#  0    Query: pF1KB7596, 292 aa
#  1    CCDS31688.1 FOXR1 gene_id:283150|Hs108|chr11    (292 aa)
#  2    CCDS35308.1 FOXR2 gene_id:139628|Hs108|chrX    (311 aa)
#  3    CCDS9126.2 FOXN4 gene_id:121643|Hs108|chr12    (517 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    1.4e-97     2006  100.0         1     292
   2    4.5e-51     1103   56.8        26     311
   3    1.5e-11      339   32.8       107     301

//
                                                                             
   0  (    1)    MGNELFLAFTTSHLPLAEQKLARYKLRIVKPPKLPLEKKPNPDKDGPDYEPNLWMWVNPN
   1  (    1)    MGNELFLAFTTSHLPLAEQKLARYKLRIVKPPKLPLEKKPNPDKDGPDYEPNLWMWVNPN
   2  (   26)    MRNELFLPCTTDQCSLAEQILAKYRVGVMKPPEMPQKRRPSPDGDGPPCEPNLWMWVDPN
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   61)    IVYPPGKLEVSGRRKREDLTSTLPSSQPPQKEEDASCSEAAGVESLSQSSSKRSPPRKRF
   1  (   61)    IVYPPGKLEVSGRRKREDLTSTLPSSQPPQKEEDASCSEAAGVESLSQSSSKRSPPRKRF
   2  (   86)    ILCPLGSQEAPKPSGKEDLTNISPFPQPPQKDEGSNCSEDKVVESLPSSSSEQSPLQKQG
   3  (  107)    ......................MPGLGPITGHRDSMSQFPVGGQ---PSSGLQDPPH---

//
                                                                             
   0  (  121)    AFSPSTWELTEEEEAEDQEDSSSMALPSPHKRAPLQSRRLRQASSQA--GRLWSRPPLNY
   1  (  121)    AFSPSTWELTEEEEAEDQEDSSSMALPSPHKRAPLQSRRLRQASSQA--GRLWSRPPLNY
   2  (  146)    IHSPSDFELTEEE-AEEPDDNS---LQSPEMKC-YQSQKLWQINNQE---KSWQRPPLNC
   3  (  139)    LYSPATQPQFPLPPGAQQCPPVGLYGPPFGVRPPYPQPHVAVHSSQELHPKHYPKPIYSY

//
                                                                             
   0  (  179)    FHLIALALRNSSPCGLNVQQIYSFTRKHFPFFRTAPEGWKNTVRHNLCFRDSFEKVPVSM
   1  (  179)    FHLIALALRNSSPCGLNVQQIYSFTRKHFPFFRTAPEGWKNTVRHNLCFRDSFEKVPVSM
   2  (  198)    SHLIALALRNNPHCGLSVQEIYNFTRQHFPFFWTAPDGWKSTIHYNLCFLDSFEKVPDSL
   3  (  199)    SCLIAMALKNSKTGSLPVSEIYSFMKEHFPYFKTAPDGWKNSVRHNLSLNKCFEKVENKM

//
                                                                       
   0  (  239)    QGGASTRPRSCLWKLTEEGHRRFAEEARALASTRLESIQQCMSQPDVMPFLFDL
   1  (  239)    QGGASTRPRSCLWKLTEEGHRRFAEEARALASTRLESIQQCMSQPDVMPFLFDL
   2  (  258)    KDEDNARPRSCLWKLTKEGHRRFWEETRVLAFAQRERIQECMSQPELLTSLFDL
   3  (  259)    SG--SSR-KGCLWALNLARIDKMEEEMHKWKRKDLAAIHRSMANPE........

//