Multiple alignment for pF1KSDA0217
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KSDA0217, 738 aa
#  1    CCDS31131.1 LARP4B gene_id:23185|Hs108|chr10    (738 aa)
#  2    CCDS44879.2 LARP4 gene_id:113251|Hs108|chr12    (723 aa)
#  3    CCDS41782.1 LARP4 gene_id:113251|Hs108|chr12    (724 aa)
#  4    CCDS81690.1 LARP4 gene_id:113251|Hs108|chr12    (730 aa)
#  5    CCDS53789.1 LARP4 gene_id:113251|Hs108|chr12    (445 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    5.2e-179    4931  100.0         1     738
   2    7.1e-43     1489   38.4         8     723
   3    7.1e-43     1489   38.4         9     724
   4    5.8e-41     1481   38.6         9     730
   5    1.7e-37     1147   45.9         9     430

//
                                                                             
   0  (    1)    MTSDQDAKVVAEPQTQRVQEGKDSAHLMNGPISQTTSQTSSIPPLSQVPATKVSELNPNA
   1  (    1)    MTSDQDAKVVAEPQTQRVQEGKDSAHLMNGPISQTTSQTSSIPPLSQVPATKVSELNPNA
   2  (    8)    .................................................ASKGTGLNPNA
   3  (    9)    .................................................ASKGTGLNPNA
   4  (    9)    .................................................ASKGTGLNPNA
   5  (    9)    .................................................ASKGTGLNPNA

//
                                                                             
   0  (   61)    EVWG--APVLHLEASSAADGVSAAWEEVA---GHHADRGPQGSDAN-GDGDQGHENAALP
   1  (   61)    EVWG--APVLHLEASSAADGVSAAWEEVA---GHHADRGPQGSDAN-GDGDQGHENAALP
   2  (   19)    KVWQEIAPG-NTDATPVTHGTESSWHEIAATSGAHPEGNAELSEDI-CKEYEVMYSSSCE
   3  (   20)    KVWQEIAPG-NTDATPVTHGTESSWHEIAATSGAHPEGNAELSEDI-CKEYEVMYSSSCE
   4  (   20)    KVWQEIAPG-NTDATPVTHGTESSWHEIA---ATSGAH-PEVSVFNTGNAELSEDICKEY
   5  (   20)    KVWQEIAPG-NTDATPVTHGTESSWHEIAATSGAHPEGNAELSEDI-CKEYEVMYSSSCE

//
                                                                             
   0  (  115)    DPQESDPAD--MNALALGPSEY-DSL---PEN-----SETGGNESQPDSQEDPREVLKKT
   1  (  115)    DPQESDPAD--MNALALGPSEY-DSL---PEN-----SETGGNESQPDSQEDPREVLKKT
   2  (   77)    TTRNTTGIEESTDGMILGPE---DLS---YQI-----YDVSGESNSAVSTEDLKECLKKQ
   3  (   78)    TTRNTTGIEESTDGMILGPE---DLS---YQI-----YDVSGESNSAVSTEDLKECLKKQ
   4  (   75)    EVMYSSSCE--TTRNTTGIEESTDGMILGPEDLSYQIYDVSGESNSAVSTEDLKECLKKQ
   5  (   78)    TTRNTTGIEESTDGMILGPE---DLS---YQI-----YDVSGESNSAVSTEDLKECLKKQ

//
                                                                             
   0  (  164)    LEFCLSRENLASDMYLISQMDSDQYVPITTVANLDHIKKLSTDVDLIVEVLRSLPLVQVD
   1  (  164)    LEFCLSRENLASDMYLISQMDSDQYVPITTVANLDHIKKLSTDVDLIVEVLRSLPLVQVD
   2  (  126)    LEFCFSRENLSKDLYLISQMDSDQFIPIWTVANMEEIKKLTTDPDLILEVLRSSPMVQVD
   3  (  127)    LEFCFSRENLSKDLYLISQMDSDQFIPIWTVANMEEIKKLTTDPDLILEVLRSSPMVQVD
   4  (  133)    LEFCFSRENLSKDLYLISQMDSDQFIPIWTVANMEEIKKLTTDPDLILEVLRSSPMVQVD
   5  (  127)    LEFCFSRENLSKDLYLISQMDSDQFIPIWTVANMEEIKKLTTDPDLILEVLRSSPMVQVD

//
                                                                             
   0  (  224)    EKGEKVRPNQNRCIVILREISESTPVEEVEALFKGDNLPKFINCEFAYNDNWFITFETEA
   1  (  224)    EKGEKVRPNQNRCIVILREISESTPVEEVEALFKGDNLPKFINCEFAYNDNWFITFETEA
   2  (  186)    EKGEKVRPSHKRCIVILREIPETTPIEEVKGLFKSENCPKVISCEFAHNSNWYITFQSDT
   3  (  187)    EKGEKVRPSHKRCIVILREIPETTPIEEVKGLFKSENCPKVISCEFAHNSNWYITFQSDT
   4  (  193)    EKGEKVRPSHKRCIVILREIPETTPIEEVKGLFKSENCPKVISCEFAHNSNWYITFQSDT
   5  (  187)    EKGEKVRPSHKRCIVILREIPETTPIEEVKGLFKSENCPKVISCEFAHNSNWYITFQSDT

//
                                                                             
   0  (  284)    DAQQAYKYLREEVKTFQGKPIKARIKAKAIAINTFLPKNGFRPLDVSLYA-----QQRYA
   1  (  284)    DAQQAYKYLREEVKTFQGKPIKARIKAKAIAINTFLPKNGFRPLDVSLYA-----QQRYA
   2  (  246)    DAQQAFKYLREEVKTFQGKPIMARIKA----INTFFAKNGYRLMDSSIYSHPIQTQAQYA
   3  (  247)    DAQQAFKYLREEVKTFQGKPIMARIKA----INTFFAKNGYRLMDSSIYSHPIQTQAQYA
   4  (  253)    DAQQAFKYLREEVKTFQGKPIMARIKA----INTFFAKNGYRLMDSSIYSHPIQTQAQYA
   5  (  247)    DAQQAFKYLREEVKTFQGKPIMARIKA----INTFFAKNGYRLMDSSIYSHPIQTQAQYA

//
                                                                             
   0  (  339)    TSFYFPPMYSPQQQFPLYSLITPQTWSATHS-YLDPPLVTPFPNTGFINGFTSP-AFKPA
   1  (  339)    TSFYFPPMYSPQQQFPLYSLITPQTWSATHS-YLDPPLVTPFPNTGFINGFTSP-AFKPA
   2  (  302)    SPVFMQPVYNPHQQYSVYSIV-PQSWSPNPTPYFETPLA-PFPNGSFVNGFNSPGSYKTN
   3  (  303)    SPVFMQPVYNPHQQYSVYSIV-PQSWSPNPTPYFETPLA-PFPNGSFVNGFNSPGSYKTN
   4  (  309)    SPVFMQPVYNPHQQYSVYSIV-PQSWSPNPTPYFETPLA-PFPNGSFVNGFNSPGSYKTN
   5  (  303)    SPVFMQPVYNPHQQYSVYSIV-PQSWSPNPTPYFETPLA-PFPNGSFVNGFNSPGSYKTN

//
                                                                             
   0  (  397)    ASPLTSLRQYPPRSRNP---SKSHLRHAIP-SAERGPGLLESPSIFNFTADRLINGVRSP
   1  (  397)    ASPLTSLRQYPPRSRNP---SKSHLRHAIP-SAERGPGLLESPSIFNFTADRLINGVRSP
   2  (  360)    AAAMNMGRPFQKNRVKPQFRSSGGSEHSTEGSVSLGDGQLNRYSSRNFPAER-----HNP
   3  (  361)    AAAMNMGRPFQKNRVKPQFRSSGGSEHSTEGSVSLGDGQLNRYSSRNFPAER-----HNP
   4  (  367)    AAAMNMGRPFQKNRVKPQFRSSGGSEHSTEGSVSLGDGQLNRYSSRNFPAER-----HNP
   5  (  361)    AAAMNMGRPFQKNRVKPQFRSSGGSEHSTEGSVSLGDGQLNRYSSRNFPAERHNPTVTGH

//
                                                                             
   0  (  453)    QTRQAGQTRTRIQNPSAYAKREAGPGRVEPGSLESSPGLGRGRKNSFGYRKKREEKFTSS
   1  (  453)    QTRQAGQTRTRIQNPSAYAKREAGPGRVEPGSLESSPGLGRGRKNSFGYRKKREEKFTSS
   2  (  415)    -TVTGHQEQTYLQKETSTLQ------------VEQNGDYGRGRRTLFRGRRRREDDRISR
   3  (  416)    -TVTGHQEQTYLQKETSTLQ------------VEQNGDYGRGRRTLFRGRRRREDDRISR
   4  (  422)    -TVTGHQEQTYLQKETSTLQ------------VEQNGDYGRGRRTLFRGRRRREDDRISR
   5  (  421)    QEQTYLQKET..................................................

//
                                                                             
   0  (  513)    QTQSPTPPKPPSPSFELGLSSFPPLPGAAGNLKTEDLFENRLSSLIIGPSKER-----TL
   1  (  513)    QTQSPTPPKPPSPSFELGLSSFPPLPGAAGNLKTEDLFENRLSSLIIGPSKER-----TL
   2  (  462)    PHPSTAESKAPTPKFDLLASNFPPLPGSSSRMPGELVLENRMSDVVKGVYKEKDNEELTI
   3  (  463)    PHPSTAESKAPTPKFDLLASNFPPLPGSSSRMPGELVLENRMSDVVKGVYKEKDNEELTI
   4  (  469)    PHPSTAESKAPTPKFDLLASNFPPLPGSSSRMPGELVLENRMSDVVKGVYKEKDNEELTI
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  568)    SADASVNTLPVVVSREP---SVPASCAVSAT-YERSPSPAHLPDDPKVAEKQRETHSVDR
   1  (  568)    SADASVNTLPVVVSREP---SVPASCAVSAT-YERSPSPAHLPDDPKVAEKQRETHSVDR
   2  (  522)    SCPVPADEQTECTSAQQLNMSTSSPCAAELTALSTTQQEKDLIEDSSVQKDGLNQTTIPV
   3  (  523)    SCPVPADEQTECTSAQQLNMSTSSPCAAELTALSTTQQEKDLIEDSSVQKDGLNQTTIPV
   4  (  529)    SCPVPADEQTECTSAQQLNMSTSSPCAAELTALSTTQQEKDLIEDSSVQKDGLNQTTIPV
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  624)    LPS-------ALTATACKSVQVNGA-ATELRKP---SYAEICQRTSKEPPSSPLQPQKEQ
   1  (  624)    LPS-------ALTATACKSVQVNGA-ATELRKP---SYAEICQRTSKEPPSSPLQPQKEQ
   2  (  582)    SPPSTTKPSRASTASPCNN-NINAATAVALQEPRKLSYAEVCQKPPKEPSSVLVQPLREL
   3  (  583)    SPPSTTKPSRASTASPCNN-NINAATAVALQEPRKLSYAEVCQKPPKEPSSVLVQPLREL
   4  (  589)    SPPSTTKPSRASTASPCNN-NINAATAVALQEPRKLSYAEVCQKPPKEPSSVLVQPLREL
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  673)    KPNTVGCGKEEKKLA--EPAERYREPPALKST-----------P----GAPRDQRRPAGG
   1  (  673)    KPNTVGCGKEEKKLA--EPAERYREPPALKST-----------P----GAPRDQRRPAGG
   2  (  641)    RSNVVSPTKNEDNGAPENSVEKPHEKPEARASKDYSGFRGNIIPRGAAGKIREQRRQFSH
   3  (  642)    RSNVVSPTKNEDNGAPENSVEKPHEKPEARASKDYSGFRGNIIPRGAAGKIREQRRQFSH
   4  (  648)    RSNVVSPTKNEDNGAPENSVEKPHEKPEARASKDYSGFRGNIIPRGAAGKIREQRRQFSH
   5  (    -)    ............................................................

//
                                        
   0  (  716)    RPSPSAMGKRLSREQSTPPKSPQ
   1  (  716)    RPSPSAMGKRLSREQSTPPKSPQ
   2  (  701)    RAIPQGVTRRNGKEQYVPPRSPK
   3  (  702)    RAIPQGVTRRNGKEQYVPPRSPK
   4  (  708)    RAIPQGVTRRNGKEQYVPPRSPK
   5  (    -)    .......................

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