# 0 Query: pF1KA0348, 1496 aa
# 1 CCDS5254.1 SYNJ2 gene_id:8871|Hs108|chr6 (1496 aa)
# 2 CCDS54484.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1526 aa)
# 3 CCDS33540.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1350 aa)
# 4 CCDS33539.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1612 aa)
# 5 CCDS54483.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1295 aa)
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exp sw-scr id% from to
1 0 10062 100.0 1 1496
2 4.3e-102 4088 45.1 1 1419
3 4.4e-96 4031 47.0 40 1349
4 1.2e-95 4042 43.5 40 1517
5 1.6e-94 4016 47.5 1 1294
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0 ( 1) MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDA
1 ( 1) MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFEAGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTDA
2 ( 1) MAFSKGFRIYHKLDPP-PFSLIVETRHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLDA
3 ( 40) MAFSKGFRIYHKLDPP-PFSLIVETRHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLDA
4 ( 40) MAFSKGFRIYHKLDPP-PFSLIVETRHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLDA
5 ( 1) MAFSKGFRIYHKLDPP-PFSLIVETRHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLDA
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0 ( 61) YGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIAL
1 ( 61) YGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIAL
2 ( 60) YGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISEV
3 ( 99) YGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISEV
4 ( 99) YGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISEV
5 ( 60) YGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISEV
//
0 ( 121) KKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDW
1 ( 121) KKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQGDDSSEWGNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCDW
2 ( 120) RKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSMQEQTT-DNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDW
3 ( 159) RKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSMQEQTT-DNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDW
4 ( 159) RKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSMQEQTT-DNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDW
5 ( 120) RKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSMQEQTT-DNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDW
//
0 ( 181) LLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVSCERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIY
1 ( 181) LLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVSCERTGTRFHTRGVNDDGHVSNFVETEQMIY
2 ( 179) LLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVY
3 ( 218) LLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVY
4 ( 218) LLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVY
5 ( 179) LLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVY
//
0 ( 241) MDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVV
1 ( 241) MDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEANAPAFDRHMVLLKEQYGQQVV
2 ( 239) LDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQII
3 ( 278) LDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQII
4 ( 278) LDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQII
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//
0 ( 301) VNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLH
1 ( 301) VNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQFAKGGKLEKLETLLRPQLKLH
2 ( 299) VNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQ-K
3 ( 338) VNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQ-K
4 ( 338) VNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQ-K
5 ( 299) VNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQ-K
//
0 ( 361) WEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKP-I
1 ( 361) WEDFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQSFIALEVLHLQLKTLGLSSKP-I
2 ( 358) FLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALGLAEKPQL
3 ( 397) FLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALGLAEKPQL
4 ( 397) FLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALGLAEKPQL
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//
0 ( 420) VDRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQE
1 ( 420) VDRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEGKAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQE
2 ( 418) VTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEGKAKAGKLKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQE
3 ( 457) VTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEGKAK---LKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQE
4 ( 457) VTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEGKAK---LKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQE
5 ( 418) VTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEGKAK---LKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQE
//
0 ( 480) AIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTP--------RILKAMTERQSEFTNFKRIR
1 ( 480) AIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTALLVTP--------RILKAMTERQSEFTNFKRIR
2 ( 478) AIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRASS--------KVLKSMCENFYKYSKPKKIR
3 ( 514) AIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQTLQSASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIR
4 ( 514) AIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQTLQSASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIR
5 ( 475) AIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQTLQSASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIR
//
0 ( 532) IAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDD-SSPADIFAVGFEEMVE
1 ( 532) IAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLSGATDSQDD-SSPADIFAVGFEEMVE
2 ( 530) VCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVE
3 ( 574) VCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVE
4 ( 574) VCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVE
5 ( 535) VCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVE
//
0 ( 591) LSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVA
1 ( 591) LSAGNIVNASTTNKKMWGEQLQKAISRSHRYILLTSAQLVGVCLYIFVRPYHVPFIRDVA
2 ( 590) LNAGNIVSASTTNQKLWAVELQKTISRDNKYVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVA
3 ( 634) LNAGNIVSASTTNQKLWAVELQKTISRDNKYVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVA
4 ( 634) LNAGNIVSASTTNQKLWAVELQKTISRDNKYVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVA
5 ( 595) LNAGNIVSASTTNQKLWAVELQKTISRDNKYVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVA
//
0 ( 651) IDTVKTGMGGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFP
1 ( 651) IDTVKTGMGGKAGNKGAVGIRFQFHSTSFCFICSHLTAGQSQVKERNEDYKEITQKLCFP
2 ( 650) VDTVKTGMGGATGNKGAVAIRMLFHTTSLCFVCSHFAAGQSQVKERNEDFIEIARKLSFP
3 ( 694) VDTVKTGMGGATGNKGAVAIRMLFHTTSLCFVCSHFAAGQSQVKERNEDFIEIARKLSFP
4 ( 694) VDTVKTGMGGATGNKGAVAIRMLFHTTSLCFVCSHFAAGQSQVKERNEDFIEIARKLSFP
5 ( 655) VDTVKTGMGGATGNKGAVAIRMLFHTTSLCFVCSHFAAGQSQVKERNEDFIEIARKLSFP
//
0 ( 711) MGRNVFSHDYVFWCGDFNYRIDLTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFH
1 ( 711) MGRNVFSHDYVFWCGDFNYRIDLTYEEVFYFVKRQDWKKLLEFDQLQLQKSSGKIFKDFH
2 ( 710) MGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDLPNEEVKELIRQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQVFRGFL
3 ( 754) MGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDLPNEEVKELIRQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQVFRGFL
4 ( 754) MGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDLPNEEVKELIRQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQVFRGFL
5 ( 715) MGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDLPNEEVKELIRQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQVFRGFL
//
0 ( 771) EGAINFGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVD
1 ( 771) EGAINFGPTYKYDVGSAAYDTSDKCRTPAWTDRVLWWRKKHPFDKTAGELNLLDSDLDVD
2 ( 770) EGKVTFAPTYKYDLFSDDYDTSEKCRTPAWTDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDE
3 ( 814) EGKVTFAPTYKYDLFSDDYDTSEKCRTPAWTDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDE
4 ( 814) EGKVTFAPTYKYDLFSDDYDTSEKCRTPAWTDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDE
5 ( 775) EGKVTFAPTYKYDLFSDDYDTSEKCRTPAWTDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDE
//
0 ( 831) TKVRHTWSPGALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDA
1 ( 831) TKVRHTWSPGALQYYGRAELQASDHRPVLAIVEVEVQEVDVGARERVFQEVSSFQGPLDA
2 ( 830) SKILYTWTPGTLLHYGRAELKTSDHRPVVALIDIDIFEVEAEERQNIYKEVIAVQGPPDG
3 ( 874) SKILYTWTPGTLLHYGRAELKTSDHRPVVALIDIDIFEVEAEERQNIYKEVIAVQGPPDG
4 ( 874) SKILYTWTPGTLLHYGRAELKTSDHRPVVALIDIDIFEVEAEERQNIYKEVIAVQGPPDG
5 ( 835) SKILYTWTPGTLLHYGRAELKTSDHRPVVALIDIDIFEVEAEERQNIYKEVIAVQGPPDG
//
0 ( 891) TVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLD
1 ( 891) TVVVNLQSPTLEEKNEFPEDLRTELMQTLGSYGTIVLVRINQGQMLVTFADSHSALSVLD
2 ( 890) TVLVSIKS-SLPENNFFDDALIDELLQQFASFGEVILIRFVEDKMWVTFLEGSSALNVLS
3 ( 934) TVLVSIKS-SLPENNFFDDALIDELLQQFASFGEVILIRFVEDKMWVTFLEGSSALNVLS
4 ( 934) TVLVSIKS-SLPENNFFDDALIDELLQQFASFGEVILIRFVEDKMWVTFLEGSSALNVLS
5 ( 895) TVLVSIKS-SLPENNFFDDALIDELLQQFASFGEVILIRFVEDKMWVTFLEGSSALNVLS
//
0 ( 951) VDGMKVKGRAVKIRPKTKDWLKGLREEIIRKRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYES
1 ( 951) VDGMKVKGRAVKIRPKTKDWLKGLREEIIRKRDSMAPVSPTANSCLLEENFDFTSLDYES
2 ( 949) LNGKELLNRTITIALKSPDWIKNLEEEMSLEKISIALPSSTS-STLLGEDAEVAA-DFDM
3 ( 993) LNGKELLNRTITIALKSPDWIKNLEEEMSLEKISIALPSSTS-STLLGEDAEVAA-DFDM
4 ( 993) LNGKELLNRTITIALKSPDWIKNLEEEMSLEKISIALPSSTS-STLLGEDAEVAA-DFDM
5 ( 954) LNGKELLNRTITIALKSPDWIKNLEEEMSLEKISIALPSSTS-STLLGEDAEVAA-DFDM
//
0 ( 1011) EGDILEDDEDYLVDEFN----QPGVSDSELG-------------GDDLSDVPGPT-ALAP
1 ( 1011) EGDILEDDEDYLVDEFN----QPGVSDSELG-------------GDDLSDVPGPT-ALAP
2 ( 1007) EGDV--DDYSAEVEELLPQHLQPS-SSSGLGTSPSSSPRTSPCQSPTISEGPVPSLPIRP
3 ( 1051) EGDV--DDYSAEVEELLPQHLQPS-SSSGLGTSPSSSPRTSPCQSPTISEGPVPSLPIRP
4 ( 1051) EGDV--DDYSAEVEELLPQHLQPS-SSSGLGTSPSSSPRTSPCQSPTISEGPVPSLPIRP
5 ( 1012) EGDV--DDYSAEVEELLPQHLQPS-SSSGLGTSPSSSPRTSPCQSPTISEGPVPSLPIRP
//
0 ( 1053) ---PSKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKRELEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPRPPQPPQ
1 ( 1053) ---PSKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKRELEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPRPPQPPQ
2 ( 1064) SRAPSRTPGPPSAQSSPIDAQPATPLPQKDPAQPL-EPKRPPPPRPVAPPTRP---APPQ
3 ( 1108) SRAPSRTPGPPSAQSSPIDAQPATPLPQKDPAQPL-EPKRPPPPRPVAPPTRP---APPQ
4 ( 1108) SRAPSRTPGPPSAQSSPIDAQPATPLPQKDPAQPL-EPKRPPPPRPVAPPTRP---APPQ
5 ( 1069) SRAPSRTPGPPSAQSSPIDAQPATPLPQKDPAQPL-EPKRPPPPRPVAPPTRP---APPQ
//
0 ( 1110) RPPPPTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSILQTARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIK
1 ( 1110) RPPPPTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSILQTARLLPGAPQQPPKARTGISKPYNVKQIK
2 ( 1120) RPPPPSGR--SQPSPQAGLAGPGPAGYS---TAR-----PTIPPRAGV-ISAPQS--HAR
3 ( 1164) RPPPPSG---------ARSPAPTRKEFGGI-------GAPPSPGVARREMEAPKSPGTTR
4 ( 1164) RPPPPSG---------ARSPAPTRKEFGGI-------GAPPSPGVARREMEAPKSPGTTR
5 ( 1125) RPPPPSG-----ARSPAPTRKEFGAPKSPGTTRKDNIGRSQPSPQAGLAGPGPAGYSTAR
//
0 ( 1170) TTNAQEAEAAIRCLLEARGGA---S--EEALSAVAPRDLEASSEPEPT-PGAAKPETPQA
1 ( 1170) TTNAQEAEAAIRCLLEARGGA---S--EEALSAVAPRDLEASSEPEPT-PGAAKPETPQA
2 ( 1167) ASAGRLTPESQSKTSETSKGS---TFLPEPLKPQAAFPPQ-SSLPPPA-QRLQEPLVPVA
3 ( 1208) KDNIGRSQPSPQAGLAGPGPA---G--YSTARPTIPPRAGVISAPQSH-ARAS------A
4 ( 1208) KDNIGRSQPSPQAGLAGPGPA---G--YSTARPTIPPRAGVISAPQSH-ARAS------A
5 ( 1180) PTIPPRAGVISAPQSHARASAGRLT--PESQSKTSETSKGSTFLPEPLKPQAAFP--PQS
//
0 ( 1224) PPLLPRRPPPRVPAIKKPTLR-RTGKPLSPEEQFEQQ--TVHFTIGPPETSVEAPPV-VT
1 ( 1224) PPLLPRRPPPRVPAIKKPTLR-RTGKPLSPEEQFEQQ--TVHFTIGPPETSVEAPPV-VT
2 ( 1222) APMPQSGPQPNLETPPQPPPRSRSSHSLPSEASSQPQVKTNGISDGKRESPLKIDPF-ED
3 ( 1256) GRLTPESQSKTSETSKGSTF---LPEPLKPQAAFPPQ--S---SLPPPAQRLQEPLVPVA
4 ( 1256) GRLTPESQSKTSETSKGSTF---LPEPLKPQAAFPPQ--S---SLPPPAQRLQEPLVPVA
5 ( 1236) S-----LPPPA---------Q-RLQEPLVPVAAPMPQ--S-----GP-QPNLETPP----
//
0 ( 1280) AP----------RVPPVPKPRTFQ----PGKAAERP--SHRKPASDEAPPGAGAS-VPPP
1 ( 1280) AP----------RVPPVPKPRTFQ----PGKAAERP--SHRKPASDEAPPGAGAS-VPPP
2 ( 1281) LSF---------NLLAVSKAQLSV----QTSPVPTP--DPKRLI--QLPSATQSN-VLSS
3 ( 1308) APMPQSGPQPNLETPPQPPPRSRSSHSLPSEASSQP--QQEQPS................
4 ( 1308) AP----------MPQSGPQPNLET----PPQPPPRSRSSHSLPSEASSQPQVKTNGISDG
5 ( 1269) QP------------PPRSRSSHSL----PSEASSQP--QQEQPS................
//
0 ( 1323) LEAPPLVPKVPPRRKKSAPAAFHLQVLQSNSQLLQGLTYNSSDSPSGHP------PAA--
1 ( 1323) LEAPPLVPKVPPRRKKSAPAAFHLQVLQSNSQLLQGLTYNSSDSPSGHP------PAA--
2 ( 1323) VSCMPTMPPIPARSQSQE------NMRSSPNPFITGLTRTN-------P------FSD--
3 ( -) ............................................................
4 ( 1354) KRESPL--KIDPFEDLS----FNLLAV-SKAQL----SVQTSPVPTPDPKRLIQLPSATQ
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 1375) GTVFPQGDFLSTSSATSPDSDGTKAMKPEAAPLLGDYQ--DPFWNLLHHPKLLNNTWLSK
1 ( 1375) GTVFPQGDFLSTSSATSPDSDGTKAMKPEAAPLLGDYQ--DPFWNLLHHPKLLNNTWLSK
2 ( 1362) RTAAPGNPF----RAKSEESEATSWFSKEEPVTISPF----PSLQPLGHNKSRASSSLDG
3 ( -) ............................................................
4 ( 1403) SNVLSSVSCMPTMPPIPARSQSQENMRSSPNPFITGLTRTNPFSDRTAAP---GNPFRAK
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 1433) SSDPLDSGTRSPKRDPIDPVSAGASAAKAELPPDHEHKTLGHWVTISDQEKRTALQVFDP
1 ( 1433) SSDPLDSGTRSPKRDPIDPVSAGASAAKAELPPDHEHKTLGHWVTISDQEKRTALQVFDP
2 ( 1414) FKDSFD......................................................
3 ( -) ............................................................
4 ( 1460) SEES-EATSWFSKEEPVT-ISPFPSLQPLGHNKSRASSSLDGFKDSFDLQGQSTLKISNP
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 1493) LAKT
1 ( 1493) LAKT
2 ( -) ....
3 ( -) ....
4 ( -) ....
5 ( -) ....
//