Multiple alignment for pF1KE3100
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE3100, 2035 aa
#  1    CCDS44020.1 HCFC1 gene_id:3054|Hs108|chrX    (2035 aa)
#  2    CCDS9097.1 HCFC2 gene_id:29915|Hs108|chr12    (792 aa)
#  3    CCDS76369.1 MUC5AC gene_id:4586|Hs108|chr11    (5654 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0          13220  100.0         1    2035
   2    7.8e-53     2022   45.1         9     705
   3    1.6e-12      772   24.3      2297    3495

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   0  (    1)    MASAVSPANLPAVLLQPRWKRVVGWSGPVPRPRHGHRAVAIKELIVVFGGGNEGIVDELH
   1  (    1)    MASAVSPANLPAVLLQPRWKRVVGWSGPVPRPRHGHRAVAIKELIVVFGGGNEGIVDELH
   2  (    9)    ..................WRRVSSFTGPVPRARHGHRAVAIRELMIIFGGGNEGIADELH
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   61)    VYNTATNQWFIPAVRGDIPPGCAAYGFVCDGTRLLVFGGMVEYGKYSNDLYELQASRWEW
   1  (   61)    VYNTATNQWFIPAVRGDIPPGCAAYGFVCDGTRLLVFGGMVEYGKYSNDLYELQASRWEW
   2  (   51)    VYNTATNQWFLPAVRGDIPPGCAAHGFVCDGTRILVFGGMVEYGRYSNELYELQASRWLW
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  121)    KRLKAKTPKNGPPPCPRLGHSFSLVGNKCYLFGGLANDSEDPKNNIPRYLNDLYILELRP
   1  (  121)    KRLKAKTPKNGPPPCPRLGHSFSLVGNKCYLFGGLANDSEDPKNNIPRYLNDLYILELRP
   2  (  111)    KKVKPHPPPSGLPPCPRLGHSFSLYGNKCYLFGGLANESEDSNNNVPRYLNDFYELELQH
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  181)    GSGVVAWDIPITYGVLPPPRESHTAVVYTEKDNKKSKLVIYGGMSGCRLGDLWTLDIDTL
   1  (  181)    GSGVVAWDIPITYGVLPPPRESHTAVVYTEKDNKKSKLVIYGGMSGCRLGDLWTLDIDTL
   2  (  171)    GSGVVGWSIPVTKGVVPSPRESHTAVIYCKKDSGSPKMYVFGGMCGARLDDLWQLDLETM
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  241)    TWNKPSLSGVAPLPRSLHSATTIGNKMYVFGGWVPLVMDDVKVATHEKEWKCTNTLACLN
   1  (  241)    TWNKPSLSGVAPLPRSLHSATTIGNKMYVFGGWVPLVMDDVKVATHEKEWKCTNTLACLN
   2  (  231)    SWSKPETKGTVPLPRSLHTASVIGNKMYIFGGWVPHKGENTETSPHDCEWRCTSSFSYLN
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  301)    LDTMAWETILMDTLEDNI---PRARAGHCAVAINTRLYIWSGRDGYRKAWNNQVCCKDLW
   1  (  301)    LDTMAWETILMDTLEDNI---PRARAGHCAVAINTRLYIWSGRDGYRKAWNNQVCCKDLW
   2  (  291)    LDTTEWTTLVSDSQEDKKNSRPRPRAGHCAVAIGTRLYFWSGRDGYKKALNSQVCCKDLW
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  358)    YLETEKPPPPARVQLVRANTNSLEVSWGAVATADSYLLQLQKYDIPATAATATSPTPNPV
   1  (  358)    YLETEKPPPPARVQLVRANTNSLEVSWGAVATADSYLLQLQKYDIPATAATATSPTPNPV
   2  (  351)    YLDTEKPPAPSQVQLIKATTNSFHVKWDEVSTVEGYLLQLST-DLPYQAASSDS------
   3  ( 2297)    .............................................PASTTSGPGNTPSPV

//
                                                                             
   0  (  418)    PSVPA-NPPKSPAPAAAAPAVQPLTQVGITLLPQAAPAPPTTTTIQVLPTVPGSSISVPT
   1  (  418)    PSVPA-NPPKSPAPAAAAPAVQPLTQVGITLLPQAAPAPPTTTTIQVLPTVPGSSISVPT
   2  (  404)    ----------SAAPNMQGVRMDPHRQGSNNIVPNSINDTINSTKTEQPATKETSMKNKPD
   3  ( 2312)    PTTSTISAPTTSITSAPTTSTTSAPTSSTTSGPGTTPSPVPTTSITSAPTT--STTSAPT

//
                                                                             
   0  (  477)    ----AARTQGVPAVL---KVTGPQATTGTPLVTM--RPASQAGKAPVTVTSLPAGVRMVV
   1  (  477)    ----AARTQGVPAVL---KVTGPQATTGTPLVTM--RPASQAGKAPVTVTSLPAGVRMVV
   2  (  454)    ----FKALTDSNAILYP-SLASNASNHNSHVVDMLRKNEGPHTSANVGVLSSCLDVRTVI
   3  ( 2370)    TSTTSARTSSTTSATTTSRISGPE-TTPSPVPT-----TSTTSATTTSTTSAPTTSTTSA

//
                                                                             
   0  (  528)    PTQSAQGTVIGSSPQMSGMAALAAAAAATQKIPPSSAPTVLSVPAGTTIVKTMAVTPGTT
   1  (  528)    PTQSAQGTVIGSSPQMSGMAALAAAAAATQKIPPSSAPTVLSVPAGTTIVKTMAVTPGTT
   2  (  509)    PETSVSSTV--SSTQ---------TMVTQQTIKTESSST------NGAVVKD---ETSLT
   3  ( 2424)    PTSSTT-----SSPQTSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTT--RTTSAPKSST

//
                                                                             
   0  (  588)    TLPATVKVASSPVMVSNPATRMLKTAAAQVGTSVSSATNTSTRPIITVHKSGTVTVAQQA
   1  (  588)    TLPATVKVASSPVMVSNPATRMLKTAAAQVGTSVSSATNTSTRPIITVHKSGTVTVAQQA
   2  (  549)    TFSTKSEVDETYAL---PATKISRVETHATATPFSKETPSN--PVATV-KAGE---RQWC
   3  ( 2477)    TSAATTSTTSGPETTPRPVPTT-STTSSPTTSTTSAPTTSTTSASTTSTTSGAGTTPSPV

//
                                                                             
   0  (  648)    QVVTTVVGGVTKTIT-LVKSPISVPGGSALISNLGKV----MSVVQTKPV--------QT
   1  (  648)    QVVTTVVGGVTKTIT-LVKSPISVPGGSALISNLGKV----MSVVQTKPV--------QT
   2  (  600)    DV------GIFKNNTALVSQFYLLPKGKQSISKVGNADVPDYSLLKKQDLVPGTGYRFRV
   3  ( 2536)    PTTSTTSAPTTSTTS-APISSTTSATTTSTTSGPGTT----PSPVPTTST---------T

//
                                                                             
   0  (  695)    SAVTGQASTGPVTQIIQTKGPLP----AGTILKL-VTSADGKP----TTIITTTQASGAG
   1  (  695)    SAVTGQASTGPVTQIIQTKGPLP----AGTILKL-VTSADGKP----TTIITTTQASGAG
   2  (  654)    AAING-CGIGPFSKISEFKTCIPGFPGAPSAVRI-SKNVEGIH----LSWEPPTSPSG..
   3  ( 2582)    SAPTTSTTSGPGT----TPSAVP----TTSITSAPTTSTNSAPISSTTSATTTSRISGPE

//
                                                                             
   0  (  746)    TKPT-ILGISSVSPSTTK----PGTT------TIIKTIPMSAII-------TQAGATGVT
   1  (  746)    TKPT-ILGISSVSPSTTK----PGTT------TIIKTIPMSAII-------TQAGATGVT
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 2634)    TTPSPVPTASTTSASTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTISVPTTSTTSASTTSTTSASTTSTT

//
                                                                             
   0  (  788)    SSPGIKSPITIITTKVMTSGTGAPAKIITAVPKIAT-GHGQQGVTQVVLKGAPGQPGTIL
   1  (  788)    SSPGIKSPITIITTKVMTSGTGAPAKIITAVPKIAT-GHGQQGVTQVVLKGAPGQPGTIL
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 2694)    SGPGT-TPSPVPT----TSTTSAPTTSTTSAPTTSTISAPTTSTTSATTTSTTSAPTPRR

//
                                                                             
   0  (  847)    RTVPMGGVRLVTPVTVSAVKPAVTTLVVKGTTGVTTLGTVTG-TVSTSLAGAGGHSTSAS
   1  (  847)    RTVPMGGVRLVTPVTVSAVKPAVTTLVVKGTTGVTTLGTVTG-TVSTSLAGAGGHSTSAS
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 2749)    TSAP-------TTSTISASTTSTTSATTTSTTSATTTSTISAPTTSTTLS-----PTTST

//
                                                                             
   0  (  906)    LATPITTLGTIATLSSQVINPTAITVSAAQTTLTAAGGLTT-PTITMQPVSQPTQVTLIT
   1  (  906)    LATPITTLGTIATLSSQVINPTAITVSAAQTTLTAAGGLTT-PTITMQPVSQPTQVTLIT
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 2797)    TSTTITST-TSAPISSTTSTPQTSTTSAPTTSTTSGPGTTSSPVPTTSTTSAPTTSTT-S

//
                                                                             
   0  (  965)    APSGVEAQPVHDLPVSILASPTTEQPTATVTIADSGQGDVQPGTVTLVCSNPPCETHETG
   1  (  965)    APSGVEAQPVHDLPVSILASPTTEQPTATVTIADSGQGDVQPGTVTLVCSNPPCETHETG
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 2855)    APT----------------TRTTSVPTSSTTSTATTSTTSGPGT-----TPSPVPTTSTT

//
                                                                             
   0  ( 1025)    TTNTATTTVVANLGGHPQPTQVQFVCDRQEAAASLVTSTVGQQNGSVVRVCSNPPCETHE
   1  ( 1025)    TTNTATTTVVANLGGHPQPTQVQFVCDRQEAAASLVTSTVGQQNGSVVRVCSNPPCETHE
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 2894)    SAPTTRTTSAPTTSTTSAPTTSTTSAPTSSTTSATTTSTISVPTTSTTSVPGTTPSPVPT

//
                                                                             
   0  ( 1085)    TGTTNTATTATSNMAGQHGCSNP---PCETHETGTTNTATTAMSSVGANHQRDARRACAA
   1  ( 1085)    TGTTNTATTATSNMAGQHGCSNP---PCETHETGTTNTATTAMSSVGANHQRDARRACAA
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 2954)    TSTISVPTTSTTSASTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSAPTTSTISAPTTSTP

//
                                                                             
   0  ( 1142)    GTPAV-IRISVATGALEAAQGSKSQCQTRQTSATSTTMTVMATGAPCSAGPLLGPSMARE
   1  ( 1142)    GTPAV-IRISVATGALEAAQGSKSQCQTRQTSATSTTMTVMATGAPCSAGPLLGPSMARE
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 3014)    SAPTTSTTLAPTTSTTSAPTTSTTSTPTSSTTSSPQTSTTSASTTSITSGPGTTPSPVPT

//
                                                                             
   0  ( 1201)    PGGRSPAFVQLAPLSSKVRLSSPSIKDLPAGRHSHAVSTAAMTRSSVGAGEPRMAPVCES
   1  ( 1201)    PGGRSPAFVQLAPLSSKVRLSSPSIKDLPAGRHSHAVSTAAMTRSSVGAGEPRMAPVCES
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 3074)    TSTTSAPTTSTTSAATTSTISAPTTSTTSAPTTSTTSASTASKTSGLGT-TPSPIPTTST

//
                                                                             
   0  ( 1261)    LQGGSPSTTVTVTALEALLC--PSATVTQVCSNPPCETHETGTTNTATTSNAGSAQRVCS
   1  ( 1261)    LQGGSPSTTVTVTALEALLC--PSATVTQVCSNPPCETHETGTTNTATTSNAGSAQRVCS
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 3133)    T---SPPTTSTTSASTASKTSGPGTTPSPVPTTSTIFAPRTSTTSASTTSTTPGP----G

//
                                                                             
   0  ( 1319)    NPPCETHETGTTHTATTATSNGGTGQPEGGQQPPAGRPCETHQTTSTGTTMSV-SVGALL
   1  ( 1319)    NPPCETHETGTTHTATTATSNGGTGQPEGGQQPPAGRPCETHQTTSTGTTMSV-SVGALL
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 3186)    TTPSPVPTTSTASVSKTSTSHVSISKTTHSQ--PVTRDCHLRCTWTKWFDIDFPSPGPHG

//
                                                                             
   0  ( 1378)    PDATSSHRTVESGLEVAAAPS-VT---------PQA-----GTALLAPFPTQRVCSNP--
   1  ( 1378)    PDATSSHRTVESGLEVAAAPS-VT---------PQA-----GTALLAPFPTQRVCSNP--
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 3244)    GDKETYNNIIRSGEKICRRPEEITRLQCRAESHPEVSIEHLGQVVQCSREEGLVCRNQDQ

//
                                                                             
   0  ( 1421)    --P---CETHETGTTHTATTVTSNMSSNQDPPPAASDQGEVESTQGDSVNITSSSAITTT
   1  ( 1421)    --P---CETHETGTTHTATTVTSNMSSNQDPPPAASDQGEVESTQGDSVNITSSSAITTT
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 3304)    QGPFKMCLNYEVRVLCCETPKGCPVTST--PVTAPSTPSGRATSPTQSTSSWQKSRTTTL

//
                                                                             
   0  ( 1476)    VSSTLTRAVTTVTQSTPVPGPSVPPPEELQVSPGPRQQLPPRQLLQSA--STALMGESAE
   1  ( 1476)    VSSTLTRAVTTVTQSTPVPGPSVPPPEELQVSPGPRQQLPPRQLLQSA--STALMGESAE
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 3362)    VTTSTTSTPQTSTTSAPTTSTTSAPTTSTTSAPTTSTTSTPQTSISSAPTSSTTSAPTSS

//
                                                                             
   0  ( 1534)    VLSASQTPELPAAVDLSSTGEPSSGQESAGSAVVATVVVQPPPPTQSEVDQLSLPQELMA
   1  ( 1534)    VLSASQTPELPAAVDLSSTGEPSSGQESAGSAVVATVVVQPPPPTQSEVDQLSLPQELMA
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 3422)    TISA-RTTSIISAPTTSTTSSPTTSTTSATTTSTTSA------PTSSTT---STPQTSKT

//
                                                                             
   0  ( 1594)    EAQAGTTTLMVTGLTPEELAVTAAAEAAAQAAATEEAQALAIQAVLQAAQQAVMGTGEPM
   1  ( 1594)    EAQAGTTTLMVTGLTPEELAVTAAAEAAAQAAATEEAQALAIQAVLQAAQQAVMGTGEPM
   2  (    -)    ............................................................
   3  ( 3472)    SA-ATSSTTSGSGTTPSPVTTTSTA...................................

//
                                                                             
   0  ( 1654)    DTSEAAATVTQAELGHLSAEGQEGQATTIPIVLTQQELAALVQQQQLQEAQAQQQHHHLP
   1  ( 1654)    DTSEAAATVTQAELGHLSAEGQEGQATTIPIVLTQQELAALVQQQQLQEAQAQQQHHHLP
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1714)    TEALAPADSLNDPAIESNCLNELAGTVPSTVALLPSTATESLAPSNTFVAPQPVVVASPA
   1  ( 1714)    TEALAPADSLNDPAIESNCLNELAGTVPSTVALLPSTATESLAPSNTFVAPQPVVVASPA
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1774)    KLQAAATLTEVANGIESLGVKPDLPPPPSKAPMKKENQWFDVGVIKGTNVMVTHYFLPPD
   1  ( 1774)    KLQAAATLTEVANGIESLGVKPDLPPPPSKAPMKKENQWFDVGVIKGTNVMVTHYFLPPD
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................

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   1  ( 2014)    NKRPMSSPEMKSAPKKSKADGQ
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