Multiple alignment for pF1KA0612
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KA0612, 1797 aa
#  1    CCDS45742.1 TSPOAP1 gene_id:9256|Hs108|chr17    (1797 aa)
#  2    CCDS11605.1 TSPOAP1 gene_id:9256|Hs108|chr17    (1857 aa)
#  3    CCDS46665.1 RIMBP3 gene_id:85376|Hs108|chr22    (1639 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0          12234   99.7         1    1797
   2    0          11885   96.4        29    1857
   3    9e-11       1497   29.9       293    1632

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   0  (    1)    MEQLTTLPRPGDPGAMEPWALPTWHSWTPGRGGEPSSAAPSIADTPPAALQLQELRSEES
   1  (    1)    MEQLTTLPRPGDPGAMEPWALPTWHSWTPGRGGEPSSAAPSIADTPPAALQLQELRSEES
   2  (   29)    ............................PGRGGEPSSAAPSIADTPPAALQLQELRSEES
   3  (  293)    ...................................SRSLDSTRSLPKASKSEERPSSPDT

//
                                                                             
   0  (   61)    SKPKGDGSSR------PVGGTDPEGAEACLPS-LGQQASSSGPACQRPEDEEVEAFLKAK
   1  (   61)    SKPKGDGSSR------PVGGTDPEGAEACLPS-LGQQASSSGPACQRPEDEEVEAFLKAK
   2  (   61)    SKPKGDGSSR------PVGGTDPEGAEACLPS-LGQQASSSGPACQRPEDEEVEAFLKAK
   3  (  318)    STP---GSRRLSPPPSPLPPPPPPSAHRKLSNPRGGEGSESQP-C------EVLTPSPPG

//
                                                                             
   0  (  114)    LNMSFGDRPNLELLRALGELRQRCAILKEENQMLRKSSFP-ETEEKVRRLKRKNAELAVI
   1  (  114)    LNMSFGDRPNLELLRALGELRQRCAILKEENQMLRKSSFP-ETEEKVRRLKRKNAELAVI
   2  (  114)    LNMSFGDRPNLELLRALGELRQRCAILKEENQMLRKSSFP-ETEEKVRRLKRKNAELAVI
   3  (  368)    LGHHELIKLNWLLAKALWVLARRCYTLQAENKQLRRAGCPYQADEKVKRLKVKRAELTGL

//
                                                                             
   0  (  173)    AKRLEERARKLQETNLR-----------------------------------------V-
   1  (  173)    AKRLEERARKLQETNLR-----------------------------------------V-
   2  (  173)    AKRLEERARKLQETNLR-----------------------------------------VV
   3  (  428)    ARRLADRARKLQETNLRAVSAPIPGESCAGLELCQVFARQRARDLSEQASAPLAKDKQI-

//
                                                                             
   0  (  191)    -----------------------------------------------------------E
   1  (  191)    -----------------------------------------------------------E
   2  (  192)    SAPLPRPGTSLELCRKALARQRARDLSETASALLAKDKQIAALQRECRELQARLTLVGKE
   3  (  487)    -----------------------------------------------------------E

//
                                                                             
   0  (  192)    ---------------GP-------------QWLHVRDFDRLLRESQREVLRLQRQIALRN
   1  (  192)    ---------------GP-------------QWLHVRDFDRLLRESQREVLRLQRQIALRN
   2  (  252)    ---------------GP-------------QWLHVRDFDRLLRESQREVLRLQRQIALRN
   3  (  488)    ELRQECHLLQARVASGPCSDLHTGRGGPCTQWLNVRDLDRLQRESQREVLRLQRQLMLQ-

//
                                                                             
   0  (  224)    QRETLPLPPSWPPGPALQARAGAPAPGAPGEATPQEDADNLPVILGEPEKEQRVQQLESE
   1  (  224)    QRETLPLPPSWPPGPALQARAGAPAPGAPGEATPQEDADNLPVILGEPEKEQRVQQLESE
   2  (  284)    QRETLPLPPSWPPGPALQARAGAPAPGAPGEATPQEDADNLPVILGEPEKEQRVQQLESE
   3  (  547)    -----------------QGNGGA-WPEAGGQSATCE------------EVRRQMLALERE

//
                                                                             
   0  (  284)    LSKKRKKCESLEQEARKKQRRCEELELQLRQAQNENARLVEENSRLSGRATEKEQVEWEN
   1  (  284)    LSKKRKKCESLEQEARKKQRRCEELELQLRQAQNENARLVEENSRLSGRATEKEQVEWEN
   2  (  344)    LSKKRKKCESLEQEARKKQRRCEELELQLRQAQNENARLVEENSRLSGRATEKEQVEWEN
   3  (  577)    LDQRRRECQELGAQAAPARRRGEEAETQLQAALLKNAWLAEENGRLQAKTDWVRKVEAEN

//
                                                                             
   0  (  344)    AELRGQLLGVTQERDSALRKSQGLQSKLESLEQVLKHMREVAQRRQQLEVEHEQARLSLR
   1  (  344)    AELRGQLLGVTQERDSALRKSQGLQSKLESLEQVLKHMREVAQRRQQLEVEHEQARLSLR
   2  (  404)    AELRGQLLGVTQERDSALRKSQGLQSKLESLEQVLKHMREVAQRRQQLEVEHEQARLSLR
   3  (  637)    SEVRGHLGRACQERDAS-----GLIA-----EQLLQQAARGQDRQQQLQRDPQKALCDLH

//
                                                                             
   0  (  404)    EKQEEVRRLQQAQAEAQREHEGAVQLLESTLDSMQARVRELEEQCRSQTEQFSLLAQELQ
   1  (  404)    EKQEEVRRLQQAQAEAQREHEGAVQLLESTLDSMQARVRELEEQCRSQTEQFSLLAQELQ
   2  (  464)    EKQEEVRRLQQAQAEAQREHEGAVQLLESTLDSMQARVRELEEQCRSQTEQFSLLAQELQ
   3  (  687)    PSWKEIQALQCRPGHPPEQPWETSQMPESQVKG-------------SRRPKF--------

//
                                                                             
   0  (  464)    AFRLHPGPLDLLTSALDCGSLGDCPPPPCCCSIPQPCRGSGPK---DLDLPPGSPGRCT-
   1  (  464)    AFRLHPGPLDLLTSALDCGSLGDCPPPPCCCSIPQPCRGSGPK---DLDLPPGSPGRCT-
   2  (  524)    AFRLHPGPLDLLTSALDCGSLGDCPPPPCCCSIPQPCRGSGPK---DLDLPPGSPGRCT-
   3  (  726)    ----HARPEDY--------------------AVSQPNRDIQEKREASLEESPVALGESAS

//
                                                                             
   0  (  520)    -PKSSEPAPATLTGVPRRTAKKAESLSNSSHSESIHNSPKSCPTPEVDTASEVEELEADS
   1  (  520)    -PKSSEPAPATLTGVPRRTAKKAESLSNSSHSESIHNSPKSCPTPEVDTASEVEELEADS
   2  (  580)    -PKSSEPAPATLTGVPRRTAKKAESLSNSSHSESIHNSPKSCPTPEVDTASEVEELEADS
   3  (  762)    VPQVSETVPAS-----QPLSKKTSSQSNSSSEGSMWATVPSSPTLDRDTASEVDDLEPDS

//
                                                                             
   0  (  579)    VSL-LPAAPEGSRGGARIQVFLARYSYNPFEGPNENPEAELPLTAGEYIYIYGNMDEDGF
   1  (  579)    VSL-LPAAPEGSRGGARIQVFLARYSYNPFEGPNENPEAELPLTAGEYIYIYGNMDEDGF
   2  (  639)    VSL-LPAAPEGSRGGARIQVFLARYSYNPFEGPNENPEAELPLTAGEYIYIYGNMDEDGF
   3  (  817)    VSLALEMGGSAAPAAPKLKIFMAQYNYNPFEGPNDHPEGELPLTAGDYIYIFGDMDEDGF

//
                                                                             
   0  (  638)    FEGELMDGRRGLVPSNFVERVSDDDLLTSLPPELADLSHSSGPELSFLSVGGGGSSSGGQ
   1  (  638)    FEGELMDGRRGLVPSNFVERVSDDDLLTSLPPELADLSHSSGPELSFLSVGGGGSSSGGQ
   2  (  698)    FEGELMDGRRGLVPSNFVERVSDDDLLTSLPPELADLSHSSGPELSFLSVGGGGSSSGGQ
   3  (  877)    YEGELEDGRRGLVPSNFVEQIPDSYIPGCLPAKSPDL----GP--SQLPAG---------

//
                                                                            *
   0  (  698)    SSVGRSQPRPEEEDAGDELSLSPSPEGLGEPPAVPYPRRLVVLKQLAHSVVLAWEPPPER
   1  (  698)    SSVGRSQPRPEEEDAGDELSLSPSPEGLGEPPAVPYPRRLVVLKQLAHSVVLAWEPPPEQ
   2  (  758)    SSVGRSQPRPEEEDAGDELSLSPSPEGLGEPPAVPYPRRLVVLKQLAHSVVLAWEPPPEQ
   3  (  922)    ------QDEALEEDS----LLSGKAQG-------------VVDRGLCQMV---------R

//
                                                  *                          
   0  (  758)    VELHGFHICVNGELRQALGPGAPPKAVLENLDLRAGPLHISV-QALTSRGSSDPLRCCLA
   1  (  758)    VELHGFHICVNGELRQALGPGAPPKAVLENLDLWAGPLHISV-QALTSRGSSDPLRCCLA
   2  (  818)    VELHGFHICVNGELRQALGPGAPPKAVLENLDLWAGPLHISV-QALTSRGSSDPLRCCLA
   3  (  950)    V-------------------GSKTEVATEILDTKTEACQLGLLQSMGKQGLSRPL---LG

//
                                                                             
   0  (  817)    VGARAGVVPSQLRVHRLTATSAEITWVPGNSNLAHAIYLNGEE--CPPASPSTYWATFCH
   1  (  817)    VGARAGVVPSQLRVHRLTATSAEITWVPGNSNLAHAIYLNGEE--CPPASPSTYWATFCH
   2  (  877)    VGARAGVVPSQLRVHRLTATSAEITWVPGNSNLAHAIYLNGEE--CPPASPSTYWATFCH
   3  (  988)    TKGVLRMAPMQLHLQNVTATSANITWVYSSHRHPHVVYLDDREHALTPAGVSCY--TFQG

//
                                                                             
   0  (  875)    LRPGTPYQAQVEAQLPPQGPWEPGWERLEQRAATLQFTTLPAGPPDAPLDVQIEPGPSPG
   1  (  875)    LRPGTPYQAQVEAQLPPQGPWEPGWERLEQRAATLQFTTLPAGPPDAPLDVQIEPGPSPG
   2  (  935)    LRPGTPYQAQVEAQLPPQGPWEPGWERLEQRAATLQFTTLPAGPPDAPLDVQIEPGPSPG
   3  ( 1046)    LCPGTHYRARVEVRLP-RDLLQVYWGTM---SSTVTFDTLLAGPPYPPLDVLVERHASPG

//
                                                                             
   0  (  935)    ILIISWLPVTIDAAGTSNGVRVTGYAIYADGQKIMEVASPTAGSVLVELSQLQLLQVCRE
   1  (  935)    ILIISWLPVTIDAAGTSNGVRVTGYAIYADGQKIMEVASPTAGSVLVELSQLQLLQVCRE
   2  (  995)    ILIISWLPVTIDAAGTSNGVRVTGYAIYADGQKIMEVASPTAGSVLVELSQLQLLQVCRE
   3  ( 1102)    VLVVSWLPVTIDSAGSSNGVQVTGYAVYADGLKVCEVADATAGSTLLEFSQLQVPLTWQK

//
                                                                             
   0  (  995)    VVVRTMSPHGESADSIPAPITPALAPASLPARVSCPSPHPSPEARAPLASASPGPGDPSS
   1  (  995)    VVVRTMSPHGESADSIPAPITPALAPASLPARVSCPSPHPSPEARAPLASASPGPGDPSS
   2  ( 1055)    VVVRTMSPHGESADSIPAPITPALAPASLPARVSCPSPHPSPEARAPLASASPGPGDPSS
   3  ( 1162)    VSVRTMSLCGESLDSVPAQI-----PEDF---FMC---HRWPET-PPFSYTC---GDPST

//
                    *                     *                                  
   0  ( 1055)    PLQLPAPLGTQEPPGAPPASPSREMPKGSHEDPPAPCSQEEAGAAVLGTSEERTASTSTL
   1  ( 1055)    PLQHPAPLGTQEPPGAPPASPSREMAKGSHEDPPAPCSQEEAGAAVLGTSEERTASTSTL
   2  ( 1115)    PLQHPAPLGTQEPPGAPPASPSREMAKGSHEDPPAPCSQEEAGAAVLGTSEERTASTSTL
   3  ( 1207)    -YRVTFPVCPQKLSLAPPSAKASPHNPGSCGEPQAKFLE-----AFFEEPPRRQSPVSNL

//
                                                                             
   0  ( 1115)    GEKDPGPAAPSLAKQEAEWTAGEACPASSSTQGARAQQ-APNTEMCQGGDPGSGLRPRAE
   1  ( 1115)    GEKDPGPAAPSLAKQEAEWTAGEACPASSSTQGARAQQ-APNTEMCQGGDPGSGLRPRAE
   2  ( 1175)    GEKDPGPAAPSLAKQEAEWTAGEACPASSSTQGARAQQ-APNTEMCQGGDPGSGLRPRAE
   3  ( 1261)    G------------------SEGE-CPSSGA--GSQAQELAEAWEGC--------------

//
                                                                             
   0  ( 1174)    KEDTAELGVHLVNSLVDHGRNSDLSDIQEEEEEEEEEEEEELGSRTCSFQKQVAGNSIR-
   1  ( 1174)    KEDTAELGVHLVNSLVDHGRNSDLSDIQEEEEEEEEEEEEELGSRTCSFQKQVAGNSIR-
   2  ( 1234)    KEDTAELGVHLVNSLVDHGRNSDLSDIQEEEEEEEEEEEEELGSRTCSFQKQVAGNSIR-
   3  ( 1286)    RKDL------LFQKSPQNHRPPSVSD----QPGEKENCSQHMGT-----SKSPAPGFIHL

//
                                                                             
   0  ( 1233)    --ENGAKSQPDPFCETDSDEEILEQILELPLQQFCSKKLFSIPEEEEEEEEDEEEEKSGA
   1  ( 1233)    --ENGAKSQPDPFCETDSDEEILEQILELPLQQFCSKKLFSIPEEEEEEEEDEEEEKSGA
   2  ( 1293)    --ENGAKSQPDPFCETDSDEEILEQILELPLQQFCSKKLFSIPEEEEEEEEDEEEEKSGA
   3  ( 1331)    RTECGPRKEP---CQ---EKAALERVLR--------------------QKQDAQ------

//
                                                                             
   0  ( 1291)    GCSSRDPGPPEPALLGLGCDSGQPRRPGQCPLSPESSRAGDCLEDMPGLVGGSSRRRGGG
   1  ( 1291)    GCSSRDPGPPEPALLGLGCDSGQPRRPGQCPLSPESSRAGDCLEDMPGLVGGSSRRRGGG
   2  ( 1351)    GCSSRDPGPPEPALLGLGCDSGQPRRPGQCPLSPESSRAGDCLEDMPGLVGGSSRRRGGG
   3  ( 1359)    GFT-----PPQ-----LGA-SQQYASDFHNVLKEE--QEALCLD-----LWGTERRE---

//
                                                                             
   0  ( 1351)    SPEKPPSRRRPPDPREHCSRLLSNNGPQASGRLGPTRERGGLPVIEGPRTGLEASGRGRL
   1  ( 1351)    SPEKPPSRRRPPDPREHCSRLLSNNGPQASGRLGPTRERGGLPVIEGPRTGLEASGRGRL
   2  ( 1411)    SPEKPPSRRRPPDPREHCSRLLSNNGPQASGRLGPTRERGGLPVIEGPRTGLEASGRGRL
   3  ( 1398)    -------ERREPEP--H-----SRQG-QA------------------------------L

//
                                                                             
   0  ( 1411)    GPSRRCSRGRALEPGLASCLSPKCLEISIEYDSEDEQEAGSGGISITSSCYPGDGEAWGT
   1  ( 1411)    GPSRRCSRGRALEPGLASCLSPKCLEISIEYDSEDEQEAGSGGISITSSCYPGDGEAWGT
   2  ( 1471)    GPSRRCSRGRALEPGLASCLSPKCLEISIEYDSEDEQEAGSGGISITSSCYPGDGEAWGT
   3  ( 1413)    GVKRGC---QLHEPSSALCPAPSAKVIKM-------------------------------

//
                                                                             
   0  ( 1471)    ATVGRPRGPPKANSGPKPYPRLPAWEKGEPERRGRSATGRAKEPLSRATETGEARGQDGS
   1  ( 1471)    ATVGRPRGPPKANSGPKPYPRLPAWEKGEPERRGRSATGRAKEPLSRATETGEARGQDGS
   2  ( 1531)    ATVGRPRGPPKANSGPKPYPRLPAWEKGEPERRGRSATGRAKEPLSRATETGEARGQDGS
   3  ( 1439)    -----PRGGPQ---------------------------------------------QLGT

//
                                                                             
   0  ( 1531)    GRRGPQKRGVRVLRPSTAELVPARSPSETLAYQHLPVRIFVALFDYDPVSMSPNPDAGEE
   1  ( 1531)    GRRGPQKRGVRVLRPSTAELVPARSPSETLAYQHLPVRIFVALFDYDPVSMSPNPDAGEE
   2  ( 1591)    GRRGPQKRGVRVLRPSTAELVPARSPSETLAYQHLPVRIFVALFDYDPVSMSPNPDAGEE
   3  ( 1449)    G-------------------------------ANTPARVFVALSDYNPLVMSANLKAAEE

//
                                                                             
   0  ( 1591)    ELPFREGQILKVFGDKDADGFYQGEGGGRTGYIPCNMVAEVAVDSPAGRQQLLQRGYLSP
   1  ( 1591)    ELPFREGQILKVFGDKDADGFYQGEGGGRTGYIPCNMVAEVAVDSPAGRQQLLQRGYLSP
   2  ( 1651)    ELPFREGQILKVFGDKDADGFYQGEGGGRTGYIPCNMVAEVAVDSPAGRQQLLQRGYLSP
   3  ( 1478)    ELVFQKRQLLRVWGSQDTHDFYLSECNRQVGNIPGRLVAEMEV----GTEQTDRR-WRSP

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                                  *                                          
   0  ( 1651)    DILLEGSGNGPFVYSTARTTGPPPKPRRSKKAESEGPAQPCPGPPKLVPSADLKAPHSMV
   1  ( 1651)    DILLEGSGNGPFVYSTAHTTGPPPKPRRSKKAESEGPAQPCPGPPKLVPSADLKAPHSMV
   2  ( 1711)    DILLEGSGNGPFVYSTAHTTGPPPKPRRSKKAESEGPAQPCPGPPKLVPSADLKAPHSMV
   3  ( 1533)    -----AQGNLPSVAHLEDFQGLTI-P--------QGSSLVLQGNSKRLP---LWTPKIMI

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   0  ( 1711)    AAFDYNPQESSPNMDVEAELPFRAGDVITVFGGMDDDGFYYGELNGQRGLVPSNFLEGPG
   1  ( 1711)    AAFDYNPQESSPNMDVEAELPFRAGDVITVFGGMDDDGFYYGELNGQRGLVPSNFLEGPG
   2  ( 1771)    AAFDYNPQESSPNMDVEAELPFRAGDVITVFGGMDDDGFYYGELNGQRGLVPSNFLEGPG
   3  ( 1576)    AALDYDPGDGQMGGQGKGRLALRAGDVVMVYGPMDDQGFYYGELGGHRGLVPAHLLD...

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   0  ( 1771)    PEAGGLDREPRTPQAESQRTRRRRVQC
   1  ( 1771)    PEAGGLDREPRTPQAESQRTRRRRVQC
   2  ( 1831)    PEAGGLDREPRTPQAESQRTRRRRVQC
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