# 0 Query: pF1KB0482, 1024 aa
# 1 CCDS33174.1 NLRC4 gene_id:58484|Hs108|chr2 (1024 aa)
# 2 CCDS77400.1 NLRC4 gene_id:58484|Hs108|chr2 (359 aa)
# 3 CCDS43327.1 NAIP gene_id:4671|Hs108|chr5 (1241 aa)
# 4 CCDS4009.1 NAIP gene_id:4671|Hs108|chr5 (1403 aa)
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exp sw-scr id% from to
1 0 6709 100.0 1 1024
2 1.6e-101 1763 97.5 82 359
3 5.7e-33 781 24.5 196 1194
4 6.4e-33 781 24.5 358 1356
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1 ( 1) MNFIKDNSRALIQRMGMTVIKQITDDLFVWNVLNREEVNIICCEKVEQDAARGIIHMILK
2 ( -) ............................................................
3 ( 196) ..........................................................LQ
4 ( 358) ..........................................................LQ
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0 ( 61) KGSESCNLFLKSLKEWNY-------PLFQDL-NGQSLFHQTSEGDLDDLAQDLKDLYHTP
1 ( 61) KGSESCNLFLKSLKEWNY-------PLFQDL-NGQSLFHQTSEGDLDDLAQDLKDLYHTP
2 ( -) ............................................................
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1 ( 113) SF--LNFYPLGEDIDIIFNLKSTFTEPVLWRKDQHHHRVEQLTLNGLLQALQSPCIIEGE
2 ( -) ............................................................
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1 ( 171) SGKGKSTLLQRIAMLWGSGKCKALTKFKFVFFLRLS--RAQGGLFETLCDQLLDIPGTIR
2 ( -) ............................................................
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0 ( 229) KQTFMAMLLKLRQRVLFLLDGYNEFKPQNCPE-IEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHI
1 ( 229) KQTFMAMLLKLRQRVLFLLDGYNEFKPQNCPE-IEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHI
2 ( -) ............................................................
3 ( 370) EMCVRNIIQQLKNQVLFLLDDYKEIC--SIPQVIGKLIQKNHLSRTCLLIAVRTNRARDI
4 ( 532) EMCVRNIIQQLKNQVLFLLDDYKEIC--SIPQVIGKLIQKNHLSRTCLLIAVRTNRARDI
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0 ( 288) RQFGALTAEVGDMTEDSAQALIREVLIKELAE--GLLLQIQKSRCLRNLMKTPLFVVITC
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2 ( -) ............................................................
3 ( 428) RRYLETILEIKAFPFYNTVCILRKLFSHNMTRLRKFMVYFGKNQSLQKIQKTPLFVAAIC
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1 ( 346) AIQMGESEFHSHTQTTLFHTFYDLLIQKNKHKHKGVAASDFIR-SLDHCGDLALEGVFSH
2 ( -) ............................................................
3 ( 488) AHWFQYPFDPSFDDVAVFKSYMERLSLRNK------ATAEILKATVSSCGELALKGFFSC
4 ( 650) AHWFQYPFDPSFDDVAVFKSYMERLSLRNK------ATAEILKATVSSCGELALKGFFSC
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0 ( 405) KFDFELQDVS--SVNEDVLLTTGLLCKYTAQRFKPKYKFFHKSFQEYTAGRRLSSLLTSH
1 ( 405) KFDFELQDVS--SVNEDVLLTTGLLCKYTAQRFKPKYKFFHKSFQEYTAGRRLSSLLTSH
2 ( -) ............................................................
3 ( 542) CFEFNDDDLAEAGVDEDEDLTMCLMSKFTAQRLRPFYRFLSPAFQEFLAGMRLIELLDSD
4 ( 704) CFEFNDDDLAEAGVDEDEDLTMCLMSKFTAQRLRPFYRFLSPAFQEFLAGMRLIELLDSD
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1 ( 463) EPEEVTKGNGYLQKMVSISDITSTYSSLLRYTCGSSVEATRA---VMKHLAAVYQHG-CL
2 ( -) ............................................................
3 ( 602) RQEHQDLGLYHLKQINSPMMTVSAYNNFLNYV--SSLPSTKAGPKIVSHLLHLVDNKESL
4 ( 764) RQEHQDLGLYHLKQINSPMMTVSAYNNFLNYV--SSLPSTKAGPKIVSHLLHLVDNKESL
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0 ( 519) LGLSIAKRPLWRQE--SLQ-----SVKNTTEQEILKAININSFVECGIHLYQESTSKSAL
1 ( 519) LGLSIAKRPLWRQE--SLQ-----SVKNTTEQEILKAININSFVECGIHLYQESTSKSAL
2 ( -) ............................................................
3 ( 660) ENISENDDYLKHQPEISLQMQLLRGLWQICPQAYFSMVSEHLLVLALKTAYQ-SNTVAAC
4 ( 822) ENISENDDYLKHQPEISLQMQLLRGLWQICPQAYFSMVSEHLLVLALKTAYQ-SNTVAAC
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0 ( 572) SQEFEAFFQGKSLYINSGNIPDYLFDFFE--------HLP----------------NC--
1 ( 572) SQEFEAFFQGKSLYINSGNIPDYLFDFFE--------HLP----------------NC--
2 ( -) ............................................................
3 ( 719) SPFVLQFLQGRTLTLGALNL-QYFFDHPESLSLLRSIHFPIRGNKTSPRAHFSVLETCFD
4 ( 881) SPFVLQFLQGRTLTLGALNL-QYFFDHPESLSLLRSIHFPIRGNKTSPRAHFSVLETCFD
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0 ( 606) ASALDFIKLDFYGG--AMASWEKA-AEDTGGIH-MEEAPETYIPSRAVSLFFNWK---QE
1 ( 606) ASALDFIKLDFYGG--AMASWEKA-AEDTGGIH-MEEAPETYIPSRAVSLFFNWK---QE
2 ( -) ............................................................
3 ( 778) KSQVPTIDQDYASAFEPMNEWERNLAEKEDNVKSYMDMQRRASPDLSTGY---WKLSPKQ
4 ( 940) KSQVPTIDQDYASAFEPMNEWERNLAEKEDNVKSYMDMQRRASPDLSTGY---WKLSPKQ
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0 ( 659) FRT--LEVTLRDFSKLNKQDIRYLGKIFSSATSLRLQIKRCAGVAGSLSLVLSTCK-NIY
1 ( 659) FRT--LEVTLRDFSKLNKQDIRYLGKIFSSATSLRLQIKRCAGVAGSLSLVLSTCK-NIY
2 ( -) ............................................................
3 ( 835) YKIPCLEVDVNDIDVVGQDMLEILMTVFSASQRIELHLNHSRGFIESIRPALELSKASVT
4 ( 997) YKIPCLEVDVNDIDVVGQDMLEILMTVFSASQRIELHLNHSRGFIESIRPALELSKASVT
//
0 ( 716) SLMVEASPLTIEDERHITSVTNLKTLSIHDL---QNQRLPGGLTDSLGNLKNLTKLIMDN
1 ( 716) SLMVEASPLTIEDERHITSVTNLKTLSIHDL---QNQRLPGGLTDSLGNLKNLTKLIMDN
2 ( 82) ............................QDL---NGQ---SGLTDSLGNLKNLTKLIMDN
3 ( 895) KCSISKLELSAAEQELLLTLPSLESLEVSGTIQSQDQIFPN--LDKFLCLKELSVDLEGN
4 ( 1057) KCSISKLELSAAEQELLLTLPSLESLEVSGTIQSQDQIFPN--LDKFLCLKELSVDLEGN
//
0 ( 773) IKM----------------------NEEDAIKLAEGLKNLKKMCLFHL--THLSDIGEGM
1 ( 773) IKM----------------------NEEDAIKLAEGLKNLKKMCLFHL--THLSDIGEGM
2 ( 108) IKM----------------------NEEDAIKLAEGLKNLKKMCLFHL--THLSDIGEGM
3 ( 953) INVFSVIPEEFPNFHHMEKLLIQISAEYDPSKLVKLIQNSPNLHVFHLKCNFFSDFGSLM
4 ( 1115) INVFSVIPEEFPNFHHMEKLLIQISAEYDPSKLVKLIQNSPNLHVFHLKCNFFSDFGSLM
//
0 ( 809) DYIVKSLSSEPCD-LEEIQLVSCCLSANAVKILAQNLHNLVKLSILDL-SENYLEKDGNE
1 ( 809) DYIVKSLSSEPCD-LEEIQLVSCCLSANAVKILAQNLHNLVKLSILDL-SENYLEKDGNE
2 ( 144) DYIVKSLSSEPCD-LEEIQLVSCCLSANAVKILAQNLHNLVKLSILDL-SENYLEKDGNE
3 ( 1013) TMLVS------CKKLTEIKFSDSFFQA--VPFVA-SLPNFISLKILNLEGQQFPDEETSE
4 ( 1175) TMLVS------CKKLTEIKFSDSFFQA--VPFVA-SLPNFISLKILNLEGQQFPDEETSE
//
0 ( 867) ALHELIDRMNVLEQLTALMLPWGCDVQGSLSSLLKHLEEVPQLVKLGLKNWRLTDTEIRI
1 ( 867) ALHELIDRMNVLEQLTALMLPWGCDVQGSLSSLLKHLEEVPQLVKLGLKNWRLTDTEIRI
2 ( 202) ALHELIDRMNVLEQLTALMLPWGCDVQGSLSSLLKHLEEVPQLVKLGLKNWRLTDTEIRI
3 ( 1064) KFAYILGSLSNLEEL---ILPTGDGIYRVAKLIIQQCQQLHCLRVLSFFK-TLNDDSVVE
4 ( 1226) KFAYILGSLSNLEEL---ILPTGDGIYRVAKLIIQQCQQLHCLRVLSFFK-TLNDDSVVE
//
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1 ( 927) LGAFFGKNPLKNFQQLNLAGN-RVSSDGWLAFMGVFENLKQLVFFDFS---TKEFLPDPA
2 ( 262) LGAFFGKNPLKNFQQLNLAGN-RVSSDGWLAFMGVFENLKQLVFFDFS---TKEFLPDPA
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4 ( 1282) IAKVAISGGFQKLENLKLSINHKITEEGYRNFFQALDNMPNLQELDISRHFTECIKAQAT
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1 ( 983) LVRKLSQVLSKLTFLQEARLVGWQFDDDDLSVITGAFKLVTA
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4 ( 1342) TVKSLSQCVLRLPRL...........................
//
