Multiple alignment for pF1KE0072
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE0072, 1340 aa
#  1    CCDS76066.1 PCDH11Y gene_id:83259|Hs108|chrY    (1340 aa)
#  2    CCDS55461.1 PCDH11X gene_id:27328|Hs108|chrX    (1310 aa)
#  3    CCDS14777.1 PCDH11Y gene_id:83259|Hs108|chrY    (1048 aa)
#  4    CCDS14462.1 PCDH11X gene_id:27328|Hs108|chrX    (1337 aa)
#  5    CCDS55460.1 PCDH11X gene_id:27328|Hs108|chrX    (1329 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0           8774  100.0         1    1340
   2    0           8378   98.0         3    1310
   3    0           6751   99.7         1    1047
   4    0           8314   96.0         3    1337
   5    0           8257   95.6         3    1329

//
                                                                             
   0  (    1)    MFRVGFLIISSSSSLSPLLLVSVVRVNTTNCHKCLLSGTYIFAVLLVCVVFHSGAQEKNY
   1  (    1)    MFRVGFLIISSSSSLSPLLLVSVVRVNTTNCHKCLLSGTYIFAVLLVCVVFHSGAQEKNY
   2  (    3)    ..................................LLSGTYIFAVLLACVVFHSGAQEKNY
   3  (    1)    MFRVGFLIISSSSSLSPLLLVSVVRVNTTNCHKCLLSGTYIFAVLLVCVVFHSGAQEKNY
   4  (    3)    ..................................LLSGTYIFAVLLACVVFHSGAQEKNY
   5  (    3)    ..................................LLSGTYIFAVLLACVVFHSGAQEKNY

//
                                                                             
   0  (   61)    TIREEIPENVLIGNLLKDLNLSLIPNKSLTTTMQFKLVYKTGDVPLIRIEEDTGEIFTTG
   1  (   61)    TIREEIPENVLIGNLLKDLNLSLIPNKSLTTTMQFKLVYKTGDVPLIRIEEDTGEIFTTG
   2  (   29)    TIREEMPENVLIGDLLKDLNLSLIPNKSLTTAMQFKLVYKTGDVPLIRIEEDTGEIFTTG
   3  (   61)    TIREEIPENVLIGNLLKDLNLSLIPNKSLTTTMQFKLVYKTGDVPLIRIEEDTGEIFTTG
   4  (   29)    TIREEMPENVLIGDLLKDLNLSLIPNKSLTTAMQFKLVYKTGDVPLIRIEEDTGEIFTTG
   5  (   29)    TIREEMPENVLIGDLLKDLNLSLIPNKSLTTAMQFKLVYKTGDVPLIRIEEDTGEIFTTG

//
                                                                             
   0  (  121)    ARIDREKLCAGIPRDEHCFYEVEVAILPDEIFRLVKIRFLIEDINDNAPLFPATVINISI
   1  (  121)    ARIDREKLCAGIPRDEHCFYEVEVAILPDEIFRLVKIRFLIEDINDNAPLFPATVINISI
   2  (   89)    ARIDREKLCAGIPRDEHCFYEVEVAILPDEIFRLVKIRFLIEDINDNAPLFPATVINISI
   3  (  121)    ARIDREKLCAGIPRDEHCFYEVEVAILPDEIFRLVKIRFLIEDINDNAPLFPATVINISI
   4  (   89)    ARIDREKLCAGIPRDEHCFYEVEVAILPDEIFRLVKIRFLIEDINDNAPLFPATVINISI
   5  (   89)    ARIDREKLCAGIPRDEHCFYEVEVAILPDEIFRLVKIRFLIEDINDNAPLFPATVINISI

//
                                                                             
   0  (  181)    PENSAINSKYTLPAAVDPDVGINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELD
   1  (  181)    PENSAINSKYTLPAAVDPDVGINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELD
   2  (  149)    PENSAINSKYTLPAAVDPDVGINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELD
   3  (  181)    PENSAINSKYTLPAAVDPDVGINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELD
   4  (  149)    PENSAINSKYTLPAAVDPDVGINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELD
   5  (  149)    PENSAINSKYTLPAAVDPDVGINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELD

//
                                                                             
   0  (  241)    REEKDTYVMKVKVEDGGFPQRSSTAILQVSVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSV
   1  (  241)    REEKDTYVMKVKVEDGGFPQRSSTAILQVSVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSV
   2  (  209)    REEKDTYVMKVKVEDGGFPQRSSTAILQVSVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSV
   3  (  241)    REEKDTYVMKVKVEDGGFPQRSSTAILQVSVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSV
   4  (  209)    REEKDTYVMKVKVEDGGFPQRSSTAILQVSVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSV
   5  (  209)    REEKDTYVMKVKVEDGGFPQRSSTAILQVSVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSV

//
                                                                             
   0  (  301)    TQLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIARRLFHLNATTGLITIKEPLDREETPNHKLLVL
   1  (  301)    TQLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIARRLFHLNATTGLITIKEPLDREETPNHKLLVL
   2  (  269)    TQLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIARRLFHLNATTGLITIKEPLDREETPNHKLLVL
   3  (  301)    TQLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIARRLFHLNATTGLITIKEPLDREETPNHKLLVL
   4  (  269)    TQLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIARRLFHLNATTGLITIKEPLDREETPNHKLLVL
   5  (  269)    TQLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIARRLFHLNATTGLITIKEPLDREETPNHKLLVL

//
                                                                             
   0  (  361)    ASDGGLMPARAMVLVNVTDVNDNVPSIDIRYIVNPVNDTVVLSENIPLNTKIALITVTDK
   1  (  361)    ASDGGLMPARAMVLVNVTDVNDNVPSIDIRYIVNPVNDTVVLSENIPLNTKIALITVTDK
   2  (  329)    ASDGGLMPARAMVLVNVTDVNDNVPSIDIRYIVNPVNDTVVLSENIPLNTKIALITVTDK
   3  (  361)    ASDGGLMPARAMVLVNVTDVNDNVPSIDIRYIVNPVNDTVVLSENIPLNTKIALITVTDK
   4  (  329)    ASDGGLMPARAMVLVNVTDVNDNVPSIDIRYIVNPVNDTVVLSENIPLNTKIALITVTDK
   5  (  329)    ASDGGLMPARAMVLVNVTDVNDNVPSIDIRYIVNPVNDTVVLSENIPLNTKIALITVTDK

//
                                                                             
   0  (  421)    DADHNGRVTCFTDHEIPFRLRPVFSNQFLLENAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQ
   1  (  421)    DADHNGRVTCFTDHEIPFRLRPVFSNQFLLENAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQ
   2  (  389)    DADHNGRVTCFTDHEIPFRLRPVFSNQFLLETAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQ
   3  (  421)    DADHNGRVTCFTDHEIPFRLRPVFSNQFLLENAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQ
   4  (  389)    DADHNGRVTCFTDHEIPFRLRPVFSNQFLLETAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQ
   5  (  389)    DADHNGRVTCFTDHEIPFRLRPVFSNQFLLETAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQ

//
                                                                             
   0  (  481)    SAMLFIKVKDENDNAPVFTQSFVTVSIPENNSPGIQLMKVSATDADSGPNAEINYLLGPD
   1  (  481)    SAMLFIKVKDENDNAPVFTQSFVTVSIPENNSPGIQLMKVSATDADSGPNAEINYLLGPD
   2  (  449)    SAMLFIKVKDENDNAPVFTQSFVTVSIPENNSPGIQLTKVSAMDADSGPNAKINYLLGPD
   3  (  481)    SAMLFIKVKDENDNAPVFTQSFVTVSIPENNSPGIQLMKVSATDADSGPNAEINYLLGPD
   4  (  449)    SAMLFIKVKDENDNAPVFTQSFVTVSIPENNSPGIQLTKVSAMDADSGPNAKINYLLGPD
   5  (  449)    SAMLFIKVKDENDNAPVFTQSFVTVSIPENNSPGIQLTKVSAMDADSGPNAKINYLLGPD

//
                                                                             
   0  (  541)    APPEFSLDRRTGMLTVVKKLDREKEDKYLFTILAKDNGVPPLTSNVTVFVSIIDQNDNSP
   1  (  541)    APPEFSLDRRTGMLTVVKKLDREKEDKYLFTILAKDNGVPPLTSNVTVFVSIIDQNDNSP
   2  (  509)    APPEFSLDCRTGMLTVVKKLDREKEDKYLFTILAKDNGVPPLTSNVTVFVSIIDQNDNSP
   3  (  541)    APPEFSLDRRTGMLTVVKKLDREKEDKYLFTILAKDNGVPPLTSNVTVFVSIIDQNDNSP
   4  (  509)    APPEFSLDCRTGMLTVVKKLDREKEDKYLFTILAKDNGVPPLTSNVTVFVSIIDQNDNSP
   5  (  509)    APPEFSLDCRTGMLTVVKKLDREKEDKYLFTILAKDNGVPPLTSNVTVFVSIIDQNDNSP

//
                                                                             
   0  (  601)    VFTHNEYKFYVPENLPRHGTVGLITVTDPDYGDNSAVTLSILDENDDFTIDSQTGVIRPN
   1  (  601)    VFTHNEYKFYVPENLPRHGTVGLITVTDPDYGDNSAVTLSILDENDDFTIDSQTGVIRPN
   2  (  569)    VFTHNEYNFYVPENLPRHGTVGLITVTDPDYGDNSAVTLSILDENDDFTIDSQTGVIRPN
   3  (  601)    VFTHNEYKFYVPENLPRHGTVGLITVTDPDYGDNSAVTLSILDENDDFTIDSQTGVIRPN
   4  (  569)    VFTHNEYNFYVPENLPRHGTVGLITVTDPDYGDNSAVTLSILDENDDFTIDSQTGVIRPN
   5  (  569)    VFTHNEYNFYVPENLPRHGTVGLITVTDPDYGDNSAVTLSILDENDDFTIDSQTGVIRPN

//
                                                                             
   0  (  661)    ISFDREKQESYTFYVKAEDGGRVSRSSSAKVTINVVDVNDNKPVFIVPPYNYSYELVLPS
   1  (  661)    ISFDREKQESYTFYVKAEDGGRVSRSSSAKVTINVVDVNDNKPVFIVPPYNYSYELVLPS
   2  (  629)    ISFDREKQESYTFYVKAEDGGRVSRSSSAKVTINVVDVNDNKPVFIVPPSNCSYELVLPS
   3  (  661)    ISFDREKQESYTFYVKAEDGGRVSRSSSAKVTINVVDVNDNKPVFIVPPYNYSYELVLPS
   4  (  629)    ISFDREKQESYTFYVKAEDGGRVSRSSSAKVTINVVDVNDNKPVFIVPPSNCSYELVLPS
   5  (  629)    ISFDREKQESYTFYVKAEDGGRVSRSSSAKVTINVVDVNDNKPVFIVPPSNCSYELVLPS

//
                                                                             
   0  (  721)    TNPGTVVFQVIAVDNDTGMNAEVRYSIVGGNTRDLFAIDQETGNITLMEKCDVTDLGLHR
   1  (  721)    TNPGTVVFQVIAVDNDTGMNAEVRYSIVGGNTRDLFAIDQETGNITLMEKCDVTDLGLHR
   2  (  689)    TNPGTVVFQVIAVDNDTGMNAEVRYSIVGGNTRDLFAIDQETGNITLMEKCDVTDLGLHR
   3  (  721)    TNPGTVVFQVIAVDNDTGMNAEVRYSIVGGNTRDLFAIDQETGNITLMEKCDVTDLGLHR
   4  (  689)    TNPGTVVFQVIAVDNDTGMNAEVRYSIVGGNTRDLFAIDQETGNITLMEKCDVTDLGLHR
   5  (  689)    TNPGTVVFQVIAVDNDTGMNAEVRYSIVGGNTRDLFAIDQETGNITLMEKCDVTDLGLHR

//
                                                                             
   0  (  781)    VLVKANDLGQPDSLFSVVIVNLFVNESVTNATLINELVRKSIEAPVTPNTEIADVSSPTS
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   5  (  749)    VLVKANDLGQPDSLFSVVIVNLFVNESVTNATLINELVRKSTEAPVTPNTEIADVSSPTS

//
                                                                             
   0  (  841)    DYVKILVAAVAGTITVVVVIFITAVVRCRQAPHLKAAQKNMQNSEWATPNPENRQMIMMK
   1  (  841)    DYVKILVAAVAGTITVVVVIFITAVVRCRQAPHLKAAQKNMQNSEWATPNPENRQMIMMK
   2  (  809)    DYVKILVAAVAGTITVVVVIFITAVVRCRQAPHLKAAQKNKQNSEWATPNPENRQMIMMK
   3  (  841)    DYVKILVAAVAGTITVVVVIFITAVVRCRQAPHLKAAQKNMQNSEWATPNPENRQMIMMK
   4  (  809)    DYVKILVAAVAGTITVVVVIFITAVVRCRQAPHLKAAQKNKQNSEWATPNPENRQMIMMK
   5  (  809)    DYVKILVAAVAGTITVVVVIFITAVVRCRQAPHLKAAQKNKQNSEWATPNPENRQMIMMK

//
                                                                             
   0  (  901)    KKKKKKKHSPKNLLLNVVTIEETKADDVDSDGNRVTLDLPIDLEEQTMGKYNWVTTPTTF
   1  (  901)    KKKKKKKHSPKNLLLNVVTIEETKADDVDSDGNRVTLDLPIDLEEQTMGKYNWVTTPTTF
   2  (  869)    KKKKKKKHSPKNLLLNFVTIEETKADDVDSDGNRVTLDLPIDLEEQTMGKYNWVTTPTTF
   3  (  901)    KKKKKKKHSPKNLLLNVVTIEETKADDVDSDGNRVTLDLPIDLEEQTMGKYNWVTTPTTF
   4  (  869)    KKKKKKKHSPKNLLLNFVTIEETKADDVDSDGNRVTLDLPIDLEEQTMGKYNWVTTPTTF
   5  (  869)    KKKKKKKHSPKNLLLNFVTIEETKADDVDSDGNRVTLDLPIDLEEQTMGKYNWVTTPTTF

//
                                                                             
   0  (  961)    KPDSPDLARHYKSASPQPAFQIQPETPLNLKHHIIQELPLDNTFVACDSISNCSSSSSDP
   1  (  961)    KPDSPDLARHYKSASPQPAFQIQPETPLNLKHHIIQELPLDNTFVACDSISNCSSSSSDP
   2  (  929)    KPDSPDLARHYKSASPQPAFQIQPETPLNSKHHIIQELPLDNTFVACDSISKCSSSSSDP
   3  (  961)    KPDSPDLARHYKSASPQPAFQIQPETPLNLKHHIIQELPLDNTFVACDSISNCSSSSSDP
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   5  (  929)    KPDSPDLARHYKSASPQPAFQIQPETPLNSKHHIIQELPLDNTFVACDSISKCSSSSSDP

//
                                                                             
   0  ( 1021)    YSVSDCGYPVTTFEVPVSVHTRP---------------------------SQRRVTFHLP
   1  ( 1021)    YSVSDCGYPVTTFEVPVSVHTRP---------------------------SQRRVTFHLP
   2  (  989)    YSVSDCGYPVTTFEVPVSVHTRP---------------------------SQRRVTFHLP
   3  ( 1021)    YSVSDCGYPVTTFEVPVSVHTRP---------------------------TDSR......
   4  (  989)    YSVSDCGYPVTTFEVPVSVHTRPPMKEVVRSCTPMKESTTMEIWIHPQPQSQRRVTFHLP
   5  (  989)    YSVSDCGYPVTTFEVPVSVHTRPPMKEVVRSCTPMKESTTMEIWIHPQPQSQRRVTFHLP

//
                                                                             
   0  ( 1054)    EGSQESSSDGGLGDHDAGSLTSTSHGLPLGYPQEEYFDRATPSNRTEGDGNSDPESTFIP
   1  ( 1054)    EGSQESSSDGGLGDHDAGSLTSTSHGLPLGYPQEEYFDRATPSNRTEGDGNSDPESTFIP
   2  ( 1022)    EGSQESSSDGGLGDHDAGSLTSTSHGLPLGYPQEEYFDRATPSNRTEGDGNSDPESTFIP
   3  (    -)    ............................................................
   4  ( 1049)    EGSQESSSDGGLGDHDAGSLTSTSHGLPLGYPQEEYFDRATPSNRTEGDGNSDPESTFIP
   5  ( 1049)    EGSQESSSDGGLGDHDAGSLTSTSHGLPLGYPQEEYFDRATPSNRTEGDGNSDPEST---

//
                                                                             
   0  ( 1114)    GLKK--EITVQPTVEEASDNCTQECLIYGHSDACWMPASLDHSSSSQAQASALCHSPPLS
   1  ( 1114)    GLKK--EITVQPTVEEASDNCTQECLIYGHSDACWMPASLDHSSSSQAQASALCHSPPLS
   2  ( 1082)    GLKKAAEITVQPTVEEASDNCTQECLIYGHSDACWMPASLDHSSSSQAQASALCHSPPLS
   3  (    -)    ............................................................
   4  ( 1109)    GLKKAAEITVQPTVEEASDNCTQECLIYGHSDACWMPASLDHSSSSQAQASALCHSPPLS
   5  ( 1106)    ---A--EITVQPTVEEASDNCTQECLIYGHSDACWMPASLDHSSSSQAQASALCHSPPLS

//
                                                                             
   0  ( 1172)    QASTQHHSPPVTQTIVLCHSPPVTQTIALCHSPPPIQVSALHHSPPLVQGTALHHSPPSA
   1  ( 1172)    QASTQHHSPPVTQTIVLCHSPPVTQTIALCHSPPPIQVSALHHSPPLVQGTALHHSPPSA
   2  ( 1142)    QASTQHHSPRVTQTIALCHSPPVTQTIALCHSPPPIQVSALHHSPPLVQATALHHSPPSA
   3  (    -)    ............................................................
   4  ( 1169)    QASTQHHSPRVTQTIALCHSPPVTQTIALCHSPPPIQVSALHHSPPLVQATALHHSPPSA
   5  ( 1161)    QASTQHHSPRVTQTIALCHSPPVTQTIALCHSPPPIQVSALHHSPPLVQATALHHSPPSA

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   1  ( 1232)    QASALCYSPPLAQAAAISHSSSLPQVIALHRSQAQSSVSLQQGWVQGANGLCSVDQGVQG
   2  ( 1202)    QASALCYSPPLAQAAAISHSSPLPQVIALHRSQAQSSVSLQQGWVQGADGLCSVDQGVQG
   3  (    -)    ............................................................
   4  ( 1229)    QASALCYSPPLAQAAAISHSSPLPQVIALHRSQAQSSVSLQQGWVQGADGLCSVDQGVQG
   5  ( 1221)    QASALCYSPPLAQAAAISHSSPLPQVIALHRSQAQSSVSLQQGWVQGADGLCSVDQGVQG

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   1  ( 1292)    SATSQFYTMSERLHPSDDSIKVIPLTTFAPRQQARPSRGDSPIMETHPL
   2  ( 1262)    SATSQFYTMSERLHPSDDSIKVIPLTTFTPRQQARPSRGDSPIMEEHPL
   3  (    -)    .................................................
   4  ( 1289)    SATSQFYTMSERLHPSDDSIKVIPLTTFTPRQQARPSRGDSPIMEEHPL
   5  ( 1281)    SATSQFYTMSERLHPSDDSIKVIPLTTFTPRQQARPSRGDSPIMEEHPL

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