Multiple alignment for pF1KE3471
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE3471, 1452 aa
#  1    CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7    (1452 aa)
#  2    CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7    (1512 aa)
#  3    CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17    (1481 aa)
#  4    CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17    (1490 aa)
#  5    CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9    (372 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0           9679  100.0         1    1452
   2    4.3e-165    9349   96.0         1    1484
   3    8.8e-62     3184   43.3        10    1481
   4    9.5e-59     3201   43.4        10    1490
   5    1.8e-18      976   46.0        16     349

//
                                                                             
   0  (    1)    MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
   1  (    1)    MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
   2  (    1)    MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   61)    LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
   1  (   61)    LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
   2  (   61)    LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  121)    FSLPQPQQDGGGGAS------SGGGVTPLVEYEDVSSQ-----SEQGLLLGGASAATAAT
   1  (  121)    FSLPQPQQDGGGGAS------SGGGVTPLVEYEDVSSQ-----SEQGLLLGGASAATAAT
   2  (  121)    FSLPQPQQDGGGGAS------SGGGVTPLVEYEDVSSQ-----SEQGLLLGGASAATAAT
   3  (   10)    ......KKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLVSKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAASL
   4  (   10)    ......KKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLVSKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAASL
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  170)    AAGGTGGSGGSPASSSGTQRRGEGSERRPRR--DRRSSSGRS----KERHREHRR-RDGQ
   1  (  170)    AAGGTGGSGGSPASSSGTQRRGEGSERRPRR--DRRSSSGRS----KERHREHRR-RDGQ
   2  (  170)    AAGGTGGSGGSPASSSGTQRRGEGSERRPRR--DRRSSSGRS----KERHREHRR-RDGQ
   3  (   64)    GTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDERRGSDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLL
   4  (   64)    GTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDERRGSDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLL
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  223)    RGG-SEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGSSSSSGGRRKS-ASATSSSSSSRKDRDSKAHR
   1  (  223)    RGG-SEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGSSSSSGGRRKS-ASATSSSSSSRKDRDSKAHR
   2  (  223)    RGG-SEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGSSSSSGGRRKS-ASATSSSSSSRKDRDSKAHR
   3  (  124)    KAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRI--SGSSKRSNEETDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLHK
   4  (  124)    KAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRI--SGSSKRSNEETDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLHK
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  281)    SRTKSSKEPPSAYKEPPKAYREDKTEPKAYR-----RRRSLSPL------GGRDDSPV--
   1  (  281)    SRTKSSKEPPSAYKEPPKAYREDKTEPKAYR-----RRRSLSPL------GGRDDSPV--
   2  (  281)    SRTKSSKEPPSAYKEPPKAYREDKTEPKAYR-----RRRSLSPL------GGRDDSPV--
   3  (  182)    EKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRET-PKSYKTVDSPKRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGA
   4  (  182)    EKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRET-PKSYKTVDSPKRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGA
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  328)    ------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGSSPYS-----RRLPRSPSPYSRRR-
   1  (  328)    ------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGSSPYS-----RRLPRSPSPYSRRR-
   2  (  328)    ------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGSSPYS-----RRLPRSPSPYSRRR-
   3  (  241)    SYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVSPPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQR
   4  (  241)    SYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVSPPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQR
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  367)    --SP-SYSRHSSYERGGDVS---PSPYSSSSWRRSRSPY--------SPV-LRRSGKSRS
   1  (  367)    --SP-SYSRHSSYERGGDVS---PSPYSSSSWRRSRSPY--------SPV-LRRSGKSRS
   2  (  367)    --SP-SYSRHSSYERGGDVS---PSPYSSSSWRRSRSPY--------SPV-LRRSGKSRS
   3  (  301)    SVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGR---RRSSSPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRS
   4  (  301)    SVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGR---RRSSSPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRS
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  412)    RSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAA
   1  (  412)    RSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAA
   2  (  412)    RSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAA
   3  (  358)    RSPAYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNSSLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDG
   4  (  358)    RSPAYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNSSLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDG
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  472)    KAAEATKA----AEAAAKAAKASNT-------------STP-------TKGNTETSASA-
   1  (  472)    KAAEATKA----AEAAAKAAKASNT-------------STP-------TKGNTETSASA-
   2  (  472)    KAAEATKA----AEAAAKAAKASNT-------------STP-------TKGNTETSASA-
   3  (  418)    KESKGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKLEKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSD
   4  (  418)    KESKGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKLEKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSD
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  507)    ---------SQTNHVKDVKK----------IKIE------------------------HA
   1  (  507)    ---------SQTNHVKDVKK----------IKIE------------------------HA
   2  (  507)    ---------SQTNHVKDVKK----------IKIE------------------------HA
   3  (  478)    TGKVKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIVTPKETETSEKETPPPLPTIASPPP
   4  (  478)    TGKVKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIVTPKETETSEKETPPPLPTIASPPP
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  524)    PSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESK---SAATKEESVSL
   1  (  524)    PSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESK---SAATKEESVSL
   2  (  524)    PSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESK---SAATKEESVSL
   3  (  538)    PLPTTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAFSQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSS
   4  (  538)    PLPTTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAFSQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSS
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  581)    KEKTKPLTPSIGAKEKEQHVALV----TSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKK
   1  (  581)    KEKTKPLTPSIGAKEKEQHVALV----TSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKK
   2  (  581)    KEKTKPLTPSIGAKEKEQHVALV----TSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKK
   3  (  598)    QANSQPPV-QVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPLPPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKK
   4  (  598)    QANSQPPV-QVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPLPPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKK
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  637)    EVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDDLSK--SPEEKK-TATQLHSKRRPKICGPRYGETKEK
   1  (  637)    EVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDDLSK--SPEEKK-TATQLHSKRRPKICGPRYGETKEK
   2  (  637)    EVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDDLSK--SPEEKK-TATQLHSKRRPKICGPRYGETKEK
   3  (  657)    EKEQRTRHLLTDLPLPPELPGGD-LSPPDSPEPKAITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQT
   4  (  657)    EKEQRTRHLLTDLPLPPELPGGD-LSPPDSPEPKAITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQT
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  694)    DIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREI
   1  (  694)    DIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREI
   2  (  694)    DIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREI
   3  (  716)    ESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELVALKKVRLDNEKEGFPITAIREI
   4  (  716)    ESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELVALKKVRLDNEKEGFPITAIREI
   5  (   16)    ........VSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFPITALREI

//
                                                                             
   0  (  754)    KILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENH
   1  (  754)    KILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENH
   2  (  754)    KILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENH
   3  (  776)    KILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDH
   4  (  776)    KILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDH
   5  (   68)    KILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSE

//
                                                                             
   0  (  814)    IKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQIKLADFGLARLYS-SEESRP--Y
   1  (  814)    IKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQIKLADFGLARLYS-SEESRP--Y
   2  (  814)    IKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQIKLADFGLARLYS-SEESRP--Y
   3  (  836)    IKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQIKLADFGLARLYN-SEESRP--Y
   4  (  836)    IKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQIKLADFGLARLYN-SEESRP--Y
   5  (  126)    IKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRY

//
                                                                             
   0  (  871)    TNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRIC
   1  (  871)    TNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRIC
   2  (  871)    TNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRIC
   3  (  893)    TNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANLELAQLELISRLC
   4  (  893)    TNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANLELAQLELISRLC
   5  (  186)    TNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLALISQLC

//
                                                                             
   0  (  931)    GSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREE---FVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRC
   1  (  931)    GSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREE---FVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRC
   2  (  931)    GSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREE---FVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRC
   3  (  953)    GSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREE---FSFIPSAALDLLDHMLTLDPSKRC
   4  (  953)    GSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREE---FSFIPSAALDLLDHMLTLDPSKRC
   5  (  246)    GSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYA-LDLIDKLLVLDPAQRI

//
                                                                             
   0  (  988)    TAEQALQCEFL-RDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMT-DDVSTIKAPRK
   1  (  988)    TAEQALQCEFL-RDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMT-DDVSTIKAPRK
   2  (  988)    TAEQALQCEFL-RDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMT-DDVSTIKAPRK
   3  ( 1010)    TAEQTLQSDFL-KDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRK
   4  ( 1010)    TAEQTLQSDFL-KDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRK
   5  (  305)    DSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQI...............

//
                                                                             
   0  ( 1046)    DLSLG-----L--DDSRTNTPQ---GVLPSSQLKSQGSSNVAP-----------------
   1  ( 1046)    DLSLG-----L--DDSRTNTPQ---GVLPSSQLKSQGSSNVAP-----------------
   2  ( 1046)    DLSLG-----L--DDSRTNTPQ---GVLPSSQLKSQGSSNVAPVKTGPGQHLNHSELAIL
   3  ( 1069)    ETTSG-----TSTEPVKNSSPA---PPQPAPGKVESGAGD-AI-----------------
   4  ( 1069)    ETTSGTSTEPV--KNSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIGLADITQ-----------------
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1079)    -------------------------------------------G-------------EKQ
   1  ( 1079)    -------------------------------------------G-------------EKQ
   2  ( 1096)    LNLLQSKTSVNMADFVQVLNIKVNSETQQQLNKINLPAGILATG-------------EKQ
   3  ( 1103)    -------------------------------------------G-------------LAD
   4  ( 1110)    -------------------------------------------QLNQSELAVLLNLLQSQ
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1083)    TDPSTPQ---------------------------------QESSKPLGGIQ-----PSSQ
   1  ( 1083)    TDPSTPQ---------------------------------QESSKPLGGIQ-----PSSQ
   2  ( 1143)    TDPSTPQ---------------------------------QESSKPLGGIQ-----PSSQ
   3  ( 1107)    ITQQLNQ---------------------------------SELAVLLNLLQ-----SQTD
   4  ( 1127)    TDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDSETMAPEESLKEAPSAP
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1105)    TIQPK------VETDAAQAA-----VQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDVLLEERENGSGHE
   1  ( 1105)    TIQPK------VETDAAQAA-----VQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDVLLEERENGSGHE
   2  ( 1165)    TIQPK------VETDAAQAA-----VQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDVLLEERENGSGHE
   3  ( 1129)    LSIPQMAQLLNIHSNPEMQQ-----QLEALNQSISALTEATSQQQDSETMAPEESLKEAP
   4  ( 1187)    VILPS------AEQTTLEASSTPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGS---LE--ENNSDKN
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1154)    ASLQLRPPPEP------STPVSGQDDL--IQHQDMRILELTPE-----------PDRPRI
   1  ( 1154)    ASLQLRPPPEP------STPVSGQDDL--IQHQDMRILELTPE-----------PDRPRI
   2  ( 1214)    ASLQLRPPPEP------STPVSGQDDL--IQHQDMRILELTPE-----------PDRPRI
   3  ( 1184)    SAPVILPSAEQTTLEASSTPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGSLEENNSDKNSGPQGPRR
   4  ( 1236)    SGPQ-GPRRTP------TMP---QE-------------EAAAC-----------P--PHI
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1195)    LP--P-----DQRPPEPP------EPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAA
   1  ( 1195)    LP--P-----DQRPPEPP------EPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAA
   2  ( 1255)    LP--P-----DQRPPEPP------EPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAA
   3  ( 1244)    TPTMPQEEAAEKRPPEPPGPPPPPPPPPLVEGDL------------SSAPQELNPAVTAA
   4  ( 1260)    LP--P-----EKRPPEPPGPPPPPPPPPLVEGDL------------SSAPQELNPAVTAA
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1242)    LLQLLAQHQPQDDPKREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAP
   1  ( 1242)    LLQLLAQHQPQDDPKREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAP
   2  ( 1302)    LLQLLAQHQPQDDPKREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAP
   3  ( 1292)    LLQLLS--QPEAEPPGHLPHEHQA-------------LRPMEYSTRPR-PNRTYGNTDGP
   4  ( 1301)    LLQLLS--QPEAEPPGHLPHEHQA-------------LRPMEYSTRPR-PNRTYGNTDGP
   5  (    -)    ............................................................

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   0  ( 1302)    PLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDI--YLNAGPMLF
   1  ( 1302)    PLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDI--YLNAGPMLF
   2  ( 1362)    PLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDI--YLNAGPMLF
   3  ( 1336)    ET------GFSAIDT-DERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSLSHLGESSSYQGTGSVQF
   4  ( 1345)    ET------GFSAIDT-DERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSLSHLGESSSYQGTGSVQF
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   3  ( 1389)    PGDQDLRF--ARVPLALHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNYG-ELGPGTTGASSSG
   4  ( 1398)    PGDQDLRF--ARVPLALHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNYG-ELGPGTTGASSSG
   5  (    -)    ............................................................

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   0  ( 1418)    -GQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY
   1  ( 1418)    -GQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY
   2  ( 1478)    -GQTWTSP............................
   3  ( 1446)    AGLHWGGPTQSSAYGKLYRGPTRVPPRGGRGRGVPY
   4  ( 1455)    AGLHWGGPTQSSAYGKLYRGPTRVPPRGGRGRGVPY
   5  (    -)    ....................................

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