Manual PowerGet PowerMatch AlignmentTable

2013年4月27日 (土) 07:28時点における版

アラインメントテーブル

アラインメントテーブルは、アラインメントした結果を表形式で表示します。このテーブルを通じて、ピークやアラインメントのアノテーションをしたり、ピークを探したり、サンプル間でのさらなる比較解析や多変量解析のためにピーク情報を出力したりします。さらに、自動的にアラインメントされた結果が気に入らない場合、手作業でそれを修正することまでできます。

ここでは、アラインメントテーブルの見方を解説します。

アラインメントテーブルの表示

アライメントテーブルは、以下の方法で表示することができます。

１）ピークのアラインメントに従ってAnalysisメニューのDo Alignmentを実行すると、新規にアラインメントが行われ、アラインメント結果が表示されます。

２）アラインメントテーブルのFileメニューでSave Alignmentを行うと、アラインメントおよびその編集結果が保存されます。一度保存したデータは以下の方法で呼び出すことができます。

PowerMatchメインウィンドウでホームディレクトリを選択した後、AnalysisメニューのLoad Alignmentを選択します。

※ここで誤ってDo Alignmentを選択してしまうと再度アラインメントが開始されてしまい、これまでの編集内容が失われてしまいますので、十分にご注意ください。

テーブルの列の構成

アラインメントテーブルの左側には、アラインメントの集計結果（ピーク強度の平均値など）を表示する列がいくつかあります。それに続けて右側には、各サンプルのピーク情報を表示する列がサンプルの数だけ存在します。サンプルのピーク情報を表示する列の各セルには、数字が２段で記載されており、緑、青、赤の小さな四角が描かれています。

表のソート

各列のヘッダーをクリックするとヘッダー部分に「▲」マークが現れ、セルの内容が昇順にソートされます。もう一度クリックすると「▼」になり降順にソートされます。さらにもう一度クリックすると元に戻ります。

表示する列の選択

SettingメニューのTable Columns...を選択すると、右図の様な画面が表示されます。Validのチェックをオン・オフすることで、アラインメントテーブル上での列の表示をオン・オフできます。

また、行を選択して▲または▼ボタンを押すと、その行が上下に移動します。アラインメントテーブルでは、この順番で左側から列が表示されることになります。

※ただし「No.」の列はValid以外選択できず、表示順の変更もできません。必ず先頭（表の左端）に表示されます。

列の意味

サンプル列のセル

各サンプルのピークを表すセルは、右図のように表示されています。