Multiple alignment for pF1KE4288
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE4288, 1683 aa
#  1    CCDS43513.2 SHPRH gene_id:257218|Hs108|chr6    (1683 aa)
#  2    CCDS47496.1 SHPRH gene_id:257218|Hs108|chr6    (1659 aa)
#  3    CCDS892.1 TTF2 gene_id:8458|Hs108|chr1    (1162 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0          11280  100.0         1    1683
   2    0          11006   99.2         1    1656
   3    1.1e-11      400   26.2       640    1048

//
                                                                             
   0  (    1)    MSSRRKRAPPVRVDEEKRQQLHWNMHEDRRNEPIIISDDDEQPCPGSDTSSAHYIILSDS
   1  (    1)    MSSRRKRAPPVRVDEEKRQQLHWNMHEDRRNEPIIISDDDEQPCPGSDTSSAHYIILSDS
   2  (    1)    MSSRRKRAPPVRVDEEKRQQLHWNMHEDRRNEPIIISDDDEQPCPGSDTSSAHYIILSDS
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   61)    LKEEVAHRDKKRCSKVVSFSKPIEKEETVGIFSPLSVKLNIVISPYHFDNSWKAFLGELT
   1  (   61)    LKEEVAHRDKKRCSKVVSFSKPIEKEETVGIFSPLSVKLNIVISPYHFDNSWKAFLGELT
   2  (   61)    LKEEVAHRDKKRCSKVVSFSKPIEKEETVGIFSPLSVKLNIVISPYHFDNSWKAFLGELT
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  121)    LQLLPAQSLIENFSERSITLMSSESSNQFLIYVHSKGEDVEKQKKEPMSICDKGILVESS
   1  (  121)    LQLLPAQSLIENFSERSITLMSSESSNQFLIYVHSKGEDVEKQKKEPMSICDKGILVESS
   2  (  121)    LQLLPAQSLIENFSERSITLMSSESSNQFLIYVHSKGEDVEKQKKEPMSICDKGILVESS
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  181)    FSGEMLEDLGWLQKKRRIKLYQKPEGNHIIKVGIYLLEAGLAKLDFLSDANSRMKKFNQL
   1  (  181)    FSGEMLEDLGWLQKKRRIKLYQKPEGNHIIKVGIYLLEAGLAKLDFLSDANSRMKKFNQL
   2  (  181)    FSGEMLEDLGWLQKKRRIKLYQKPEGNHIIKVGIYLLEAGLAKLDFLSDANSRMKKFNQL
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  241)    MKKVMEKLHNSIIPDVLEEDEDDPESEPEGQDIDELYHFVKQTHQQETQSIQVDVQHPAL
   1  (  241)    MKKVMEKLHNSIIPDVLEEDEDDPESEPEGQDIDELYHFVKQTHQQETQSIQVDVQHPAL
   2  (  241)    MKKVMEKLHNSIIPDVLEEDEDDPESEPEGQDIDELYHFVKQTHQQETQSIQVDVQHPAL
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  301)    IPVLRPYQREAVNWMLQQECFRSSPATESALHFLWREIVTSEGLKLYYNPYTGCIIREYP
   1  (  301)    IPVLRPYQREAVNWMLQQECFRSSPATESALHFLWREIVTSEGLKLYYNPYTGCIIREYP
   2  (  301)    IPVLRPYQREAVNWMLQQECFRSSPATESALHFLWREIVTSEGLKLYYNPYTGCIIREYP
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  361)    NSGPQLLGGILADEMGLGKTVEVLALILTHTRQDVKQDALTLPEGKVVNYFIPSHYFGGK
   1  (  361)    NSGPQLLGGILADEMGLGKTVEVLALILTHTRQDVKQDALTLPEGKVVNYFIPSHYFGGK
   2  (  361)    NSGPQLLGGILADEMGLGKTVEVLALILTHTRQDVKQDALTLPEGKVVNYFIPSHYFGGK
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  421)    LKKTEIQNIEFEPKEKVQCPPTRVMILTAVKEMNGKKGVSILSIYKYVSSIYRYDVQRNR
   1  (  421)    LKKTEIQNIEFEPKEKVQCPPTRVMILTAVKEMNGKKGVSILSIYKYVSSIYRYDVQRNR
   2  (  421)    LKKTEIQNIEFEPKEKVQCPPTRVMILTAVKEMNGKKGVSILSIYKYVSSIYRYDVQRNR
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  481)    SLLKRMLKCLIFEGLVKQIKGHGFSGTFTLGKNYKEEDICDKTKKQAVGSPRKIQKETRK
   1  (  481)    SLLKRMLKCLIFEGLVKQIKGHGFSGTFTLGKNYKEEDICDKTKKQAVGSPRKIQKETRK
   2  (  481)    SLLKRMLKCLIFEGLVKQIKGHGFSGTFTLGKNYKEEDICDKTKKQAVGSPRKIQKETRK
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  541)    SGNKDTDSEYLPSDTSDDDDDPYYYYYKSRRNRSKLRKKLVPSTKKGKSQPFINPDSQGH
   1  (  541)    SGNKDTDSEYLPSDTSDDDDDPYYYYYKSRRNRSKLRKKLVPSTKKGKSQPFINPDSQGH
   2  (  541)    SGNKDTDSEYLPSDTSDDDDDPYYYYYKSRRNRSKLRKKLVPSTKKGKSQPFINPDSQGH
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  601)    CPATSDSGITDVAMSKSTCISEFNQEHETEDCAESLNHADSDVPPSNTMSPFNTSDYRFE
   1  (  601)    CPATSDSGITDVAMSKSTCISEFNQEHETEDCAESLNHADSDVPPSNTMSPFNTSDYRFE
   2  (  601)    CPATSDSGITDVAMSKSTCISEFNQEHETEDCAESLNHADSDVPPSNTMSPFNTSDYRFE
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  661)    CICGELDQIDRKPRVQCLKCHLWQHAKCVNYDEKNLKIKPFYCPHCLVAMEPVSTRATLI
   1  (  661)    CICGELDQIDRKPRVQCLKCHLWQHAKCVNYDEKNLKIKPFYCPHCLVAMEPVSTRATLI
   2  (  661)    CICGELDQIDRKPRVQCLKCHLWQHAKCVNYDEKNLKIKPFYCPHCLVAMEPVSTRATLI
   3  (  640)    .....................................................TSHGTLI

//
                                                                             
   0  (  721)    ISPSSICHQWVDEINRHVRSSSLRVLVYQGVKKDGFLQPHFLAEQDIVIITYDVLRSELN
   1  (  721)    ISPSSICHQWVDEINRHVRSSSLRVLVYQGVKKDGFLQPHFLAEQDIVIITYDVLRSELN
   2  (  721)    ISPSSICHQWVDEINRHVRSSSLRVLVYQGVKKDGFLQPHFLAEQDIVIITYDVLRSELN
   3  (  647)    ICPASLIHHWKNEVEKRVNSNKLRVYLYHGPNRDS--RARVLSTYDIVITTYSLVAKE--

//
                                                                             
   0  (  781)    YVDIPHSNSEDGRRLRNQKRYMAIPSPLVAVEWWRICLDEAQMVECPTVKAAEMAQRLSG
   1  (  781)    YVDIPHSNSEDGRRLRNQKRYMAIPSPLVAVEWWRICLDEAQMVECPTVKAAEMAQRLSG
   2  (  781)    YVDIPHSNSEDGRRLRNQKRYMAIPSPLVAVEWWRICLDEAQMVECPTVKAAEMAQRLSG
   3  (  703)    ---IP-TNKQEAEIPGANLNVEGTSTPLLRIAWARIILDEAHNVKNPRVQTSIAVCKLQA

//
                                                                             
   0  (  841)    INRWCISGTPVQRGLEDLFGLVVFLGIEPYCVKHWWVRLLYRPYCKKNPQHLYSFIAKIL
   1  (  841)    INRWCISGTPVQRGLEDLFGLVVFLGIEPYCVKHWWVRLLYRPYCKKNPQHLYSFIAKIL
   2  (  841)    INRWCISGTPVQRGLEDLFGLVVFLGIEPYCVKHWWVRLLYRPYCKKNPQHLYSFIAKIL
   3  (  759)    CARWAVTGTPIQNNLLDMYSLLKFLRCSPFDEFNLW-RSQVDNGSKKGGERL-SILTKSL

//
                                                                             
   0  (  901)    WRSAKKDVIDQIQIP----PQTE-EIHWLHFSPVERHFYH--------------RQHEV-
   1  (  901)    WRSAKKDVIDQIQIP----PQTE-EIHWLHFSPVERHFYH--------------RQHEV-
   2  (  901)    WRSAKKDVIDQIQIP----PQTE-EIHWLHFSPVERHFYH--------------RQHEV-
   3  (  817)    LLRRTKDQLDSTGRPLVILPQRKFQLHHLKLSEDEETVYNVFFARSRSALQSYLKRHESR

//
                                                                             
   0  (  941)    CCQDVVVKLRKISDWALKLSSLD----------RRTVTSILYPLLRLRQACCHPQAVRGE
   1  (  941)    CCQDVVVKLRKISDWALKLSSLD----------RRTVTSILYPLLRLRQACCHPQAVRGE
   2  (  941)    CCQDVVVKLRKISDWALKLSSLD----------RRTVTSILYPLLRLRQACCHPQAVRGE
   3  (  877)    GNQSGRSPNNPFSRVALEFGSEEPRHSEAADSPRSSTVHILSQLLRLRQCCCHLSLLKSA

//
                                                                             
   0  (  991)    FLPLQKS---------TMTMEELLTSLQKKCGTECEEAHRQLVCALNG-LAGIHIIKG--
   1  (  991)    FLPLQKS---------TMTMEELLTSLQKKCGTECEEAHRQLVCALNG-LAGIHIIKG--
   2  (  991)    FLPLQKSFEQSTFSFSTMTMEELLTSLQKKCGTECEEAHRQLVCALNG-LAGIHIIKG--
   3  (  937)    LDPMELKGEGL-----VLSLEEQLSALTL---SELRDSEPSSTVSLNGTFFKMELFEGMR

//
                                                                             
   0  ( 1039)    EYALAAELYREVLRSSEEHKGKLKTDSLQRLHATHNLMELLIARHPGIPPTLRDGRLEEE
   1  ( 1039)    EYALAAELYREVLRSSEEHKGKLKTDSLQRLHATHNLMELLIARHPGIPPTLRDGRLEEE
   2  ( 1048)    EYALAAELYREVLRSSEEHKGKLKTDSLQRLHATHNLMELLIARHPGIPPTLRDGRLEEE
   3  (  989)    ESTKISSLLAE-LEAIQRNSASQKSVIVSQWTNMLKVVALHLKKH-GLTYATIDGSVNPK

//
                                                                             
   0  ( 1099)    AKQLREHYMSKCNTEVAEAQQALYPVQQTIHELQRKIHSNSPWWLNVIHRAIEFTIDEEL
   1  ( 1099)    AKQLREHYMSKCNTEVAEAQQALYPVQQTIHELQRKIHSNSPWWLNVIHRAIEFTIDEEL
   2  ( 1108)    AKQLREHYMSKCNTEVAEAQQALYPVQQTIHELQRKIHSNSPWWLNVIHRAIEFTIDEEL
   3  ( 1047)    QR..........................................................

//
                                                                             
   0  ( 1159)    VQRVRNEITSNYKQQTGKLSMSEKFRDCRGLQFLLTTQMEELNKCQKLVREAVKNLEGPP
   1  ( 1159)    VQRVRNEITSNYKQQTGKLSMSEKFRDCRGLQFLLTTQMEELNKCQKLVREAVKNLEGPP
   2  ( 1168)    VQRVRNEITSNYKQQTGKLSMSEK-----GLQFLLTTQMEELNKCQKLVREAVKNLEGPP
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1219)    SRNVIESATVCHLRPARLPLNCCVFCKADELFTEYESKLFSNTVKGQTAIFEEMIEDEEG
   1  ( 1219)    SRNVIESATVCHLRPARLPLNCCVFCKADELFTEYESKLFSNTVKGQTAIFEEMIEDEEG
   2  ( 1223)    SRNVIESATVCHLRPARLPLNCCVFCKADELFTEYESKLFSNTVKGQTAIFEEMIEDEEG
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1279)    LVDDRAPTTTRGLWAISETERSMKAILSFAKSHRFDVEFVDEGSTSMDLFEAWKKEYKLL
   1  ( 1279)    LVDDRAPTTTRGLWAISETERSMKAILSFAKSHRFDVEFVDEGSTSMDLFEAWKKEYKLL
   2  ( 1283)    LVDDRAPTTTRGLWAISETERSMKAILSFAKSHRFDVEFVDEGSTSMDLFEAWKKEYKLL
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1339)    HEYWMALRNRVSAVDELAMATERLRVRDPREPKPNPPVLHIIEPHEVEQNRIKLLNDKAV
   1  ( 1339)    HEYWMALRNRVSAVDELAMATERLRVRDPREPKPNPPVLHIIEPHEVEQNRIKLLNDKAV
   2  ( 1343)    HEYWMALRNRVSAVDELAMATERLRVRDPREPKPNPPVLHIIEPHEVEQNRIKLLNDKAV
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1399)    ATSQLQKKLGQLLYLTNLEKSQDKTSGGVNPEPCPICARQLGKQWAVLTCGHCFCNECIS
   1  ( 1399)    ATSQLQKKLGQLLYLTNLEKSQDKTSGGVNPEPCPICARQLGKQWAVLTCGHCFCNECIS
   2  ( 1403)    ATSQLQKKLGQLLYLTNLEKSQDKTSGGVNPEPCPICARQLGKQWAVLTCGHCFCNECIS
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1459)    IIIEQYSVGSHRSSIKCAICRQTTSHKEISYVFTSEKANQEEDIPVKGSHSTKVEAVVRT
   1  ( 1459)    IIIEQYSVGSHRSSIKCAICRQTTSHKEISYVFTSEKANQEEDIPVKGSHSTKVEAVVRT
   2  ( 1463)    IIIEQYSVGSHRSSIKCAICRQTTSHKEISYVFTSEKANQEEDIPVKGSHSTKVEAVVRT
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1519)    LMKIQLRDPGAKALVFSTWQDVLDIISKALTDNNMEFAQISRVKTFQENLSAFKRDPQIN
   1  ( 1519)    LMKIQLRDPGAKALVFSTWQDVLDIISKALTDNNMEFAQISRVKTFQENLSAFKRDPQIN
   2  ( 1523)    LMKIQLRDPGAKALVFSTWQDVLDIISKALTDNNMEFAQISRVKTFQENLSAFKRDPQIN
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1579)    ILLLPLHTGSNGLTIIEATHVLLVEPILNPAHELQAIGRVHRIGQTKPTIVHRFLIKATI
   1  ( 1579)    ILLLPLHTGSNGLTIIEATHVLLVEPILNPAHELQAIGRVHRIGQTKPTIVHRFLIKATI
   2  ( 1583)    ILLLPLHTGSNGLTIIEATHVLLVEPILNPAHELQAIGRVHRIGQTKPTIVHRFLIKATI
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                              
   0  ( 1639)    EERMQAMLKTAERSHTNSSAKHSEASVLTVADLADLFTKETEELE
   1  ( 1639)    EERMQAMLKTAERSHTNSSAKHSEASVLTVADLADLFTKETEELE
   2  ( 1643)    EERMQAMLKTAERS...............................
   3  (    -)    .............................................

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