# 0 Query: pF1KB7001, 1307 aa
# 1 CCDS46401.1 CNTNAP5 gene_id:129684|Hs108|chr2 (1306 aa)
# 2 CCDS73915.1 CNTNAP4 gene_id:85445|Hs108|chr16 (1308 aa)
# 3 CCDS6616.1 CNTNAP3 gene_id:79937|Hs108|chr9 (1288 aa)
# 4 CCDS75836.1 CNTNAP3B gene_id:728577|Hs108|chr9 (1288 aa)
# 5 CCDS5889.1 CNTNAP2 gene_id:26047|Hs108|chr7 (1331 aa)
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exp sw-scr id% from to
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4 ( 11) .........VLLLLPTQTWSPVGAGNPPDCDSPLASALPRSSFSSSSELSSSHGPGFSRL
5 ( 30) ........................STSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSPGYAKI
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*
0 ( 297) ETDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVGN
1 ( 297) ETDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYT-GN
2 ( 300) EFNLMNLDYEISFGGIPAPGKSVSFPHRNFHGCLENLYYNGVDIIDLAKQQKPQIIAMGN
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4 ( 300) DSSNLDLNFEISFGGILSPGRSRAFTRKSFHGCLENLYYNGVDVTELAKKHKPQILMMGN
5 ( 304) EFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSNVGN
//
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1 ( 356) VTFSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGT
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3 ( 360) VSFSCPQPQTVPVTFL-SSRSYLALPGNSGEDKVSVTFQFRTWNRAGHLLFGELRRGSGS
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5 ( 364) LSFSCVEPYTVPV-FFNAT-SYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLGN
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2 ( 419) ILLFL---SDGKLKSNLY-QPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQMA
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4 ( 419) FVLFL---KDGKLKLSLF-QAGQSPRNVTAGAGLNDGQWHSVSFSAKWSHMNVVVDDDTA
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1 ( 472) PPAPDSTWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQ--CLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQ
2 ( 475) SAAPLLGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSK--CKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQ
3 ( 475) --VQPLVAVLIDSGDTYYFGGCLDNSSGSG--CKSPLGGFQGCLRLITIGDKAVDPILVQ
4 ( 475) --VQPLVAVLIDSGDTYYFGGCLGNSSGSG--CKSPLGGFQGCLRLITIGDKAVDPILVQ
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1 ( 530) QGSLGNFSDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQ
2 ( 533) QGSLGNFSDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQ
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4 ( 531) QGALGSFRDLQIDSCGITDRCLPSYCEHGGECSQSWDTFSCDCLGTGYTGETCHSSLYEQ
5 ( 538) QRKPGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEP
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1 ( 590) SCEVYRHQGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEK
2 ( 593) SCEAYKHRGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTETA-WTIIQHNGSDLTRVRNTNPEN
3 ( 591) SCEAHKHRGNPSGLYYIDADGSGPLGPFLVYCNMTADAAWTVVQHGGPDAVTLRGAPSGH
4 ( 591) SCEAHKHRGNPSGLYYIDADGSGPLGPFLVYCNMTADSAWTVVRHGGPDAVTLRGAPSGH
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2 ( 652) PY-AGFFEYVASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLSWWVGRTNETQT
3 ( 651) PRSAVSFAYAAGAGQLRSAVNLAERCEQRLALRCGTARRPDSRDGTPLSWWVGRTNETHT
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2 ( 831) LENLGIADFIRIELRSPTVVTFSFDVGNGPFEISVQSPTHFNDNQWHHVRVERNMKEASL
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1 ( 889) QVDNLPRSTRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKV
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1 ( 1009) TYMFQEPYPVTKNISLSSSAIYTDSAPSKEN---------IALSFVTTQAPSLLLFINSS
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4 ( 1011) TYHFQEHYTLSENSSSLVSSLHRDVTLTREM---------ITLSFRTTRTPSLLLYVSSF
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1 ( 1060) SQDFVVVLLCKNGSLQVRYHLN-K-EET-HVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQM
2 ( 1062) YKEYLSVIIAKNGSLQIRYKLN-KYQEP-DVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEI
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4 ( 1062) YEEYLSVILANNGSLQIRYKLD-R-HQNPDAFTFDFKNMADGQLHQVKINREEAVVMVEV
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1 ( 1117) DQQLRLSYNF--SPEVEFRVIRSLTLGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIA
2 ( 1120) DDNRRRQVHL--SSGTEFSAVKSLVLGRILEHSDVDQDTALAGAQGFTGCLSAVQLSHVA
3 ( 1120) NQSTKKQVIL--SSGTEFNAVKSLILGKVLEAAGADPDTRRAATSGFTGCLSAVRFGRAA
4 ( 1120) NQSAKKQVIL--SSGTEFNAVKSLILGKVLEAAGADPDTRRAATSGFTGCLSAVRFGCAA
5 ( 1129) DHYPSVSYHLPSSSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIA
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1 ( 1175) PLKAALRHATV-APVTVHGTLTE-SSCGF--MVDSDVNA---VTT------VHSSSDPFG
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1 ( 1280) PENLDSSF-RNEIDLQNTVSECKREYFI
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3 ( -) ............................
4 ( -) ............................
5 ( 1304) AESADAAIMNNDPNFTETIDESKKEWLI
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