# 0 Query: pF1KE4255, 1022 aa
# 1 CCDS47098.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (1022 aa)
# 2 CCDS54777.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (986 aa)
# 3 CCDS3630.1 HERC5 gene_id:51191|Hs108|chr4 (1024 aa)
# 4 CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050 aa)
# 5 CCDS82939.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (368 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 6881 100.0 1 1022
2 0 6564 96.5 1 986
3 2.9e-199 3181 49.8 26 1023
4 5e-60 2319 39.2 38 1047
5 1.9e-59 1009 54.1 38 322
//
0 ( 1) MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAEL--LQAASGERHSLLLLTN-HRVLSCGDNSRGQLGR
1 ( 1) MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAEL--LQAASGERHSLLLLTN-HRVLSCGDNSRGQLGR
2 ( 1) MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAEL--LQAASGERHSLLLLTN-HRVLSCGDNSRGQLGR
3 ( 26) .................AKSPGAQLWLFPSAAGLHRALLRRVEVTRQLCCSPGRLAVLER
4 ( 38) ............................EVACGGNHSVFLLED-GEVYTCGLNTKGQLGH
5 ( 38) ............................EVACGGNHSVFLLED-GEVYTCGLNTKGQLGH
//
0 ( 58) RGA--QRGEL---------PEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQ
1 ( 58) RGA--QRGEL---------PEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQ
2 ( 58) RGA--QRGEL---------PEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQ
3 ( 69) GGAGVQVHQLLAGSGGARTPKCIKLGKNMKIHSVDQGAEHMLILSSDGKPFEYDNYSMKH
4 ( 69) E----REGNK---------PEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQ
5 ( 69) E----REGNK---------PEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQ
//
0 ( 107) LGIGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEF
1 ( 107) LGIGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEF
2 ( 107) LGIGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEF
3 ( 129) L---RFESI---------LQEKKIIQITCGDYHSLALSKGGELFAWGQNLHGQLGVGRKF
4 ( 116) LGLMTTEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEF
5 ( 116) LGLMTTEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEF
//
0 ( 167) PSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNK
1 ( 167) PSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNK
2 ( 167) PSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNK
3 ( 177) PSTTTPQIVEHLAGVPLAQISAGEAHSMALSMSGNIYSWGKNECGQLGLGHTE---SKDD
4 ( 176) PSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEK---DRES
5 ( 176) PSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEK---DRES
//
0 ( 227) PLSVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLV-ERI
1 ( 227) PLSVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLV-ERI
2 ( 227) PLSVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLV-ERI
3 ( 234) PSLIEGLDNQKVEFVACGGSHSALLTQDGLLFTFGAGKHGQLGHNSTQNELRPCLV-AEL
4 ( 233) PCHVKLLRTQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELM
5 ( 233) PCHVKLLRTQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELM
//
0 ( 286) DGL-VSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPS---------DT--SKPTHPEALTENFD
1 ( 286) DGL-VSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPS---------DT--SKPTHPEALTENFD
2 ( 286) DGL-VSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPS---------DT--SKPTHPEALTENFD
3 ( 293) VGYRVTQIACGRWHTLAYVSDLGKVFSFGSGKD---------GQLGNGGTRDQLMPLPVK
4 ( 293) GSE-VTQIACGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNV--KCPSPVKGYWAAHS
5 ( 293) GSE-VTQIACGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCG.............................
//
0 ( 334) ISCL--ISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFVT-THQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKW
1 ( 334) ISCL--ISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFVT-THQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKW
2 ( 334) ISCL--ISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFVT-THQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKW
3 ( 344) VSSSEELKLESHTSEKELIMIAGGNQSILL-WIKKENSYVNLKRTIPTL---NEGTVKRW
4 ( 350) GQLS--ARADRFKYHIVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQ-AHYTSLINDET
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 391) IAVKRRS-TEHEMAKS--EIRMIFSSPACLTASFLKKR-GTGETTSIDV---DLEMARDT
1 ( 391) IAVKRRS-TEHEMAKS--EIRMIFSSPACLTASFLKKR-GTGETTSIDV---DLEMARDT
2 ( 391) IAVKRRS-TEHEMAKS--EIRMIFSSPACLTASFLKKR-GTGETTSIDV---DLEMARDT
3 ( 400) IA-DVET-KRWQSTKR--EIQEIFSSPACLTGSFLRKR-RTTEMMPVYL---DLNKARNI
4 ( 407) IAVWRQKLSEHNNANTINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVL
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 444) FKKL--TKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLV
1 ( 444) FKKL--TKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLV
2 ( 444) FKKL--TKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLV
3 ( 452) FKEL--TQKDWITNMITTCLKDNLLKRLPFHSPPQEALEIFFLLPECPMMHISNNWESLV
4 ( 467) FEKLMNSQHSMILEQILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLT
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 502) VPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQD----HC
1 ( 502) VPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQD----HC
2 ( 502) VPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQD----HC
3 ( 510) VPFAKVVCKMSDQSSLVLEEYWATLQESTFSKLVQMFKTAVICQLDYWDESAEE----NG
4 ( 527) IPLAMAILRLDTNPSKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVL-YLLRGRKTFLIPVLFNN
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 558) NVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLI--PAET-
1 ( 558) NVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLI--PAET-
2 ( 558) NVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHL--------
3 ( 566) NVQALLEMLKKLHRVNQVKCQLPESIFQVDELLHRLNFFVEVCRRYLWKMTVD--ASENV
4 ( 586) YITAALKLLEKLYKVNLKVKHVEYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQAGMKARPSII-
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 615) PSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFIL
1 ( 615) PSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFIL
2 ( 610) -------------------------------MSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFIL
3 ( 624) QCCVIFSHFPFIFNNLSKIKLLHTDTLLKIESKKHKAYLRSAAIEEERESEFALRPTFDL
4 ( 645) QDTVTLCSYPFIFDAQAKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVL
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 675) RVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYG
1 ( 675) RVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYG
2 ( 639) RVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYG
3 ( 684) TVRRNHLIEDVLNQLSQFENEDLRKELWVSFSGEIGYDLGGVKKEFFYCLFAEMIQPEYG
4 ( 705) HVRRNNLVGDALRELSIHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYG
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 735) MFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSL
1 ( 735) MFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSL
2 ( 699) MFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSL
3 ( 744) MFMYPEGASCMWFPVKPKFEKKRYFFFGVLCGLSLFNCNVANLPFPLALFKKLLDQMPSL
4 ( 765) MFTYYQDSNLLWFSDTCFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGL
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 795) EDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDV----DLIPNGISIPVDQT
1 ( 795) EDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDV----DLIPNGISIPVDQT
2 ( 759) EDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDV----DLIPNGISIPVDQT
3 ( 804) EDLKELSPDLGKNLQTLLDDEGDNFEEVFYIHFNVHWDRNDT----NLIPNGSSITVNQT
4 ( 825) EDLKELSPTEGRSLQELLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKD
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 851) NKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQ
1 ( 851) NKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQ
2 ( 815) NKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQ
3 ( 860) NKRDYVSKYINYIFNDSVKAVYEEFRRGFYKMCDEDIIKLFHPEELKDVIVGNTDYDWKT
4 ( 885) NRQEFVDAYVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEE
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 911) FEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRC
1 ( 911) FEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRC
2 ( 875) FEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRC
3 ( 920) FEKNARYEPGYNSSHPTIVMFWKAFHKLTLEEKKKFLVFLTGTDRLQMKDLNNMKITFCC
4 ( 945) LEETAIYKGDYSATHPTVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQS
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 971) PETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
1 ( 971) PETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
2 ( 935) PETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
3 ( 980) PESWNERDPIRALTCFSVLFLPKYSTMETVEEALQEAINNNRGF........
4 ( 1005) TAS-GEEYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGF........
5 ( -) ....................................................
//