# 0 Query: pF1KA1313, 1101 aa
# 1 CCDS43976.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1101 aa)
# 2 CCDS48141.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1100 aa)
# 3 CCDS55462.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1148 aa)
# 4 CCDS75193.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1134 aa)
# 5 CCDS34064.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1135 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 7206 100.0 1 1101
2 0 7189 99.9 1 1100
3 0 7008 95.9 1 1133
4 3e-117 2212 37.0 13 1070
5 3.4e-117 2209 36.9 13 1071
//
0 ( 1) MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
1 ( 1) MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
2 ( 1) MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
3 ( 1) MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
4 ( 13) .......VFALLIVSFNHDVLGKNLKYRIYEEQRVGSVIARLSEDVADVLLKLPNPSTVR
5 ( 13) .......VFALLIVSFNHDVLGKNLKYRIYEEQRVGSVIARLSEDVADVLLKLPNPSTVR
//
0 ( 61) FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMS---SSMEICVIKV
1 ( 61) FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMS---SSMEICVIKV
2 ( 61) FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMS---SSMEICVIKV
3 ( 61) FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMS---SSMEICVIKV
4 ( 66) FRAMQRGNSPLLVVNEDNGEISIGATIDREQLCQKNLNCSIEFDVITLPTEHLQLFHIEV
5 ( 66) FRAMQRGNSPLLVVNEDNGEISIGATIDREQLCQKNLNCSIEFDVITLPTEHLQLFHIEV
//
0 ( 118) EIKDLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLE
1 ( 118) EIKDLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLE
2 ( 118) EIKDLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLE
3 ( 118) EIKDLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLE
4 ( 126) EVLDINDNSPQFSRSLIPIEISESAAVGTRIPLDSAFDPDVGENSLHTYSLSANDFFNIE
5 ( 126) EVLDINDNSPQFSRSLIPIEISESAAVGTRIPLDSAFDPDVGENSLHTYSLSANDFFNIE
//
0 ( 178) IKTRGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPV
1 ( 178) IKTRGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPV
2 ( 178) IKTRGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPV
3 ( 178) IKTRGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPV
4 ( 186) VRTRTDGAKYAELIVVRELDRELKSSYELQLTASDMGVPQRSGSSILKISISDSNDNSPA
5 ( 186) VRTRTDGAKYAELIVVRELDRELKSSYELQLTASDMGVPQRSGSSILKISISDSNDNSPA
//
0 ( 238) FSESTYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGL
1 ( 238) FSESTYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGL
2 ( 238) FSESTYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGL
3 ( 238) FSESTYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGL
4 ( 246) FEQQSYIIQLLENSPVGTLLLDLNATDPDEGANGKIVYSFSSHVSPKIMETFKIDSERGH
5 ( 246) FEQQSYIIQLLENSPVGTLLLDLNATDPDEGANGKIVYSFSSHVSPKIMETFKIDSERGH
//
0 ( 298) VTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVIN--LLSVNSEL
1 ( 298) VTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVIN--LLSVNSEL
2 ( 298) VTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVIN--LLSVNSEL
3 ( 298) VTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVIN--LLSVNSEL
4 ( 306) LTLFKQVDYEITKSYEIDVQAQDLGPNSIPAHCKIIIKVVDVNDNKPEININLMSPGKEE
5 ( 306) LTLFKQVDYEITKSYEIDVQAQDLGPNSIPAHCKIIIKVVDVNDNKPEININLMSPGKEE
//
0 ( 356) VE-VSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQE-YESFSTILVDGRLDR
1 ( 356) VE-VSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQE-YESFSTILVDGRLDR
2 ( 356) VE-VSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQE-YESFSTILVDGRLDR
3 ( 356) VE-VSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQE-YESFSTILVDGRLDR
4 ( 366) ISYIFEGDPIDTFVALVRVQDKDSGLNGEIVCKLHGHGHFKLQKTYENNYLILTNATLDR
5 ( 366) ISYIFEGDPIDTFVALVRVQDKDSGLNGEIVCKLHGHGHFKLQKTYENNYLILTNATLDR
//
0 ( 414) EQHDQYNLTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLL
1 ( 414) EQHDQYNLTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLL
2 ( 414) EQHDQYNLTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLL
3 ( 414) EQHDQYNLTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLL
4 ( 426) EKRSEYSLTVIAEDRGTPSLSTVKHFTVQINDINDNPPHFQRSRYEFVISENNSPGAYIT
5 ( 426) EKRSEYSLTVIAEDRGTPSLSTVKHFTVQINDINDNPPHFQRSRYEFVISENNSPGAYIT
//
0 ( 474) SVSARDPDLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKV
1 ( 474) SVSARDPDLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKV
2 ( 474) SVSARDPDLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKV
3 ( 474) SVSARDPDLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKV
4 ( 486) TVTATDPDLGENGQVTYTILESFILGSSITTYVTIDPSNGAIYALRIFDHEEVSQITFVV
5 ( 486) TVTATDPDLGENGQVTYTILESFILGSSITTYVTIDPSNGAIYALRIFDHEEVSQITFVV
//
0 ( 534) LAKDGGLPS-LQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKA
1 ( 534) LAKDGGLPS-LQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKA
2 ( 534) LAKDGGLPS-LQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKA
3 ( 534) LAKDGGLPS-LQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKA
4 ( 546) EARDGGSPKQLVSNTTVVLTIIDENDNVPVVIGPALRNNTAEITIPKGAESGFHVTRIRA
5 ( 546) EARDGGSPKQLVSNTTVVLTIIDENDNVPVVIGPALRNNTAEITIPKGAESGFHVTRIRA
//
0 ( 593) EDYDEGENGRVTYDMTEGDR-GFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKTS
1 ( 593) EDYDEGENGRVTYDMTEGDR-GFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKTS
2 ( 593) EDYDEGENGRVTYDMTEGDR-GFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKTS
3 ( 593) EDYDEGENGRVTYDMTEGDR-GFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKTS
4 ( 606) IDRDSGVNAELSCAIVAGNEENIFIIDPRSCDIHTNVSMDSVPYTEWELSVIIQDKGNPQ
5 ( 606) IDRDSGVNAELSCAIVAGNEENIFIIDPRSCDIHTNVSMDSVPYTEWELSVIIQDKGNPQ
//
0 ( 652) LSASALV--LIY------LSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKC
1 ( 652) LSASALV--LIY------LSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKC
2 ( 652) LSASALV--LIY------LSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKC
3 ( 652) LSASALV--LIY------LSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKC
4 ( 666) LHTKVLLKCMIFEYAESVTSTAM-TSVSQASLDVSMIIIISLGAICAVLLVIMVLFATRC
5 ( 666) LHTKVLLKCMIFEYAESVTSTAM-TSVSQASLDVSMIIIISLGAICAVLLVIMVLFATRC
//
0 ( 704) KRDNKEIRTYNC-----------------------------------------------R
1 ( 704) KRDNKEIRTYNC-----------------------------------------------R
2 ( 704) KRDNKEIRTYNC-----------------------------------------------R
3 ( 704) KRDNKEIRTYNCSNCLTITCLLGCFIKGQNSKCLHCISVSPISEEQDKKTEEKVSLRGKR
4 ( 725) NREKKDTRSYNC-----------------------------------------------R
5 ( 725) NREKKDTRSYNC-----------------------------------------------R
//
0 ( 717) IAEYSYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPL
1 ( 717) IAEYSYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPL
2 ( 717) IAEYSYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPL
3 ( 764) IAEYSYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPL
4 ( 738) VAESTYQHHPKRPSRQ-IHKGDITLVPT-INGTLPIRSHHRSSPSSS-PTLERGQ----M
5 ( 738) VAESTYQHHPKRPSRQ-IHKGDITLVPT-INGTLPIRSHHRSSPSSS-PTLERGQ----M
//
0 ( 777) GCRRSESTFLNVENQNTRNTSANHI--------YHHSFNSQGP--QQPDLIINGVPLPET
1 ( 777) GCRRSESTFLNVENQNTRNTSANHI--------YHHSFNSQGP--QQPDLIINGVPLPET
2 ( 777) GCRRSESTFLNVENQNTRNTSANHI--------YHHSFNSQGP--QQPDLIINGVPLPET
3 ( 824) GCRRSESTFLNVENQNTRNTSANHI--------YHHSFNSQGP--QQPDLIINGVPLPET
4 ( 791) GSRQSHNSHQSLNSLVT--ISSNHVPENFSLELTHATPAVEVS--QLLSMLHQGQYQPRP
5 ( 791) GSRQSHNSHQSLNSLVT--ISSNHVPEN-----FSLELTHATPAVEQVSQLLSMLHQGQY
//
0 ( 827) ENY-SFDSNYVNSRAHLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVN
1 ( 827) ENY-SFDSNYVNSRAHLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVN
2 ( 827) ENY-SFDSNYVNSRAHLIKSS-TFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVN
3 ( 874) ENY-SFDSNYVNSRAHLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVN
4 ( 847) ----SFRGNKY-SRSY----RYALQDMDKFSLKDSGRGDSEAGDSDYDLGR----DSPID
5 ( 844) QPRPSFRGNKY-SRSY----RYALQDMDKFSLKDSGRGDSEAGDSDYDLGR----DSPID
//
0 ( 886) DVLNTSVTSMGSQMPDHDQNEGFH-CREECRILGHSDRCWMPRNPMPIRSKSPEHVRNII
1 ( 886) DVLNTSVTSMGSQMPDHDQNEGFH-CREECRILGHSDRCWMPRNPMPIRSKSPEHVRNII
2 ( 885) DVLNTSVTSMGSQMPDHDQNEGFH-CREECRILGHSDRCWMPRNPMPIRSKSPEHVRNII
3 ( 933) DVLNTSVTSMGSQMPDHDQNEGFH-CREECRILGHSDRCWMPRNPMPIRSKSPEHVRNII
4 ( 894) RLLGEGFSDL--FLTDGRIPAAMRLCTEECRVLGHSDQCWMP--PLP--SPSSDYRSNMF
5 ( 895) RLLGEGFSDL--FLTDGRIPAAMRLCTEECRVLGHSDQCWMP--PLP--SPSSDYRSNMF
//
0 ( 945) ALSIE-----------ATAADVEAYDDCGPTKRTFATFGKDV-SDHPAEERPT---LKGK
1 ( 945) ALSIE-----------ATAADVEAYDDCGPTKRTFATFGKDV-SDHPAEERPT---LKGK
2 ( 944) ALSIE-----------ATAADVEAYDDCGPTKRTFATFGKDV-SDHPAEERPT---LKGK
3 ( 992) ALSIE-----------ATAADVEAYDDCGPTKRTFATFGKDV-SDHPAEERPT---LKGK
4 ( 948) IPGEEFPTQPQQQHPHQSLEDDAQPADSGEKKKSFSTFGKDSPNDEDTGDTSTSSLLSEM
5 ( 949) IPGEEFPTQPQQQHPHQSLEDDAQPADSGEKKKSFSTFGKDSPNDEDTGDTSTSSLLSEM
//
0 ( 990) RTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQ
1 ( 990) RTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQ
2 ( 989) RTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQ
3 ( 1037) RTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQ
4 ( 1008) SSVFQRLLPPSLDTY-----SECSEVDRSNSLERRKGPLPAK-TVGYPQGVAAWAASTHF
5 ( 1009) SSVFQRLLPPSLDTY-----SECSEVDRSNSLERRKGPLPAK-TVGYPQGVAAWAASTHF
//
0 ( 1050) YVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSPILKEGRNKESPGVKRLKDIVL
1 ( 1050) YVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSPILKEGRNKESPGVKRLKDIVL
2 ( 1049) YVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSPILKEGRNKESPGVKRLKDIVL
3 ( 1097) YVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSPILKEGR...............
4 ( 1062) QNPTTNCGP...........................................
5 ( 1063) QNPTTNCGP...........................................
//
