Multiple alignment for pF1KA1116
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KA1116, 1271 aa
#  1    CCDS5247.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6    (1271 aa)
#  2    CCDS75541.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6    (1349 aa)
#  3    CCDS69226.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6    (1337 aa)
#  4    CCDS54482.1 SCAF4 gene_id:57466|Hs108|chr21    (1132 aa)
#  5    CCDS33537.1 SCAF4 gene_id:57466|Hs108|chr21    (1147 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    2.6e-190    8658   99.9         1    1271
   2    2.7e-190    8658   99.9        79    1349
   3    5.8e-189    8606   98.3        46    1337
   4    8.2e-25     2365   40.4         1    1089
   5    8.3e-25     2482   41.4         1    1104

//
                                                                             
   0  (    1)    MEAVKTFNSE---------------------LYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKF
   1  (    1)    MEAVKTFNSE---------------------LYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKF
   2  (   79)    MEAVKTFNSE---------------------LYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKF
   3  (   46)    MEAVKTFNSEDCASTPACTDCFSSSMDTRSILYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKF
   4  (    1)    MDAVNAFNQE---------------------LFSLMDMKPPISRAKMILITKAAIKAIK-
   5  (    1)    MDAVNAFNQE---------------------LFSLMDMKPPISRAKMILITKAAIKAIKL

//
                                                                             
   0  (   40)    YKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNL
   1  (   40)    YKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNL
   2  (  118)    YKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNL
   3  (  106)    YKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNL
   4  (   39)    --------------CKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYL
   5  (   40)    YKHVVQIVEKFIKKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYL

//
                                                                             
   0  (  100)    YRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPG
   1  (  100)    YRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPG
   2  (  178)    YRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPG
   3  (  166)    YRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPG
   4  (   85)    YLCPSEDKSKIVRVLNLWQKNGVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPP
   5  (  100)    YLCPSEDKSKIVRVLNLWQKNGVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPP

//
                                                                             
   0  (  160)    TPVTPVTPANVVQGLPD--PWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKP
   1  (  160)    TPVTPVTPANVVQGLPD--PWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKP
   2  (  238)    TPVTPVTPANVVQGLPD--PWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKP
   3  (  226)    TPVTPVTPANVVQGLPD--PWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKP
   4  (  142)    PPVK-VSSEPPTQATPNSVPAVPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKP
   5  (  157)    PPVK-VSSEPPTQATPNSVPAVPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKP

//
                                                                             
   0  (  218)    QPSILQALDAGLVVQLQALTAQL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDS
   1  (  218)    QPSILQALDAGLVVQLQALTAQL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDS
   2  (  296)    QPSILQALDAGLVVQLQALTAQL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDS
   3  (  284)    QPSILQALDAGLVVQLQALTAQL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDS
   4  (  200)    QSP---ALDNAVMAQVQAITAQLKTTPTQPSEQKAAFPPPEQKTAFDKKLLDRFDYDDEP
   5  (  215)    QSP---ALDNAVMAQVQAITAQLKTTPTQPSEQKAAFPPPEQKTAFDKKLLDRFDYDDEP

//
                                                                             
   0  (  274)    EHSEEPKKE-------------IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ--
   1  (  274)    EHSEEPKKE-------------IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ--
   2  (  352)    EHSEEPKKE-------------IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ--
   3  (  340)    EHSEEPKKE-------------IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ--
   4  (  257)    EAVEESKKEDTTAVTTTAPAAAVPPAPTATVPAAAAPAAASPPPPQAPFGFPGDGMQQPA
   5  (  272)    EAVEESKKEDTTAVTTTAPAAAVPPAPTATVPAAAAPAAASPPPPQAPFGFPGDGMQQPA

//
                                                                             
   0  (  310)    ----QNLEHLRQQLLE-QQQP---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--
   1  (  310)    ----QNLEHLRQQLLE-QQQP---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--
   2  (  388)    ----QNLEHLRQQLLE-QQQP---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--
   3  (  376)    ----QNLEHLRQQLLE-QQQP---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--
   4  (  317)    YTQHQNMDQFQPRMMGIQQDPMHHQVPLPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPMAQPVIPPTPP
   5  (  332)    YTQHQNMDQFQPRMMGIQQDPMHHQVPLPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPMAQPVIPPTPP

//
                                                                             
   0  (  360)    VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRS
   1  (  360)    VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRS
   2  (  438)    VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRS
   3  (  426)    VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRS
   4  (  375)    VQQPFQASFQAQNEPLTQKPHQQEMEVEQPCIQEVKRHMSDNR-KSRSRSASRSPKRRRS
   5  (  390)    VQQPFQASFQAQNEPLTQKPHQQEMEVEQPCIQEVKRHMSDNR-KSRSRSASRSPKRRRS

//
                                                                             
   0  (  417)    RSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCS
   1  (  417)    RSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCS
   2  (  495)    RSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCS
   3  (  483)    RSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCS
   4  (  434)    RSGSRSRRSRHR-RSRSRSRDRRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQVKPETASVCS
   5  (  449)    RSGSRSRRSRHR-RSRSRSRDRRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQVKPETASVCS

//
                                                                             
   0  (  477)    TTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGS
   1  (  477)    TTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGS
   2  (  555)    TTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGS
   3  (  543)    TTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGS
   4  (  493)    TTLWVGQLDKRTTQQDVASLLEEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGN
   5  (  508)    TTLWVGQLDKRTTQQDVASLLEEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGN

//
                                                                             
   0  (  537)    YKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVN
   1  (  537)    YKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVN
   2  (  615)    YKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVN
   3  (  603)    YKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVN
   4  (  553)    YKVNQKSIKIAWALNKGIKADYKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLN
   5  (  568)    YKVNQKSIKIAWALNKGIKADYKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLN

//
                                                                             
   0  (  597)    TEWETVKSSEPVKETVQT-------TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-A
   1  (  597)    TEWETVKSSEPVKETVQT-------TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-A
   2  (  675)    TEWETVKSSEPVKETVQT-------TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-A
   3  (  663)    TEWETVKSSEPVKETVQT-------TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-A
   4  (  613)    PDWKGIPK-KPENEVAQNGGAETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQ
   5  (  628)    PDWKGIPK-KPENEVAQNGGAETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQ

//
                                                                             
   0  (  647)    PAVPTV-SLVPPAFPVSMPVPPPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPP
   1  (  647)    PAVPTV-SLVPPAFPVSMPVPPPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPP
   2  (  725)    PAVPTV-SLVPPAFPVSMPVPPPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPP
   3  (  713)    PAVPTV-SLVPPAFPVSMPVPPPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPP
   4  (  672)    PGPPVVGALQPPAFTPPLGIPPPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPPGFLPPGPPPP
   5  (  687)    PGPPVVGALQPPAFTPPLGIPPPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPPGFLPPGPPPP

//
                                                                             
   0  (  701)    VVPPPTIPP--VVPTSLVQPSLS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVF
   1  (  701)    VVPPPTIPP--VVPTSLVQPSLS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVF
   2  (  779)    VVPPPTIPP--VVPTSLVQPSLS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVF
   3  (  767)    VVPPPTIPP--VVPTSLVQPSLS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVF
   4  (  732)    ITPPVSIPPPHTPPISIPNSTIAGINEDTTKDLSIGN-----------------PIPTVV
   5  (  747)    ITPPVSIPPPHTPPISIPNSTIAGINEDTTKDLSIGN-----------------PIPTVV

//
                                                                             
   0  (  758)    NAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQR
   1  (  758)    NAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQR
   2  (  836)    NAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQR
   3  (  824)    NAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQR
   4  (  775)    SGARGNAESGDSV-KMYGSAVPPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQA
   5  (  790)    SGARGNAESGDSV-KMYGSAVPPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQA

//
                                                                 *           
   0  (  818)    PNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNI
   1  (  818)    PNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNI
   2  (  896)    PNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNI
   3  (  884)    PNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNI
   4  (  830)    PSTG----LLGARP-------GLIPLQRPP---------GMPPPHLQR----FPLMPPR-
   5  (  845)    PSTG----LLGARP-------GLIPLQRPP---------GMPPPHLQR----FPLMPPR-

//
                                                                             
   0  (  877)    PNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP
   1  (  877)    PNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP
   2  (  955)    PNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP
   3  (  943)    PNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP
   4  (  865)    PMPPHMMHRGPP--PG-PGGFAMPPPHGMKGPFPPHG-PFVRPGGMPGLG-GPGPGPGGP
   5  (  880)    PMPPHMMHRGPP--PG-PGGFAMPPPHGMKGPFPPHG-PFVRPGGMPGLG-GPGPGPGGP

//
                                                                             
   0  (  936)    ----GPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSV
   1  (  936)    ----GPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSV
   2  ( 1014)    ----GPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSV
   3  ( 1002)    ----GPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSV
   4  (  920)    EDRDGRQQPPQQPQQQPQPQAPQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ-FRNDNRQQF
   5  (  935)    EDRDGRQQPPQQPQQQPQPQAPQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ-FRNDNRQQF

//
                                                                             
   0  (  992)    DNVTNPEK--RIPLGN---DNIQQEGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVDV-RDVVGRPI
   1  (  992)    DNVTNPEK--RIPLGN---DNIQQEGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVDV-RDVVGRPI
   2  ( 1070)    DNVTNPEK--RIPLGN---DNIQQEGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVDV-RDVVGRPI
   3  ( 1058)    DNVTNPEK--RIPLGN---DNIQQEGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVDV-RDVVGRPI
   4  (  977)    NSGRDQERFGRRSFGNRVENDRERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--
   5  (  992)    NSGRDQERFGRRSFGNRVENDRERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--

//
                                                                             
   0  ( 1044)    DPREGPGRP-PLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFD
   1  ( 1044)    DPREGPGRP-PLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFD
   2  ( 1122)    DPREGPGRP-PLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFD
   3  ( 1110)    DPREGPGRP-PLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFD
   4  ( 1035)    NRRSSGHRDRERDSRDRESR-----REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVEPPISQVGNVD
   5  ( 1050)    NRRSSGHRDRERDSRDRESR-----REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVEPPISQVGNVD

//
                                                                             
   0  ( 1101)    EREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQR
   1  ( 1101)    EREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQR
   2  ( 1179)    EREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQR
   3  ( 1167)    EREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQR
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

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