Manual PowerGet PowerMatch AlignmentTable
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+ | アラインメントテーブルは、アラインメントした結果を表形式で表示します。このテーブルを通じて、ピークやアラインメントのアノテーションをしたり、ピークを探したり、サンプル間でのさらなる比較解析や多変量解析のためにピーク情報を出力したりします。さらに、自動的にアラインメントされた結果が気に入らない場合、手作業でそれを修正することまでできます。 | ||
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+ | ここでは、アラインメントテーブルの見方を解説します。 | ||
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+ | アライメントテーブルは、以下の方法で表示することができます。 | ||
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+ | 1){{Link|Manual_PowerGet_PowerMatch_PeakAlignment|ピークのアラインメント}}に従って{{Menu|Analysis}}メニューの{{Menu|Do Alignment}}を実行すると、新規にアラインメントが行われ、アラインメント結果が表示されます。 | ||
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+ | 2)アラインメントテーブルの{{Menu|File}}メニューで{{Menu|Save Alignment}}を行うと、アラインメントおよびその編集結果が保存されます。一度保存したデータは以下の方法で呼び出すことができます。 | ||
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+ | PowerMatchメインウィンドウでホームディレクトリを選択した後、{{Menu|Analysis}}メニューの{{Menu|Load Alignment}}を選択します。 | ||
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+ | ※ここで誤って{{Menu|Do Alignment}}を選択してしまうと再度アラインメントが開始されてしまい、これまでの編集内容が失われてしまいますので、十分にご注意ください。 | ||
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+ | == テーブルの列の構成 == | ||
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+ | アラインメントテーブルの左側には、アラインメントの集計結果(ピーク強度の平均値など)を表示する列がいくつかあります。それに続けて右側には、各サンプルのピーク情報を表示する列がサンプルの数だけ存在します。サンプルのピーク情報を表示する列の各セルには、数字が2段で記載されており、緑、青、赤の小さな四角が描かれています。 | ||
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+ | === 表のソート === | ||
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+ | 各列のヘッダーをクリックするとヘッダー部分に「▲」マークが現れ、セルの内容が昇順にソートされます。もう一度クリックすると「▼」になり降順にソートされます。さらにもう一度クリックすると元に戻ります。 | ||
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+ | === 表示する情報の選択 === | ||
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+ | {{Menu|Setting}}メニューの{{Menu|Table Columns...}}を選択すると、右図の様な画面が表示されます。Validのチェックをオン・オフすることで、アラインメントテーブル上での列の表示をオン・オフできます。 | ||
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+ | また、行を選択して{{Button|▲}}または{{Button|▼}}ボタンを押すと、その行が上下に移動します。アラインメントテーブルでは、この順番で左側から列が表示されることになります。 | ||
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+ | ※ただし「No.」の列はValid以外選択できず、表示順の変更もできません。必ず先頭(表の左端)に表示されます。 |
2013年4月27日 (土) 07:17時点における版
アラインメントテーブル
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アラインメントテーブルは、アラインメントした結果を表形式で表示します。このテーブルを通じて、ピークやアラインメントのアノテーションをしたり、ピークを探したり、サンプル間でのさらなる比較解析や多変量解析のためにピーク情報を出力したりします。さらに、自動的にアラインメントされた結果が気に入らない場合、手作業でそれを修正することまでできます。
ここでは、アラインメントテーブルの見方を解説します。
アラインメントテーブルの表示
アライメントテーブルは、以下の方法で表示することができます。
1)ピークのアラインメントに従って メニューの を実行すると、新規にアラインメントが行われ、アラインメント結果が表示されます。
2)アラインメントテーブルの メニューで を行うと、アラインメントおよびその編集結果が保存されます。一度保存したデータは以下の方法で呼び出すことができます。
PowerMatchメインウィンドウでホームディレクトリを選択した後、
メニューの を選択します。
※ここで誤って を選択してしまうと再度アラインメントが開始されてしまい、これまでの編集内容が失われてしまいますので、十分にご注意ください。
テーブルの列の構成
アラインメントテーブルの左側には、アラインメントの集計結果(ピーク強度の平均値など)を表示する列がいくつかあります。それに続けて右側には、各サンプルのピーク情報を表示する列がサンプルの数だけ存在します。サンプルのピーク情報を表示する列の各セルには、数字が2段で記載されており、緑、青、赤の小さな四角が描かれています。
表のソート
各列のヘッダーをクリックするとヘッダー部分に「▲」マークが現れ、セルの内容が昇順にソートされます。もう一度クリックすると「▼」になり降順にソートされます。さらにもう一度クリックすると元に戻ります。
表示する情報の選択
メニューの を選択すると、右図の様な画面が表示されます。Validのチェックをオン・オフすることで、アラインメントテーブル上での列の表示をオン・オフできます。
また、行を選択して
または ボタンを押すと、その行が上下に移動します。アラインメントテーブルでは、この順番で左側から列が表示されることになります。※ただし「No.」の列はValid以外選択できず、表示順の変更もできません。必ず先頭(表の左端)に表示されます。