# 0 Query: pF1KB4854, 1226 aa
# 1 CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226 aa)
# 2 CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251 aa)
# 3 CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218 aa)
# 4 CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210 aa)
# 5 CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 8159 99.9 1 1226
2 0 8089 97.9 1 1251
3 6.4e-38 1942 34.8 14 1212
4 9.3e-38 1937 34.9 7 1204
5 2.8e-32 2251 37.7 5 1161
//
0 ( 1) MDSFDLALLQEWDLESL-----------------------C--VYEPDRNALRRKERERR
1 ( 1) MDSFDLALLQEWDLESL-----------------------C--VYEPDRNALRRKERERR
2 ( 1) MDSFDLALLQEWDLESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERR
3 ( 14) ...........................................LYNDDRNLLRIREKERR
4 ( 7) ...........................................LYNDDRNLLRIREKERR
5 ( 5) ...............................................DRNVLRMKERERR
//
0 ( 36) NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-TNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL--
1 ( 36) NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-TNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL--
2 ( 61) NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-TNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL--
3 ( 31) NQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDA
4 ( 24) NQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDA
5 ( 18) NQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRSIPK-L--
//
0 ( 93) ----VGVPK-PGVP--------------------QTP------VNKIDEHF-V-------
1 ( 93) ----VGVPK-PGVP--------------------QTP------VNKIDEHF-V-------
2 ( 118) ----VGVPK-PGVP--------------------QTP------VNKIDEHF-V-------
3 ( 90) SENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKM-------
4 ( 83) SENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKM-------
5 ( 75) ----VAIPK-PTVP--------------------PSA------DEKSNPNF-FEQRHGGS
//
0 ( 114) -----------ADSRAQNQPSSI----------CSTTTSTPAAVPVQQSKR------GTM
1 ( 114) -----------ADSRAQNQPSSI----------CSTTTSTPAAVPVQQSKR------GTM
2 ( 139) -----------ADSRAQNQPSSI----------CSTTTSTPAAVPVQQSKR------GTM
3 ( 143) -----------AQPRTEPMPS-L----------HAKSCGPPDSQHLTQDRL------GQE
4 ( 136) -----------AQPRTEPMPS-L----------HAKSCGPPDSQHLTQDRL------GQE
5 ( 103) HQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRESYNNSGSS
//
0 ( 147) GW----QKAGHPPSDGQQRATQQG------SL-----RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEV
1 ( 147) GW----QKAGHPPSDGQQRATQQG------SL-----RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEV
2 ( 172) GW----QKAGHPPSDGQQRATQQG------SL-----RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEV
3 ( 175) GFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTD------SAP----ERELSPLISLPSP-VPPLSPIHS
4 ( 168) GFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTD------SAP----ERELSPLISLPSP-VPPLSPIHS
5 ( 163) SR----KKGQHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSPRDPDA
//
0 ( 192) GLQTQERPPAMAAKHSSS----GHC-----------------------------VQNFPP
1 ( 192) GLQTQERPPAMAAKHSSS----GHC-----------------------------VQNFPP
2 ( 217) GLQTQERPPAMAAKHSSS----GHC-----------------------------VQNFPP
3 ( 224) NQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPP
4 ( 217) NQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPP
5 ( 219) NWDSPSRVP-----FSSG----QHS-----------------------------TQSFPP
//
0 ( 219) -SLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE-PAR
1 ( 219) -SLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE-PAR
2 ( 244) -SLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE-PAR
3 ( 284) PSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEKTDLKVP
4 ( 277) PSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEKTDLKVP
5 ( 241) -SLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQESM---EPKLSSEHYSS----QSHGNSMTELK-PS-
//
0 ( 277) AKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPN
1 ( 277) AKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPN
2 ( 302) AKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPN
3 ( 338) AKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPT
4 ( 331) AKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPT
5 ( 291) SKAHLTKLKIPSQPLDASASGDV-SCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPT
//
0 ( 334) KDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRAL
1 ( 334) KDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRAL
2 ( 359) KDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRAL
3 ( 397) KDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPP----
4 ( 390) KDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPP----
5 ( 350) KESQQSNFGTGEQKRYN--PSKTSNGHQSKS-MLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRST
//
0 ( 393) SDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPH
1 ( 393) SDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPH
2 ( 418) SDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPH
3 ( 453) SSSA---PPSAPQSLPEPV-ASAHSSSAESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENEPLE
4 ( 446) SSSA---PPSAPQSLPEPV-ASAHSSSAESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENEPLE
5 ( 407) PGS------NSEPSHHNSEGADNSRD--DSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQ
//
*
0 ( 453) FSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGK-V
1 ( 453) FSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGK-V
2 ( 478) FSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGK-V
3 ( 507) TPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKGS--
4 ( 500) TPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKGS--
5 ( 459) SASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVN-PHKVSPASSVDSNIPSSQGYKKEGRE--QGTGNSY
//
0 ( 511) PDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAV-PC
1 ( 511) PDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAV-PC
2 ( 536) PDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAV-PC
3 ( 555) ----SDSATSQE-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPEA---------PHPGKRSC
4 ( 548) ----SDSATSQE-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPEA---------PHPGKRSC
5 ( 516) TDTSGP----KET-SSATPGRDSKTIQKGSESGRGRQKSP--------------------
//
0 ( 570) --APAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSA--GDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPT
1 ( 570) --APAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSA--GDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPT
2 ( 595) --APAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSA--GDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPT
3 ( 593) QKSPAQQEP-PQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSKDKP
4 ( 586) QKSPAQQEP-PQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSKDKP
5 ( 551) ----AQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAA--EEPRGGLKIESETPVD-LASSM--PSSRH
//
0 ( 626) KTRPCGNNRASHRKELRSSV--TCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLES
1 ( 626) KTRPCGNNRASHRKELRSSV--TCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLES
2 ( 651) KTRPCGNNRASHRKELRSSV--TCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLES
3 ( 651) KVKTKGRPRAAASNEPKPAV--PPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDR
4 ( 644) KVKTKGRPRAAASNEPKPAV--PPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDR
5 ( 602) KAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIETDTSSS----DSD---
//
0 ( 684) EQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFY
1 ( 684) EQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFY
2 ( 709) EQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFY
3 ( 704) TPEHFAL-----VPLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSRKDR
4 ( 697) TPEHFAL-----VPLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSRKDR
5 ( 655) ESESLPPS-SQT-----------------------PKYPESNRTPVKPSSV--EEEDSFF
//
0 ( 744) T---LVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESA
1 ( 744) T---LVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESA
2 ( 769) T---LVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESA
3 ( 746) L---PLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI----PQPPGKGSRQ-RKAEDKQ
4 ( 739) L---PLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI----PQPPGKGSRQ-RKAEDKQ
5 ( 689) RQRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTRI----PGKPYKETEPPKGEKKNV
//
0 ( 801) PPS---HTSDTP---AEKALPKSKRKRKCDNEDDYR--EIKKSQGEKDSSSRLATSTSNT
1 ( 801) PPS---HTSDTP---AEKALPKSKRKRKCDNEDDYR--EIKKSQGEKDSSSRLATSTSNT
2 ( 826) PPS---HTSDTP---AEKALPKSKRKRKCDNEDDYR--EIKKSQGEKDSSSRLATSTSNT
3 ( 798) PPAGKKHSSEKR---SSDSSSKLAKKRKGEAERDC---DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-
4 ( 791) PPAGKKHSSEKR---SSDSSSKLAKKRKGEAERDC---DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-
5 ( 745) PEK---HTREAQKQASEKVSNKGKRKHK--NEDDNRASESKKPKTE-DKNSAGHKPSSNR
//
0 ( 853) LSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDA---SKHKYTSEDLTSSS--RPN---G
1 ( 853) LSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDA---SKHKYTSEDLTSSS--RPN---G
2 ( 878) LSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDA---SKHKYTSEDLTSSS--RPN---G
3 ( 851) ----HKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSS---SQ-KPAKPALKRSR--READTCG
4 ( 844) ----HKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSS---SQ-KPAKPALKRSR--READTCG
5 ( 799) ESSKQ------SAA----KEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEHGSRKRTISQSSSLKSS---S
//
0 ( 905) NSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCK
1 ( 905) NSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCK
2 ( 930) NSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCK
3 ( 901) QDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPG
4 ( 894) QDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPG
5 ( 846) NSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAP--SSSSNCPPSAPTLDSSKP-R
//
0 ( 965) RQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPME
1 ( 965) RQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPME
2 ( 990) RQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPME
3 ( 961) KPQVKFDK--QQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQS
4 ( 954) KPQVKFDK--QQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQS
5 ( 903) RTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNAQE
//
0 ( 1025) SKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAV
1 ( 1025) SKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAV
2 ( 1050) SKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAV
3 ( 1019) SKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAI
4 ( 1012) SKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAI
5 ( 963) SKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYLRLFKLKKENAL
//
0 ( 1085) KYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSP
1 ( 1085) KYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSP
2 ( 1110) KYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSP
3 ( 1079) KYSRTLNKHFESSSKVAQAPSP--CIARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGV
4 ( 1072) KYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIAS---TGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGV
5 ( 1023) KYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSP-GLGSKAVGMPSPVSPKLSPGNSGNYSSGASSASASGS
//
0 ( 1145) STIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSS
1 ( 1145) STIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSS
2 ( 1170) STIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSS
3 ( 1137) AATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSS
4 ( 1129) AATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSS
5 ( 1082) S--VTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKVMGPLIFNAS
//
0 ( 1205) -MEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
1 ( 1205) -MEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
2 ( 1230) -MEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
3 ( 1197) -LVDLVHYTRQGFQQLQ......
4 ( 1189) -LVDLVHYTRQGFQQLQ......
5 ( 1140) IMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKL.
//
