# 0 Query: pF1KE9647, 1467 aa
# 1 CCDS33765.2 RAD54L2 gene_id:23132|Hs108|chr3 (1467 aa)
# 2 CCDS14435.1 ATRX gene_id:546|Hs108|chrX (2454 aa)
# 3 CCDS14434.1 ATRX gene_id:546|Hs108|chrX (2492 aa)
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exp sw-scr id% from to
1 0 9838 100.0 1 1467
2 5.2e-18 1713 33.2 1248 2311
3 5.3e-18 1713 33.2 1286 2349
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0 ( 1) MSDESASGSD-PDLDPDVELEDAEEEEEEEEVAVE---ECDRDDEEDLLDDPSLEGMCGT
1 ( 1) MSDESASGSD-PDLDPDVELEDAEEEEEEEEVAVE---ECDRDDEEDLLDDPSLEGMCGT
2 ( 1248) .SDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKNQVNSESDSDSEES--KKPRYRHRL-L
3 ( 1286) .SDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKNQVNSESDSDSEES--KKPRYRHRL-L
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0 ( 57) EHAQLGEDGQQPPRCTSTTSSQSEPSEQLRRHQGKN---LASEDPKKKRAQKPSHMRRNI
1 ( 57) EHAQLGEDGQQPPRCTSTTSSQSEPSEQLRRHQGKN---LASEDPKKKRAQKPSHMRRNI
2 ( 1304) RHKLTVSDGE------SGEEKKTKPKEH-KEVKGRNRRKVSSEDSEDSDFQE-SGVSEEV
3 ( 1342) RHKLTVSDGE------SGEEKKTKPKEH-KEVKGRNRRKVSSEDSEDSDFQE-SGVSEEV
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0 ( 114) RKLLREDQLEPVTKAAQQEELERRKRLEQQRKDY-----AAPIPTVPLEFLPEEIALRAS
1 ( 114) RKLLREDQLEPVTKAAQQEELERRKRLEQQRKDY-----AAPIPTVPLEFLPEEIALRAS
2 ( 1356) SE--SEDEQRPRTRSAKKAELEENQRSYKQKKKRRRIKVQEDSSSENKSNSEEEEEEKEE
3 ( 1394) SE--SEDEQRPRTRSAKKAELEENQRSYKQKKKRRRIKVQEDSSSENKSNSEEEEEEKEE
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0 ( 169) DGPQLPPRVLAQEVICLDSSSGSEDEKSSRDEVIELSSGEEDTLHIVDSSESVSEDDEEE
1 ( 169) DGPQLPPRVLAQEVICLDSSSGSEDEKSSRDEVIELSSGEEDTLHIVDSSESVSEDDEEE
2 ( 1414) EEEEEEEEEEEEEDENDDSKSPGKGRKKIR-KILKDDKLRTETQNALKEEEERRKRIAER
3 ( 1452) EEEEEEEEEEEEEDENDDSKSPGKGRKKIR-KILKDDKLRTETQNALKEEEERRKRIAER
//
0 ( 229) EKGGTHVNDVLNQRDA-------LGRVLVNLNHPPEEENVFLAPQLARAVKPHQIGGIRF
1 ( 229) EKGGTHVNDVLNQRDA-------LGRVLVNLNHPPEEENVFLAPQLARAVKPHQIGGIRF
2 ( 1473) EREREKLREVIEIEDASPTKCPITTKLVLDEDEETKEPLVQVHRNMVIKLKPHQVDGVQF
3 ( 1511) EREREKLREVIEIEDASPTKCPITTKLVLDEDEETKEPLVQVHRNMVIKLKPHQVDGVQF
//
0 ( 282) LYDNLVESLERFKTSSGFGCILAHSMGLGKTLQVISFID--VLFRHTPAKTVLAIVPVNT
1 ( 282) LYDNLVESLERFKTSSGFGCILAHSMGLGKTLQVISFID--VLFRHTPAKTVLAIVPVNT
2 ( 1533) MWDCCCESVKKTKKSPGSGCILAHCMGLGKTLQVVSFLHTVLLCDKLDFSTALVVCPLNT
3 ( 1571) MWDCCCESVKKTKKSPGSGCILAHCMGLGKTLQVVSFLHTVLLCDKLDFSTALVVCPLNT
//
0 ( 340) LQNWLAEFNMWLPPPEALPADNKPEEVQPRFFKVHILNDEHKTMASRAKVMADWVSEGGV
1 ( 340) LQNWLAEFNMWLPPPEALPADNKPEEVQPRFFKVHILNDEHKTMASRAKVMADWVSEGGV
2 ( 1593) ALNWMNEFEKW---QEGLKDDEK--------LEVSELATVKRPQE-RSYMLQRWQEDGGV
3 ( 1631) ALNWMNEFEKW---QEGLKDDEK--------LEVSELATVKRPQE-RSYMLQRWQEDGGV
//
0 ( 400) LLMGYEMYRLLTLKKSFATGRPKKTKKRSHPVIIDLDEEDRQQEFRREFEKALCRPGPDV
1 ( 400) LLMGYEMYRLLTLKKSFATGRPKKTKKRSHPVIIDLDEEDRQQEFRREFEKALCRPGPDV
2 ( 1641) MIIGYEMYR------NLAQGRNVKSRK-----------------LKEIFNKALVDPGPDF
3 ( 1679) MIIGYEMYR------NLAQGRNVKSRK-----------------LKEIFNKALVDPGPDF
//
0 ( 460) VICDEGHRIKNCQASTSQALKNIRSRRRVVLTGYPLQNNLIEYWCMVDFVRPDFLGTRQE
1 ( 460) VICDEGHRIKNCQASTSQALKNIRSRRRVVLTGYPLQNNLIEYWCMVDFVRPDFLGTRQE
2 ( 1678) VVCDEGHILKNEASAVSKAMNSIRSRRRIILTGTPLQNNLIEYHCMVNFIKENLLGSIKE
3 ( 1716) VVCDEGHILKNEASAVSKAMNSIRSRRRIILTGTPLQNNLIEYHCMVNFIKENLLGSIKE
//
0 ( 520) FSNMFERPILNGQCIDSTPQDVRLMRYRSHVLHSLLEGFVQRRGHTVLKIHLPAKEENVI
1 ( 520) FSNMFERPILNGQCIDSTPQDVRLMRYRSHVLHSLLEGFVQRRGHTVLKIHLPAKEENVI
2 ( 1738) FRNRFINPIQNGQCADSTMVDVRVMKKRAHILYEMLAGCVQRKDYTALTKFLPPKHEYVL
3 ( 1776) FRNRFINPIQNGQCADSTMVDVRVMKKRAHILYEMLAGCVQRKDYTALTKFLPPKHEYVL
//
0 ( 580) LVRLSKIQRDLYTQFMDRFRDCGSS-----GWLGLNPLKAFCVCCKIWNHPDVLY-EALQ
1 ( 580) LVRLSKIQRDLYTQFMDRFRDCGSS-----GWLGLNPLKAFCVCCKIWNHPDVLY-EALQ
2 ( 1798) AVRMTSIQCKLYQYYLDHLTGVGNNSEGGRGKAGAKLFQDFQMLSRIWTHPWCLQLDYIS
3 ( 1836) AVRMTSIQCKLYQYYLDHLTGVGNNSEGGRGKAGAKLFQDFQMLSRIWTHPWCLQLDYIS
//
0 ( 634) KES------------LANEQDLDVEELGSAGTSARCPPQGTKGKGEDSTLASSMGEAT--
1 ( 634) KES------------LANEQDLDVEELGSAGTSARCPPQGTKGKGEDSTLASSMGEAT--
2 ( 1858) KENKGYFDEDSMDEFIASDSDETSMSLSSDDYTKK-KKKGKKGKKDSSSSGSGSDNDVEV
3 ( 1896) KENKGYFDEDSMDEFIASDSDETSMSLSSDDYTKK-KKKGKKGKKDSSSSGSGSDNDVEV
//
0 ( 680) ----NSKFLQGVGFNPFQERGNNIVTY-------------------EWAKDLLTNYQTGV
1 ( 680) ----NSKFLQGVGFNPFQERGNNIVTY-------------------EWAKDLLTNYQTGV
2 ( 1917) IKVWNSRS-RGGGEGNVDETGNNPSVSLKLEESKATSSSNPSSPAPDWYKDFVTDADAEV
3 ( 1955) IKVWNSRS-RGGGEGNVDETGNNPSVSLKLEESKATSSSNPSSPAPDWYKDFVTDADAEV
//
0 ( 717) LENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFSQSLSTLALIEEFL--GKREVPC----PPGTEG
1 ( 717) LENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFSQSLSTLALIEEFL--GKREVPC----PPGTEG
2 ( 1976) LEHSGKMVLLFEILRMAEEIGDKVLVFSQSLISLDLIEDFLELASREKTEDKDKPLIYKG
3 ( 2014) LEHSGKMVLLFEILRMAEEIGDKVLVFSQSLISLDLIEDFLELASREKTEDKDKPLIYKG
//
0 ( 771) QGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFNDPSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANR
1 ( 771) QGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFNDPSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANR
2 ( 2036) EG--KWLRNIDYYRLDGSTTAQSRKKWAEEFNDETNVRGRLFIISTKAGSLGINLVAANR
3 ( 2074) EG--KWLRNIDYYRLDGSTTAQSRKKWAEEFNDETNVRGRLFIISTKAGSLGINLVAANR
//
0 ( 831) VVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYRLVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVD
1 ( 831) VVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYRLVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVD
2 ( 2094) VIIFDASWNPSYDIQSIFRVYRFGQTKPVYVYRFLAQGTMEDKIYDRQVTKQSLSFRVVD
3 ( 2132) VIIFDASWNPSYDIQSIFRVYRFGQTKPVYVYRFLAQGTMEDKIYDRQVTKQSLSFRVVD
//
0 ( 891) DLNPMLNFTRKEVENLLHF---VEKEPAPQVSLNVKGI---KESVL-QLACLKYPHLITK
1 ( 891) DLNPMLNFTRKEVENLLHF---VEKEPAPQVSLNVKGI---KESVL-QLACLKYPHLITK
2 ( 2154) QQQVERHFTMNELTELYTFEPDLLDDPNSEKKKKRDTPMLPKDTILAELLQIHKEHIVGY
3 ( 2192) QQQVERHFTMNELTELYTFEPDLLDDPNSEKKKKRDTPMLPKDTILAELLQIHKEHIVGY
//
0 ( 944) EPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEEDKR-TSVPYTRPSYAQYYPASDQSLTS-I
1 ( 944) EPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEEDKR-TSVPYTRPSYAQYYPASDQSLTS-I
2 ( 2214) H--EHDSLLDHKEEEELTEEERKAAWAEYEAEKKGLTMRFNIPTGTNLPPVSFNSQTPYI
3 ( 2252) H--EHDSLLDHKEEEELTEEERKAAWAEYEAEKKGLTMRFNIPTGTNLPPVSFNSQTPYI
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0 ( 1002) P-------AFSQRNWQPTL-KGDEKPVASVRPVQSTPIPMMPRHVPLGGSVSSASSTNPS
1 ( 1002) P-------AFSQRNWQPTL-KGDEKPVASVRPVQSTPIPMMPRHVPLGGSVSSASSTNPS
2 ( 2272) PFNLGALSAMSNQQLEDLINQGREKVVEATNSV--TAVRIQP..................
3 ( 2310) PFNLGALSAMSNQQLEDLINQGREKVVEATNSV--TAVRIQP..................
//
0 ( 1054) MNFPINYLQRAGVLVQKVVTTTDIVIPGLNSSTDVQARINAGESIHIIRGTKGTYIRTSD
1 ( 1054) MNFPINYLQRAGVLVQKVVTTTDIVIPGLNSSTDVQARINAGESIHIIRGTKGTYIRTSD
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
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0 ( 1114) GRIFAVRATGKPKVPEDGRMAASGSQGPSCESTSNGRHSASSPKAPDPEGLARPVSPDSP
1 ( 1114) GRIFAVRATGKPKVPEDGRMAASGSQGPSCESTSNGRHSASSPKAPDPEGLARPVSPDSP
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 1174) EIISELQQYADVAAARESRQSSPSTNAALPGPPAQLMDSSAVPGTALGTEPRLGGHCLNS
1 ( 1174) EIISELQQYADVAAARESRQSSPSTNAALPGPPAQLMDSSAVPGTALGTEPRLGGHCLNS
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
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0 ( 1234) SLLVTGQPCGDRHPVLDLRGHKRKLATPPAAQESSRRRSRKGHLPAPVQPYEHGYPVSGG
1 ( 1234) SLLVTGQPCGDRHPVLDLRGHKRKLATPPAAQESSRRRSRKGHLPAPVQPYEHGYPVSGG
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 1294) FAMPPVSLNHNLTTPFTSQAGENSLFMGSTPSYYQLSNLLADARLVFPVTTDPLVPAGPV
1 ( 1294) FAMPPVSLNHNLTTPFTSQAGENSLFMGSTPSYYQLSNLLADARLVFPVTTDPLVPAGPV
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
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0 ( 1354) SSSSTATSVTASNPSFMLNPSVPGILPSYSLPFSQPLLSEPRMFAPFPSPVLPSNLSRGM
1 ( 1354) SSSSTATSVTASNPSFMLNPSVPGILPSYSLPFSQPLLSEPRMFAPFPSPVLPSNLSRGM
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
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0 ( 1414) SIYPGYMSPHAGYPAGGLLRSQVPPFDSHEVAEVGFSSNDDEDKDDDVIEVTGK
1 ( 1414) SIYPGYMSPHAGYPAGGLLRSQVPPFDSHEVAEVGFSSNDDEDKDDDVIEVTGK
2 ( -) ......................................................
3 ( -) ......................................................
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