# 0 Query: pF1KE9394, 1163 aa
# 1 CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163 aa)
# 2 CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218 aa)
# 3 CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210 aa)
# 4 CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226 aa)
# 5 CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 3.1e-209 7646 100.0 1 1163
2 5.7e-39 2437 39.7 25 1216
3 6.5e-39 2435 39.8 18 1208
4 1.6e-26 2213 37.5 31 1225
5 1.6e-26 2213 37.5 56 1250
//
0 ( 1) MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYD
1 ( 1) MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYD
2 ( 25) ...........REKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDELSSRIQNMLGNYE
3 ( 18) ...........REKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDELSSRIQNMLGNYE
4 ( 31) ............ERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-TNKGDELSNRIQNTLGNYD
5 ( 56) ............ERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-TNKGDELSNRIQNTLGNYD
//
0 ( 61) EMKDFIGDRS-IPK-LVA----IPKPTVPPSADEKSN-PNFFEQRHGGSHQSSKWTPV-G
1 ( 61) EMKDFIGDRS-IPK-LVA----IPKPTVPPSADEKSN-PNFFEQRHGGSHQSSKWTPV-G
2 ( 73) EVKEFLSTKSHTHR-LDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPS--SSFHTSVHHQSIHTPASG
3 ( 66) EVKEFLSTKSHTHR-LDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPS--SSFHTSVHHQSIHTPASG
4 ( 78) EMKDFLTDRS-NQSHLVG----VPKPGVPQTPVNKID-EHFV------------------
5 ( 103) EMKDFLTDRS-NQSHLVG----VPKPGVPQTPVNKID-EHFV------------------
//
0 ( 113) P------APSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRESYNNSGSSSRKK
1 ( 113) P------APSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRESYNNSGSSSRKK
2 ( 130) PLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLH------AKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKK
3 ( 123) PLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLH------AKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKK
4 ( 114) -------ADSRAQNQPSSI----------CSTTTSTPAAVPVQQSKR------GTMGWQK
5 ( 139) -------ADSRAQNQPSSI----------CSTTTSTPAAVPVQQSKR------GTMGWQK
//
0 ( 167) GQH--GSEHSKSRS-SSPGK--------PQAVSSLNSSHS------------RSHGNDHH
1 ( 167) GQH--GSEHSKSRS-SSPGK--------PQAVSSLNSSHS------------RSHGNDHH
2 ( 184) GDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNN
3 ( 177) GDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNN
4 ( 151) AGH--PPSDGQQRA-TQQG--------------SL-----------------RTLLGDGV
5 ( 176) AGH--PPSDGQQRA-TQQG--------------SL-----------------RTLLGDGV
//
0 ( 204) SKEHQRSKSPRDPDA---NWDSPSRVP-----FSSGQHSTQSFPP-SLMSKSNSMLQKPT
1 ( 204) SKEHQRSKSPRDPDA---NWDSPSRVP-----FSSGQHSTQSFPP-SLMSKSNSMLQKPT
2 ( 244) SKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSL-----VAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPT
3 ( 237) SKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSL-----VAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPT
4 ( 177) GRQQPRAKQVCNVEV---GLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPP-SLASKPSLVQQKPT
5 ( 202) GRQQPRAKQVCNVEV---GLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPP-SLASKPSLVQQKPT
//
0 ( 255) AYVRPMDGQE---SME---PKLSS--EHYSS----QSHGNSMTELKPS-SKAHLTKLKIP
1 ( 255) AYVRPMDGQE---SME---PKLSS--EHYSS----QSHGNSMTELKPS-SKAHLTKLKIP
2 ( 299) AYVRPMDGQDQAPSES---PELKPLPEDYRQ----QTFEK--TDLKVP-AKAKLTKLKMP
3 ( 292) AYVRPMDGQDQAPSES---PELKPLPEDYRQ----QTFEK--TDLKVP-AKAKLTKLKMP
4 ( 233) AYVRPMDGQD---QAPDESPKLKS--SSETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIP
5 ( 258) AYVRPMDGQD---QAPDESPKLKS--SSETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIP
//
0 ( 302) SQPLDASASGDV-SCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTG
1 ( 302) SQPLDASASGDV-SCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTG
2 ( 349) SQSVEQTYSNEV-HCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQ
3 ( 342) SQSVEQTYSNEV-HCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQ
4 ( 288) KQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHN
5 ( 313) KQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHN
//
0 ( 361) EQKRYN--PS-KT-SNGHQ-SKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGS------
1 ( 361) EQKRYN--PS-KT-SNGHQ-SKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGS------
2 ( 408) NQKQYD--TSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQT-----PEKPPSS------
3 ( 401) NQKQYD--TSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQT-----PEKPPSS------
4 ( 345) NPKKGDAEPE-SP-DNGTS-NTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQP
5 ( 370) NPKKGDAEPE-SP-DNGTS-NTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQP
//
0 ( 410) NSEPSHHNS--EGADNSRDD--SS-SHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEP
1 ( 410) NSEPSHHNS--EGADNSRDD--SS-SHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEP
2 ( 455) SAPPSAPQSLPEPVASAHSS--SAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEP
3 ( 448) SAPPSAPQSLPEPVASAHSS--SAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEP
4 ( 402) NCRTSVPSS--KGSSSSSSSGSSS-SSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEA
5 ( 427) NCRTSVPSS--KGSSSSSSSGSSS-SSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEA
//
0 ( 465) EPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSPASSVDSNIPSSQGYKKEGRE--QGTGNSYTDTSGP-
1 ( 465) EPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSPASSVDSNIPSSQGYKKEGRE--QGTGNSYTDTSGP-
2 ( 513) EPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSD--SATSQEHSESKDP-
3 ( 506) EPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSD--SATSQEHSESKDP-
4 ( 459) EPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGK-VPDVCQPS
5 ( 484) EPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGK-VPDVCQPS
//
0 ( 522) ---K-ETSSATPGRDSKTIQKGSESGRG-RQKSP---------------------AQSDS
1 ( 522) ---K-ETSSATPGRDSKTIQKGSESGRG-RQKSP---------------------AQSDS
2 ( 570) ---PPKSSSKAPRAPPEAPHPGK---RS-CQKSP---------------------AQQEP
3 ( 563) ---PPKSSSKAPRAPPEAPHPGK---RS-CQKSP---------------------AQQEP
4 ( 518) LREK-EIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAP
5 ( 543) LREK-EIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAP
//
0 ( 556) TTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEE-PRGGLKIESET---PVD-LASSM--PSSRHKAATKGS
1 ( 556) TTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEE-PRGGLKIESET---PVD-LASSM--PSSRHKAATKGS
2 ( 602) P-QRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYG-SRDQT--SKDKPKVKTKGR
3 ( 595) P-QRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYG-SRDQT--SKDKPKVKTKGR
4 ( 577) APARRSAGKKPTRRTERTSAGD-GANCHRPEEPA---AADALGTSVVVPPEPTKTRPCGN
5 ( 602) APARRSAGKKPTRRTERTSAGD-GANCHRPEEPA---AADALGTSVVVPPEPTKTRPCGN
//
0 ( 609) RKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIET--DTSSS----DSD---ESESL
1 ( 609) RKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIET--DTSSS----DSD---ESESL
2 ( 658) PRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVED----RTP---EHFAL
3 ( 651) PRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVED----RTP---EHFAL
4 ( 633) NRASHRKELRSSV--TCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIET--ESSSSSSSSDSDLESEQEEY
5 ( 658) NRASHRKELRSSV--TCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIET--ESSSSSSSSDSDLESEQEEY
//
0 ( 660) PPSS-------------QTPKYPES---N-----RTP-V------KPSSV--EEEDSFFR
1 ( 660) PPSS-------------QTPKYPES---N-----RTP-V------KPSSV--EEEDSFFR
2 ( 711) VPLT-------------ESQGPPHSGSGS-----RTSGC------RQAVV--VQEDSR-K
3 ( 704) VPLT-------------ESQGPPHSGSGS-----RTSGC------RQAVV--VQEDSR-K
4 ( 689) PLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAA---NGGSGPRAP-VGSINARTTSDIAKELEEQFYT
5 ( 714) PLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAA---NGGSGPRAP-VGSINARTTSDIAKELEEQFYT
//
0 ( 690) QRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIP----GKPYKETEPPKGEKKNVP
1 ( 690) QRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIP----GKPYKETEPPKGEKKNVP
2 ( 744) DRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIP----QPPGKGSRQRKAEDKQPP
3 ( 737) DRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIP----QPPGKGSRQRKAEDKQPP
4 ( 745) ---LVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAP
5 ( 770) ---LVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAP
//
0 ( 746) EKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHK--NEDDNRASESKKPKTE-D--KNSAGHKPSSNRES
1 ( 746) EKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHK--NEDDNRASESKKPKTE-D--KNSAGHKPSSNRES
2 ( 800) AGKKHSSEKRSSDS-SSKLAKKRK--GEAE-RDCDNKKIRLE-KEIKSQSSSSSSSHKES
3 ( 793) AGKKHSSEKRSSDS-SSKLAKKRK--GEAE-RDCDNKKIRLE-KEIKSQSSSSSSSHKES
4 ( 802) PSHTSDTP---AEKALPKSKRKRKCDNEDDYR--EIKKSQGEKD--SSSRLATSTSNTLS
5 ( 827) PSHTSDTP---AEKALPKSKRKRKCDNEDDYR--EIKKSQGEKD--SSSRLATSTSNTLS
//
0 ( 801) SK------Q------SAA----KEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEHGSRKRTISQSSSLKSS
1 ( 801) SK------Q------SAA----KEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEHGSRKRTISQSSSLKSS
2 ( 855) SKTKPSRPS------SQS----SKKEMLPPP--PVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQD
3 ( 848) SKTKPSRPS------SQS----SKKEMLPPP--PVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQD
4 ( 855) AN------HCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPL---SDASKHKYTSEDLTSSS--RPN
5 ( 880) AN------HCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPL---SDASKHKYTSEDLTSSS--RPN
//
0 ( 845) SNSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAP--SSSSNCP-PSAPTLDSSKP
1 ( 845) SNSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAP--SSSSNCP-PSAPTLDSSKP
2 ( 903) PPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSG--DTANPFPVPSLPN-GNSKP
3 ( 896) PPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSG--DTANPFPVPSLPN-GNSKP
4 ( 904) GNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTK-PWSPGSNGHRD
5 ( 929) GNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTK-PWSPGSNGHRD
//
0 ( 902) -RRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNA
1 ( 902) -RRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNA
2 ( 960) -GKPQVKFDKQQ--ADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESES
3 ( 953) -GKPQVKFDKQQ--ADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESES
4 ( 963) CKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGP
5 ( 988) CKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGP
//
0 ( 961) QESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYLRLFKLKKEN
1 ( 961) QESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYLRLFKLKKEN
2 ( 1017) QSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDI
3 ( 1010) QSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDI
4 ( 1023) MESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDH
5 ( 1048) MESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDH
//
0 ( 1021) ALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSP-GLGSKAVGMPSPVSPKLSPGNSGNYSSGASSASAS
1 ( 1021) ALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSP-GLGSKAVGMPSPVSPKLSPGNSGNYSSGASSASAS
2 ( 1077) AIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSP-CI-ARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSS
3 ( 1070) AIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSP-CIAS--TGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSS
4 ( 1083) AVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASAL
5 ( 1108) AVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASAL
//
0 ( 1080) GSS--VTI--PQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKVMGPLI
1 ( 1080) GSS--VTI--PQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKVMGPLI
2 ( 1135) GVA--ATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLA
3 ( 1127) GVA--ATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLA
4 ( 1143) SPSTIVSI--PQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVT
5 ( 1168) SPSTIVSI--PQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVT
//
0 ( 1136) FNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
1 ( 1136) FNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
2 ( 1193) LNSS-LVDLVHYTRQGFQQLQELTK...
3 ( 1185) LNSS-LVDLVHYTRQGFQQLQELTK...
4 ( 1201) LHSS-MEHLVQYSQQGLHWLRNSAHL..
5 ( 1226) LHSS-MEHLVQYSQQGLHWLRNSAHL..
//
