Multiple alignment for pF1KE3200
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE3200, 2109 aa
#  1    CCDS32414.1 GTF3C1 gene_id:2975|Hs108|chr16    (2109 aa)
#  2    CCDS66988.1 GTF3C1 gene_id:2975|Hs108|chr16    (2084 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0          14099  100.0         1    2109
   2    0          13862   98.8         1    2084

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   0  (    1)    MDALESLLDEVALEGLDGLCLPALWSRLETRVPPFPLPLEPCTQEFLWRALATHPGISFY
   1  (    1)    MDALESLLDEVALEGLDGLCLPALWSRLETRVPPFPLPLEPCTQEFLWRALATHPGISFY
   2  (    1)    MDALESLLDEVALEGLDGLCLPALWSRLETRVPPFPLPLEPCTQEFLWRALATHPGISFY

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   1  (   61)    EEPRERPDLQLQDRYEEIDLETGILESRRDPVALEDVYPIHMILENKDGIQGSCRYFKER
   2  (   61)    EEPRERPDLQLQDRYEEIDLETGILESRRDPVALEDVYPIHMILENKDGIQGSCRYFKER

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   0  (  121)    KNITNDIRTKSLQPRCTMVEAFDRWGKKLIIVASQAMRYRALIGQEGDPDLKLPDFSYCI
   1  (  121)    KNITNDIRTKSLQPRCTMVEAFDRWGKKLIIVASQAMRYRALIGQEGDPDLKLPDFSYCI
   2  (  121)    KNITNDIRTKSLQPRCTMVEAFDRWGKKLIIVASQAMRYRALIGQEGDPDLKLPDFSYCI

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   0  (  181)    LERLGRSRWQGELQRDLHTTAFKVDAGKLHYHRKILNKNGLITMQSHVIRLPTGAQQHSI
   1  (  181)    LERLGRSRWQGELQRDLHTTAFKVDAGKLHYHRKILNKNGLITMQSHVIRLPTGAQQHSI
   2  (  181)    LERLGRSRWQGELQRDLHTTAFKVDAGKLHYHRKILNKNGLITMQSHVIRLPTGAQQHSI

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   0  (  241)    LLLLNRFHVDRRSKYDILMEKLSVMLSTRTNHIETLGKLREELGLCERTFKRLYQYMLNA
   1  (  241)    LLLLNRFHVDRRSKYDILMEKLSVMLSTRTNHIETLGKLREELGLCERTFKRLYQYMLNA
   2  (  241)    LLLLNRFHVDRRSKYDILMEKLSVMLSTRTNHIETLGKLREELGLCERTFKRLYQYMLNA

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   2  (  301)    GLAKVVSLRLQEIHPECGPCKTKKGTDVMVRCLKLLKEFKRNDHDDDEDEEVISKTVPPV

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   2  (  361)    DIVFERDMLTQTYDLIERRGTKGISQAEIRVAMNVGKLEARMLCRLLQRFKVVKGFMEDE

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   0  (  421)    GRQRTTKYISCVFAEESDLSRQYQREKARSELLTTVSLASMQEESLLPEGEDTFLSESDS
   1  (  421)    GRQRTTKYISCVFAEESDLSRQYQREKARSELLTTVSLASMQEESLLPEGEDTFLSESDS
   2  (  421)    GRQRTTKYISCVFAEESDLSRQYQREKARSELLTTVSLASMQEESLLPEGEDTFLSESDS

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   1  (  481)    EEERSSSKRRGRGSQKDTRASANLRPKTQPHHSTPTKGGWKVVNLHPLKKQPPSFPGAAE
   2  (  481)    EEERSSSKRRGRGSQKDTRASANLRPKTQPHHSTPTKGGWKVVNLHPLKKQPPSFPGAAE

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   0  (  541)    ERACQSLASRDSLLDTSSVSEPNVSFVSHCADSNSGDIAVIEEVRMENPKESSSSLKTGR
   1  (  541)    ERACQSLASRDSLLDTSSVSEPNVSFVSHCADSNSGDIAVIEEVRMENPKESSSSLKTGR
   2  (  541)    ERACQSLASRDSLLDTSSVSEPNVSFVSHCADSNSGDIAVIEEVRMENPKESSSSLKTGR

//
                                                                             
   0  (  601)    HSSGQDKPHETYRLLKRRNLIIEAVTNLRLIESLFTIQKMIMDQEKQEGVSTKCCKKSIV
   1  (  601)    HSSGQDKPHETYRLLKRRNLIIEAVTNLRLIESLFTIQKMIMDQEKQEGVSTKCCKKSIV
   2  (  601)    HSSGQDKPHETYRLLKRRNLIIEAVTNLRLIESLFTIQKMIMDQEKQEGVSTKCCKKSIV

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   0  (  661)    RLVRNLSEEGLLRLYRTTVIQDGIKKKVDLVVHPSMDQNDPLVRSAIEQVRFRISNSSTA
   1  (  661)    RLVRNLSEEGLLRLYRTTVIQDGIKKKVDLVVHPSMDQNDPLVRSAIEQVRFRISNSSTA
   2  (  661)    RLVRNLSEEGLLRLYRTTVIQDGIKKKVDLVVHPSMDQNDPLVRSAIEQVRFRISNSSTA

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   0  (  721)    NRVKTSQPPVPQGEAEEDSQGKEGPSGSGDSQLSASSRSESGRMKKSDNKMGITPLRNYH
   1  (  721)    NRVKTSQPPVPQGEAEEDSQGKEGPSGSGDSQLSASSRSESGRMKKSDNKMGITPLRNYH
   2  (  721)    NRVKTSQPPVPQGEAEEDSQGKEGPSGSGDSQLSASSRSESGRMKKSDNKMGITPLRNYH

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   0  (  781)    PIVVPGLGRSLGFLPKMPRLRVVHMFLWYLIYGHPASNTVEKPSFISERRTIKQESGRAG
   1  (  781)    PIVVPGLGRSLGFLPKMPRLRVVHMFLWYLIYGHPASNTVEKPSFISERRTIKQESGRAG
   2  (  781)    PIVVPGLGRSLGFLPKMPRLRVVHMFLWYLIYGHPASNTVEKPSFISERRTIKQESGRAG

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   0  (  841)    VRPSSSGSAWEACSEAPSKGSQDGVTWEAEVELATETVYVDDASWMRYIPPIPVHRDFGF
   1  (  841)    VRPSSSGSAWEACSEAPSKGSQDGVTWEAEVELATETVYVDDASWMRYIPPIPVHRDFGF
   2  (  841)    VRPSSSGSAWEACSEAPSKGSQDGVTWEAEVELATETVYVDDASWMRYIPPIPVHRDFGF

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   0  (  901)    GWALVSDILLCLPLSIFIQIVQVSYKVDNLEEFLNDPLKKHTLIRFLPRPIRQQLLYKRR
   1  (  901)    GWALVSDILLCLPLSIFIQIVQVSYKVDNLEEFLNDPLKKHTLIRFLPRPIRQQLLYKRR
   2  (  901)    GWALVSDILLCLPLSIFIQIVQVSYKVDNLEEFLNDPLKKHTLIRFLPRPIRQQLLYKRR

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   0  (  961)    YIFSVVENLQRLCYMGLLQFGPTEKFQDKDQVFIFLKKNAVIVDTTICDPHYNLARSSRP
   1  (  961)    YIFSVVENLQRLCYMGLLQFGPTEKFQDKDQVFIFLKKNAVIVDTTICDPHYNLARSSRP
   2  (  961)    YIFSVVENLQRLCYMGLLQFGPTEKFQDKDQVFIFLKKNAVIVDTTICDPHYNLARSSRP

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   1  ( 1021)    FERRLYVLNSMQDVENYWFDLQCVCLNTPLGVVRCPRVRKNSSTDQGSDEEGSLQKEQES
   2  ( 1021)    FERRLYVLNSMQDVENYWFDLQCVCLNTPLGVVRCPRVRKNSSTDQGSDEEGSLQKEQES

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   0  ( 1081)    AMDKHNLERKCAMLEYTTGSREVVDEGLIPGDGLGAAGLDSSFYGHLKRNWIWTSYIINQ
   1  ( 1081)    AMDKHNLERKCAMLEYTTGSREVVDEGLIPGDGLGAAGLDSSFYGHLKRNWIWTSYIINQ
   2  ( 1081)    AMDKHNLERKCAMLEYTTGSREVVDEGLIPGDGLGAAGLDSSFYGHLKRNWIWTSYIINQ

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   0  ( 1141)    AKKENTAAENGLTVRLQTFLSKRPMPLSARGNSRLNIWGEARVGSELCAGWEEQFEVDRE
   1  ( 1141)    AKKENTAAENGLTVRLQTFLSKRPMPLSARGNSRLNIWGEARVGSELCAGWEEQFEVDRE
   2  ( 1141)    AKKENTAAENGLTVRLQTFLSKRPMPLSARGNSRLNIWGEARVGSELCAGWEEQFEVDRE

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   1  ( 1201)    PSLDRNRRVRGGKSQKRKRLKKDPGKKIKRKKKGEFPGEKSKRLRYHDEADQSALQRMTR
   2  ( 1201)    PSLDRNRRVRGGKSQKRKRLKKDPGKKIKRKKKGEFPGEKSKRLRYHDEADQSALQRMTR

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   0  ( 1261)    LRVTWSMQEDGLLVLCRIASNVLNTKVKGPFVTWQVVRDILHATFEESLDKTSHSVGRRA
   1  ( 1261)    LRVTWSMQEDGLLVLCRIASNVLNTKVKGPFVTWQVVRDILHATFEESLDKTSHSVGRRA
   2  ( 1261)    LRVTWSMQEDGLLVLCRIASNVLNTKVKGPFVTWQVVRDILHATFEESLDKTSHSVGRRA

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   2  ( 1321)    RYIVKNPQAYLNYKVCLAEVYQDKALVGDFMNRRGDYDDPKVCANEFKEFVEKLKEKFSS

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   2  ( 1381)    ALRNSNLEIPDTLQELFARYRVLAIGDEKDQTRKEDELNSVDDIHFLVLQNLIQSTLALS

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   2  ( 1501)    YQLSQTYYRIFTWRFPSTICTESFQFLDRMRAAGKLDQPDRFSFKDQDNNEPTNDMVAFS

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   1  ( 1561)    LDGPGGNCVAVLTLFSLGLISVDVRIPEQIIVVDSSMVENEVIKSLGKDGSLEDDEDEED
   2  ( 1561)    LDGPGGNCVAVLTLFSLGLISVDVRIPEQIIVVDSSMVENEVIKSLGKDGSLEDDEDEED

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   2  ( 1621)    DLDEGVGGKRRSMEVKPAQASHTNYLLMRGYYSPGIVSTRNLNPNDSIVVNSCQMKFQLR

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   0  ( 1681)    CTPVPARLRPAAAPLEELTMGTSCLPDTFTKLINPQENTCSLEEFVLQLELSGYSPEDLT
   1  ( 1681)    CTPVPARLRPAAAPLEELTMGTSCLPDTFTKLINPQENTCSLEEFVLQLELSGYSPEDLT
   2  ( 1681)    CTPVPARLRPAAAPLEELTMGTSCLPDTFTKLINPQENTCSLEEFVLQLELSGYSPEDLT

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   0  ( 1741)    AALEILEAIIATGCFGIDKEELRRRFSALEKAGGGRTRTFADCIQALLEQHQVLEVGGNT
   1  ( 1741)    AALEILEAIIATGCFGIDKEELRRRFSALEKAGGGRTRTFADCIQALLEQHQVLEVGGNT
   2  ( 1741)    AALEILEAIIATGCFGIDKEELRRRFSALEKAGGGRTRTFADCIQALLEQHQVLEVGGNT

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   1  ( 1801)    ARLVAMGSAWPWLLHSVRLKDREDADIQREDPQARPLEGSSSEDSPPEGQAPPSHSPRGT
   2  ( 1801)    ARLVAMGSAWPWLLHSVRLKDREDADIQREDPQARPLEGSSSEDSPPEGQAPPSHSPRGT

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   1  ( 1861)    KRRASWASENGETDAEGTQMTPAKRPALQDSNLAPSLGPGAEDGAEAQAPSPPPALEDTA
   2  ( 1861)    KRRASWASENGETDAEGTQMTPAKRPALQDSNLAPSLGPGAEDGAEAQAPSPPPALEDTA

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   0  ( 1921)    AAGAAQEDQEGVGEFSSPGQEQLSGQAQPPEGSEDPRGFTESFGAANISQAARERDCESV
   1  ( 1921)    AAGAAQEDQEGVGEFSSPGQEQLSGQAQPPEGSEDPRGFTESFGAANISQAARERDCESV
   2  ( 1921)    AAGAAQEDQEGVG-------------------------FTESFGAANISQAARERDCESV

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   0  ( 1981)    CFIGRPWRVVDGHLNLPVCKGMMEAMLYHIMTRPGIPESSLLRHYQGVLQPVAVLELLQG
   1  ( 1981)    CFIGRPWRVVDGHLNLPVCKGMMEAMLYHIMTRPGIPESSLLRHYQGVLQPVAVLELLQG
   2  ( 1956)    CFIGRPWRVVDGHLNLPVCKGMMEAMLYHIMTRPGIPESSLLRHYQGVLQPVAVLELLQG

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   0  ( 2041)    LESLGCIRKRWLRKPRPVSLFSTPVVEEVEVPSSLDESPMAFYEPTLDCTLRLGRVFPHE
   1  ( 2041)    LESLGCIRKRWLRKPRPVSLFSTPVVEEVEVPSSLDESPMAFYEPTLDCTLRLGRVFPHE
   2  ( 2016)    LESLGCIRKRWLRKPRPVSLFSTPVVEEVEVPSSLDESPMAFYEPTLDCTLRLGRVFPHE

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   0  ( 2101)    VNWNKWIHL
   1  ( 2101)    VNWNKWIHL
   2  ( 2076)    VNWNKWIHL

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