# 0 Query: pF1KE1299, 255 aa
# 1 CCDS4752.1 DQA1 gene_id:3117|Hs108|chr6 (255 aa)
# 2 CCDS4753.1 DQA2 gene_id:3118|Hs108|chr6 (255 aa)
# 3 CCDS4764.1 DPA1 gene_id:3113|Hs108|chr6 (260 aa)
# 4 CCDS4763.1 DOA gene_id:3111|Hs108|chr6 (250 aa)
# 5 CCDS4750.1 DRA gene_id:3122|Hs108|chr6 (254 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 1.7e-109 1697 98.0 1 255
2 4.7e-97 1514 88.6 1 255
3 4.9e-60 970 57.6 7 260
4 3.1e-59 958 57.4 1 242
5 7.2e-58 938 54.7 1 254
//
*
0 ( 1) MILNKALLLGALALTTVMSPCGGEDIVADHVASCGVNLYQFY-GP--SGQFTHEFDGDEQ
1 ( 1) MILNKALLLGALALTTVMSPCGGEDIVADHVASCGVNLYQFY-GP--SGQYTHEFDGDEQ
2 ( 1) MILNKALLLGALALTAVMSPCGGEDIVADHVASYGVNFYQSH-GP--SGQYTHEFDGDEE
3 ( 7) MFHIRAVILRALSLAFLLSLRGAGAIKADHV-STYAAFVQTH-RP--TGEFMFEFDEDEM
4 ( 1) MALRAGLVLGFHTLMTLLSPQEAGATKADHMGSYGPAFYQSY-GA--SGQFTHEFDEEQL
5 ( 1) MAISGVPVLGFFIIAVLMSAQESWAIKEEHV----IIQAEFYLNPDQSGEFMFDFDGDEI
//
*
0 ( 58) FYVDLEKKETAWRWPEFSKFGGFDPQGALRNMAVAKHNLNIMIKRYNSTAATNEVPEVTV
1 ( 58) FYVDLERKETAWRWPEFSKFGGFDPQGALRNMAVAKHNLNIMIKRYNSTAATNEVPEVTV
2 ( 58) FYVDLETKETVWQLPMFSKFISFDPQSALRNMAVGKHTLEFMMRQSNSTAATNEVPEVTV
3 ( 63) FYVDLDKKETVWHLEEFGQAFSFEAQGGLANIAILNNNLNTLIQRSNHTQATNDPPEVTV
4 ( 58) FSVDLKKSEAVWRLPEFGDFARFDPQGGLAGIAAIKAHLDILVERSNRSRAINVPPRVTV
5 ( 57) FHVDMAKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLEIMTKRSNYTPITNVPPEVTV
//
**
0 ( 118) FSKSPVTLGQPNTLICLVDNIFPPVVNITWLSNGHAVTEGVSETSFLSKSDHSFFKISYL
1 ( 118) FSKSPVTLGQPNTLICLVDNIFPPVVNITWLSNGQSVTEGVSETSFLSKSDHSFFKISYL
2 ( 118) FSKFPVTLGQPNTLICLVDNIFPPVVNITWLSNGHSVTEGVSETSFLSKSDHSFFKISYL
3 ( 123) FPKEPVELGQPNTLICHIDKFFPPVLNVTWLCNGELVTEGVAESLFLPRTDYSFHKFHYL
4 ( 118) LPKSRVELGQPNILICIVDNIFPPVINITWLRNGQTVTEGVAQTSFYSQPDHLFRKFHYL
5 ( 117) LTNSPVELREPNVLICFIDKFTPPVVNVTWLRNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFHYL
//
*
0 ( 178) TFLPSADEIYDCKVEHWGLDQPLLKHWEPEIPAPMSELTETVVCALGLSVGLVGIVVGTV
1 ( 178) TFLPSADEIYDCKVEHWGLDQPLLKHWEPEIPAPMSELTETVVCALGLSVGLMGIVVGTV
2 ( 178) TFLPSADEIYDCKVEHWGLDEPLLKHWEPEIPAPMSELTETLVCALGLSVGLMGIVVGTV
3 ( 183) TFVPSAEDFYDCRVEHWGLDQPLLKHWEAQEPIQMPETTETVLCALGLVLGLVGIIVGTV
4 ( 178) PFVPSAEDVYDCQVEHWGLDAPLLRHWELQVPIPPPDAMETLVCALGLAIGLVGFLVGTV
5 ( 177) PFLPSTEDVYDCRVEHWGLDEPLLKHWEFDAPSPLPETTENVVCALGLTVGLVGIIIGTI
//
0 ( 238) FIIQGLRSVGASRHQGPL
1 ( 238) FIIQGLRSVGASRHQGPL
2 ( 238) FIIQGLRSVGASRHQGLL
3 ( 243) LIIKSLRSGHDPRAQGTL
4 ( 238) LIIMG.............
5 ( 237) FIIKGLRKSNAAERRGPL
//