Multiple alignment for pF1KB9653
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB9653, 276 aa
#  1    CCDS9473.1 SOX21 gene_id:11166|Hs108|chr13    (276 aa)
#  2    CCDS3094.1 SOX14 gene_id:8403|Hs108|chr3    (240 aa)
#  3    CCDS3239.1 SOX2 gene_id:6657|Hs108|chr3    (317 aa)
#  4    CCDS9523.1 SOX1 gene_id:6656|Hs108|chr13    (391 aa)
#  5    CCDS14669.1 SOX3 gene_id:6658|Hs108|chrX    (446 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    1.6e-67     1856  100.0         1     276
   2    6.6e-21      978   57.9         1     240
   3    4.3e-19      620   43.0        39     304
   4    1.1e-18      684   46.2        49     349
   5    2.8e-18      612   48.2       137     383

//
                                                                             
   0  (    1)    MSKPVDHVKRPMNAFMVWSRAQRRKMAQENPKMHNSEISKRLGAEWKLLTESEKRPFIDE
   1  (    1)    MSKPVDHVKRPMNAFMVWSRAQRRKMAQENPKMHNSEISKRLGAEWKLLTESEKRPFIDE
   2  (    1)    MSKPSDHIKRPMNAFMVWSRGQRRKMAQENPKMHNSEISKRLGAEWKLLSEAEKRPYIDE
   3  (   39)    .....DRVKRPMNAFMVWSRGQRRKMAQENPKMHNSEISKRLGAEWKLLSETEKRPFIDE
   4  (   49)    .....DRVKRPMNAFMVWSRGQRRKMAQENPKMHNSEISKRLGAEWKVMSEAEKRPFIDE
   5  (  137)    .....DRVKRPMNAFMVWSRGQRRKMALENPKMHNSEISKRLGADWKLLTDAEKRPFIDE

//
                                                                             
   0  (   61)    AKRLRAMHMKEHPDYKYRPRRKPKTLLKKDKFAFP---VPYGLGGVADAEHPALKAGAGL
   1  (   61)    AKRLRAMHMKEHPDYKYRPRRKPKTLLKKDKFAFP---VPYGLGGVADAEHPALKAGAGL
   2  (   61)    AKRLRAQHMKEHPDYKYRPRRKPKNLLKKDRYVFP---LPY-LG---DTD-P-LKA-AGL
   3  (   94)    AKRLRALHMKEHPDYKYRPRRKTKTLMKKDKYTLP--------GGLLAPGGNSMASGVGV
   4  (  104)    AKRLRALHMKEHPDYKYRPRRKTKTLLKKDKYSLAGGLLAAGAGGGGAAVAMGVGVGVGA
   5  (  192)    AKRLRAVHMKEYPDYKYRPRRKTKTLLKKDKYSLP---SGLLPPGAAAAAAAAAAAAAAA

//
                                                                             
   0  (  118)    HA----------GAGGGLVP--ESLLAN---PEKAAAAAAAAA----ARVFFPQSAAAAA
   1  (  118)    HA----------GAGGGLVP--ESLLAN---PEKAAAAAAAAA----ARVFFPQSAAAAA
   2  (  111)    PV----------GASDGL-------LSA---PEKA-------------RAFLPPASA---
   3  (  146)    GA----------GLGAGVNQRMDSYAHM---NGWSNGSYSMMQ----DQLGYPQHPGLNA
   4  (  164)    AAVGQRLESPGGAAGGGYAH--VNGWANGAYPGSVAAAAAAAAMMQEAQLAYGQHPGAGG
   5  (  249)    SS----------PVGVGQRL--DTYTHV---NGWANGAYSLVQ----EQLGYAQPPSMSS

//
                                                                             
   0  (  159)    AAAAAA--------AAG-------------SPYS-LLDLG-S-------K----MAEISS
   1  (  159)    AAAAAA--------AAG-------------SPYS-LLDLG-S-------K----MAEISS
   2  (  135)    -------------------------------PYS-LLDPA-QFSSSAIQK----MGEVPH
   3  (  189)    HGAAQM--------QPM-------------HRYD-VSALQYN-------S----MTSSQT
   4  (  222)    AHPHAH--------PAHPHPHHPHAHPHNPQPMH-RYDMG-AL------Q----YSPISN
   5  (  290)    PPPPPALPPMHRYDMAG-------------LQYSPMMPPG-A-------QSYMNVAAAAA

//
                                                                             
   0  (  185)    S--SS----------GLP-YA---SSLGYPTAGAGAFHG---AAAAAAAAAAAA------
   1  (  185)    S--SS----------GLP-YA---SSLGYPTAGAGAFHG---AAAAAAAAAAAA------
   2  (  158)    TLATG----------ALP-YA---STLGYQN---GAF-G---SLSCPSQ-----------
   3  (  216)    Y--MN----------GSPTYSMSYSQQGTPGMALGSM-G---SVVKSEASSSPP------
   4  (  262)    S--QGYMSASPSGYGGLP-YG---AAAAAAAAAGGAHQN---SAVAAAAAAAAASSGALG
   5  (  329)    A--AS----------G---YG---GMAPSATAAAAAAYGQQPATAAAAAAAAAAMSLGPM

//
                                                                             
   0  (  220)    --GGHTHSHP-SPGNPGYMIPCNCSAWPSPGLQPPLAYILLPGMGKPQLDPYPAAYAAAL
   1  (  220)    --GGHTHSHP-SPGNPGYMIPCNCSAWPSPGLQPPLAYILLPGMGKPQLDPYPAAYAAAL
   2  (  186)    ----HTHTHP-SPTNPGYVVPCNCTAWSASTLQPPVAYILFPGMTKTGIDPYSSAHATAM
   3  (  254)    --VVTSSSHSRAPCQAGDLRDMISMYLPGAEVPEPAAPSRLHMSQHYQSGPVP.......
   4  (  313)    ALGSLVKSEP-SGSPPA---PAHSRA-PCPGDLREMISMYLP..................
   5  (  371)    --GSVVKSEP-SSPPP............................................

//
                  
   0  (    -)    
   1  (    -)    
   2  (    -)    
   3  (    -)    
   4  (    -)    
   5  (    -)    

//
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com