Multiple alignment for pF1KB8960
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB8960, 340 aa
#  1    CCDS2266.1 HOXD10 gene_id:3236|Hs108|chr2    (340 aa)
#  2    CCDS8868.1 HOXC10 gene_id:3226|Hs108|chr12    (342 aa)
#  3    CCDS5410.2 HOXA10 gene_id:3206|Hs108|chr7    (410 aa)
#  4    CCDS2267.2 HOXD9 gene_id:3235|Hs108|chr2    (352 aa)
#  5    CCDS11534.1 HOXB9 gene_id:3219|Hs108|chr17    (250 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    2.8e-100    2271  100.0         1     340
   2    3.8e-39      958   50.5        25     342
   3    1.3e-22      802   46.1        57     410
   4    5.6e-15      443   30.6        12     346
   5    9.3e-15      436   39.5        35     246

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   0  (    1)    MSFPNSSPAANTFLVDSLISACRSDSFYSSSASMYMPP-PSADMGTYGMQ----------
   1  (    1)    MSFPNSSPAANTFLVDSLISACRSDSFYSSSASMYMPP-PSADMGTYGMQ----------
   2  (   25)    ...........................YSRSAGMYMQS-GS-DFNCGVMR----------
   3  (   57)    ...........................YYAHGGVYLPP--AADL-PYGLQ----------
   4  (   12)    ....SSSGTLSNYYVDSLIGHEGDEVF----AARFGPPGPGAQGRPAGVADGPAATAAEF
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   50)    -TCGLLP-----SLA-KR-EVNHQ--------NMGMNVHP-YIPQ---VDSWTDPNRSCR
   1  (   50)    -TCGLLP-----SLA-KR-EVNHQ--------NMGMNVHP-YIPQ---VDSWTDPNRSCR
   2  (   46)    -GCGLAP-----SLS-KRDEGSSP--------SLALNTYPSYLSQ---LDSWGDPKAAYR
   3  (   77)    -SCGLFP-----TLGGKR-NEAASPGSGGGGGGLGPGAHG-YGPSP--IDLWLDAPRSCR
   4  (   64)    ASCSFAPRSAVFSAS-WS-AVPSQPPAAA---AMSGLYHP-YVPPPPLAASASEPGRYVR
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   90)    IEQP-----VTQQVP--------------TCSFTTNIKEESNCCMY--SDKRNKL--ISA
   1  (   90)    IEQP-----VTQQVP--------------TCSFTTNIKEESNCCMY--SDKRNKL--ISA
   2  (   88)    LEQP-----VGRPLS--------------SCSYPPSVKEENVCCMY--SAEKRAK--SGP
   3  (  127)    MEPPDGPPPPPQQQPPPPPQPPQPAPQATSCSFAQNIKEESSYCLYDSADKCPKVSATAA
   4  (  118)    ----------SWMEP--------------LPGFPGGAGGGGGGGGG--GPGRGPS--PGP
   5  (   35)    ..........................................................SS

//
                                                                             
   0  (  127)    EVPSY-QRLVP-ESCPV-ENPEVPVPG--YFRLSQTY-ATGKTQEYN--N---SPEGSST
   1  (  127)    EVPSY-QRLVP-ESCPV-ENPEVPVPG--YFRLSQTY-ATGKTQEYN--N---SPEGSST
   2  (  125)    EAALY-SHPLP-ESCLG-EH-EVPVPS--YYRASPSYSALDKTPHCSGAN---DFEAPFE
   3  (  187)    ELAPF-PRGPPPDGCALGTSSGVPVPG--YFRLSQAY-GTAKG--YG--S---GGGGAQQ
   4  (  150)    SGPAN-GRHY---GIKP-ETRAAPAPA----TAASTT-SSSSTSLSS--S---SKRTECS
   5  (   37)    RQPGHAEHLEF-PSCSF-Q-PKAPVFGASWAPLSP-H-ASGSLPSVY--HPYIQPQGVPP

//
                                                                             
   0  (  176)    V-------M---LQLNPRGA--A---KPQLSAAQLQMEKKMNEPVSGQEPTKV------S
   1  (  176)    V-------M---LQLNPRGA--A---KPQLSAAQLQMEKKMNEPVSGQEPTKV------S
   2  (  176)    Q-------R---ASLNPRAEHLE---SPQLGG-KVSFPETPKSDSQTPSPNEI------K
   3  (  236)    L-------GAGPFPAQPPGR--GFDLPPALASGSADAARKERALDSPPPPTLACGSGGGS
   4  (  195)    V-------A---RE--SQGS--S---GPEFSCNSF-LQEKAAAATGGTGPG--------A
   5  (   90)    AESRYLRTW---LEPAPRGE--A---APGQGQAAVKAEPLLGAP--GELLKQG------T

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   0  (  215)    QV-ESPEAKGG----LPEE-RS-C----LAEVSVSSPEVQEKE-SKEEIKSDTPTSNWLT
   1  (  215)    QV-ESPEAKGG----LPEE-RS-C----LAEVSVSSPEVQEKE-SKEEIKSDTPTSNWLT
   2  (  216)    TE-QSLAGPKG----SPSESEK-E----RAKAADSSPDTSDNE-AKEEIKAENTTGNWLT
   3  (  287)    QGDEEAHASSS----AAEE-LSPA----PSESSKASPE---KD-SLGNSKGEN-AANWLT
   4  (  229)    GI-GAATGTGG----SSEP-SA-CSDHPIPGCSLKEEEKQHSQPQQQQLDPNNPAANWIH
   5  (  134)    PE-YSLETSAGREAVLSNQ-RP-G----YGDNKIC----EGSE-DKERPDQTNPSANWLH

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   0  (  263)    AKSGRKKRCPYTKHQTLELEKEFLFNMYLTRERRLEISKSVNLTDRQVKIWFQNRRMKLK
   1  (  263)    AKSGRKKRCPYTKHQTLELEKEFLFNMYLTRERRLEISKSVNLTDRQVKIWFQNRRMKLK
   2  (  265)    AKSGRKKRCPYTKHQTLELEKEFLFNMYLTRERRLEISKTINLTDRQVKIWFQNRRMKLK
   3  (  333)    AKSGRKKRCPYTKHQTLELEKEFLFNMYLTRERRLEISRSVHLTDRQVKIWFQNRRMKLK
   4  (  282)    ARSTRKKRCPYTKYQTLELEKEFLFNMYLTRDRRYEVARILNLTERQVKIWFQNRRMKMK
   5  (  182)    ARSSRKKRCPYTKYQTLELEKEFLFNMYLTRDRRHEVARLLNLSERQVKIWFQNRRMKMK

//
                                   
   0  (  323)    KMSRENRIRELTANLTFS
   1  (  323)    KMSRENRIRELTANLTFS
   2  (  325)    KMNRENRIRELTSNFNFT
   3  (  393)    KMNRENRIRELTANFNFS
   4  (  342)    KMSKE.............
   5  (  242)    KMNKE.............

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