# 0 Query: pF1KB0496, 1042 aa
# 1 CCDS3967.1 SKIV2L2 gene_id:23517|Hs108|chr5 (1042 aa)
# 2 CCDS4731.1 SKIV2L gene_id:6499|Hs108|chr6 (1246 aa)
# 3 CCDS33833.1 POLQ gene_id:10721|Hs108|chr3 (2590 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 6856 100.0 1 1042
2 2.6e-46 1983 36.4 250 1244
3 3.6e-13 387 27.3 105 520
//
0 ( 1) MADAFGDELFSVFEGDSTTAAGTKKDKEKDKGKWKGPPGSADKAGKRFDGKLQSESTNNG
1 ( 1) MADAFGDELFSVFEGDSTTAAGTKKDKEKDKGKWKGPPGSADKAGKRFDGKLQSESTNNG
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 61) KNKRDVDFEGTDEPIFGKKPRIEESITEDLSLADLMPRVKVQSVETVEGCTHEV-ALPAE
1 ( 61) KNKRDVDFEGTDEPIFGKKPRIEESITEDLSLADLMPRVKVQSVETVEGCTHEV-ALPAE
2 ( 250) ...................PLARASSLEDLVLKE--ASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVD
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 120) E-----DYLPLKPRVGKAAKEYPFILDAFQREAIQCVDNNQSVLVSAHTSAGKTVCAEYA
1 ( 120) E-----DYLPLKPRVGKAAKEYPFILDAFQREAIQCVDNNQSVLVSAHTSAGKTVCAEYA
2 ( 289) ATSPVGDFYRLIP---QPAFQWAFEPDVFQKQAILHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYA
3 ( 105) ....................................VLEGKNLVYSAPTSAGKTLVAELL
//
0 ( 175) I-ALALREKQRVIFTSPIKALSNQKYREMYEEFQDVGL-MTGDV-TINPT--------AS
1 ( 175) I-ALALREKQRVIFTSPIKALSNQKYREMYEEFQDVGL-MTGDV-TINPT--------AS
2 ( 346) I-ALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGL-LTGDV-QLHPE--------AS
3 ( 129) ILKRVLEMRKKALFILPFVSVAKEKKYYLQSLFQEVGIKVDGYMGSTSPSRHFSSLDIAV
//
0 ( 224) CLVMTTEILRSMLYRGSEVMREVAWVIFDEIHYMRDSERGVVWEETIIL-----------
1 ( 224) CLVMTTEILRSMLYRGSEVMREVAWVIFDEIHYMRDSERGVVWEETIIL-----------
2 ( 395) CLIMTTEILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIM-----------
3 ( 189) CTIERANGLINRLIEENK-MDLLGMVVVDELHMLGDSHRGYLLELLLTKICYITRKSASC
//
0 ( 273) -------LPDNVHYVFLSATIPNARQFAEWICHLHKQPCHVIYTDYRPTPLQHYIFPAGG
1 ( 273) -------LPDNVHYVFLSATIPNARQFAEWICHLHKQPCHVIYTDYRPTPLQHYIFPAGG
2 ( 444) -------LPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVTRPVPLEHYLFTGNS
3 ( 248) QADLASSLSNAVQIVGMSATLPNLELVASWLN------AELYHTDFRPVPLLESV-KVGN
//
0 ( 326) DG----LHLVVDENGDF-REDNFNTAMQVLRD-AGDLAK---GDQKGRKGGTKGPSNVF-
1 ( 326) DG----LHLVVDENGDF-REDNFNTAMQVLRD-AGDLAK---GDQKGRKGGTKGPSNVF-
2 ( 497) SKTQGELFLLLDSRGAF-HTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYL
3 ( 301) S--------IYDSSMKLVRE--FEPMLQV---------K---GDE----------DHVV-
//
0 ( 376) KIVKMIMERNFQPVIIFSFSKKDCEAYALQMTKLDFNTDEEKK-MVEE-----VFSNAID
1 ( 376) KIVKMIMERNFQPVIIFSFSKKDCEAYALQMTKLDFNTDEEKK-MVEE-----VFSNAID
2 ( 556) SLLASLRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKS-EIHL-----FLQRCLA
3 ( 328) SLCYETICDN-HSVLLFCPSKKWCEKLADIIAREFYNLHHQAEGLVKPSECPPVILEQKE
//
0 ( 430) CLS--DEDKKLPQ-VEHVLP-LLKRGIGIHHGGLLPILKETIEILFSEGLIKALFATETF
1 ( 430) CLS--DEDKKLPQ-VEHVLP-LLKRGIGIHHGGLLPILKETIEILFSEGLIKALFATETF
2 ( 610) RLR--GSDRQLPQ-VLHMSE-LLNRGLGVHHSGILPILKEIVEMLFSRGLVKVLFATETF
3 ( 387) LLEVMDQLRRLPSGLDSVLQKTVPWGVAFHHAGLTFEERDIIEGAFRQGLIRVLAATSTL
//
0 ( 486) AMGINMPARTVLFTNARKFDGKDFRWISSGEYIQMSGRAGRRGMDDRGIVILMVDEKMSP
1 ( 486) AMGINMPARTVLFTNARKFDGKDFRWISSGEYIQMSGRAGRRGMDDRGIVILMVDEKMSP
2 ( 666) AMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRV-P
3 ( 447) SSGVNLPARRVIIRTP-IFGGRPLDILT---YKQMVGRAGRKGVDTVGESILICKNSEK-
//
0 ( 546) TIG--KQLLKGSADPLNSAFHLTYNMVLNLLRVEEINPEYMLEKSFYQFQHYRAIPGVVE
1 ( 546) TIG--KQLLKGSADPLNSAFHLTYNMVLNLLRVEEINPEYMLEKSFYQFQHYRAIPGVVE
2 ( 725) EMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQ
3 ( 502) SKG--IALLQGSLKPVRSCLQ.......................................
//
0 ( 604) KVKNSEEQYNKIVIPNEESVVI----YYKIRQQLAKLGKEIEEYIHKPKYCLPFLQPGRL
1 ( 604) KVKNSEEQYNKIVIPNEESVVI----YYKIRQQLAKLGKEIEEYIHKPKYCLPFLQPGRL
2 ( 785) ALAELTKRLGALEEPDMTGQLVDLPEYYSWGEELTETQHMIQRRIMESVNGLKSLSAGRV
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 660) VKVKNEGDDFGWGVVVNFSKKSNVKPNSGELDPLYVVEVLLRCSK---ESLKNSATEAAK
1 ( 660) VKVKNEGDDFGWGVVVNFSKKSNVKPNSGELDPLYVVEVLLRCSK---ESLKNSATEAAK
2 ( 845) VVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSR----------VFTTLVLCDKPLSQDPQDRGPATAE
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 717) PAKPDEK-GEMQVVP------VLVHL----LSAISS--VRLYIPKDLRPVDNRQ------
1 ( 717) PAKPDEK-GEMQVVP------VLVHL----LSAISS--VRLYIPKDLRPVDNRQ------
2 ( 895) VPYPDDLVGFKLFLPEGPCDHTVVKLQPGDMAAITTKVLRVNGEKILEDFSKRQQPKFKK
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 758) -----SVLKSIQEVQK---RFPDGIPLLDPIDDMGIQDQGLKKVIQKVEAFEHRMYSHPL
1 ( 758) -----SVLKSIQEVQK---RFPDGIPLLDPIDDMGIQDQGLKKVIQKVEAFEHRMYSHPL
2 ( 955) DPPLAAVTTAVQELLRLAQAHPAGPPTLDPVNDLQLKDMSVVEGGLRARKLEELIQGAQC
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 810) HNDPNLETVYTLCEKKAQIAIDIKSAKRELKKARTVLQMDELKCRKRVLRRLGFATSSDV
1 ( 810) HNDPNLETVYTLCEKKAQIAIDIKSAKRELKKARTVLQMDELKCRKRVLRRLGFATSSDV
2 ( 1015) VHSPRFPAQYLKLRERMQIQKEMERL-RFLLSDQSLLLLPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGT
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 870) IEMKGRVACEISSADELLLTEMMFNGLFNDLSAEQATALLSCFVFQENSSEMPKLTEQLA
1 ( 870) IEMKGRVACEISSADELLLTEMMFNGLFNDLSAEQATALLSCFVFQENSSEMPKLTEQLA
2 ( 1074) VKLAGRVACAMSS-HELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSPGDAGDQLPNTLK
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 930) GPLRQMQECAKRIAKVSAEAKLEIDEETYLSSFKPHLMDVVYTWATGATFAHICKMTDVF
1 ( 930) GPLRQMQECAKRIAKVSAEAKLEIDEETYLSSFKPHLMDVVYTWATGATFAHICKMTDVF
2 ( 1133) QGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTP
3 ( -) ............................................................
//
0 ( 990) EGSIIRCMRRLEELLRQMCQAAKAIGNTELENKFAEGITKIKRDIVFAASLYL
1 ( 990) EGSIIRCMRRLEELLRQMCQAAKAIGNTELENKFAEGITKIKRDIVFAASLYL
2 ( 1193) EGLVVRCIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLY.
3 ( -) .....................................................
//