Multiple alignment for pF1KB8143
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB8143, 406 aa
#  1    CCDS11316.1 LHX1 gene_id:3975|Hs108|chr17    (406 aa)
#  2    CCDS9171.1 LHX5 gene_id:64211|Hs108|chr12    (402 aa)
#  3    CCDS1338.1 LHX4 gene_id:89884|Hs108|chr1    (390 aa)
#  4    CCDS6994.1 LHX3 gene_id:8022|Hs108|chr9    (397 aa)
#  5    CCDS6995.1 LHX3 gene_id:8022|Hs108|chr9    (402 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    4.6e-82     2863  100.0         1     406
   2    1.6e-59     2122   74.6         2     402
   3    7e-12        842   37.0        29     389
   4    2.9e-11      815   39.5        31     358
   5    2.9e-11      815   39.5        36     363

//
                                                                             
   0  (    1)    MVHCAGCKRPILDRFLLNVLDRAWHVKCVQCCECKCNLTEKCFSREGKLYCKNDFFRCFG
   1  (    1)    MVHCAGCKRPILDRFLLNVLDRAWHVKCVQCCECKCNLTEKCFSREGKLYCKNDFFRCFG
   2  (    2)    MVHCAGCERPILDRFLLNVLDRAWHIKCVQCCECKTNLSEKCFSREGKLYCKNDFFRRFG
   3  (   29)    ..QCAGCNQHILDKFILKVLDRHWHSSCLKCADCQMQLADRCFSRAGSVYCKEDFFKRFG
   4  (   31)    ...CAGCDQHILDRFILKALDRHWHSKCLKCSDCHTPLAERCFSRGESVYCKDDFFKRFG
   5  (   36)    ...CAGCDQHILDRFILKALDRHWHSKCLKCSDCHTPLAERCFSRGESVYCKDDFFKRFG

//
                                                                             
   0  (   61)    TKCAGCAQGISPSDLVRRARSKVFHLNCFTCMMCNKQLSTGEELYIIDENKFVCKEDYLS
   1  (   61)    TKCAGCAQGISPSDLVRRARSKVFHLNCFTCMMCNKQLSTGEELYIIDENKFVCKEDYLS
   2  (   62)    TKCAGCAQGISPSDLVRKARSKVFHLNCFTCMVCNKQLSTGEELYVIDENKFVCKDDYLS
   3  (   87)    TKCTACQQGIPPTQVVRKAQDFVYHLHCFACIICNRQLATGDEFYLMEDGRLVCKEDY--
   4  (   88)    TKCAACQLGIPPTQVVRRAQDFVYHLHCFACVVCKRQLATGDEFYLMEDSRLVCKADY--
   5  (   93)    TKCAACQLGIPPTQVVRRAQDFVYHLHCFACVVCKRQLATGDEFYLMEDSRLVCKADY--

//
                                                                             
   0  (  121)    NSSVAKENSLHSATTGSDPSLSPDSQDPSQDDAKDSESANVSDKEAGSNENDDQNLGAKR
   1  (  121)    NSSVAKENSLHSATTGSDPSLSPDSQDPSQDDAKDSESANVSDKEAGSNENDDQNLGAKR
   2  (  122)    SSSL-KEGSLNSVSSCTDRSLSPDLQDALQDDPKETDNSTSSDKETANNENEEQNSGTKR
   3  (  145)    ------------------------------------ETAK---------QNDDSEAGAKR
   4  (  146)    ------------------------------------ETAKQREAEA----------TAKR
   5  (  151)    ------------------------------------ETAKQREAEA----------TAKR

//
                                                                             
   0  (  181)    RGPRTTIKAKQLETLKAAFAATPKPTRHIREQLAQETGLNMRVIQVWFQNRRSKERRMKQ
   1  (  181)    RGPRTTIKAKQLETLKAAFAATPKPTRHIREQLAQETGLNMRVIQVWFQNRRSKERRMKQ
   2  (  181)    RGPRTTIKAKQLETLKAAFAATPKPTRHIREQLAQETGLNMRVIQVWFQNRRSKERRMKQ
   3  (  160)    --PRTTITAKQLETLKNAYKNSPKPARHVREQLSSETGLDMRVVQVWFQNRRAKEKRLKK
   4  (  160)    --PRTTITAKQLETLKSAYNTSPKPARHVREQLSSETGLDMRVVQVWFQNRRAKEKRLKK
   5  (  165)    --PRTTITAKQLETLKSAYNTSPKPARHVREQLSSETGLDMRVVQVWFQNRRAKEKRLKK

//
                                                                             
   0  (  241)    LSALGARRHAFFRSPRRMRPLV----DRLEPGEL----IPNGPFSFYGD-------YQSE
   1  (  241)    LSALGARRHAFFRSPRRMRPLV----DRLEPGEL----IPNGPFSFYGD-------YQSE
   2  (  241)    LSALGARRHAFFRSPRRMRPLG----GRLDESEM----LGSTPYTYYGD-------YQGD
   3  (  218)    -DAGRHRWGQFYKSVKRSRGSS----KQEKESSAEDCGVSDSELSFREDQILSELGHTNR
   4  (  218)    -DAGRQRWGQYFRNMKRSRGGSKSDKDSVQEGQD-----SDAEVSFPDE-------PSLA
   5  (  223)    -DAGRQRWGQYFRNMKRSRGGSKSDKDSVQEGQD-----SDAEVSFPDE-------PSLA

//
                                                                             
   0  (  286)    YYG-----PGG---NYDFFPQGPPSSQAQ----TPVDLPFVPSSG---PSGTPL-GGLEH
   1  (  286)    YYG-----PGG---NYDFFPQGPPSSQAQ----TPVDLPFVPSSG---PSGTPL-GGLEH
   2  (  286)    YYA-----PGS---NYDFFAHGPPS-QAQ----SPADSSFLAASG---PGSTPL-GALEP
   3  (  273)    IYGNVGDVTGGQLMNGSFSMDGTGQSYQDLRDGSPYGIPQSPSSISSLPSHAPLLNGLDY
   4  (  265)    EMG-----PA----NGLYGSLGEPTQALG----RP--------SG---ALGNF---SLEH
   5  (  270)    EMG-----PA----NGLYGSLGEPTQALG----RP--------SG---ALGNF---SLEH

//
                                                                             
   0  (  330)    P-LPGHHPSSEAQRFTDILAHP-PGDSPSPEPSLPGPLHSMSAEVF--GPSPPFSSLS-V
   1  (  330)    P-LPGHHPSSEAQRFTDILAHP-PGDSPSPEPSLPGPLHSMSAEVF--GPSPPFSSLS-V
   2  (  329)    P-LAGPH-AADNPRFTDMISHP---DTPSPEPGLPGTLHPMPGEVFSGGPSPPFP----M
   3  (  333)    T-VDSN---------LGIIAHAGQGVSQTLRAMAGGPTSDIST-----GSSVGYPDFP-T
   4  (  298)    GGLAGPEQYREL-RPGSPYGVP-P--SPAAPQSLPGPQPLLSSLVY------PDTSLGLV
   5  (  303)    GGLAGPEQYREL-RPGSPYGVP-P--SPAAPQSLPGPQPLLSSLVY------PDTSLGLV

//
                                        
   0  (  385)    NGGASYGNHLSHP-PEMNEAAVW
   1  (  385)    NGGASYGNHLSHP-PEMNEAAVW
   2  (  380)    SGTSGYSGPLSHPNPELNEAAVW
   3  (  377)    SPG-SWLDEMDHP-P........
   4  (  348)    PSGAPGG-----P-PPM......
   5  (  353)    PSGAPGG-----P-PPM......

//
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com