Multiple alignment for pF1KA1714
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KA1714, 1127 aa
#  1    CCDS6616.1 CNTNAP3 gene_id:79937|Hs108|chr9    (1288 aa)
#  2    CCDS75836.1 CNTNAP3B gene_id:728577|Hs108|chr9    (1288 aa)
#  3    CCDS73915.1 CNTNAP4 gene_id:85445|Hs108|chr16    (1308 aa)
#  4    CCDS46401.1 CNTNAP5 gene_id:129684|Hs108|chr2    (1306 aa)
#  5    CCDS5889.1 CNTNAP2 gene_id:26047|Hs108|chr7    (1331 aa)

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   3  (    1)    MGSVTGAVLKTLLLLSTQNWNRVEAGNSYDCDDPLVSALPQASFSSSSELSSSHGPGFAR
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//
                                                                             
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   2  (   61)    LNRRDGAGGWTPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSDWVTSYLLMFSDGGRNW
   3  (   61)    LNRRDGAGGWSPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSNWVTSYLLMFSDSGWNW
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//
                                                                             
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   2  (  121)    KQYRREESIWGFPGNTNADSVVHYRLQPPFEARFLRFLPLAWNPRGRIGMRIEVYGCAYK
   3  (  121)    KQYRQEDSIWGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLEWNPKGRIGMRIEVFGCAYR
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//
                                                                             
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   1  (  181)    SEVVYFDGQSALLYRLDKKPLKPIRDVISLKFKAMQSNGILLHREGQHGNHITLELIKGK
   2  (  181)    SEVVYFDGQSALLYTLDKKPLKPIRDVISLKFKAMQSNGILLHREGQHGNHITLELIKGK
   3  (  181)    SEVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGILLHREGPNGDHITLQLRRAR
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//
                                                                             
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   2  (  241)    LVFFLNSGN--AKLPSTIAPVTLTLGSLLDDQHWHSVLIELLDTQVNFTVDKHTHHFQAK
   3  (  241)    LFLLINSGE--AKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLGKQVNFTVDEHRHHFHAR
   4  (  238)    LALHLNLGDSKARLSSSL-P-SATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTK
   5  (  245)    LVLSLNLGS--NQLGPIYGHTSVMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFRTN

//
                                                                             
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   1  (  299)    GDSSYLDLNFEISFGGIPTPGRSRAFRRKSFHGCLENLYYNGVDVTELAKKHKPQILMMG
   2  (  299)    GDSSNLDLNFEISFGGILSPGRSRAFTRKSFHGCLENLYYNGVDVTELAKKHKPQILMMG
   3  (  299)    GEFNLMNLDYEISFGGIPAPGKSVSFPHRNFHGCLENLYYNGVDIIDLAKQQKPQIIAMG
   4  (  296)    GETDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQI-YTG
   5  (  303)    GEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSNVG

//
                                                                             
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   1  (  359)    NVSFSCPQPQTVPVTFL-SSRSYLALPGNSGEDKVSVTFQFRTWNRAGHLLFGELRRGSG
   2  (  359)    NVSFSCPQPQTVPVTFL-SSRSYLALPGNSGEDKVSVTFQFRTWNRAGHLLFGELQRGSG
   3  (  359)    NVSFSCSQPQSMPVTFL-SSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLISG
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   5  (  363)    NLSFSCVEPYTVPV-FF-NATSYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLG

//
                                                                             
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   1  (  418)    SFVLFLKDGKL--KLSLFQPGQSPRNVTAGAGLNDGQWHSVSFSAKWSHMNVVVDDD--T
   2  (  418)    SFVLFLKDGKL--KLSLFQAGQSPRNVTAGAGLNDGQWHSVSFSAKWSHMNVVVDDD--T
   3  (  418)    GILLFLSDGKL--KSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQ--M
   4  (  415)    TLLLSLEGGIL--RLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDE--A
   5  (  421)    NVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEAS

//
                                                                             
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   1  (  474)    A--VQPLVAV-LIDSGDTYYFGGCLDNSSGSGCKSPLGGFQGCLRLITIGDKAVDPILVQ
   2  (  474)    A--VQPLVAV-LIDSGDTYYFGGCLGNSSGSGCKSPLGGFQGCLRLITIGDKAVDPILVQ
   3  (  474)    AS-AAPLLGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQ
   4  (  471)    APPAPDSTWV-QIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQ
   5  (  481)    A--VRTNSPL-QVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQPSFQGCMQLIQVDDQLVNLYEVA

//
                                                                             
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   2  (  531)    QGALGSFRDLQIDSCGITDRCLPSYCEHGGECSQSWDTFSCDCLGTGYTGETCHSSLYEQ
   3  (  533)    QGSLGNFSDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQ
   4  (  530)    QGSLGNFSDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQ
   5  (  538)    QRKPGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEP

//
                                                                             
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   1  (  591)    SCEAHKHRGNPSGLYYIDADGSGPLGPFLVYCNMTADAAWTVVQHGGPDAVTLRGAPSGH
   2  (  591)    SCEAHKHRGNPSGLYYIDADGSGPLGPFLVYCNMTADSAWTVVRHGGPDAVTLRGAPSGH
   3  (  593)    SCEAYKHRGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMT-ETAWTIIQHNGSDLTRVRNTNPEN
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//
                                                                             
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   1  (  651)    PRSAVSFAYAAGAGQLRSAVNLAERCEQRLALRCGTARRPDSRDGTPLSWWVGRTNETHT
   2  (  651)    PLSAVSFAYAAGAGQLRAAVNLAERCEQRLALRCGTARRPDSRDGTPLSWWVGRTNETHT
   3  (  652)    PYAGF-FEYVASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLSWWVGRTNETQT
   4  (  650)    PY-AMALDYGGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHP
   5  (  657)    KYSVTQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEKHY

//
                 *  *                                                        
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//
                                                                             
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//
                               *                                             
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//
                                                                             
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   1  (  891)    QVDQLPQKMQPAPADGHVRLQLNSQLFIGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGVALDLEERATV
   2  (  891)    QVDQLPQKMQPAPADGHVRLQLNSQLFIGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGVALDLEERATV
   3  (  891)    QVDQLTPKTQPAPADGHVLLQLNSQLFVGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGMTLDLEERAQV
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//
                                                                             
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//
                                                                             
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   1  ( 1011)    TYHFQEHYTLSENSSSLVSSL------HRDVTLTREMITLSFRTTRTPSLLLYVSSFYEE
   2  ( 1011)    TYHFQEHYTLSENSSSLVSSL------HRDVTLTREMITLSFRTTRTPSLLLYVSSFYEE
   3  ( 1011)    IYNFQENYLLSKNSSSHAASF------HGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKE
   4  ( 1009)    TYMFQEPYPVTKNISLSSSAI------YTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQD
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//
                                                                        *****
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   1  ( 1065)    YLSVILANNGSLQIRYKLDRHQNPDAFTFDFKNMADGQLHQVKINREEAVVMVEVNQSTK
   2  ( 1065)    YLSVILANNGSLQIRYKLDRHQNPDAFTFDFKNMADGQLHQVKINREEAVVMVEVNQSAK
   3  ( 1065)    YLSVIIAKNGSLQIRYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEI.....
   4  ( 1063)    FVVVLLCKNGSLQVRYHLNKEET-HVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLR
   5  ( 1074)    FLAVLVKPTGSLQIRYNLGGTREPYNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKL.....

//
                  **
   0  ( 1125)    KSN
   1  ( 1125)    K..
   2  ( 1125)    K..
   3  (    -)    ...
   4  ( 1122)    LS.
   5  (    -)    ...

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