# 0 Query: pF1KE1055, 1580 aa
# 1 CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7 (1580 aa)
# 2 CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586 aa)
# 3 CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1065 aa)
# 4 CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1106 aa)
# 5 CCDS53807.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (978 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 10745 99.9 1 1580
2 4e-68 4118 48.0 51 1569
3 1.1e-32 1828 36.3 37 1061
4 1.7e-32 1870 35.8 20 1102
5 9.1e-32 1653 35.7 2 974
//
0 ( 1) MEAQSHSSTTTEKKKVENSIVKCSTRTDVSEKAVASSTTSNEDESPGQTYHRERRNAITM
1 ( 1) MEAQSHSSTTTEKKKVENSIVKCSTRTDVSEKAVASSTTSNEDESPGQTYHRERRNAITM
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 61) QPQNVQGLSKVSEEPSTSSDERASLIKKEIHGSLPHVAEPSVPYRGTVFAMDPRNGYMEP
1 ( 61) QPQNVQGLSKVSEEPSTSSDERASLIKKEIHGSLPHVAEPSVPYRGTVFAMDPRNGYMEP
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 121) HYHPPHLFPAFHPPVPIDARHHEGRYHYDPSPIPPLHMTSALSSSPTYPDLPFIRISPHR
1 ( 121) HYHPPHLFPAFHPPVPIDARHHEGRYHYDPSPIPPLHMTSALSSSPTYPDLPFIRISPHR
2 ( 51) ...PQHLLPPFHAPLPIDMRHQEGRYHYEPHSVHGVHGPPALSGSPVISDISLIRLSPH-
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
*
0 ( 181) NPAAASESPFSPPHPYINPYMD-YIRSLHSSPSLSMISATRGLSPTDA------------
1 ( 181) NPTAASESPFSPPHPYINPYMD-YIRSLHSSPSLSMISATRGLSPTDA------------
2 ( 107) -PAGPGESPFNAPHPYVNPHMEHYLRSVHSSPTLSMISAARGLSPADVAQEHLKERGLFG
3 ( -) ............................................................
4 ( 20) ........................................RPLPSQGA------------
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 228) -PHAG---VSPAEYYHQMALLTGQRSPYADIIPSAATAGTGAIHM-EYLHAMDSTRFSSP
1 ( 228) -PHAG---VSPAEYYHQMALLTGQRSPYADIIPSAATAGTGAIHM-EYLHAMDSTRFSSP
2 ( 166) LPAPG---TTPSDYYHQMTLVAGHPAPYGDLLMQSGGAAS-APHLHDYLNPVDVSRFSSP
3 ( -) ............................................................
4 ( 28) -PSVGTEGLSGPPFCHQANLMSGPHS-YG---PARETNSC-----------TEGPLFSSP
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 283) RLSARPSRKRTLSISPLSDHSFDLQTMIRTSPNSLVTILNNSRSSSSASGSYGHLSASAI
1 ( 283) RLSARPSRKRTLSISPLSDHSFDLQTMIRTSPNSLVTILNNSRSSSSASGSYGHLSASAI
2 ( 222) RVTPRLSRKRALSISPLSDASLDLQRMIRTSPNSLVAYINNSRSSSAASGSYGHLSAGAL
3 ( 37) ......TKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFIN-SRCTSPG-GSYGHLSIGTM
4 ( 72) RSAVKLTKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFIN-SRCTSPG-GSYGHLSIGTM
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 343) SPALSFTYSSAPVSLHMHQQILSRQQSLGSAFGHSPPL-IHPAPTFPTQRPIP--GIPTV
1 ( 343) SPALSFTYSSAPVSLHMHQQILSRQQSLGSAFGHSPPL-IHPAPTFPTQRPIP--GIPTV
2 ( 282) SPAFTFPHPINPVA---YQQILSQQRGLGSAFGHTPPL-IQPSPTFLAQQPMA--LTSIN
3 ( 89) SPSLGF-----PAQMN-HQK------------GPSPSFGVQPCGPHDSARG----G----
4 ( 130) SPSLGF-----PAQMN-HQK------------GPSPSFGVQPCGPHDSARG----G----
5 ( 2) ..................................SPSL-GFPAQMNHQKGPSPSFGVQPC
//
0 ( 400) LNPVQVSSG---P---SESSQNKPTSESAVSSTGDPMH-NKRSKIK--PDE-DLP-SPGA
1 ( 400) LNPVQVSSG---P---SESSQNKPTSESAVSSTGDPMH-NKRSKIK--PDE-DLP-SPGA
2 ( 336) ATPTQLSSS---SNCLSDTNQNKQSSESAVSSTVNPVAIHKRSKVKTEPEG-LRPASPLA
3 ( 123) MIPHPQSRG---P---FPTCQLKSELDMLVG----------KCREE--PLEGDMS-SPNS
4 ( 164) MIPHPQSRG---P---FPTCQLKSELDMLVG----------KCREE--PLEGDMS-SPNS
5 ( 27) -GPHDSARGGMIP---HPQSRG-PFPTCQLKSELD-ML-VGKCREE--PLEGDMS-SPNS
//
0 ( 449) --RGQ--QEQPEGTTL---------VKEEGDKDESKQEPEV-IYETNCHWEGCAREFDTQ
1 ( 449) --RGQ--QEQPEGTTL---------VKEEGDKDESKQEPEV-IYETNCHWEGCAREFDTQ
2 ( 392) LTQGQVSGHGSCGCALPLSQEQLADLKEDLDRDDCKQEAEVVIYETNCHWEDCTKEYDTQ
3 ( 164) --TGI--QDPLLGMLD---------GREDLEREE-KREPES-VYETDCRWDGCSQEFDSQ
4 ( 205) --TGI--QDPLLGMLD---------GREDLEREE-KREPES-VYETDCRWDGCSQEFDSQ
5 ( 77) --TGI--QDPLLGMLD---------GREDLEREE-KREPES-VYETDCRWDGCSQEFDSQ
//
0 ( 495) EQLVHHINNDHIHGEKKEFVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCT
1 ( 495) EQLVHHINNDHIHGEKKEFVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCT
2 ( 452) EQLVHHINNEHIHGEKKEFVCRWQACTREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCS
3 ( 209) EQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCR
4 ( 250) EQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCR
5 ( 122) EQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCR
//
0 ( 555) KAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKIPGC
1 ( 555) KAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKIPGC
2 ( 512) KAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYICKIPGC
3 ( 269) KSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGC
4 ( 310) KSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGC
5 ( 182) KSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGC
//
0 ( 615) TKRYTDPSSLRKHVKTVHGPEAHVTKKQRGDIHPRPPPPRDSGSHSQSRSPGRPTQGALG
1 ( 615) TKRYTDPSSLRKHVKTVHGPEAHVTKKQRGDIHPRPPPPRDSGSHSQSRSPGRPTQGALG
2 ( 572) TKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKKQRNDVHLRTPLLKENGDSEAGTEPGGP------
3 ( 329) TKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGD-GPLPRAPSISTVEPKREREGGPI-----
4 ( 370) TKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGD-GPLPRAPSISTVEPKREREGGPI-----
5 ( 242) TKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGD-GPLPRAPSISTVEPKREREGGPI-----
//
0 ( 675) EQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPISNYSN--SGLELPL
1 ( 675) EQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPISNYSN--SGLELPL
2 ( 626) ESTEASSTSQAVEDCLHVRAIKTESSGLCQSSPGAQSSCSSEPSPLGSAPNNDSGVEMPG
3 ( 383) -----------REES---RLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTG
4 ( 424) -----------REES---RLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTG
5 ( 296) -----------REES---RLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTG
//
0 ( 733) TDGGSIGDLSAIDETPI-MDSTISTATTALALQARRNPAGTKWMEHVKLERLKQVNGMFP
1 ( 733) TDGGSIGDLSAIDETPI-MDSTISTATTALALQARRNPAGTKWMEHVKLERLKQVNGMFP
2 ( 686) TGPGSLGDLTALDDTPPGADTSALAAPSAGGLQLRKHMTTMHRFEQLKKEKLKSLKDSCS
3 ( 429) NAGGSTEDLSSLDEGPC-I------AGTGLSTLRR--------LENLRLDQLHQ------
4 ( 470) NAGGSTEDLSSLDEGPC-I------AGTGLSTLRR--------LENLRLDQLHQ------
5 ( 342) NAGGSTEDLSSLDEGPC-I------AGTGLSTLRR--------LENLRLDQLHQ------
//
0 ( 792) RLNPILPPKAPAVSPLIGNGTQSNNTCSLGG--PMTLLPGR--SDLSGVDVTMLNMLN-R
1 ( 792) RLNPILPPKAPAVSPLIGNGTQSNNTCSLGG--PMTLLPGR--SDLSGVDVTMLNMLN-R
2 ( 746) WAGPTPHTRNTKLPPLPGSGSILENFSGSGGGGPAGLLPNPRLSELSASEVTMLSQLQER
3 ( 468) -LRPI--------------GTRGLKLPSLSH--TGTTVSRR--V---GPPVS----LE-R
4 ( 509) -LRPI--------------GTRGLKLPSLSH--TGTTVSRR-----VGPPVS----LE-R
5 ( 381) -LRPI--------------GTRGLKLPSLSH--TGTTVSRR--V---GPPVS----LE-R
//
0 ( 847) RDSSASTISSAYLSSRRSSGISPCFSSRRSSEASQ-AEGRPQNVSVADSYDPISTDASRR
1 ( 847) RDSSASTISSAYLSSRRSSGISPCFSSRRSSEASQ-AEGRPQNVSVADSYDPISTDASRR
2 ( 806) RDSSTSTVSSAYTVSRRSSGISPYFSSRRSSEASPLGAGRPHNASSADSYDPISTDASRR
3 ( 501) RSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP--------------------------FPPGSPPENGA
4 ( 542) RSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP--------------------------FPPGSPPENGA
5 ( 414) RSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP--------------------------FPPGSPPENGA
//
0 ( 906) SSEASQSDGLPSLLSLTPAQQYRLKAKYAAATGG-PPPTPLPNMERMSLKTRLALLGDAL
1 ( 906) SSEASQSDGLPSLLSLTPAQQYRLKAKYAAATGG-PPPTPLPNMERMSLKTRLALLGDAL
2 ( 866) SSEASQCSGGSGLLNLTPAQQYSLRAKYAAATGG-PPPTPLPGLERMSLRTRLALL-DA-
3 ( 535) SS-------LPGLM---PAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIG------------
4 ( 576) SS-------LPGLM---PAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIG------------
5 ( 448) SS-------LPGLM---PAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIG------------
//
0 ( 965) EPGVALP-----PVHAPRRCSDGGAHGYGRRHLQP---HDAPGHGV-RRASDPVRTGSEG
1 ( 965) EPGVALP-----PVHAPRRCSDGGAHGYGRRHLQP---HDAPGHGV-RRASDPVRTGSEG
2 ( 923) -PERTLPAGCPRPL-GPRRGSDGPTYGHGHAGAAPAFPHEAPGGGA-RRASDPVRR-PDA
3 ( 573) --GLPMP-----PWRS--------------RAEYP---GYNPNAGVTRRASDPAQAADRP
4 ( 614) --GLPMP-----PWRS--------------RAEYP---GYNPNAGVTRRASDPAQAADRP
5 ( 486) --GLPMP-----PWRS--------------RAEYP---GYNPNAGVTRRASDPAQAADRP
//
0 ( 1016) LALPRVPRFSSLSSC--NPPAMATSAEKRSLVLQNYTRPEGGQSRNFHSSPCPPSITENV
1 ( 1016) LALPRVPRFSSLSSC--NPPAMATSAEKRSLVLQNYTRPEGGQSRNFHSSPCPPSITENV
2 ( 979) LSLPRVQRFHSTHNV--NPGPLPPCADRRGLRLQSHPSTDGGLARGAYS-PRPPSISENV
3 ( 609) -APARVQRFKSLG-CVHTPPTVAGGG-------QNFD-PYLPTSVY---SPQPPSITENA
4 ( 650) -APARVQRFKSLG-CVHTPPTVAGGG-------QNFD-PYLPTSV---YSPQPPSITENA
5 ( 522) -APARVQRFKSLG-CVHTPPTVAGGG-------QNFD-PYLPTSVY---SPQPPSITENA
//
0 ( 1074) TLESLTM-------DAD---------ANLNDE-DF-LPDDVVQYLNSQNQAGYEQHFPSA
1 ( 1074) TLESLTM-------DAD---------ANLNDE-DF-LPDDVVQYLNSQNQAGYEQHFPSA
2 ( 1036) AMEAVAAGVDGAGPEAD---------LGLPED-DLVLPDDVVQYIKAHASGALDEGTGQV
3 ( 656) AMDARGL-------QEEPEVGTSMVGSGLNPYMDF-PPTDTLGYGGPEGAAAE----PYG
4 ( 697) AMDARGL-------QEEPEVGTSMVGSGLNPYMDF-PPTDTLGYGGPEGAAAE----PYG
5 ( 569) AMDARGL-------QEEPEVGTSMVGSGLNPYMDF-PPTDTLGYGGPEGAAAE----PYG
//
0 ( 1116) LPDDSKVPHGPGDFDAPGL--------PDSHAGQQFHALEQPCPEG-------SKTDLPI
1 ( 1116) LPDDSKVPHGPGDFDAPGL--------PDSHAGQQFHALEQPCPEG-------SKTDLPI
2 ( 1086) YPTESTGFSDNPRLPSPGLHGQRRMVAADSNVGPSAPML-GGCQLGFGAPSSLNKNNMPV
3 ( 704) ARGPGSLPLGPG---------------PPTNYGPN------PCPQQ-------ASYPDPT
4 ( 745) ARGPGSLPLGPG---------------PPTNYGPN------PCPQQ-------ASYPDPT
5 ( 617) ARGPGSLPLGPG---------------PPTNYGPN------PCPQQ-------ASYPDPT
//
0 ( 1161) Q--WNEVSSGSADLSSSKLKCGPRPAVPQTRAFGFCNGMVVHPQN--PLRSGPAGGYQTL
1 ( 1161) Q--WNEVSSGSADLSSSKLKCGPRPAVPQTRAFGFCNGMVVHPQN--PLRSGPAGGYQTL
2 ( 1145) Q--WNEVSSGTVDALASQVK--P-PPFPQ-------GNLAVVQQK--PAF-GQYPGYSPQ
3 ( 736) QETWGEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYG---QVQVKPEQGCPVGSDSTGLAPCL
4 ( 777) QETWGEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYG---QVQVKPEQGCPVGSDSTGLAPCL
5 ( 649) QETWGEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYG---QVQVKPEQGCPVGSDSTGLAPCL
//
0 ( 1217) GENSNPYGGPEHLMLHNSPGSGTSGNAFHEQPCKAPQYGNCLNRQPVA----PGALDG--
1 ( 1217) GENSNPYGGPEHLMLHNSPGSGTSGNAFHEQPCKAPQYGNCLNRQPVA----PGALDG--
2 ( 1190) GLQASP-GGLDSTQPHLQPRSGAPS-----QGIPRVNYMQQL-RQPVAGSQCPGMTTTMS
3 ( 793) --NAHPSEGPPH------PQPLFS---HYPQP-SPPQY---LQSGPYT----QPPPDY--
4 ( 834) --NAHPSEGPPH------PQPLFS---HYPQP-SPPQY---LQSGPYT----QPPPDY--
5 ( 706) --NAHPSEGPPH------PQPLFS---HYPQP-SPPQY---LQSGPYT----QPPPDY--
//
0 ( 1271) --ACGAGIQASKLKSTPMQGSGGQLNFGLPVAPNESAGSMV-NGMQNQ---DPVGQ--GY
1 ( 1271) --ACGAGIQASKLKSTPMQGSGGQLNFGLPVAPNESAGSMV-NGMQNQ---DPVGQ--GY
2 ( 1243) PHACYGQVHP-QLSPSTISGALNQFPQSCSNMPAKP-GHLG-HPQQTEVAPDPTTM--GN
3 ( 832) --LPSEPRPCLDFDS-PTH-STGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGRE---DAPAQEPSY
4 ( 873) --LPSEPRPCLDFDS-PTH-STGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGRE---DAPAQEPSY
5 ( 745) --LPSEPRPCLDFDS-PTH-STGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGRE---DAPAQEPSY
//
0 ( 1323) LAHQLLG--DSM------QHPGAGRPGQQMLGQISATSHINIYQGPE--SCLPGAHG---
1 ( 1323) LAHQLLG--DSM------QHPGAGRPGQQMLGQISATSHINIYQGPE--SCLPGAHG---
2 ( 1298) -RHRELGVPDSALAGVPPPHPVQSYP-QQSHHLAASMSQEGYHQVP---SLLPARQPGFM
3 ( 885) QSPKFLG--GSQ------VSPS------------RAKAPVNTY-GPGFGPNLPN-HK---
4 ( 926) QSPKFLG--GSQ------VSPS------------RAKAPVNTY-GPGFGPNLPN-HK---
5 ( 798) QSPKFLG--GSQ------VSPS------------RAKAPVNTY-GPGFGPNLPN-HK---
//
0 ( 1370) ------MGSQPSSLAVVRGYQPC--ASFGGSR--RQAMPRDSLALQSGQ----LSDTSQT
1 ( 1370) ------MGSQPSSLAVVRGYQPC--ASFGGSR--RQAMPRDSLALQSGQ----LSDTSQT
2 ( 1353) EPQTGPMGVATAGFGLVQPRPPLEPSPTGRHRGVRAVQQQLAYARATGHAMAAMPSSQET
3 ( 920) ------SGSYPTPSPCHENFVVG--ANRASHR--AAAPPR-------------LLPPLPT
4 ( 961) ------SGSYPTPSPCHENFVVG--ANRASHR--AAAPPR-------------LLPPLPT
5 ( 833) ------SGSYPTPSPCHENFVVG--ANRASHR--AAAPPR-------------LLPPLPT
//
0 ( 1416) CRV--NGIKMEMKG---QPHPL-CSNLQNYSGQFYDQTVGFSQQD---TKAGSFSI----
1 ( 1416) CRV--NGIKMEMKG---QPHPL-CSNLQNYSGQFYDQTVGFSQQD---TKAGSFSI----
2 ( 1413) AEAVPKGAMGNMGSVPPQPPPQDAGGAPDHSMLYYYGQIHMYEQDGGLENLGSCQVMRSQ
3 ( 957) CY---GPLKV---G---GTNPS-CGHPE----------VGR-------------------
4 ( 998) CY---GPLKV---G---GTNPS-CGHPE----------VGR-------------------
5 ( 870) CY---GPLKV---G---GTNPS-CGHPE----------VGR-------------------
//
0 ( 1463) --SDASCLLQGTSAKNSELLSPGANQVTSTVDSLDSHDLEGVQIDFDAIIDDGDHSSLMS
1 ( 1463) --SDASCLLQGTSAKNSELLSPGANQVTSTVDSLDSHDLEGVQIDFDAIIDDGDHSSLMS
2 ( 1473) PPQPQAC---QDSIQPQPLPSPGVNQVSSTVD---SQLLEAPQIDFDAIMDDGDHSSLFS
3 ( 978) --------LGGGPA----LYPPPEGQVCNPLDSLD---LDNTQLDFVAILDEPQ------
4 ( 1019) --------LGGGPA----LYPPPEGQVCNPLDSLD---LDNTQLDFVAILDEPQ------
5 ( 891) --------LGGGPA----LYPPPEGQVCNPLDSLD---LDNTQLDFVAILDEPQ------
//
0 ( 1521) GALSPSIIQNLSHSSSRLTTPRASLPFPALSMSTTNMAIGDMSSLLTSLAEESKFLAVMQ
1 ( 1521) GALSPSIIQNLSHSSSRLTTPRASLPFPALSMSTTNMAIGDMSSLLTSLAEESKFLAVMQ
2 ( 1527) GALSPSLLHSLSQNSSRLTTPRNSLTLPSIPAGISNMAVGDMS.................
3 ( 1017) -GLSPPPSHDQRGSSGH--TPPPSGP-P-------NMAVGNMSVLLRSLPGETEFL....
4 ( 1058) -GLSPPPSHDQRGSSGH--TPPPSGP-P-------NMAVGNMSVLLRSLPGETEFL....
5 ( 930) -GLSPPPSHDQRGSSGH--TPPPSGP-P-------NMAVGNMSVLLRSLPGETEFL....
//
0 ( -)
1 ( -)
2 ( -)
3 ( -)
4 ( -)
5 ( -)
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