# 0 Query: pF1KB8941, 301 aa
# 1 CCDS32675.1 HOXB1 gene_id:3211|Hs108|chr17 (301 aa)
# 2 CCDS5401.1 HOXA1 gene_id:3198|Hs108|chr7 (335 aa)
# 3 CCDS2271.1 HOXD1 gene_id:3231|Hs108|chr2 (328 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 7.9e-62 2090 99.7 1 301
2 4.9e-15 732 44.5 1 328
3 3.4e-12 560 41.9 1 305
//
0 ( 1) MDYNRMNSFLEYPLCNR-GPSAY-SAHSAP-----TSFPPSSAQAVD-SYASEGRY--GG
1 ( 1) MDYNRMNSFLEYPLCNR-GPSAY-SAHSAP-----TSFPPSSAQAVD-SYASEGRY--GG
2 ( 1) MDNARMNSFLEYPILSS-GDSGTCSARAYPSDHRITTFQ-SCAVSAN-SCGGDDRFLVGR
3 ( 1) .....MSSYLEYVSCSSSGGVGG-DVLSLA-----PKFCRSDARPVALQPAFPLGN--GD
//
0 ( 51) G--LSSPAFQQNSGYPAQQPPSTLGVPF--PSSAPS------------G--YAPAACS--
1 ( 51) G--LSSPAFQQNSGYPAQQPPSTLGVPF--PSSAPS------------G--YAPAACS--
2 ( 58) GVQIGSPHHHHHHHHRHPQPAT-----Y--QTSGNL------------GVSYSHSSCG--
3 ( 48) G--AFVSCLPLAAARPSPSPPAAPARPSVPPPAAPQYAQCTLEGAYEPG--AAPAAAAGG
//
0 ( 91) PSYG------PSQYYP--LGQSEGD--GG-YFH--PSSYGAQLGG-------LSDG---Y
1 ( 91) PSYG------PSQYYP--LGQSEGD--GG-YFH--PSSYGAQLGG-------LSDG---Y
2 ( 97) PSYGSQNFSAPYSPYA--LNQ-EADVSGG-YPQCAPAVYSGNLSSPMVQHHHHHQG---Y
3 ( 104) ADYGFLGSG-PAYDFPGVLGRAADD--GGSHVH--YATSAVFSGGGSF----LLSGQVDY
//
0 ( 128) GAGGAGPGPYPP-------QHPPYGNEQTASFAPA-YADLLSE---DKETPC--PSEPNT
1 ( 128) GAGGAGPGPYPP-------QHPPYGNEQTASFAPA-YADLLSE---DKETPC--PSEPNT
2 ( 150) AGGAVGSPQYI---------HHSYGQEHQSLALAT-YNNSLSPLHASHQEACRSPASETS
3 ( 155) AAFGE-PGPFPACLKASADGHP--GAFQTASPAPGTYPKSVS--------PA--SGLPAA
//
0 ( 175) PTARTFDWMKVKRNPPKTAKVSEPG-LGSPSG-LRTNFTTRQLTELEKEFHFNKYLSRAR
1 ( 175) PTARTFDWMKVKRNPPKTAKVSEPG-LGSPSG-LRTNFTTRQLTELEKEFHFNKYLSRAR
2 ( 200) SPAQTFDWMKVKRNPPKTGKVGEYGYLGQPNA-VRTNFTTKQLTELEKEFHFNKYLTRAR
3 ( 202) FS--TFEWMKVKRNASKKGKLAEYG-AASPSSAIRTNFSTKQLTELEKEFHFNKYLTRAR
//
*
0 ( 233) RVEIAATLELNETQVKIWFQNRRMKQKKREREG---GR-VPPAPPGCPKEAAGDASDQST
1 ( 233) RVEIAATLELNETQVKIWFQNRRMKQKKREREE---GR-VPPAPPGCPKEAAGDASDQST
2 ( 259) RVEIAASLQLNETQVKIWFQNRRMKQKKREKEG---LLPISPATPPGNDEKAEESSEKSS
3 ( 259) RIEIANCLHLNDTQVKIWFQNRRMKQKKREREGLLATA-IPVAPLQLP............
//
0 ( 289) CTSPEASPSSVTS
1 ( 289) CTSPEASPSSVTS
2 ( 316) SSPCVPSPGSSTS
3 ( -) .............
//