Multiple alignment for pF1KE3428
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE3428, 602 aa
#  1    CCDS54749.1 LCORL gene_id:254251|Hs108|chr4    (602 aa)
#  2    CCDS3425.1 LCORL gene_id:254251|Hs108|chr4    (318 aa)
#  3    CCDS53561.1 LCOR gene_id:84458|Hs108|chr10    (406 aa)
#  4    CCDS7451.1 LCOR gene_id:84458|Hs108|chr10    (433 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0           3946  100.0         1     602
   2    7.3e-98     1741   95.6         1     274
   3    4.5e-17      607   35.7         1     403
   4    4.8e-17      607   35.7         1     403

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   0  (    1)    MDKGRERMAAAAAAAAAAAAAAQCRSPRCAAERRGFRRELDSWRHRLMHCVGFESILEGL
   1  (    1)    MDKGRERMAAAAAAAAAAAAAAQCRSPRCAAERRGFRRELDSWRHRLMHCVGFESILEGL
   2  (    1)    MDKGRERMAAAAAAAAAAAAAAQCRSPRCAAERRGFRRELDSWRHRLMHCVGFESILEGL
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   61)    YGPRLRRDLSLFEDCEPEELTDWSMDEKCSFCNLQREAVSDCIPSLDSSQSTPTEELSSQ
   1  (   61)    YGPRLRRDLSLFEDCEPEELTDWSMDEKCSFCNLQREAVSDCIPSLDSSQSTPTEELSSQ
   2  (   61)    YGPRLRRDLSLFEDCEPEELTDWSMDEKCSFCNLQREAVSDCIPSLDSSQSTPTEELSSQ
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  121)    GQSNTDKIECQAENYLNALFRKKDLPQNCDPNIPLVAQELMKKMIRQFAIEYISKSGKTQ
   1  (  121)    GQSNTDKIECQAENYLNALFRKKDLPQNCDPNIPLVAQELMKKMIRQFAIEYISKSGKTQ
   2  (  121)    GQSNTDKIECQAENYLNALFRKKDLPQNCDPNIPLVAQELMKKMIRQFAIEYISKSGKTQ
   3  (    1)    ........................................MQRMIQQFAAEYTSKNSSTQ
   4  (    1)    ........................................MQRMIQQFAAEYTSKNSSTQ

//
                                                                             
   0  (  181)    E------NRNGSIGP-SIVCKSIQMNQAENS-----LQEEQEGPLDLTVNRMQEQNTQQG
   1  (  181)    E------NRNGSIGP-SIVCKSIQMNQAENS-----LQEEQEGPLDLTVNRMQEQNTQQG
   2  (  181)    E------NRNGSIGP-SIVCKSIQMNQAENS-----LQEEQEGPLDLTVNRMQEQNTQQG
   3  (   21)    DPSQPNSTKNQSLPKASPVTTSPTAATTQNPVLSKLLMADQDSPLDLTVRKSQSEPSEQ-
   4  (   21)    DPSQPNSTKNQSLPKASPVTTSPTAATTQNPVLSKLLMADQDSPLDLTVRKSQSEPSEQ-

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   0  (  229)    DGVLDLSTKKT----SIKSEESSICDPSSENSVAGRLHRNREDYVERSAEFADGLLSKAL
   1  (  229)    DGVLDLSTKKT----SIKSEESSICDPSSENSVAGRLHRNREDYVERSAEFADGLLSKAL
   2  (  229)    DGVLDLSTKKT----SIKSEESSICDPSSENSVAGMLQVKTDEKLNVSDE..........
   3  (   80)    DGVLDLSTKKSPCAGSTSLSHSPGCSSTQGNGRPGRPSQYRPDGL-RSG---DGVPPRSL
   4  (   80)    DGVLDLSTKKSPCAGSTSLSHSPGCSSTQGNGRPGRPSQYRPDGL-RSG---DGVPPRSL

//
                                                                             
   0  (  285)    KDIQSGALDINKAGILYGIP-QKTLLLHLEALPAGK---PASFKNKTRDFHDSYSYKDSK
   1  (  285)    KDIQSGALDINKAGILYGIP-QKTLLLHLEALPAGK---PASFKNKTRDFHDSYSYKDSK
   2  (    -)    ............................................................
   3  (  136)    QD---GTREGFGHSTSLKVPLARSLQISEELLSRNQLSTAASLGPSGLQNHGQH------
   4  (  136)    QD---GTREGFGHSTSLKVPLARSLQISEELLSRNQLSTAASLGPSGLQNHGQH------

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   0  (  341)    ETCAVLQKVALWARAQAERTEKSKLNLLETSEIKFPTASTYLHQLT-LQKMVTQFKEKNE
   1  (  341)    ETCAVLQKVALWARAQAERTEKSKLNLLETSEIKFPTASTYLHQLT-LQKMVTQFKEKNE
   2  (    -)    ............................................................
   3  (  187)    ---LILSREASWAKPHYE-FNLSRMKFRGNGALSNISDLPFLAENSAFPKMALQAKQDGK
   4  (  187)    ---LILSREASWAKPHYE-FNLSRMKFRGNGALSNISDLPFLAENSAFPKMALQAKQDGK

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   0  (  400)    SLQYETSNPTVQLKIPQLRVSSVS-KSQPDGSGLLDVMYQVSKTSSVLEGSALQKLKNIL
   1  (  400)    SLQYETSNPTVQLKIPQLRVSSVS-KSQPDGSGLLDVMYQVSKTSSVLEGSALQKLKNIL
   2  (    -)    ............................................................
   3  (  243)    K-DVSHSSP-VDLKIPQVRGMDLSWESRTGDQYSYSSLVMGSQTESALS----KKLRAIL
   4  (  243)    K-DVSHSSP-VDLKIPQVRGMDLSWESRTGDQYSYSSLVMGSQTESALS----KKLRAIL

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   0  (  459)    PKQNK--IECSGPVTHSSVDSYFLHGDLSPLCLNSKNGTVDGTSENTEDGLDRKDSKQPR
   1  (  459)    PKQNK--IECSGPVTHSSVDSYFLHGDLSPLCLNSKNGTVDGTSENTEDGLDRKDSKQPR
   2  (    -)    ............................................................
   3  (  297)    PKQSRKSMLDAGP------DSW---G-------SDAEQSTSGQPYPTSDQEGDPGSKQPR
   4  (  297)    PKQSRKSMLDAGP------DSW---G-------SDAEQSTSGQPYPTSDQEGDPGSKQPR

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   0  (  517)    KKRGRYRQYDHEIMEEAIAMVMSGKMSVSKAQGIYGVPHSTLEYKVKERSGTLKTPPKKK
   1  (  517)    KKRGRYRQYDHEIMEEAIAMVMSGKMSVSKAQGIYGVPHSTLEYKVKERSGTLKTPPKKK
   2  (    -)    ............................................................
   3  (  341)    KKRGRYRQYNSEILEEAISVVMSGKMSVSKAQSIYGIPHSTLEYKVKERLGTLKNPPKKK
   4  (  341)    KKRGRYRQYNSEILEEAISVVMSGKMSVSKAQSIYGIPHSTLEYKVKERLGTLKNPPKKK

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   0  (  577)    LRLPDTGLYNMTDSGTGSCKNSSKPV
   1  (  577)    LRLPDTGLYNMTDSGTGSCKNSSKPV
   2  (    -)    ..........................
   3  (  401)    MKL.......................
   4  (  401)    MKL.......................

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