Miyakogusa Predicted Gene

chr1.LjT04O21.220.nd
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.18 [Mar-02-2008]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= chr1.LjT04O21.220.nd
         (3321 letters)

Database: lotus_EST_unigene 
           20,423 sequences; 9,996,863 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

KMC000244A_C01 KMC000244A_c01                                        1195   0.0  
BP030378  MF040c04_f                                                 1084   0.0  

>KMC000244A_C01 KMC000244A_c01;
          Length = 710

 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0
 Identities = 684/707 (96%), Gaps = 3/707 (0%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                        
Query: 2617 tgatatggagaagaagcagcacttgctcgtgcaggagcaacaggtttggaatcagtatgc 2676
            ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||
Sbjct: 710  tgatatggagaagaagccgcacttgctcgtgccggagccaccggtttggaatccgtatgc 651

                                                                        
Query: 2677 gagggatgggatgcaaggccaatctagcttggccaaattgaacggtgccggatactatcc 2736
            |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 650  gagggatgggatgccaggcccatctag-ttggctaaattgaacggtgccggatactatcc 592

                                                                        
Query: 2737 tggaggtcctatgccaatgatgccttatgggatgcccccagtcaatggaatgggacctcc 2796
            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct: 591  tggaggtcctatgcccatgatgccttatgggatgccccccgtccatggaatgggacctcc 532

                                                                        
Query: 2797 aaccgggtattaccaagctccttactgattttgccacatacatataggttgtttcgttta 2856
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531  caccgggtattacccagctccttactgattttgccacatacatataggttgtttcgttta 472

                                                                        
Query: 2857 ttttcattttttactatgacatagtgtttttcctttgtttgaaatggtgtcatcttatta 2916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 471  ttttcattttttactatgacatagtgtttttcctttgtttgaaatggtgtcatcttatta 412

                                                                        
Query: 2917 ttcttgagacctgcacatcagtaggatggggatgctaaggagactgagtttaacgaaaca 2976
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 411  ttcttgagacctgcacatccgtaggatggggatgctaaggagactgagtttaacgaaacc 352

                                                                        
Query: 2977 acttcttgttgggttttggtgctgggagagatgtgtaactcagttgtattgtctctgtct 3036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 351  acttcttgttgggttttggtgctgggagagatgtgtaactccgttgtattgtctctgtct 292

                                                                        
Query: 3037 gtgtcttttgtaatagtagcattttcttctccattttgtattca-agtgattcttgttcc 3095
            |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 291  gtgtcttttgtaatagtagccttttcttctcccttttgtattcacagtgattcttgttcc 232

                                                                        
Query: 3096 ttgcaacaaacgcttaactactgtaaatttcatcaaatgctggtactgagtactgacaat 3155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 231  ttgcaacaaacgcttaactactgtaaatttcatcaaatgctggtactgagtactgacaat 172

                                                                        
Query: 3156 cttgattggttacgccga-tgataattcatcttgtgggaatagctgtggctgcttattaa 3214
            |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 171  cttgattggttacgccgattgataattcatcttgtgggaatagctgtggctgcttattaa 112

                                                                        
Query: 3215 gcaaatgatagtgaaagtttaattgtcatttgtactgtatcttaatcttaattttttgat 3274
            |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 111  gcaaatgatagtgaaagtttaattgtcatttggactggatcttaatcttaattttttgat 52

                                                           
Query: 3275 tggttgtgtagaactaaactcatgtaagaaatactgttagatatttc 3321
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 51   tggttgtgtagaactaaactcatgtaagaaatactgttagatatttc 5


>BP030378  MF040c04_f;
          Length = 558

 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0
 Identities = 553/556 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 2014 tgaacagccagaagaggagcctgtaccggatatgaacgaaatcaaggcactgcctccacc 2073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3    tgaacagccagaagaggagcctgtaccggatatgaacgaaatcaaggcactgcctccacc 62

                                                                        
Query: 2074 tgagaattataccccgccacctcaacctgagccagagcctaaaccacaaccacaagttca 2133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63   tgagaattataccccgccacctcaacctgagccagagcctaaaccacaaccacaagttca 122

                                                                        
Query: 2134 ggaggacttggtgaatctgagggaggatgcagtcactgcagatgaccagggcaatagatt 2193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123  ggaggacttggtgaatctgagggaggatgcagtcactgcagatgaccagggcaatagatt 182

                                                                        
Query: 2194 tgctttggcactctttgctggtgcaccagctaatggaaatggatcatggcaagcctttcc 2253
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183  tgcttnggcactctttgctggtgcaccagctaatggaaatggatcatggcaagcctttcc 242

                                                                        
Query: 2254 ctcaaacggacagccggaagtgacttcagcttggcaaaacccagcggcagaacctgggaa 2313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243  ctcaaacggacagccggaagtgacttcagcttggcaaaacccagcggcagaacctgggaa 302

                                                                        
Query: 2314 agccgattgggaattggcattggtagagactgctagcaatttggcaaaccagaaggcagc 2373
            ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303  agccgatngggaatnggcattggtagagactgctagcaatttggcaaaccagaaggcagc 362

                                                                        
Query: 2374 tttaggtggtggccttgatcccttattgttgaatggcatgtatgatcaaggaatggtgag 2433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363  tttaggtggtggccttgatcccttattgttgaatggcatgtatgatcaaggaatggtgag 422

                                                                        
Query: 2434 gcagcatgtcagcactgccaatctgagtggaggaagtgcaagtagcgtggcattgccagg 2493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423  gcagcatgtcagcactgccaatctgagtggaggaagtgcaagtagcgtggcattgccagg 482

                                                                        
Query: 2494 accggggaagaccacaacacctgttttagctcttccagccccagatggatcggtgcagcc 2553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 483  accggggaagaccacaacacctgttttagctcttccagccccagatggatcggtgcagcc 542

                            
Query: 2554 agttaatcaggatcca 2569
            ||||||||||||||||
Sbjct: 543  agttaatcaggatcca 558