# 0 Query: pF1KSDA0482, 1290 aa
# 1 CCDS11131.1 PER1 gene_id:5187|Hs108|chr17 (1290 aa)
# 2 CCDS2528.1 PER2 gene_id:8864|Hs108|chr2 (1255 aa)
# 3 CCDS89.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1201 aa)
# 4 CCDS76097.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1191 aa)
# 5 CCDS72695.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1210 aa)
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exp sw-scr id% from to
1 0 8794 99.9 1 1290
2 3.8e-43 3152 44.5 9 1245
3 2.5e-41 2241 38.2 43 1187
4 2e-40 2259 38.0 43 1177
5 2.7e-40 2248 38.2 43 1196
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0 ( 1) MSGPLEGADGGGDPRPGESFCPGGVPSPGPPQHRPC-PGPS---LADDTDANSNGSSGNE
1 ( 1) MSGPLEGADGGGDPRPGESFCPGGVPSPGPPQHRPC-PGPS---LADDTDANSNGSSGNE
2 ( 9) .........................PSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSS-GSSGHE
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 57) SNGHESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSPPSSSIAYSLLSASSEQ
1 ( 57) SNGHESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSPPSSSIAYSLLSASSEQ
2 ( 43) TNENCSTGRDSQGSDCDDS--GKELGMLVEPPDAR----QSPD------TFSLMMAKSEH
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 117) DNPSTSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQ
1 ( 117) DNPSTSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQ
2 ( 91) -NPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKVHLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVK
3 ( 43) .........SEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERRNK--PSTLDALNYALRCVHSVQ
4 ( 43) .........SEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERRNK--PSTLDALNYALRCVHSVQ
5 ( 43) .........SEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERRNK--PSTLDALNYALRCVHSVQ
//
0 ( 177) ANQEYYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISE
1 ( 177) ANQEYYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISE
2 ( 150) ANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMESVTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISD
3 ( 92) ANSEFFQILS-QNGAP-QADVSMYSLEELATIASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISE
4 ( 92) ANSEFFQILS-QNGAP-QADVSMYSLEELATIASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISE
5 ( 92) ANSEFFQILS-QNGAP-QADVSMYSLEELATIASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISE
//
0 ( 237) QAAVLLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKS
1 ( 237) QAAVLLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKS
2 ( 210) QVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFHSFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKS
3 ( 150) QAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQLPFWNNW-TQRAARYECAPVKP
4 ( 150) QAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQLPFWNNWTQRAAARYECAPVKP
5 ( 150) QAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQLPFWNNWTQRAAARYECAPVKP
//
0 ( 297) VFCRIRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAP---AQPCCLLIAERIHSGYEAPRI
1 ( 297) VFCRIRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAP---AQPCCLLIAERIHSGYEAPRI
2 ( 270) FFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRDQQGAE---SQLCCLLLAERVHSGYEAPRI
3 ( 209) FFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVH-HPAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRI
4 ( 210) FFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVH-HPAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRI
5 ( 210) FFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVH-HPAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRI
//
0 ( 354) PPDKRIFTTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPEDRPLMLAIHKKIL
1 ( 354) PPDKRIFTTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPEDRPLMLAIHKKIL
2 ( 327) PPEKRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQDLIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKIL
3 ( 268) PVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLPQDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVL
4 ( 269) PVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLPQDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVL
5 ( 269) PVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLPQDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVL
//
0 ( 414) QLAGQP-FDHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRKVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFT
1 ( 414) QLAGQP-FDHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRKVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFT
2 ( 387) QSGGQP-FDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINPWSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFA
3 ( 328) KYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFA
4 ( 329) KYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFA
5 ( 329) KYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFA
//
0 ( 473) PPAPSPAPSLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNG
1 ( 473) PPAPSPAPSLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNG
2 ( 446) AHPCTEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSSGYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNG
3 ( 388) TKIKKMNDN-DKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASG
4 ( 389) TKIKKMNDN-DKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASG
5 ( 389) TKIKKMNDN-DKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASG
//
0 ( 533) GDAEGPGPPAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRL-----PATGTFKAKA
1 ( 533) GDAEGPGPPAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRL-----PATGTFKAKA
2 ( 506) HE------DSRRRRAEICKNGNKTKNRSHYSHESGEQKKKSVTEM-----QTNPPAEKKA
3 ( 447) HRVE-ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKSSFKP-V-----TGTRTEPNGG
4 ( 448) HRVE-ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGESANG
5 ( 448) HRVE-ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGESANG
//
0 ( 588) L-PCQ---SPDPELEAGSAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNL
1 ( 588) L-PCQ---SPDPELEAGSAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNL
2 ( 555) V----------PAMEKDSLGVS-----FPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNE
3 ( 500) G-ECKTFTSFHQTLKNNSVYTE------PCEDLRNDEHSPSYQQINCIDSVIRYLKSYNI
4 ( 507) GGECKTFTSFHQTLKNNSVYTE------PCEDLRNDEHSPSYQQINCIDSVIRYLKSYNI
5 ( 507) GGECKTFTSFHQTLKNNSVYTE------PCEDLRNDEHSPSYQQINCIDSVIRYLKSYNI
//
0 ( 644) PSTTKRKCASSSSYTTSSASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEG--ATPRKE-PVVG
1 ( 644) PSTTKRKCASSSSYTTSSASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEG--ATPRKE-PVVG
2 ( 600) AATLKRKCEFPANVPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTG-----------VG
3 ( 553) PAL-KRKCISCTN-TTSSSSEEDKQ-------NHKADDVQALQAGLQIPAIPKSEMPTNG
4 ( 561) PAL-KRKCISCTN-TTSSSSEEDKQ-------NHKADDVQALQAGLQIPAIPKSEMPTNG
5 ( 561) PAL-KRKCISCTN-TTSSSSEEDKQ-------NHKADDVQALQAGLQIPAIPKSEMPTNG
//
0 ( 701) -----GTLSPLALANKAESVVSVTSQCSFSSTIVHVGDKKPPES--DIIMMEDLPGLAPG
1 ( 701) -----GTLSPLALANKAESVVSVTSQCSFSSTIVHVGDKKPPES--DIIMMEDLPGLAPG
2 ( 649) -----THLTSLALPGKAESVASLTSQCSYSSTIVHVGDKKP-QP--ELEMVEDA---ASG
3 ( 604) RSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHV---PPPETARDATLFCEPWTLNMQ
4 ( 612) RSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHV---PPPETARDATLFCEPWTLNMQ
5 ( 612) RSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHV---PPPETARDATLFCEPWTLNMQ
//
0 ( 754) PAP-----SPAPSPTVAPDPAPDAYRPVGLTKAVLSLHTQKEEQAFLSRFRD--------
1 ( 754) PAP-----SPAPSPTVAPDPAPDAYRPVGLTKAVLSLHTQKEEQAFLSRFRD--------
2 ( 698) PESLDCLAGPALACGLSQEKEP--FKKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKE--------
3 ( 661) PAP-----LTS-----------EEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQNYVDKFREKILSSPYS
4 ( 669) PAP-----LTS-----------EEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQNYVDKFREKILSSPYS
5 ( 669) PAP-----LTS-----------EEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQNYVDKFREKILSSPYS
//
0 ( 801) ------------LGRL---------------RGLDSSSTAPSALGERGCHHG---PAPPS
1 ( 801) ------------LGRL---------------RGLDSSSTAPSALGERGCHHG---PAPPS
2 ( 748) ------------IRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPGLRNTSGIDSP---WKKTG
3 ( 705) SYLQQESRSKAKYSYF---------------QGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPPD
4 ( 713) SYLQQESRSKAKYSYF---------------QGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPPD
5 ( 713) SYLQQESRSKAKYSYF---------------QGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPPD
//
0 ( 831) RRHHCRSKAKRSRHHQN------PRAEAPCYVSHP---SPV--PPSTPWPT--P---PAT
1 ( 831) RRHHCRSKAKRSRHHQN------PRAEAPCYVSHP---SPV--PPSTPWPT--P---PAT
2 ( 793) KNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLN---ATAWSPSDTSQSS--C---PAV
3 ( 750) SSSSNTGSGPRRGAHQN------AQPCCPSAASSPHTSSPTF-PPAAMVPSQAPYLVPAF
4 ( 758) SSSSNTGSGPRRGAHQN------AQPCCPSAASSPHTSSPTF-PPAAMVPSQAPYLVPAF
5 ( 758) SSSSNTGSGPRRGAHQN------AQPCCPSAASSPHTSSPTF-PPAAMVPSQAPYLVPAF
//
0 ( 875) TPFPAVVQP---YPLPVFSPRGGPQPLPPAPT----SVP-------------PAAFPAPL
1 ( 875) TPFPAVVQP---YPLPVFSPRGGPQPLPPAPT----SVP-------------PAAFPAPL
2 ( 845) -PFPAPVPAA--YSLPVF-PAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQHQFAVQPPPFPAPL
3 ( 803) -PLPAATSPGREYAAPGTAPEGL-HGLPLSEG----LQP-------------YPAFPFPY
4 ( 811) -PLPAATSPGREYAAPGTAPEGL-HGLPLSEG----LQP-------------YPAFPFPY
5 ( 811) -PLPAATSPGREYAAPGTAPEGL-HGLPLSEG----LQP-------------YPAFPFPY
//
0 ( 915) VTPMVALVLPNY-LFP--TPS-SYPYGALQTPAEGPPTP------A-SHS----PS----
1 ( 915) VTPMVALVLPNY-LFP--TPS-SYPYGALQTPAEGPPTP------A-SHS----PS----
2 ( 901) A-PVMAFMLPSY-SFP--SGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMA-SASQPEFPSRTSI
3 ( 844) LDTFMTVFLPDPPVCPLLSPS-FLPCPFLGATASSAISP------SMSSA----MS----
4 ( 852) LDTFMTVFLPDPPVCPLLSPS-FLPCPFLGATASSAISP------SMSSA----MS----
5 ( 852) LDTFMTVFLPDPPVCPLLSPS-FLPCPFLGATASSAISP------SMSSA----MS----
//
*
0 ( 956) PSLP-------ALPPSPPHRPDS----------PLFNSRCSSPLQLNLLQLEELPR----
1 ( 956) PSLP-------ALAPSPPHRPDS----------PLFNSRCSSPLQLNLLQLEELPR----
2 ( 956) PRQPCACPATRATPPSAMGRASP----------PLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPE----
3 ( 889) PTLD-------PPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQLNLLQ-EEMPR----
4 ( 897) PTLD-------PPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQLNLLQ-EEMPR----
5 ( 897) PTLD-------PPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQLNLLQ-EEMPRPSES
//
0 ( 995) -----------AEGAA--------------VAGGPGSS------AGPPPPSAEAAEPEAR
1 ( 995) -----------AEGAA--------------VAGGPGSS------AGPPPPSAEAAEPEAR
2 ( 1002) -----------G-GTG--------------AMGTTGATETAAVGADCKPGTSRDQQPKAP
3 ( 937) -----------PSESPDQMRRNTCPQTEYCVTGNNGSE------SSPATTGALSTGSPPR
4 ( 945) -----------PSESPDQMRRNTCPQTEYCVTGNNGSE------SSPATTGALSTGSPPR
5 ( 949) PDQMRRNTCPQTEYQC--------------VTGNNGSE------SSPATTGALSTGSPPR
//
0 ( 1024) LA--EVTESSNQDALS-GSSDLLELLLQEDSRSGTGSAA----SGSLGSGLGSG---SGS
1 ( 1024) LA--EVTESSNQDALS-GSSDLLELLLQEDSRSGTGSAA----SGSLGSGLGSG---SGS
2 ( 1036) LTRDEPSDTQNSDALS-TSSGLLNLLLNEDLCSASGSAA----SESLGSGSLGC---DAS
3 ( 980) ----ENPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRT
4 ( 988) ----ENPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASTLSMGLPP----SRTPSHPTATV---LST
5 ( 989) ----ENPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRT
//
0 ( 1074) GSHE-------GGSTSASITRS----SQSSHTSKYF-GSIDSSEAEAGAARG-GAEPGDQ
1 ( 1074) GSHE-------GGSTSASITRS----SQSSHTSKYF-GSIDSSEAEAGAARG-GAEPGDQ
2 ( 1088) PSGA-------G---------S----SDTSHTSKYF-GSIDSSENNHKAKMNTGMEESEH
3 ( 1036) PSHPTATVLSTGSPPSESPSRTGSAASGSSDSSIYLTSSVYSSKISQNGQQS-QDVQKKE
4 ( 1037) GSPP-------SESPSRTGSAA----SGSSDSSIYLTSSVYSSKISQNGQQS-QDVQKKE
5 ( 1045) PSHPTATVLSTGSPPSESPSRTGSAASGSSDSSIYLTSSVYSSKISQNGQQS-QDVQKKE
//
0 ( 1121) VIKYVLQDPIWLLMANADQRVMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRE
1 ( 1121) VIKYVLQDPIWLLMANADQRVMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRE
2 ( 1127) FIKCVLQDPIWLLMADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQE
3 ( 1095) TFPNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLKEDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEE
4 ( 1085) TFPNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLKEDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEE
5 ( 1104) TFPNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLKEDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEE
//
0 ( 1181) LGAVHSWVRKGQLPRALDVMACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGL-EPMEEGGGEQG
1 ( 1181) LGAVHSWVRKGQLPRALDVMACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGL-EPMEEGGGEQG
2 ( 1187) LREVHQWMQTGGLPAAIDVAECVYC--ENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENG
3 ( 1155) LAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCENEDSADG...........................
4 ( 1145) LAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCENEDSADG...........................
5 ( 1164) LAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCENEDSADG...........................
//
0 ( 1240) SSGGGSGEGEGCEEAQGGAKASSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS
1 ( 1240) SSGGGSGEGEGCEEAQGGAKASSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS
2 ( 1245) S..................................................
3 ( -) ...................................................
4 ( -) ...................................................
5 ( -) ...................................................
//
