# 0 Query: pF1KE3351, 1042 aa
# 1 CCDS3758.1 USP38 gene_id:84640|Hs108|chr4 (1042 aa)
# 2 CCDS77964.1 USP38 gene_id:84640|Hs108|chr4 (1004 aa)
# 3 CCDS41693.1 USP35 gene_id:57558|Hs108|chr11 (1018 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 6879 100.0 1 1042
2 0 6502 100.0 1 989
3 5e-100 2543 43.1 1 1018
//
0 ( 1) MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIVRKVVESAEHWLDEAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQV
1 ( 1) MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIVRKVVESAEHWLDEAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQV
2 ( 1) MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIVRKVVESAEHWLDEAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQV
3 ( 1) MDKILEAVVTSSYPVSVKQGLVRRVLEAARQPLEREQCLALLALGARLYVGGAEELPRRV
//
0 ( 61) GHQVLEAYARYHRPEFESFFNKTFVLGLLHQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIMSCPSV
1 ( 61) GHQVLEAYARYHRPEFESFFNKTFVLGLLHQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIMSCPSV
2 ( 61) GHQVLEAYARYHRPEFESFFNKTFVLGLLHQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIMSCPSV
3 ( 61) GCQLLHVAGRHHPDVFAEFFSARRVLRLLQGGAGPPGPRALAC---VQLGLQLLPEGPAA
//
0 ( 121) LDLFSLLQVEVLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQC
1 ( 121) LDLFSLLQVEVLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQC
2 ( 121) LDLFSLLQVEVLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQC
3 ( 118) DEVFALLRREVLRTVCERPGPAACAQVARLLARHPRCVPDGPHRLLFCQQLVRCLGRFRC
//
0 ( 181) VSTQERELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPATLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASL
1 ( 181) VSTQERELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPATLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASL
2 ( 181) VSTQERELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPATLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASL
3 ( 178) PAEGEEGAVEFLEQAQQVSGLLAQLWRAQPAAILPCLKELFAVISCAEEE-PPSSALASV
//
0 ( 241) VQHIPLQMITVLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAV
1 ( 241) VQHIPLQMITVLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAV
2 ( 241) VQHIPLQMITVLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAV
3 ( 237) VQHLPLELMDGVVRNLSNDDSVTDSQMLTAISRMIDWVSWPLGKNIDKWIIALLKGLAAV
//
0 ( 301) QKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHLIVPHVVNLVH
1 ( 301) QKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHLIVPHVVNLVH
2 ( 301) QKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHLIVPHVVNLVH
3 ( 297) KKFSILIEVSLTKIEKVFSKLLYPIVRGAALSVLKYMLLTFQHSHEAFHLLLPHIPPMVA
//
0 ( 361) SFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEEKIKLILNQS
1 ( 361) SFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEEKIKLILNQS
2 ( 361) SFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEEKIKLILNQS
3 ( 357) SLVKEDSNSGTSCLEQLAELVHCMVFRFPGFPDLYEPVMEAIKDLHVPNEDRIKQLLGQD
//
0 ( 421) AWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNG
1 ( 421) AWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNG
2 ( 421) AWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNG
3 ( 417) AWTSQKSELAGFYPRLMAKSDTGKIGLINLGNTCYVNSILQALFMASDFRHCVLRLTENN
//
0 ( 481) CNSLMKKLQHLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEE
1 ( 481) CNSLMKKLQHLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEE
2 ( 481) CNSLMKKLQHLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEE
3 ( 477) SQPLMTKLQWLFGFLEHSQRPAISPENFLSASWTPWFSPGTQQDCSEYLKYLLDRLHEEE
//
0 ( 541) KILKVQASHKPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRC
1 ( 541) KILKVQASHKPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRC
2 ( 541) KILKVQASHKPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRC
3 ( 537) KT--------GTRI--CQK--LKQSSSPSPP-EEPPAPSS---TSVEKMFGGKIVTRICC
//
0 ( 601) LNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENM---SVQDPASSPSIQD-GGLMQASVPG---P
1 ( 601) LNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENM---SVQDPASSPSIQD-GGLMQASVPG---P
2 ( 601) LNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENM---SVQDPASSPSIQD-GGLMQASVPG---P
3 ( 581) LCCLNVSSREEAFTDLSLAFPPPERCRRRRLGSVMRPTEDITARELPPPTSAQGPGRVGP
//
0 ( 654) SEEP---VVYN-PTTAAFI--CDSLV------------------NEKT----IG----SP
1 ( 654) SEEP---VVYN-PTTAAFI--CDSLV------------------NEKT----IG----SP
2 ( 654) SEEP---VVYN-PTTAAFI--CDSLV------------------NEKT----IG----SP
3 ( 641) RRQRKHCITEDTPPTSLYIEGLDSKEAGGQSSQEERIEREEEGKEERTEKEEVGEEEEST
//
0 ( 682) PNEFYCSENTSVPNESNKIL--VNKDVPQK----------------PGGETT------PS
1 ( 682) PNEFYCSENTSVPNESNKIL--VNKDVPQK----------------PGGETT------PS
2 ( 682) PNEFYCSENTSVPNESNKIL--VNKDVPQK----------------PGGETT------PS
3 ( 701) RGEGEREKEEEVEEEEEKVEKETEKEAEQEKEEDSLGAGTHPDAAIPSGERTCGSEGSRS
//
0 ( 718) VTDLLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVR
1 ( 718) VTDLLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVR
2 ( 718) VTDLLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVR
3 ( 761) VLDLVNYFLSPEKLTAENRYYCESCASLQDAEKVVELSQGPCYLILTLLRFSFDLRTMRR
//
0 ( 778) RKILDNVSLPLVLELPVKRITSFSSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKL
1 ( 778) RKILDNVSLPLVLELPVKRITSFSSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKL
2 ( 778) RKILDNVSLPLVLELPVKRITSFSSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKL
3 ( 821) RKILDDVSIPLLLRLPLA-------------------------------GGRGQA-----
//
0 ( 838) VPYLLSSVVVHSGISSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGR-DSP
1 ( 838) VPYLLSSVVVHSGISSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGR-DSP
2 ( 838) VPYLLSSVVVHSGISSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGR-DSP
3 ( 845) --YDLCSVVVHSGVSSESGHYYCYAR-------------EGAARPAAS-----LGTADRP
//
0 ( 897) SAVFEQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQHSTNGLS
1 ( 897) SAVFEQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQHSTNGLS
2 ( 897) SAVFEQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQHSTNGLS
3 ( 885) -----------EPENQWYLFNDTRVSFSSFESVSNVTSFFPKDTAYVLFYR-QRPREGPE
//
0 ( 957) GNNPTSGLWINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQEQELNARARALQAASASCSFR-PNGFD
1 ( 957) GNNPTSGLWINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQEQELNARARALQAASASCSFR-PNGFD
2 ( 957) GNNPTSGLWINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQ...........................
3 ( 933) AELGSSR--VRTEPTLHKDLMEAISKDNILYLQEQEKEARSRAAYISALPTSPHWGRGFD
//
0 ( 1016) -----DNDPPGSCGPTGGGGGGGFNTVGRLVF
1 ( 1016) -----DNDPPGSCGPTGGGGGGGFNTVGRLVF
2 ( -) ................................
3 ( 991) EDKDEDEGSPGGCNPAGGNGGD-FH---RLVF
//
