Multiple alignment for pF1KB8941
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB8941, 301 aa
#  1    CCDS32675.1 HOXB1 gene_id:3211|Hs108|chr17    (301 aa)
#  2    CCDS5401.1 HOXA1 gene_id:3198|Hs108|chr7    (335 aa)
#  3    CCDS2271.1 HOXD1 gene_id:3231|Hs108|chr2    (328 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    7.9e-62     2090   99.7         1     301
   2    4.9e-15      732   44.5         1     328
   3    3.4e-12      560   41.9         1     305

//
                                                                             
   0  (    1)    MDYNRMNSFLEYPLCNR-GPSAY-SAHSAP-----TSFPPSSAQAVD-SYASEGRY--GG
   1  (    1)    MDYNRMNSFLEYPLCNR-GPSAY-SAHSAP-----TSFPPSSAQAVD-SYASEGRY--GG
   2  (    1)    MDNARMNSFLEYPILSS-GDSGTCSARAYPSDHRITTFQ-SCAVSAN-SCGGDDRFLVGR
   3  (    1)    .....MSSYLEYVSCSSSGGVGG-DVLSLA-----PKFCRSDARPVALQPAFPLGN--GD

//
                                                                             
   0  (   51)    G--LSSPAFQQNSGYPAQQPPSTLGVPF--PSSAPS------------G--YAPAACS--
   1  (   51)    G--LSSPAFQQNSGYPAQQPPSTLGVPF--PSSAPS------------G--YAPAACS--
   2  (   58)    GVQIGSPHHHHHHHHRHPQPAT-----Y--QTSGNL------------GVSYSHSSCG--
   3  (   48)    G--AFVSCLPLAAARPSPSPPAAPARPSVPPPAAPQYAQCTLEGAYEPG--AAPAAAAGG

//
                                                                             
   0  (   91)    PSYG------PSQYYP--LGQSEGD--GG-YFH--PSSYGAQLGG-------LSDG---Y
   1  (   91)    PSYG------PSQYYP--LGQSEGD--GG-YFH--PSSYGAQLGG-------LSDG---Y
   2  (   97)    PSYGSQNFSAPYSPYA--LNQ-EADVSGG-YPQCAPAVYSGNLSSPMVQHHHHHQG---Y
   3  (  104)    ADYGFLGSG-PAYDFPGVLGRAADD--GGSHVH--YATSAVFSGGGSF----LLSGQVDY

//
                                                                             
   0  (  128)    GAGGAGPGPYPP-------QHPPYGNEQTASFAPA-YADLLSE---DKETPC--PSEPNT
   1  (  128)    GAGGAGPGPYPP-------QHPPYGNEQTASFAPA-YADLLSE---DKETPC--PSEPNT
   2  (  150)    AGGAVGSPQYI---------HHSYGQEHQSLALAT-YNNSLSPLHASHQEACRSPASETS
   3  (  155)    AAFGE-PGPFPACLKASADGHP--GAFQTASPAPGTYPKSVS--------PA--SGLPAA

//
                                                                             
   0  (  175)    PTARTFDWMKVKRNPPKTAKVSEPG-LGSPSG-LRTNFTTRQLTELEKEFHFNKYLSRAR
   1  (  175)    PTARTFDWMKVKRNPPKTAKVSEPG-LGSPSG-LRTNFTTRQLTELEKEFHFNKYLSRAR
   2  (  200)    SPAQTFDWMKVKRNPPKTGKVGEYGYLGQPNA-VRTNFTTKQLTELEKEFHFNKYLTRAR
   3  (  202)    FS--TFEWMKVKRNASKKGKLAEYG-AASPSSAIRTNFSTKQLTELEKEFHFNKYLTRAR

//
                                                 *                           
   0  (  233)    RVEIAATLELNETQVKIWFQNRRMKQKKREREG---GR-VPPAPPGCPKEAAGDASDQST
   1  (  233)    RVEIAATLELNETQVKIWFQNRRMKQKKREREE---GR-VPPAPPGCPKEAAGDASDQST
   2  (  259)    RVEIAASLQLNETQVKIWFQNRRMKQKKREKEG---LLPISPATPPGNDEKAEESSEKSS
   3  (  259)    RIEIANCLHLNDTQVKIWFQNRRMKQKKREREGLLATA-IPVAPLQLP............

//
                              
   0  (  289)    CTSPEASPSSVTS
   1  (  289)    CTSPEASPSSVTS
   2  (  316)    SSPCVPSPGSSTS
   3  (    -)    .............

//
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com