# 0 Query: pF1KB4155, 299 aa
# 1 CCDS1213.1 F11R gene_id:50848|Hs108|chr1 (299 aa)
# 2 CCDS42911.1 JAM2 gene_id:58494|Hs108|chr21 (298 aa)
# 3 CCDS8494.2 JAM3 gene_id:83700|Hs108|chr11 (310 aa)
# 4 CCDS58787.1 JAM2 gene_id:58494|Hs108|chr21 (312 aa)
# 5 CCDS58788.1 JAM2 gene_id:58494|Hs108|chr21 (262 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 7.5e-80 1950 100.0 1 299
2 1.9e-19 563 35.2 2 298
3 7.8e-19 549 33.6 18 310
4 6.4e-18 528 35.9 2 287
5 1.4e-17 520 38.2 26 262
//
0 ( 1) MGTKAQVERKLLCLFILAILLCSLALGSVTVHS-SEPE----VRIPENNPVKLSCAY--S
1 ( 1) MGTKAQVERKLLCLFILAILLCSLALGSVTVHS-SEPE----VRIPENNPVKLSCAY--S
2 ( 2) ....ARRSRHRLLLLLLRYLVVALGYHKAYGFS-APKDQQV-VTAVEYQEAILACKT--P
3 ( 18) ..............FFLLLLFRGCLIGAVNLKS-SNRT----PVVQEFESVELSCIITDS
4 ( 2) ....ARRSRHRLLLLLLRYLV--VALGYHKAYGFSAPKDQQVVTAVEYQEAILACKT--P
5 ( 26) .......................................................AY---
//
0 ( 54) GFS-SPRVEWKFDQGDTTRLVCYNNKITASYEDRVTFL-PTGITFKSVTREDTGTYTC-M
1 ( 54) GFS-SPRVEWKFDQGDTTRLVCYNNKITASYEDRVTFL-PTGITFKSVTREDTGTYTC-M
2 ( 54) KKTVSSRLEWK-KLGRSVSFVYYQQTLQGDFKNRAEMI-DFNIRIKNVTRSDAGKYRC-E
3 ( 59) QTS-DPRIEWKKIQDEQTTYVFFDNKIQGDLAGRAEILGKTSLKIWNVTRRDSALYRCEV
4 ( 54) KKTVSSRLEWK-KLGRSVSFVYYQQTLQGDFKNRAEMI-DFNIRIKNVTRSDAGKYRC-E
5 ( 28) GFS-APK-----DQ-QVVTAVEYQG----DFKNRAEMI-DFNIRIKNVTRSDAGKYRC-E
//
0 ( 111) VSE--EGGNSYGEVKVKLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYTWFK
1 ( 111) VSE--EGGNSYGEVKVKLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYTWFK
2 ( 111) VSAPSEQGQNLEEDTVTLEVLVAPAVPSCEVPSSALSGTVVELRCQDKEGNPAPEYTWFK
3 ( 118) VAR--NDRKEIDEIVIELTVQVKPVTPVCRVPKAVPVGKMATLHCQESEGHPRPHYSWYR
4 ( 111) VSAPSEQGQNLEEDTVTLEVLVAPAVPSCEVPSSALSGTVVELRCQDKEGNPAPEYTWFK
5 ( 75) VSAPSEQGQNLEEDTVTLEVLVAPAVPSCEVPSSALSGTVVELRCQDKEGNPAPEYTWFK
//
0 ( 169) DGIVMPTNPKSTRAFSNSSYVLNPTTGELVFDPLSASDTGEYSCEARNGYGTPMTSNAVR
1 ( 169) DGIVMPTNPKSTRAFSNSSYVLNPTTGELVFDPLSASDTGEYSCEARNGYGTPMTSNAVR
2 ( 171) DGIRLLENPRLGSQSTNSSYTMNTKTGTLQFNTVSKLDTGEYSCEARNSVGYRRCPGK-R
3 ( 176) NDVPLPTDSRANPRFRNSSFHLNSETGTLVFTAVHKDDSGQYYCIASNDAGSARCEEQ-E
4 ( 171) DGIRLLENPRLGSQSTNSSYTMNTKTGTLQFNTVSKLDTGEYSCEARNSVGYRRCPGK-R
5 ( 135) DGIRLLENPRLGSQSTNSSYTMNTKTGTLQFNTVSKLDTGEYSCEARNSVGYRRCPGK-R
//
0 ( 229) MEAVERNVGVIVAAVLVTLILLGILVFGIWFAYSRGHFDRT----KKGTSSKKVIYSQPS
1 ( 229) MEAVERNVGVIVAAVLVTLILLGILVFGIWFAYSRGHFDRT----KKGTSSKKVIYSQPS
2 ( 230) MQVDDLNISGIIAAVVVVALVISVCGLGVCYAQRKGYF--S----KETSFQKSNSSSKAT
3 ( 235) MEVYDLNIGGIIGGVLVVLAVLALITLGICCAYRRGYFINN----KQDGESYKNP-GKPD
4 ( 230) MQVDDLNISGIIAAVVVVALVISVCGLGVCYAQRKGYFSKETSFQKSNSSSKATTMSE--
5 ( 194) MQVDDLNISGIIAAVVVVALVISVCGLGVCYAQRKGYF--S----KETSFQKSNSSSKAT
//
0 ( 285) A----RS--EGEFKQTSSFLV
1 ( 285) A----RS--EGEFKQTSSFLV
2 ( 284) T----MS--ENDFKHTKSFII
3 ( 290) GVNYIRTDEEGDFRHKSSFVI
4 ( -) ----.................
5 ( 248) T----MS--ENDFKHTKSFII
//