# 0 Query: pF1KB9478, 1211 aa
# 1 CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210 aa)
# 2 CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218 aa)
# 3 CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163 aa)
# 4 CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251 aa)
# 5 CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 8.6e-191 8039 99.9 1 1210
2 1.4e-190 8030 99.9 12 1218
3 3e-33 2476 39.7 4 1160
4 8.4e-27 1945 35.0 43 1245
5 1.1e-26 1940 35.0 19 1220
//
0 ( 1) MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDELSSRIQN
1 ( 1) MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDELSSRIQN
2 ( 12) ....NSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDELSSRIQN
3 ( 4) .........EDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQS
4 ( 43) .....SVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-TNKGDELSNRIQN
5 ( 19) ......VYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-TNKGDELSNRIQN
//
0 ( 60) MLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPS--SSFHTSVHHQSIH
1 ( 60) MLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPS--SSFHTSVHHQSIH
2 ( 67) MLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPS--SSFHTSVHHQSIH
3 ( 55) MLGNYDEMKDFIGDRS-IPKLVA----IPKPTVPPSADEKSN-PNFFEQRHGGSHQSSKW
4 ( 97) TLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL------VGVPK-PGVP----------------------Q
5 ( 72) TLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL------VGVPK-PGVP----------------------Q
//
0 ( 118) TPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPS-LH------AKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFG
1 ( 118) TPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPS-LH------AKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFG
2 ( 125) TPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPS-LH------AKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFG
3 ( 109) TPV-GP------APSTSQSQKRSSGLQS-GHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRESYNNSG
4 ( 128) TP------VNKIDEHF-VADSRAQNQPSSIC------STTTSTPAAVPVQQSKRGTMGW-
5 ( 103) TP------VNKIDEHF-VADSRAQNQPSSIC------STTTSTPAAVPVQQSKRGTMGW-
//
0 ( 171) SSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSP-VPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSK
1 ( 171) SSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSP-VPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSK
2 ( 178) SSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSP-VPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSK
3 ( 161) SSSRKKGQH---GSEHSKSRSSSPGK--------PQA-VSSLNSSHS------------R
4 ( 174) ---QKAGHPPSDGQQRATQQGSL-RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAA
5 ( 149) ---QKAGHPPSDGQQRATQQGSL-RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAA
//
0 ( 230) VHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQK
1 ( 230) VHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQK
2 ( 237) VHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQK
3 ( 197) SHGNDHHSKEHQRSKSPRDPDA---NWDSPSRVPFSSGQHSTQSFPP-SLMSKSNSMLQK
4 ( 230) KHSSS----GHC-----------------------------VQNFPP-SLASKPSLVQQK
5 ( 205) KHSSS----GHC-----------------------------VQNFPP-SLASKPSLVQQK
//
0 ( 290) PTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEK--TDLKVPAKAKLTKLKMP
1 ( 290) PTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEK--TDLKVPAKAKLTKLKMP
2 ( 297) PTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEK--TDLKVPAKAKLTKLKMP
3 ( 253) PTAYVRPMDGQE---SMEPKLS--SE------HYSSQSHGNSMTELKPSSKAHLTKLKIP
4 ( 256) PTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASK--PE-PARAKAKLSKFSIP
5 ( 231) PTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASK--PE-PARAKAKLSKFSIP
//
0 ( 342) SQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQ
1 ( 342) SQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQ
2 ( 349) SQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQ
3 ( 302) SQPLDASASGDVS-CVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTG
4 ( 313) KQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHN
5 ( 288) KQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHN
//
0 ( 401) NQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQT-----PEKPP----SSSA--
1 ( 401) NQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQT-----PEKPP----SSSA--
2 ( 408) NQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQT-----PEKPP----SSSA--
3 ( 361) EQKRYNPS-KT-SNGHQ-SKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTP----GSNS--
4 ( 370) NPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQA-----AQRTALRALSDSAVV
5 ( 345) NPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQA-----AQRTALRALSDSAVV
//
0 ( 450) -PPSAPQSLPEPVASAHSSSA-ESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENEPLETPAPEP
1 ( 450) -PPSAPQSLPEPVASAHSSSA-ESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENEPLETPAPEP
2 ( 457) -PPSAPQSLPEPVASAHSSSA-ESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENEPLETPAPEP
3 ( 412) -EPSHHNS--EGADNSRDDSS--SHSGSESSSGS--DSESESSSSDSEANEPSQSASPEP
4 ( 424) QQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEA
5 ( 399) QQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEA
//
0 ( 506) EPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKGS-----SDS
1 ( 506) EPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKGS-----SDS
2 ( 513) EPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKGS-----SDS
3 ( 465) EPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSP-------ASSVDSN---IPSSQGYKKEG-----REQ
4 ( 484) EPASSNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPS
5 ( 459) EPASSNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPS
//
0 ( 551) ATSQE-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPEA--------PHPGK---RSCQKSPA
1 ( 551) ATSQE-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPEA--------PHPGK---RSCQKSPA
2 ( 558) ATSQE-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPEA--------PHPGK---RSCQKSPA
3 ( 510) GTGNS-YTDTSGPK--ETSSATP-------GRDSKT--------IQKGSESGRGRQKSPA
4 ( 543) LREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPA---VPC--APA
5 ( 518) LREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPA---VPC--APA
//
0 ( 591) QQEP-P-QRQTVGTKQPKKPVKASAR--AGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSKDKPKV
1 ( 591) QQEP-P-QRQTVGTKQPKKPVKASAR--AGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSKDKPKV
2 ( 598) QQEP-P-QRQTVGTKQPKKPVKASAR--AGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSKDKPKV
3 ( 552) QSDS-TTQRRTVGKKQPKKAEKAAAE--E-PRGGLKIESET---P-VDLASSMPSSRHKA
4 ( 598) ENAPAP-ARRSAG----KKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKT
5 ( 573) ENAPAP-ARRSAG----KKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKT
//
0 ( 646) KTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDRTPEH
1 ( 646) KTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDRTPEH
2 ( 653) KTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDRTPEH
3 ( 604) ATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSR-----EIIET--DTSSSDSDES
4 ( 653) RPCGNNRASHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEE
5 ( 628) RPCGNNRASHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEE
//
0 ( 701) FAL-----VPLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSR-KDRLPL
1 ( 701) FAL-----VPLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSR-KDRLPL
2 ( 708) FAL-----VPLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSR-KDRLPL
3 ( 657) ESL-----PPSSQTPK--------YPES---NRTP--VKPSS----VEEEDSFFRQRMFS
4 ( 713) YPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEE-QFYTLV
5 ( 688) YPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEE-QFYTLV
//
0 ( 742) PLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIP----QPPGKGSRQ-RKAEDKQPPAGKK
1 ( 742) PLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIP----QPPGKGSRQ-RKAEDKQPPAGKK
2 ( 749) PLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIP----QPPGKGSRQ-RKAEDKQPPAGKK
3 ( 695) PMEEKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIP----GKPYKETEP-PKGEKKNVP--EK
4 ( 772) PFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPS---
5 ( 747) PFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPS---
//
0 ( 797) HSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDC-DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-----HKESSKT
1 ( 797) HSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDC-DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-----HKESSKT
2 ( 804) HSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDC-DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-----HKESSKT
3 ( 748) HTREAQKQ-ASEKVSNKGK-RKHKNE-DDNRASESKKPKTEDKNSAG------HKPSSNR
4 ( 829) HTSDTPAEKALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNIN
5 ( 804) HTSDTPAEKALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNIN
//
0 ( 851) KPSRPSSQSSKKEMLPPP--PVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNH
1 ( 851) KPSRPSSQSSKKEMLPPP--PVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNH
2 ( 858) KPSRPSSQSSKKEMLPPP--PVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNH
3 ( 799) ESSKQSA-AKEKDLLPSPAGPVPSKDP-KTEHGSRKRTISQSSSLKSSSNSNKETSGSSK
4 ( 889) SVAIPINKNEKMLRSPIS--PLSDASKHKYTSEDLTSSSRPN---GNSLFTSASSSKKPK
5 ( 864) SVAIPINKNEKMLRSPIS--PLSDASKHKYTSEDLTSSSRPN---GNSLFTSASSSKKPK
//
0 ( 908) KDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPN-GNSKPGKPQVKFDK--QQ-
1 ( 908) KDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPN-GNSKPGKPQVKFDK--QQ-
2 ( 915) KDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPN-GNSKPGKPQVKFDK--QQ-
3 ( 857) NSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAPSSSSNCP-PSAPTLDSSKPRRTKLVFDD--RNY
4 ( 944) ADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSN-GHRDCKRQKLVFDDMPRS-
5 ( 919) ADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSN-GHRDCKRQKLVFDDMPRS-
//
0 ( 964) -ADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSET
1 ( 964) -ADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSET
2 ( 971) -ADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSET
3 ( 914) SADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMYSET
4 ( 1002) -ADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSET
5 ( 977) -ADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSET
//
0 ( 1023) VDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFE
1 ( 1023) VDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFE
2 ( 1030) VDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFE
3 ( 974) VDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTEHLK
4 ( 1061) VELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK
5 ( 1036) VELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK
//
*
0 ( 1083) SSSKVAQAPSPCI-A--RSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTI
1 ( 1083) SSSKVAQAPSPCI-A---STGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTI
2 ( 1090) SSSKVAQAPSPCI-A--RSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTI
3 ( 1034) NSYNNSQAPSPGLGS--KAVGMPSPVSPKLSPGNSGNYSSGASSASASGSSVTI--PQKI
4 ( 1121) NSSKAAQAPSPWG-ASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRI
5 ( 1096) NSSKAAQAPSPWG-ASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRI
//
0 ( 1140) QNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLV-DLVHYTR
1 ( 1139) QNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLV-DLVHYTR
2 ( 1147) QNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLV-DLVHYTR
3 ( 1090) HQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKVMGPLIFNASIMTDLVRYTR
4 ( 1180) HQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSME-HLVQYSQ
5 ( 1155) HQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSME-HLVQYSQ
//
0 ( 1199) QGFQQLQELTKTP
1 ( 1198) QGFQQLQELTKTP
2 ( 1206) QGFQQLQELTKTP
3 ( 1150) QGLHWLRQDAK..
4 ( 1239) QGLHWLR......
5 ( 1214) QGLHWLR......
//
