# 0 Query: pF1KB7320, 1288 aa
# 1 CCDS3189.1 SMC4 gene_id:10051|Hs108|chr3 (1288 aa)
# 2 CCDS75046.1 SMC4 gene_id:10051|Hs108|chr3 (1263 aa)
# 3 CCDS75985.1 SMC1A gene_id:8243|Hs108|chrX (1211 aa)
# 4 CCDS14352.1 SMC1A gene_id:8243|Hs108|chrX (1233 aa)
# 5 CCDS31285.1 SMC3 gene_id:9126|Hs108|chr10 (1217 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 8209 100.0 1 1288
2 1.4e-214 7980 98.1 1 1263
3 7.1e-12 1120 25.5 15 1206
4 7.2e-12 1252 26.4 10 1228
5 3.7e-11 868 22.1 1 1206
//
0 ( 1) MPRKGTQPSTARRREEGPPPPSPDGASSDAEPEPPSGRTESPATAAETASEELDNRSLEE
1 ( 1) MPRKGTQPSTARRREEGPPPPSPDGASSDAEPEPPSGRTESPATAAETASEELDNRSLEE
2 ( 1) MPRKGTQPSTARRREEGPPPPSPDGASSDAEPEPPSGRTESPATAA--------------
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 61) ILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCIIGPNGSGKS
1 ( 61) ILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCIIGPNGSGKS
2 ( 47) -----------AMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCIIGPNGSGKS
3 ( 15) .........................................................GKS
4 ( 10) .............................ENFKSYKGRQIIGPF-QRFTAIIGPNGSGKS
5 ( 1) .....................MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKS
//
0 ( 121) NVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPN
1 ( 121) NVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPN
2 ( 96) NVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPN
3 ( 18) NLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLIHGAPVGKPAAN---RAFVSMVYSEEGAE-----D
4 ( 40) NLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLIHGAPVGKPAAN---RAFVSMVYSEEGAE-----D
5 ( 40) NFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPR-VISAFVEIIFDN-----SDNRLPIDK
//
0 ( 181) SNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMM
1 ( 181) SNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMM
2 ( 156) SNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMM
3 ( 70) RTF--ARV--IV-GGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMK
4 ( 92) RTF--ARV--IV-GGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMK
5 ( 94) EEVSLRRVIGAKKDQ---YFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMA--
//
0 ( 239) KPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRG--EKLN--RV-KMVEK
1 ( 239) KPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRG--EKLN--RV-KMVEK
2 ( 214) KPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRG--EKLN--RV-KMVEK
3 ( 125) NPKERTA-------LFEEISRSGELAQEYDK--RKKEMVKAEED--TQFNYHRK-KNIAA
4 ( 147) NPKERTA-------LFEEISRSGELAQEYDK--RKKEMVKAEED--TQFNYHRK-KNIAA
5 ( 149) -----TAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKE---ESISLMKETEGKREKIN--ELLKYIEE
//
0 ( 294) EKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIY-----ELQKRIAEMETQKEKIHEDT
1 ( 294) EKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIY-----ELQKRIAEMETQKEKIHEDT
2 ( 269) EKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIY-----ELQKRIAEMETQKEKIHEDT
3 ( 173) ERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEV-EIEKLNKELASKNKEIEKDK
4 ( 195) ERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEV-EIEKLNKELASKNKEIEKDK
5 ( 199) RLHTLEEEKEELAQY-----QKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKS
//
0 ( 349) KEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIE----ENKEKF---TQLDLEDVQVR
1 ( 349) KEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIE----ENKEKF---TQLDLEDVQVR
2 ( 324) KEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIE----ENKEKF---TQLDLEDVQVR
3 ( 232) KRMDK----VEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIK----EKDSEL---NQKRPQYIKAK
4 ( 254) KRMDK----VEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIK----EKDSEL---NQKRPQYIKAK
5 ( 254) RQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQ
//
0 ( 402) EKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFKSIPAKSN---NIINETTTRNNALEKEKEKEEK
1 ( 402) EKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFKSIPAKSN---NIINETTTRNNALEKEKEKEEK
2 ( 377) EKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFKSIPAKSN---NIINETTTRNNALEKEKEKEEK
3 ( 281) ENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKH---YK----KRK---GDMDE-------LEKEMLSVEK
4 ( 303) ENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKH---YK----KRK---GDMDE-------LEKEMLSVEK
5 ( 314) DELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERT
//
0 ( 459) KLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLSRHNTAVS
1 ( 459) KLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLSRHNTAVS
2 ( 434) KLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLSRHNTAVS
3 ( 324) ARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKF-NRDQKA--
4 ( 346) ARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKF-NRDQKA--
5 ( 374) DLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIK-KELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLE
//
0 ( 519) QLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEGKLPQTEQELKEKEKELQKLTQEETNFKS----
1 ( 519) QLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEGKLPQTEQELKEKEKELQKLTQEETNFKS----
2 ( 494) QLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEGKLPQTEQELKEKEKELQKLTQEETNFKS----
3 ( 381) ----DQDRL-----DLEERKKV--ETEAKIKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEE
4 ( 403) ----DQDRL-----DLEERKKV--ETEAKIKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEE
5 ( 433) QYNKL-------DQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQ----
//
0 ( 575) ---LVHDLFQKVEEAKSSL-AMNRSRGKV--L----DAIIQEKKSGR-------------
1 ( 575) ---LVHDLFQKVEEAKSSL-AMNRSRGKV--L----DAIIQEKKSGR-------------
2 ( 550) ---LVHDLFQKVEEAKSSL-AMNRSRGKV--L----DAIIQEKKSGR-------------
3 ( 430) QKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQV--MEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKR
4 ( 452) QKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQV--MEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKR
5 ( 482) ---ALAAKREDLEKKQQLL-RAATGKAILNGI----DSINKVLDHFR-------------
//
0 ( 612) -IPG-IYGRL--GDL-GAIDEKYDV--AISSCC-HA-----LDYIVVDSIDIAQECVNFL
1 ( 612) -IPG-IYGRL--GDL-GAIDEKYDV--AISSCC-HA-----LDYIVVDSIDIAQECVNFL
2 ( 587) -IPG-IYGRL--GDL-GAIDEKYDV--AISSCC-HA-----LDYIVVDSIDIAQECVNFL
3 ( 488) LYPGSVYGRL--IDLCQPTQKKYQI--AVTKVLGKN-----MDAIIVDSEKTGRDCIQYI
4 ( 510) LYPGSVYGRL--IDLCQPTQKKYQI--AVTKVLGKN-----MDAIIVDSEKTGRDCIQYI
5 ( 521) -RKG-INQHVQNGYH-GIVMNNFECEPAFYTCV-EVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEF
//
0 ( 659) KRQNI-GVATFIGLDKMAVWA--KKMTEIQTPENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRD
1 ( 659) KRQNI-GVATFIGLDKMAVWA--KKMTEIQTPENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRD
2 ( 634) KRQNI-GVATFIGLDKMAVWA--KKMTEIQTPENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRD
3 ( 539) KEQRG-EPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELK---GAKLVIDVIRYE-PPHIKKALQYACGN
4 ( 561) KEQRG-EPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELK---GAKLVIDVIRYE-PPHIKKALQYACGN
5 ( 577) NKMNLPGEVTFLPLNKLDV-------RDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGK
//
0 ( 715) TLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQIIEQSGTMTGGGS--KVMKGRMGSSLVIEIS
1 ( 715) TLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQIIEQSGTMTGGGS--KVMKGRMGSSLVIEIS
2 ( 690) TLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQIIEQSGTMTGGGS--KVMKGRMGSSLVIEIS
3 ( 594) ALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLKAKARRWDEKAVDKLK
4 ( 616) ALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLKAKARRWDEKAVDKLK
5 ( 630) TLICRSMEVSTQLA--RAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYY--DTRKSRLELQKDVRKA
//
0 ( 773) EEE---VNKMESQLQNDSKKAM--QIQEQKVQLEERVVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQR
1 ( 773) EEE---VNKMESQLQNDSKKAM--QIQEQKVQLEERVVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQR
2 ( 748) EEE---VNKMESQLQNDSKKAM--QIQEQKVQLEERVVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQR
3 ( 654) EKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMR---LKYSQSDLEQTKTRHLA----
4 ( 676) EKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMR---LKYSQSDLEQTKTRHLA----
5 ( 686) EEE---LGELEAKLNENLRR----NIERINNEIDQLMNQMQQIETQQR----KFKASRDS
//
0 ( 828) LIEQEEYLNVQVK-ELEANVLATAPDKKKQKLLEENVSAFKTEYDAV-AEKAGKVEAEVK
1 ( 828) LIEQEEYLNVQVK-ELEANVLATAPDKKKQKLLEENVSAFKTEYDAV-AEKAGKVEAEVK
2 ( 803) LIEQEEYLNVQVK-ELEANVLATAPDKKKQKLLEENVSAFKTEYDAV-AEKAGKVEAEVK
3 ( 707) -------LNLQEKSKLESELANFGP---RINDIKRIIQSREREMKDL-KEKMNQVEDEVF
4 ( 729) -------LNLQEKSKLESELANFGP---RINDIKRIIQSREREMKDL-KEKMNQVEDEVF
5 ( 735) ILSEMKMLKEKRQ-QSEKTFM---PKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAELGTDLLSQLS
//
0 ( 886) RLHNTIVEINNHKLKA-QQDKL---DKINKQLDECASAITKAQVAIKTADRNLQKAQDSV
1 ( 886) RLHNTIVEINNHKLKA-QQDKL---DKINKQLDECASAITKAQVAIKTADRNLQKAQDSV
2 ( 861) RLHNTIVEINNHKLKA-QQDKL---DKINKQLDECASAITKAQVAIKTADRNLQKAQDSV
3 ( 756) EEFCREIGVRNIR-EF-EEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKV
4 ( 778) EEFCREIGVRNIR-EF-EEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKV
5 ( 791) LEDQKRVDALNDEIRQLQQENR---QLLNERI-KLEGIITRVETYL---NENLRKRLDQV
//
0 ( 942) LRTEKEIKDTEKEVDDLTAE----LKSLEDKAAEV--VKNTNAAEES-LPEIQKEHRNLL
1 ( 942) LRTEKEIKDTEKEVDDLTAE----LKSLEDKAAEV--VKNTNAAEES-LPEIQKEHRNLL
2 ( 917) LRTEKEIKDTEKEVDDLTAE----LKSLEDKAAEV--VKNTNAAEES-LPEIQKEHRNLL
3 ( 814) HMWEQTVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIR
4 ( 836) HMWEQTVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIR
5 ( 844) EQELNELRETEGGTV-LTAT----TSELE-AINKR--VKDTMARSED-LDNSIDKTEAGI
//
0 ( 995) QELKVIQENEHALQKDAL-SIKLKLEQI--DGHIAEHNSKIKYWHKEISKIS-LHPIEDN
1 ( 995) QELKVIQENEHALQKDAL-SIKLKLEQI--DGHIAEHNSKIKYWHKEISKIS-LHPIEDN
2 ( 970) QELKVIQENEHALQKDAL-SIKLKLEQI--DGHIAEHNSKIKYWHKEISKIS-LHPIEDN
3 ( 874) KKLGGANKEMTHLQKEVT-AIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGT-M---DDI
4 ( 896) KKLGGANKEMTHLQKEVT-AIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGT-M---DDI
5 ( 895) KELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKEL--EKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQE
//
0 ( 1051) PIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLEAR----CH---------EMKPNLGAIAEYK
1 ( 1051) PIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLEAR----CH---------EMKPNLGAIAEYK
2 ( 1026) PIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLEAR----CH---------EMKPNLGAIAEYK
3 ( 929) SQEEGSSQGEDSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKL
4 ( 951) SQEEGSSQGEDSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKL
5 ( 953) AFEKYQTLSLKQL--FRKLEQCNTE---LKKY----SH---------VNKKALDQFVNFS
//
0 ( 1098) KKEELYLQRVAE-----LDKITYERDSF-----------------RQAYEDLRKQRLNEF
1 ( 1098) KKEELYLQRVAE-----LDKITYERDSF-----------------RQAYEDLRKQRLNEF
2 ( 1073) KKEELYLQRVAE-----LDKITYERDSF-----------------RQAYEDLRKQRLNEF
3 ( 989) NEQQSVLQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRF
4 ( 1011) NEQQSVLQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRF
5 ( 995) EQKEKLIKRQEE-----LDR-GYK--SI-----------------MELMNVLELRKYEAI
//
0 ( 1136) MAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDAELEL-----------------------------VDS
1 ( 1136) MAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDAELEL-----------------------------VDS
2 ( 1111) MAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDAELEL-----------------------------VDS
3 ( 1049) NACFESVATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGP---------------------------ENP
4 ( 1071) NACFESVATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGP---------------------------ENP
5 ( 1030) QLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPS
//
0 ( 1167) LDPFSE-GIMFSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAAL
1 ( 1167) LDPFSE-GIMFSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAAL
2 ( 1142) LDPFSE-GIMFSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAAL
3 ( 1082) EEPYLD-GINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHSYKPAPFFVLDEIDAAL
4 ( 1104) EEPYLD-GINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHSYKPAPFFVLDEIDAAL
5 ( 1090) VDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQAL
//
0 ( 1226) DFKNVSIVAFYIYEQ-TKNAQFIIISLRNNMFEISDRLIGIYK-----------TYNITK
1 ( 1226) DFKNVSIVAFYIYEQ-TKNAQFIIISLRNNMFEISDRLIGIYK-----------TYNITK
2 ( 1201) DFKNVSIVAFYIYEQ-TKNAQFIIISLRNNMFEISDRLIGIYK-----------TYNITK
3 ( 1141) DNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPEQGDCVISKVLTFDLTK
4 ( 1163) DNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPEQGDCVISKVLTFDLTK
5 ( 1150) DAQHRKAVSDMIMEL-AVHAQFITTTFRPELLESADKFYGV-K-----------FRNKVS
//
0 ( 1274) SVAVNPKEIASKGLC
1 ( 1274) SVAVNPKEIASKGLC
2 ( 1249) SVAVNPKEIASKGLC
3 ( 1201) YPDANP.........
4 ( 1223) YPDANP.........
5 ( 1197) HIDVITAEMA.....
//
