVSQTNELASR--GLLNKSIGSLLENPH------WGPWERKSSSTAPEMKQ
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0 ( 853) LPLLP-PTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICTKEEVEEVL---
1 ( 853) LPLLP-PTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICTKEEVEEVL---
2 ( 834) INLTDYPIPRKFEIEPQ---SSAHEPGGSLSERRSVICDISPLRQIV--RDPGAHSLGHM
3 ( 834) INLTDYPIPRKFEIEPQ---SSAHEPGGSLSERRSVICDISPLRQIV--RDPGAHSLGHM
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0 ( 909) --DSKAGWGSPCHLS-GESVILLGPTVGTESKVQSW--------FESSLS----------
1 ( 909) --DSKAGWGSPCHLS-GESVILLGPTVGTESKVQSW--------FESSLS----------
2 ( 889) SADTRIGRNDRLNPTLSQSVILPGGLVSMETKLKSQSGQIKEEDFEQSKSQASFNNKKSG
3 ( 889) SADTRIGRNDRLNPTLSQSVILPGGLVSMETKLKSQSGQIKEEDFEQSKSQASFNNKKSG
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0 ( 948) -HMKPG---EEGPDGERAPGDSTTSDAS-LAQKPNKPA-VPEAP--IAKKEPVPRGKSLR
1 ( 948) -HMKPG---EEGPDGERAPGDSTTSDAS-LAQKPNKPA-VPEAP--IAKKEPVPRGKSLR
2 ( 949) DHCHPPSIKHESYRGNASPGAATHDSLSDYGPQDSRPTPMRRVPGRVGGREGM-RGRS--
3 ( 949) DHCHPPSIKHESYRGNASPGAATHDSLSDYGPQDSRPTPMRRVPGRVGGREGM-RGRS--
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0 ( 1000) SRRVHRGLPEAEDSP--CRAPVLPKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCT
1 ( 1000) SRRVHRGLPEAEDSP--CRAPVLPKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCT
2 ( 1006) PSQYHDFAEKLKMSPGRSRGPGGDPHHMNPHM-TFSERANRSSLHTPFSPNSETL----A
3 ( 1006) PSQYHDFAEKLKMSPGRSRGPGGDPHHMNPHM-TFSERANRSSLHTPFSPNSETL----A
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0 ( 1058) RSLTALSEPRTPGPP--GLTTTPAPPDKLGGKQRAAFK---SGKRVG--------KPSPK
1 ( 1058) RSLTALSEPRTPGPP--GLTTTPAPPDKLGGKQRAAFK---SGKRVG--------KPSPK
2 ( 1061) SAYHANTRAHAYGDPNAGLNSQLHYKRQMYQQQPEEYKDWSSGSAQGVIAAAQHRQEGPR
3 ( 1061) SAYHANTRAHAYGDPNAGLNSQLHYKRQMYQQQPEEYKDWSSGSAQGVIAAAQHRQEGPR
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0 ( 1105) AASSPSNPAAL-----PVASDSSPM--GSKTKETDSPS----------TPGKDQRSMILR
1 ( 1105) AASSPSNPAAL-----PVASDSSPM--GSKTKETDSPS----------TPGKDQRSMILR
2 ( 1121) --KSPRQQQFLDRVRSPLKNDKDGMMYGPPVGTYHDPSAQEAGRCLMSSDGLPNKGMELK
3 ( 1121) --KSPRQQQFLDRVRSPLKNDKDGMMYGPPVGTYHDPSAQEAGRCLMSSDGLPNKGMELK
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0 ( 1148) SRT-KTQEIFH--SKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQ--KEGRVSQR
1 ( 1148) SRT-KTQEIFH--SKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQ--KEGRVSQR
2 ( 1179) HGSQKLQESCWDLSRQTSPAKSSGPPGMSSQKRYGPPHETDGHGLAEATQSSKPGSVMLR
3 ( 1179) HGSQKLQESCWDLSRQTSPAKSSGPPGMSSQKRYGPPHETDGHGLAEATQSSKPGSVMLR
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0 ( 1203) ARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKEER
1 ( 1203) ARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKEER
2 ( 1239) L----PGQEDHSSQNPLIMRRRVRSFISPIPSKRQSQDVKN---SSTEDKGRLLHSSKEG
3 ( 1239) L----PGQEDHSSQNPLIMRRRVRSFISPIPSKRQSQDVKN---SSTEDKGRLLHSSKEG
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0 ( 1263) PEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLPPR
1 ( 1263) PEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLPPR
2 ( 1292) ADKAFNSYAHLSHSQDIK-SIPKRDSSKDLPSPDSRN-C----PAVTLTSPAKTKILPPR
3 ( 1292) ADKAFNSYAHLSHSQDIK-SIPKRDSSKDLPSPDSRN-C----PAVTLTSPAKTKILPPR
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0 ( 1323) KGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEEGL
1 ( 1323) KGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEEGL
2 ( 1346) KGRGLKLEAIVQKITSPNIRRSASSNSAEAGGDTV--TLDDI---LSLKSGPPEG---GS
3 ( 1346) KGRGLKLEAIVQKITSPNIRRSASSNSAEAGGDTV--TLDDI---LSLKSGPPEG---GS
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0 ( 1383) VNVGTGQKLPTSG--ADPLCRNPTNRSL--KGKLMNSK---KLSSTDCFKTE--AFTSPE
1 ( 1383) VNVGTGQKLPTSG--ADPLCRNPTNRSL--KGKLMNSK---KLSSTDCFKTE--AFTSPE
2 ( 1398) VAVQDADIEKRKGEVASDLV-SPANQELHVEKPLPRSSEEWRGSVDDKVKTETHAETVTA
3 ( 1398) VAVQDADIEKRKGEVASDLV-SPANQELHVEKPLPRSSEEWRGSVDDKVKTETHAETVTA
//
0 ( 1434) ALQPGG---TALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPL--EKRPYLGPALLLTPR------DRAS
1 ( 1434) ALQPGG---TALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPL--EKRPYLGPALLLTPR------DRAS
2 ( 1457) GKEPPGAMTSTTSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVPPVGILAPEANPKAEEKEN
3 ( 1457) GKEPPGAMTSTTSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVPPVGILAPEANPKAEEKEN
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0 ( 1483) GTQGASEDNSG----G---GGKKPKMEELG-LASQPPEGRPCQPQTRAQKQP-GHTNYSS
1 ( 1483) GTQGASEDNSG----G---GGKKPKMEELG-LASQPPEGRPCQPQTRAQKQP-GHTNYSS
2 ( 1517) DTVTISPKQEGFPPKGYFPSGKK-KGRPIGSVNKQKKQQQPPPPPPQPPQIPEGSADGEP
3 ( 1517) DTVTISPKQEGFPPKGYFPSGKK-KGRPIGSVNKQKKQQQPPPPPPQPPQIPEGSADGEP
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0 ( 1534) YSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRRRQQQVLPL-DPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRT
1 ( 1534) YSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRRRQQQVLPL-DPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRT
2 ( 1576) KPKKQRQRRERRK-PGAQP-----RKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQ-PLDKTDAKN
3 ( 1576) KPKKQRQRRERRK-PGAQP-----RKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQ-PLDKTDAKN
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*******************************************
0 ( 1593) PAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADARPLCTTRDRRAYSAREQGQR
1 ( 1593) PAFSPF..........................................
2 ( 1629) KSFYP...........................................
3 ( 1629) KSFYP...........................................
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