# 0 Query: pF1KSDA0293, 1486 aa
# 1 CCDS41837.1 CUX2 gene_id:23316|Hs108|chr12 (1486 aa)
# 2 CCDS56498.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7 (1516 aa)
# 3 CCDS5720.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7 (678 aa)
# 4 CCDS47672.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7 (676 aa)
# 5 CCDS5721.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7 (1505 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 9830 99.9 1 1486
2 2.6e-28 3724 45.6 1 1516
3 2.9e-27 1162 49.5 1 399
4 3.1e-27 1161 49.5 1 397
5 8e-24 3449 44.7 48 1505
//
0 ( 1) MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
1 ( 1) MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
2 ( 1) MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDL
3 ( 1) MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDL
4 ( 1) MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDL
5 ( 48) ..........................................................DL
//
0 ( 61) REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQP-P
1 ( 61) REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQP-P
2 ( 61) RKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRLH
3 ( 61) RKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRLH
4 ( 61) RKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRLH
5 ( 50) RKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRLH
//
0 ( 120) SFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGK--ALLTETL
1 ( 120) SFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGK--ALLTETL
2 ( 121) DIETENQKLRE--TLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQK
3 ( 121) DIETENQKLRE--TLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQK
4 ( 121) DIETENQKLRE--TLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQK
5 ( 110) DIETENQKLRE--TLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQK
//
0 ( 178) LQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKAD
1 ( 178) LQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKAD
2 ( 179) LQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKAD
3 ( 179) LQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKAD
4 ( 179) LQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKAD
5 ( 168) LQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKAD
//
0 ( 238) EVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGP
1 ( 238) EVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGP
2 ( 239) EIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVL-TRS
3 ( 239) EIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVL-TRS
4 ( 239) EIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPD---VAIEVLTRS
5 ( 228) EIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVLTRSS
//
0 ( 298) RLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQ
1 ( 298) RLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQ
2 ( 298) SLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLK
3 ( 298) SLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLK
4 ( 296) SLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLK
5 ( 288) -LEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLK
//
0 ( 358) AQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLE-KPSLL
1 ( 358) AQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLE-KPSLL
2 ( 358) GQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEKNRSLQSENAALRISNSDL
3 ( 358) GQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEK..................
4 ( 356) GQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEK..................
5 ( 347) GQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEKNRSLQSENAALRISNSDL
//
0 ( 417) ASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPS-LGPDGTRT
1 ( 417) ASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPS-LGPDGTRT
2 ( 418) SGSARRKGKDQPESRRPGSLPA-PPPSQLPRNPGEQA--SNTNGTHQFSPAGLSQDFFSS
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 407) SGSARRKGKDQPESRRPGSLPA-PPPSQLPRNPGEQA--SNTNGTHQFSPAGLSQDFFSS
//
0 ( 476) FSLSP-FPSLASG--------ERLMMPPAAFKG--EAGGL-LVFPPAFYGAKPPTAPATP
1 ( 476) FSLSP-FPSLASG--------ERLMMPPAAFKG--EAGGL-LVFPPAFYGAKPPTAPATP
2 ( 475) SLASPSLPLASTGKFALNSLLQRQLMQSFYSKAMQEAGSTSMIFSTGPYSTNSISSQSPL
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 464) SLASPSLPLASTGKFALNSLLQRQLMQSFYSKAMQEAGSTSMIFSTGPYSTNSISSQSPL
//
0 ( 524) APGPEPLG-GPEPADGGGGGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQRVFGHYVLG
1 ( 524) APGPEPLG-GPEPADGGGGGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQRVFGHYVLG
2 ( 535) QQSPDVNGMAPSPSQSESAGSVSEG---EEMDTAEIARQVKEQLIKHNIGQRIFGHYVLG
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 524) QQSPDVNGMAPSPSQSESAGSVSEG---EEMDTAEIARQVKEQLIKHNIGQRIFGHYVLG
//
0 ( 583) LSQGSVSEILARPKPWRKLTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQR---------
1 ( 583) LSQGSVSEILARPKPWRKLTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQR---------
2 ( 592) LSQGSVSEILARPKPWNKLTVRGKEPFHKMKQFLSDEQNILALRSIQGRQRENPGQSLNR
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 581) LSQGSVSEILARPKPWNKLTVRGKEPFHKMKQFLSDEQNILALRSIQGRQRENPGQSLNR
//
0 ( 634) -------------GSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKKEIESQKGGEPKTSVAPLSIA
1 ( 634) -------------GSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKKEIESQKGGEPKTSVAPLSIA
2 ( 652) LFQEVPKRRNGSEGNITTRIRASETGSDEAIKSILEQAKRELQVQKTAEP----AQPSSA
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 641) LFQEVPKRRNGSEGNITTRIRASETGSDEAIKSILEQAKRELQVQKTAEP----AQPSSA
//
0 ( 681) NGTTPASTSEDAIKSILEQARREMQAQQQAL---LEME---------VAPRGRSVPPSPP
1 ( 681) NGTTPASTSEDAIKSILEQARREMQAQQQAL---LEME---------VAPRGRSVPPSPP
2 ( 708) SGS---GNSDDAIRSILQQARREMEAQQAALDPALKQAPLSQSDITILTPKLLSTSPMPT
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 697) SGS---GNSDDAIRSILQQARREMEAQQAALDPALKQAPLSQSDITILTPKLLSTSPMPT
//
0 ( 729) --ERPSLA-------TASQNGAPALVKQEEGSGGPAQAP-LPVLSPAAFVQSIIRKVKSE
1 ( 729) --ERPSLA-------TASQNGAPALVKQEEGSGGPAQAP-LPVLSPAAFVQSIIRKVKSE
2 ( 765) VSSYPPLAISLKKPSAAPEAGASALPNPPALKKEAQDAPGLDPQGAADCAQGVLRQVKNE
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 754) VSSYPPLAISLKKPSAAPEAGASALPNPPALKKEAQDAPGLDPQGAADCAQGVLRQVKNE
//
0 ( 779) IGDAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSSGY---SGQPNGRAWPRGDEAPV--P
1 ( 779) IGDAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSSGY---SGQPNGRAWPRGDEAPV--P
2 ( 825) VGRSGAWKDHWWSAVQPERRNAASSEEAKAEETGGGKEKGSGGSGGGSQPRAERSQLQGP
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 814) VGRSGAWKDHWWSAVQPERRNAASSEEAKAEETGGGKEKGSGGSGGGSQPRAERSQLQGP
//
0 ( 834) PEDE---AAAGAEDEPPRTGELKAEGAT---AEAGARLPYYPAYVP--RTLKPTVPPLTP
1 ( 834) PEDE---AAAGAEDEPPRTGELKAEGAT---AEAGARLPYYPAYVP--RTLKPTVPPLTP
2 ( 885) SSSEYWKEWPSAESPYSQSSELSLTGASRSETPQNSPLPSSPI-VPMSKPTKPSVPPLTP
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 874) SSSEYWKEWPSAESPYSQSSELSLTGASRSETPQNSPLPSSPI-VPMSKPTKPSVPPLTP
//
0 ( 886) EQYELYMYREVDTLELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLT
1 ( 886) EQYELYMYREVDTLELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLT
2 ( 944) EQYEVYMYQEVDTIELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLT
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 933) EQYEVYMYQEVDTIELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLT
//
0 ( 946) QKGREPFIRMQLWLSDQLGQAV----GQQPG------ASQASPTE---------PRSSPS
1 ( 946) QKGREPFIRMQLWLSDQLGQAV----GQQPG------ASQASPTE---------PRSSPS
2 ( 1004) QKGREPFIRMQLWLNGELGQGVLPVQGQQQGPVLHSVTSLQDPLQQGCVSSESTPKTSAS
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 993) QKGREPFIRMQLWLNGELGQGVLPVQGQQQGPVLHSVTSLQDPLQQGCVSSESTPKTSAS
//
0 ( 987) PPPSPTEPEKSSQEPLSLS---------LESSKENQQPEGR----SSSSLSGKMYSGSQA
1 ( 987) PPPSPTEPEKSSQEPLSLS---------LESSKENQQPEGR----SSSSLSGKMYSGSQA
2 ( 1064) CSPAPESPMSSSESVKSLTELVQQPCPPIEASKDSKPPEPSDPPASDSQPTTPLPLSGHS
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 1053) CSPAPESPMSSSESVKSLTELVQQPCPPIEASKDSKPPEPSDPPASDSQPTTPLPLSGHS
//
0 ( 1034) PGGIQEIVAMSPELDTYSITKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKPWH
1 ( 1034) PGGIQEIVAMSPELDTYSITKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKPWH
2 ( 1124) ALSIQELVAMSPELDTYGITKRVKEVLTDNNLGQRLFGETILGLTQGSVSDLLARPKPWH
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 1113) ALSIQELVAMSPELDTYGITKRVKEVLTDNNLGQRLFGETILGLTQGSVSDLLARPKPWH
//
0 ( 1094) KLSLKGREPFVRMQLWLNDPHNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLISTGSDSESPAT---R
1 ( 1094) KLSLKGREPFVRMQLWLNDPHNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLISTGSDSESPAT---R
2 ( 1184) KLSLKGREPFVRMQLWLNDPNNVEKLMDMKRMEKKAYMKRRHSSVSDSQPCEPPSVGTEY
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 1173) KLSLKGREPFVRMQLWLNDPNNVEKLMDMKRMEKKAYMKRRHSSVSDSQPCEPPSVGTEY
//
0 ( 1151) SECPSPCLQPQDLSLLQIKKPRVVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTN
1 ( 1151) SECPSPCLQPQDLSLLQIKKPRVVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTN
2 ( 1244) SQGASP--QPQH----QLKKPRVVLAPEEKEALKRAYQQKPYPSPKTIEDLATQLNLKTS
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 1233) SQGASP--QPQH----QLKKPRVVLAPEEKEALKRAYQQKPYPSPKTIEDLATQLNLKTS
//
0 ( 1211) TVINWFHNYRSRMRREMLVEGTQDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQSPDSETEDQKP
1 ( 1211) TVINWFHNYRSRMRREMLVEGTQDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQSPDSETEDQKP
2 ( 1298) TVINWFHNYRSRIRRELFIEEIQ-------AGSQG--QAGASD-SPSARSGRAAPSSEGD
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 1287) TVINWFHNYRSRIRRELFIEEIQ-------AGSQG--QAGASD-SPSARSGRAAPSSEGD
//
0 ( 1271) TVKELELQEGPEENSTPLTTQDKAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGELDKGQGPPKE
1 ( 1271) TVKELELQEGPEENSTPLTTQDKAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGELDKGQGPPKE
2 ( 1348) SCDGVEATEGP---GSADTEEPKSQGEAEREEVPRPAEQ---TEPPPSGT----PGPDDA
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 1337) SCDGVEATEGP---GSADTEEPKSQGEAEREEVPRPAEQ---TEPPPSGT----PGPDDA
//
0 ( 1331) EHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPGGSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCS
1 ( 1331) EHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPGGSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCS
2 ( 1398) RDDD---HEGGPVEGPGPL---------PS--PASATATAAPAAPEDAATSAAAAPGE--
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 1387) RDDD---HEGGPVEGPGPL---------PS--PASATATAAPAAPEDAATSAAAAPGE--
//
0 ( 1391) LEVSLNSPSAASSPGLMMSVSPVPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTADMAGALHPSAK
1 ( 1391) LEVSLNSPSAASSPGLMMSVSPVPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTADMAGALHPSAK
2 ( 1442) ------GPAAPSS-------APPPSNSS--SSSAPRRP-SSLQSLFGLPEAAGAR--DSR
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 1431) ------GPAAPSS-------APPPSNSS--SSSAP-RRPSSLQSLFGLPEAAGA--RDSR
//
*
0 ( 1451) VNPNLQRRHEKMANLNNIIYRLERAANREEALEWEF
1 ( 1451) VNPNLQRRHEKMANLNNIIYRVERAANREEALEWEF
2 ( 1484) DNP---LRKKKAANLNSIIHRLEKAASREEPIEWEF
3 ( -) ....................................
4 ( -) ....................................
5 ( 1473) DNP---LRKKKAANLNSIIHRLEKAASREEPIEWEF
//
