# 0 Query: pF1KE2571, 1326 aa
# 1 CCDS54973.1 CARMIL1 gene_id:55604|Hs108|chr6 (1371 aa)
# 2 CCDS32054.1 CARMIL3 gene_id:90668|Hs108|chr14 (1372 aa)
# 3 CCDS81998.1 CARMIL2 gene_id:146206|Hs108|chr16 (1372 aa)
# 4 CCDS45513.1 CARMIL2 gene_id:146206|Hs108|chr16 (1435 aa)
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exp sw-scr id% from to
1 0 8403 96.7 1 1358
2 1.2e-94 2975 40.6 1 1323
3 1.6e-68 2216 33.7 23 1333
4 3.9e-38 2148 32.6 23 1373
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0 ( 1) MTEESSDVPRELIESIKDVIGRKIKISVKKKVKLEVK----GD-KVENKVLVLTSCRAFL
1 ( 1) MTEESSDVPRELIESIKDVIGRKIKISVKKKVKLEVK----GD-KVENKVLVLTSCRAFL
2 ( 1) MAKPSVELTRELQDSIRRCLSQGAVLQ-QHHVKLETK----PK-KFEDRVLALTSWRLHL
3 ( 23) .............................KEVELLLKTWLPGEGAVQNHVLALLRWRAYL
4 ( 23) .............................KEVELLLKTWLPGEGAVQNHVLALLRWRAYL
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1 ( 56) V-TARIPTKLELTFSYLEIHGVVCSKSA-QMIVETEKCS-ISMKMASPEDVSEVLAHIGT
2 ( 55) F-LLKVPAKVESSFNVLEIRAFNTLSQN-QILVETERGM-VSMRLPSAESVDQVTRHVSS
3 ( 54) LHTTCLPLRVDCTFSYLEVQAMALQETPPQVTFELESLRELVLEFPGVAALEQLAQHVAA
4 ( 54) LHTTCLPLRVDCTFSYLEVQAMALQETPPQVTFELESLRELVLEFPGVAALEQLAQHVAA
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0 ( 113) CLRKIFPGLSPVRIMKKVSMEPSERLASLQALWDSQTVAEQGPCGGFSQMYACVCDWLGF
1 ( 113) CLRKIFPGLSPVRIMKKVSMEPSERLASLQALWDSQTVAEQGPCGGFSQMYACVCDWLGF
2 ( 112) ALSKVCPG--PGCLIRRGNADTPEGPRDTSPNSETSTSTTHSVCGGFSETYAALCDYNGL
3 ( 114) AIKKVFPRSTLGKLFRRPT--PASMLARLERSSPSESTDPCSPCGGFLETYEALCDYNGF
4 ( 114) AIKKVFPRSTLGKLFRRPT--PASMLARLERSSPSESTDPCSPCGGFLETYEALCDYNGF
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0 ( 173) SYREEVQWDVDTIYLTQDTRELNLQDFSHLDHRDLIPIIAALEYNQWFTKLSSKDLKLST
1 ( 173) SYREEVQWDVDTIYLTQDTRELNLQDFSHLDHRDLIPIIAALEYNQWFTKLSSKDLKLST
2 ( 170) HCREEVQWDVDTIYHAEDNREFNLLDFSHLESRDLALMVAALAYNQWFTKLYCKDLRLGS
3 ( 172) PFREEIQWDVDTIYHRQGCRHFSLGDFSHLGSRDLALSVAALSYNLWFRCLSCVDMKLSL
4 ( 172) PFREEIQWDVDTIYHRQGCRHFSLGDFSHLGSRDLALSVAALSYNLWFRCLSCVDMKLSL
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0 ( 233) DVCEQILRVVSRSNRLEELVLENAGLRTDFAQKLASALAHNPNSGLHTINLAGNPLEDRG
1 ( 233) DVCEQILRVVSRSNRLEELVLENAGLRTDFAQKLASALAHNPNSGLHTINLAGNPLEDRG
2 ( 230) EVLEQVLHTLSKSGSLEELVLDNAGLKTDFVQKLAGVFGENGSCVLHALTLSHNPIEDKG
3 ( 232) EVSEQILHMMSQSSHLEELVLETCSLRGDFVRRLAQALAGHSSSGLRELSLAGNLLDDRG
4 ( 232) EVSEQILHMMSQSSHLEELVLETCSLRGDFVRRLAQALAGHSSSGLRELSLAGNLLDDRG
//
0 ( 293) VSSLSIQFAKLPKGLKHLNLSKTSLSPKGVNSLSQSLSANPLTASTLVHLDLSGN---VL
1 ( 293) VSSLSIQFAKLPKGLKHLNLSKTSLSPKGVNSLSQSLSANPLTASTLVHLDLSGN---VL
2 ( 290) FLSLSQQLLCFPSGLTKLCLAKTAISPRGLQALGQTFGANPAFASSLRYLDLSKNPG-LL
3 ( 292) MTALSRHLERCPGALRRLSLAQTGLTPRGMRALGRALATNAAFDSTLTHLDLSGNPGALG
4 ( 292) MTALSRHLERCPGALRRLSLAQTGLTPRGMRALGRALATNAAFDSTLTHLDLSGNPGALG
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0 ( 350) RGDDLSHMYNFLAQPNAIVHLDLSNTECSLDMVCG-------------------------
1 ( 350) RGDDLSHMYNFLAQPNAIVHLDLSNTECSLDMVCG-------------------------
2 ( 349) ATDEANALYSFLAQPNALVHLDLSGTDCVIDLLLG-------------------------
3 ( 352) ASEDSGGLYSFLSRPNVLSFLNLAGTDTALDTLFA-------------------------
4 ( 352) ASEDSGGLYSFLSRPNVLSFLNLAGTDTALDTVRGCSVGGWMTGRADWRAGRGGLGPPAG
//
0 ( 385) -----------ALLRGCLQYLAVLNLSRTVFSHRKGKEVPPSFKQFFSSSLALMHINLSG
1 ( 385) -----------ALLRGCLQYLAVLNLSRTVFSHRKGKEVPPSFKQFFSSSLALMHINLSG
2 ( 384) -----------ALLHGCCSHLTYLNLARNSCSHRKGREAPPAFKQFFSSAYTLSHVNLSA
3 ( 387) -----------AVSRGCCTSLTHLDASRNVFSRTKSRAAPAALQLFLSRARTLRHLGLAG
4 ( 412) VANSLPPQLFAAVSRGCCTSLTHLDASRNVFSRTKSRAAPAALQLFLSRARTLRHLGLAG
//
0 ( 434) TKLSPEPLKALLLGLACNHNLKGVSLDLSNCELRSGGAQVLEGCIAEIHNITSLDISDNG
1 ( 434) TKLSPEPLKALLLGLACNHNLKGVSLDLSNCELRSGGAQVLEGCIAEIHNITSLDISDNG
2 ( 433) TKLPLEALRALLQGLSLNSHLSDLHLDLSSCELRSAGAQALQEQLGAVTCVGSLDLSDNG
3 ( 436) CKLPPDALRALLDGLALNTHLRDLHLDLSACELRSAGAQVIQDLVCDAGAVSSLDLADNG
4 ( 472) CKLPPDALRALLDGLALNTHLRDLHLDLSACELRSAGAQVIQDLVCDAGAVSSLDLADNG
//
0 ( 494) LESDLSTLIVWLSKNRSIQHLALGKNFNNMKSKNLTPVLDNLVQMIQDEESPLQSLSLAD
1 ( 494) LESDLSTLIVWLSKNRSIQHLALGKNFNNMKSKNLTPVLDNLVQMIQDEESPLQSLSLAD
2 ( 493) FDSDLLTLVPALGKNKSLKHLFLGKNFN-VKAKTLEEILHKLVQLIQEEDCSLQSLSVAD
3 ( 496) FGSDMVTLVLAIGRSRSLRHVALGRNFNVRCKETLDDVLHRIVQLMQDDDCPLQSLSVAE
4 ( 532) FGSDMVTLVLAIGRSRSLRHVALGRNFNVRCKETLDDVLHRIVQLMQDDDCPLQSLSVAE
//
0 ( 554) SKLKTEVTIIINALGSNTSLTKVDISGNGMGDMGAKMLAKALQINTKLRTVIWDKNNITA
1 ( 554) SKLKTEVTIIINALGSNTSLTKVDISGNGMGDMGAKMLAKALQINTKLRTVIWDKNNITA
2 ( 552) SRLKLRTSILINALGSNTCLAKVDLSGNGMEDIGAKMLSKALQINSSLRTILWDRNNTSA
3 ( 556) SRLKLGASVLLRALATNPNLTALDISGNAMGDAGAKLLAKALRVNSRLRSVVWDRNHTSA
4 ( 592) SRLKLGASVLLRALATNPNLTALDISGNAMGDAGAKLLAKALRVNSRLRSVVWDRNHTSA
//
0 ( 614) QGFQDIAVAMEKNYTLRFMPIPMYDASQALKTNPEKTEDALQKIENYLLRNHETRKYLQE
1 ( 614) QGFQDIAVAMEKNYTLRFMPIPMYDASQALKTNPEKTEDALQKIENYLLRNHETRKYLQE
2 ( 612) LGFLDIARALESNHTLRFMSFPVSDISQAYRSAPERTEDVWQKIQWCLVRNNHSQTCPQE
3 ( 616) LGLLDVAQALEQNHSLKAMPLPLNDVAQAQRSRPELTARAVHQIQACLLRNNRADPASSD
4 ( 652) LGLLDVAQALEQNHSLKAMPLPLNDVAQAQRSRPELTARAVHQIQACLLRNNRADPASSD
//
0 ( 674) QAYRLQQ-GIVTSTTQQMIDRICVKVQDHLNSLRNCG-GDAIQEDLKSAERLMRDAKNSK
1 ( 674) QAYRLQQ-GIVTSTTQQMIDRICVKVQDHLNSLRNCG-GDAIQEDLKSAERLMRDAKNSK
2 ( 672) QAFRLQQ-GLVTSSAEQMLQRLCGRVQEEVRALRLCP-LEPVQDELLYARDLIKDAKNSR
3 ( 676) HTTRLQPLGLVSDPSEQEVNELCQSVQEHVE-LLGCGAGPQGEAAVRQAEDAIQNANFSL
4 ( 712) HTTRLQPLGLVSDPSEQEVNELCQSVQEHVELL-GCGAGPQGEAAVRQAEDAIQNANFSL
//
0 ( 732) TLLPNLYHVGGASWAGASGLLSSPIQETLESMAGEVTRVVDEQLKALLESMVDAAENLCP
1 ( 732) TLLPNLYHVGGASWAGASGLLSSPIQETLESMAGEVTRVVDEQLKALLESMVDAAENLCP
2 ( 730) ALFPSLYELGHV--LANDG----PVRQRLESVASEVSKAVDKELQVILESMVSLTQELCP
3 ( 735) SILPILYE------AGSSPSHHWQLGQKLEGLLRQVGEVCRQDIQDFTQATLDTARSLCP
4 ( 771) SILPILYE------AGSSPSHHWQLGQKLEGLLRQVGEVCRQDIQDFTQATLDTARSLCP
//
0 ( 792) NVMKKAHIRQDLIHASTEKISIPRTFVKNVLLEQSGIDILNKISEVKLTVASFLSDRIVD
1 ( 792) NVMKKAHIRQDLIHASTEKISIPRTFVKNVLLEQSGIDILNKISEVKLTVASFLSDRIVD
2 ( 784) VAMRVAEGHNKMLSNVAERVTVPRNFIRGALLEQAGQDIQNKLDEVKLSVVTYLTSSIVD
3 ( 789) QMLQGSSWREQLEGVLAGSRGLPE-----LLPEQLLQDAFTRLRDMRLSITGTLAESIVA
4 ( 825) QMLQGSSWREQLEGVLAGSRGLPE-----LLPEQLLQDAFTRLRDMRLSITGTLAESIVA
//
0 ( 852) EILDALSHCHHKLADHFSR-RGKT-----LPQQESLEIELAEEKPVKRSIITVEELTEIE
1 ( 852) EILDALSHCHHKLADHFSR-RGKT-----LPQQESLEIELAEEKPVKRSIITVEELTEIE
2 ( 844) EILQELYHSHKSLARHLTQLRTLS-----DPPGCPGQGQDLSSRGRGRNH-DHEETTDDE
3 ( 844) QALAGLSAARDQLVESLAQ-QATVTMPPALPAPDGGEPSLLE--PGELEGLFFPEEKEEE
4 ( 880) QALAGLSAARDQLVESLAQ-QATVTMPPALPAPDGGEPSLLE--PGELEGLFFPEEKEEE
//
0 ( 906) RLEDLDTCMMTPKSKRKSIHSRMLRPVSRAF--EMEFDLDKALEEVPIHIEDPP--FPSL
1 ( 906) RLEDLDTCMMTPKSKRKSIHSRMLRPVSRAF--EMEFDLDKALEEVPIHIEDPP--FPSL
2 ( 898) LGTNIDT-MAIKKQKR----CRKIRPVS-AFISGSPQDMESQLGNLGI----PPGWFSGL
3 ( 901) KEKD-DS---PPQKWPELSHGLHLVPFIHSA--AEEAEPEPELAAPGEDAEPQA--GPSA
4 ( 937) KEKD-DS---PPQKWPELSHGLHLVPFIHSA--AEEAEPEPELAAPGEDAEPQA--GPSA
//
0 ( 962) R-QEKRSSGF---ISELPSEE----GKKLEHFTKLRPK--RNKKQQPTQAAVCAANIVSQ
1 ( 962) R-QEKRSSGF---ISELPSEE----GKKLEHFTKLRPK--RNKKQQPTQAAVCAANIVSQ
2 ( 948) GGSQPTASGSWEGLSELPTH-----GYKLRHQTQGRPRPPRTTPPGPGRPSMPAPG----
3 ( 953) R-GSPSPAAPGPPAGPLPRMDLPLAGQPLRHPTRARPRPRRQHHHRPPPGGPQVPPALPQ
4 ( 989) R-GSPSPAAPGPPAGPLPRMDLPLAGQPLRHPTRARPRPRRQHHHRPPPGGPQVPPALPQ
//
0 ( 1012) DGEQNGLMGRVDEGVDEFFTKKVTKMDSKKWSTRGSESHELNEGGDEKKKRDSRKSSGFL
1 ( 1012) DGEQNGLMGRVDEGVDEFFTKKVTKMDSKKWSTRGSESHELNEGGDEKKKRDSRKSSGFL
2 ( 999) TRQENGMATRLDEGLEDFFSRRVLEESSSYPRTLRTVRPGLSEAPLPPLQKKRRR--GLF
3 ( 1012) EG--NGLSARVDEGVEEFFSKRLIQQD-RLWAP---EEDPATEGGATPVPRTLRKKLGTL
4 ( 1048) EG--NGLSARVDEGVEEFFSKRLIQQD-RLWAP---EEDPATEGGATPVPRTLRKKLGTL
//
0 ( 1072) NLIKSRS-KSER----PPTILMTEEPSSPK------GAVRSPPVDCPRK--------DTK
1 ( 1072) NLIKSRS-KSER----PPTILMTEEPSSPK------GAVRSPPVDCPRK--------DTK
2 ( 1057) HFRRPRSFKGDRGPGSPTTGLLLPPPPPPP------PTQESPPSPDPPS--------LGN
3 ( 1066) FAFKKPR-STRG----PRTDLETSPGAAPRTRKTTFGDLLRPPTRPSRGEELGGAEGDTS
4 ( 1102) FAFKKPR-STRG----PRTDLETSPGAAPRTRKTTFGDLLRPPTRPSRGEELGGAEGDTS
//
0 ( 1113) AAEHNG--------NSERIEEIKTPDSFEESQG----EEIGK---VERSDSKSSPQAGRR
1 ( 1113) AAEHNG--------NSERIEEIKTPDSFEESQG----EEIGK---VERSDSKSSPQAGRR
2 ( 1103) NSSPCW--------SPE--EESSLLPGFGGGRGPSFRRKMGT---EGSEPGEGGPAPGTA
3 ( 1121) SPDPAGRSRPRYTRDSKAYSMILLPAEEEATLG----ARPDKRRPLERGETELAPSFEQR
4 ( 1157) SPDPAGRSRPRYTRDSKAYSMILLPAEEEATLG----ARPDKRRPLERGETELAPSFEQR
//
*****************************
0 ( 1158) YGVQVM--------GSGLLAEMKAK----QE-----------------------------
1 ( 1158) YGVQVM--------GSGLLAEMKAK----QEKRAACAQKKLGNDAVSQDSSSPALSGVER
2 ( 1150) QQPRVH--------GVALPGLERAKGWSFDG-----------------------------
3 ( 1177) --VQVMLQRIGVSRGSGG-AEGKRK----QS-----------------------------
4 ( 1213) --VQVMLQRIGVSRGSGG-AEGKRK----QS-----------------------------
//
****************
0 ( 1177) ----------------N-----RFGL-GTPEKNTKAEPKAEAGSRSRSSSST-PTS--PK
1 ( 1206) SDGGGAVPKLHPGLPEN-----RFGL-GTPEKNTKAEPKAEAGSRSRSSSST-PTS--PK
2 ( 1173) ----------------K-----REGP-G-PDQ----EGSTQAWQKRRSSDDAGPGSWKPP
3 ( 1201) ----------------KDGEIKKAGSDGDIMDSSTEAPPISIKSRTHSVSAD-PSCR-PG
4 ( 1237) ----------------KDGEIKKAGSDGDIMDSSTEAPPISIKSRTHSVSAD-PSCR-PG
//
0 ( 1212) PLLQSPKPS------------LAA--R---------PVIP-QK--P---RTASRPDDI--
1 ( 1257) PLLQSPKPS------------LAA--R---------PVIP-QK--P---RTASRPDDI--
2 ( 1206) PPPQSTKPS------------FSAMRR---------AEAT-WH--I---AEESAPNHS--
3 ( 1243) PGSQGPESATWKTLGQQLNAELRS--RGWGQQDGPGPPSPGQS--PSPCRTSPSPDSLGL
4 ( 1279) PGSQGPES--------------AT--W---------KTLG-QQLNA---ELRSRGWGQ--
//
0 ( 1241) PDSPS-SPKV--------ALLPPVLKKVPSDKERDGQSSPQPSPRTFSQEVSRR--SWGQ
1 ( 1286) PDSPS-SPKV--------ALLPPVLKKVPSDKERDGQSSPQPSPRTFSQEVSRR--SWGQ
2 ( 1237) CQSPS-PASQDGEEEKEGTLFPERTLPARNAKLQDPALAPWP-PKPVA--VPRG--RQPP
3 ( 1299) PEDPCLGPRN--------EERPLRLQRSPVLKRRPKLEAP-PSP--..............
4 ( 1308) QDGPG-PPSP--------GQSPSPCRTSPSPDSLGLPEDPCLGPRNEDGQLRPRPLSAGR
//
*************
0 ( 1290) QAQEYQEQKQRSSSKDGHQGSKSNDSGEEAEKEFIFV
1 ( 1335) QAQEYQEQKQRSSSKDGHQGSKSN.............
2 ( 1291) QEPGVREEAEAGDAAPGVNKPRLRLSSQQDQEE....
3 ( -) .....................................
4 ( 1359) RAVSVHEDQLQAPAE......................
//