Manual PowerGet PowerMatch AlignmentTable

(版間での差分)
移動: 案内, 検索
(ページの作成:「{{Breadcrumb |メインページ|メイン |Manual_PowerGet|PowerGetマニュアル |Manual_PowerGet_PowerMatch|PowerMatch }} = アラインメントテーブル = {| s...」)
 
4行: 4行:
 
|Manual_PowerGet_PowerMatch|PowerMatch
 
|Manual_PowerGet_PowerMatch|PowerMatch
 
}}
 
}}
= アラインメントテーブル =
+
<p class="km_title"> アラインメントテーブル </p>
 
{| style="float: right"
 
{| style="float: right"
 
|__TOC__
 
|__TOC__
 
|}
 
|}
 +
<br style="clear: both;">
 +
 +
アラインメントテーブルは、アラインメントした結果を表形式で表示します。このテーブルを通じて、ピークやアラインメントのアノテーションをしたり、ピークを探したり、サンプル間でのさらなる比較解析や多変量解析のためにピーク情報を出力したりします。さらに、自動的にアラインメントされた結果が気に入らない場合、手作業でそれを修正することまでできます。
 +
 +
 +
ここでは、アラインメントテーブルの見方を解説します。
 +
 +
== アラインメントテーブルの表示 ==
 +
 +
アライメントテーブルは、以下の方法で表示することができます。
 +
 +
1){{Link|Manual_PowerGet_PowerMatch_PeakAlignment|ピークのアラインメント}}に従って{{Menu|Analysis}}メニューの{{Menu|Do Alignment}}を実行すると、新規にアラインメントが行われ、アラインメント結果が表示されます。
 +
 +
 +
2)アラインメントテーブルの{{Menu|File}}メニューで{{Menu|Save Alignment}}を行うと、アラインメントおよびその編集結果が保存されます。一度保存したデータは以下の方法で呼び出すことができます。
 +
 +
PowerMatchメインウィンドウでホームディレクトリを選択した後、{{Menu|Analysis}}メニューの{{Menu|Load Alignment}}を選択します。
 +
 +
 +
※ここで誤って{{Menu|Do Alignment}}を選択してしまうと再度アラインメントが開始されてしまい、これまでの編集内容が失われてしまいますので、十分にご注意ください。
 +
 +
== テーブルの列の構成 ==
 +
 +
アラインメントテーブルの左側には、アラインメントの集計結果(ピーク強度の平均値など)を表示する列がいくつかあります。それに続けて右側には、各サンプルのピーク情報を表示する列がサンプルの数だけ存在します。サンプルのピーク情報を表示する列の各セルには、数字が2段で記載されており、緑、青、赤の小さな四角が描かれています。
 +
 +
=== 表のソート ===
 +
 +
各列のヘッダーをクリックするとヘッダー部分に「▲」マークが現れ、セルの内容が昇順にソートされます。もう一度クリックすると「▼」になり降順にソートされます。さらにもう一度クリックすると元に戻ります。
 +
 +
=== 表示する情報の選択 ===
 +
 +
{{Menu|Setting}}メニューの{{Menu|Table Columns...}}を選択すると、右図の様な画面が表示されます。Validのチェックをオン・オフすることで、アラインメントテーブル上での列の表示をオン・オフできます。
 +
 +
また、行を選択して{{Button|▲}}または{{Button|▼}}ボタンを押すと、その行が上下に移動します。アラインメントテーブルでは、この順番で左側から列が表示されることになります。
 +
 +
※ただし「No.」の列はValid以外選択できず、表示順の変更もできません。必ず先頭(表の左端)に表示されます。

2013年4月27日 (土) 07:17時点における版

アラインメントテーブル

目次


アラインメントテーブルは、アラインメントした結果を表形式で表示します。このテーブルを通じて、ピークやアラインメントのアノテーションをしたり、ピークを探したり、サンプル間でのさらなる比較解析や多変量解析のためにピーク情報を出力したりします。さらに、自動的にアラインメントされた結果が気に入らない場合、手作業でそれを修正することまでできます。


ここでは、アラインメントテーブルの見方を解説します。

アラインメントテーブルの表示

アライメントテーブルは、以下の方法で表示することができます。

1)ピークのアラインメントに従ってAnalysisメニューのDo Alignmentを実行すると、新規にアラインメントが行われ、アラインメント結果が表示されます。


2)アラインメントテーブルのFileメニューでSave Alignmentを行うと、アラインメントおよびその編集結果が保存されます。一度保存したデータは以下の方法で呼び出すことができます。

PowerMatchメインウィンドウでホームディレクトリを選択した後、AnalysisメニューのLoad Alignmentを選択します。


※ここで誤ってDo Alignmentを選択してしまうと再度アラインメントが開始されてしまい、これまでの編集内容が失われてしまいますので、十分にご注意ください。

テーブルの列の構成

アラインメントテーブルの左側には、アラインメントの集計結果(ピーク強度の平均値など)を表示する列がいくつかあります。それに続けて右側には、各サンプルのピーク情報を表示する列がサンプルの数だけ存在します。サンプルのピーク情報を表示する列の各セルには、数字が2段で記載されており、緑、青、赤の小さな四角が描かれています。

表のソート

各列のヘッダーをクリックするとヘッダー部分に「▲」マークが現れ、セルの内容が昇順にソートされます。もう一度クリックすると「▼」になり降順にソートされます。さらにもう一度クリックすると元に戻ります。

表示する情報の選択

SettingメニューのTable Columns...を選択すると、右図の様な画面が表示されます。Validのチェックをオン・オフすることで、アラインメントテーブル上での列の表示をオン・オフできます。

また、行を選択してまたはボタンを押すと、その行が上下に移動します。アラインメントテーブルでは、この順番で左側から列が表示されることになります。

※ただし「No.」の列はValid以外選択できず、表示順の変更もできません。必ず先頭(表の左端)に表示されます。

個人用ツール
名前空間
変種
操作
案内
ツールボックス