Manual PowerGet PowerFT MainWorkFlow PeakAssignment

2013年1月18日 (金) 01:11時点における版

解析ステップ４）Peak Assignment

これまでの解析ステップで処理したデータを統合します。まず内標補正した質量データをとりこみ、質量精度が高い位置でピークの精密質量を決定します。MS/MSデータも統合します。さらに、化合物中の炭素原子の数の絞り込みに役立つ13C/12C比の計算も行います。これらの情報と、推定されたイオン付加体の種類をもとに、組成式の推定と代表的なデータベースに対する検索を、全ピークに対して高速に行います。これらの集計結果はマニュアルでの編集・修正が可能です。

Peak Assignmentまで解析したデータは、PowerMatchで読み込んで他の解析データとアラインメントをとることができます。繰り返し分析やブランクとの比較など、複数の分析データがある場合、データベース検索などのアノテーション作業は、PowerMatchで行うことをお勧めします。PowerMatchではより強力なアノテーション機能が提供されています。

解析の流れ

前ステップまでの解析データを開いたら、まず以下の処理を行います。

1. 精密質量の計算
2. 13C/12C比の計算
3. MS/MSデータの統合
4. イオン付加体の推定

これで、アノテーションに必要な情報がすべて統合されます。その後は、データベース検索ツールなどを使って、アノテーションを進めます。

必要に応じて、解析したデータをMicrosoft Excelなどで編集するために出力します。

編集したピークのアノテーション情報は、FileメニューのSave Dataを行うことで保存されます。時間をかけて作った大切なアノテーション結果を守るためにも、こまめな保存をお勧めします。

ツールの起動とデータの読み込み

解析ステップ３まで終了した後、PowerFTメイン画面からホームディレクトリを選択して、AnalysisメニューのPeak Assignmentを選択します。右図のようなウィンドウが開きます。

FileメニューOpen Analysisを選択し、解析名を選択したのちにOKボタンを押します。

進捗ウィンドウが表示された後、ツール画面の大きな表にデータが表示されたら、データの読み込み完了です。

はじめに行う処理

最初にPeak Assignmentでの処理を行う時は、データを読み込んだ後、以下の４つの処理を行ってください。この操作により、これまでに解析したデータが全て統合され、アノテーションを進めるための準備が整います。

精密質量の計算

前準備のステップで作成した、内標補正した質量データを統合します。

AnalysisメニューのAttach Corrected Massを選択すると、右図のような画面が現れます。フォルダアイコンのついたボタンをクリックして、内標補正で作成したISC_~という名前のファイルを選択してください。OKボタンを押してFile Settings画面を閉じます。

※　内標補正をせずISCファイルが存在しない場合は、このファイル選択手順はスキップしてください。

次に、WindowメニューからExact Mass Calcを選択し、右図の様な画面を表示させてください。このExact Mass Caluculation画面が表示されている状態で、AnalysisメニューのCalc. All Exact Massを選択してください。進捗ウィンドウが現れたのち、すぐに消えて処理が終了します。

※　内標補正をせずISCファイルが存在しない場合も、この操作は行ってください。

上記の操作をすると、全ピークに対して精密質量の計算がされます。

※この段階では、まだピークテーブルのm/z Actual Predictedの列は質量値が0のままです。この列のデータは、イオン付加体の推定のステップが終わった後に表示されるようになります。

13C/12C比の計算

MS/MSデータの統合

イオン付加体の推定