FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00274.ptfa, 1530 aa vs ./tmplib.26680 library 1767487 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5851+/-0.00793; mu= -3.1348+/- 0.527 mean_var=305.9028+/-74.665, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 90 in 1/35 Lambda= 0.0733 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1362 ( 1407 res) mia41047 (1407) 1550 179 6.9e-45 mKIAA4239 ( 1059 res) mfj24184 (1059) 433 61 2.1e-09 mKIAA1415 ( 1665 res) mib23074 (1665) 252 42 0.0017 mKIAA0305 ( 1536 res) mbg08215 (1536) 241 40 0.0035 mKIAA4037 ( 919 res) mfj00669 ( 919) 232 39 0.0048 >>mKIAA1362 ( 1407 res) mia41047 (1407 aa) initn: 1726 init1: 703 opt: 1550 Z-score: 898.3 bits: 178.8 E(): 6.9e-45 Smith-Waterman score: 1712; 30.371% identity (34.875% ungapped) in 1564 aa overlap (11-1530:2-1407) 10 20 30 40 50 mFLJ00 PTRTARSDQPRAPRWKMHR--ADSPKPPLAPKPK-VATNPYAPAAKFPPSQRPD-SFPSP : :: 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.:::..:.....:: mKIAA1 TQRWIDAFQEGTVL 1400 >>mKIAA4239 ( 1059 res) mfj24184 (1059 aa) initn: 584 init1: 259 opt: 433 Z-score: 261.2 bits: 60.5 E(): 2.1e-09 Smith-Waterman score: 751; 24.976% identity (29.613% ungapped) in 1041 aa overlap (577-1524:44-1014) 550 560 570 580 590 600 mFLJ00 RARPHSGKVAGHVPETVLEETGPETCSSGMGIRDTSDEVRKIGILPEGKPPECVRALP-- : : .. .:. : : . ::: : : mKIAA4 LPAWGQGWRCLARQRRWPRLLLLLPPRLLAGARVGGSSLRS-GAEPAAPPPEPEAAAPPG 20 30 40 50 60 70 610 620 630 640 650 660 mFLJ00 AKPRAFTLYPRSFSVEGRESPLSMFREPEGAGLDSHRVRRKEDNLSLPGAIGSSGSFSQR : : . :. . :. .: .. : .: ::: ::. : : .: mKIAA4 AGPSPPAPPPQELEPSGEPGPRAQARTMHG-----HRV---------PGGPGPSDP--ER 80 90 100 110 670 680 690 700 710 mFLJ00 SHLPSSGTSTPSSVVDIPPPFDLACITKKPITKSSPSLL---IDGDTL--EKASKKKKSS : . :.. : . .: : : :....: . : .: . . :: : mKIAA4 SAANTPGAA-PLACADSDPG---ALEPGLPVSRGSGTALGGPLDPQFVGPSDASLGAPPS 120 130 140 150 160 170 720 730 740 750 760 770 mFLJ00 FKRFLELTFRKKTESKVHVDMNLSSSRSSSESSYHGPARVL----ELDR-RSLSNSPQLK .: : . . .. ...: .:. . . : :.: :: .:: :. mKIAA4 -SRVLPCGPSPQHHRALRFSYHLEGSQP--RPGLHQGNRILVKSLSLDPGQSLEPHPEGP 180 190 200 210 220 780 790 800 810 820 mFLJ00 CRTGKLRASDSPAALIFY-RDSKRKGVPFSRT-VSRVESFEDRSR----------PPFLP : ::.. .: . : : : : .: . : :. . : :: : mKIAA4 QR---LRSDPGPPTEIPGPRPSPLKRAPGPKPQVPPKPSYLQMPRVLPPPEPIPPPPSRP 230 240 250 260 270 280 830 840 850 860 mFLJ00 LPLTKPRSIS--FPNADTS-----------DYENIPAM-NSDYEN---IQIPPR-----R :: . :: . : :..: .: :.. :: .::. . mKIAA4 LP-ADPRVAKGLVPRAEASTSSAAVSSLIEKFEREPVIVASDRPAPGPCPVPPEPAMLPQ 290 300 310 320 330 340 870 880 890 900 910 mFLJ00 PVRTGTFTKLFE-EQSRALS--TANENDGY-VDM--SSFNAFESKQQSSEQEAESAYTEP : : ..: : : :: : . . :: : :..... : ..: : : : mKIAA4 PPPQPTGSQLPEGEASRCLFLLAPGPRDGEKVPNRDSGIDSISSPSNSEETCFVSDDGPP 350 360 370 380 390 400 920 930 940 950 mFLJ00 -YKVCP----ISAAP----------REDLTSDEEQGSSEEEDSASRD---PSLSHKG--- ...:: ... : ... :: :. :::. :. : . .. mKIAA4 IHSLCPGPPALASMPVALADPHRPGSQEVDSDLEEEEEEEEEEKEREIPVPPMERQESVE 410 420 430 440 450 460 960 970 980 990 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RVRGK--SRHPRHLFLMNDTLLYTHPQK---DGKYRLKSSLPVANMKVSRPVMDKVPYAL .. .: . . :.:.:.:: ::: :. :. ... . : .:.... ..: .. mKIAA4 KLSAKNGTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFSVRARIDVDGMELKESSNLNMPRTF 700 710 720 730 740 750 1250 1260 1270 1280 1290 mFLJ00 KIETPESCLTLSASSCAERDEWHYCLSRALPEDYKTQALAAFHHSVEIRERL------GI . . : :.: . :. .: .. .: . .: . .:.. .. .. mKIAA4 LVSGKQRSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQTLETFKLLNSTNRDDEDTPPNSPNV 760 770 780 790 800 810 1300 1310 1320 1330 1340 1350 mFLJ00 SLGERLPTLVPVTHAMMCMNCGCDF-SLTVRRHHCHACGKIVCRNCSRNKYPLKCLKNRM .::.: :: . .. ::: : : :.: :::::.:::..:: .::. . : .:: mKIAA4 DLGKRAPTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHCKACGHVVCGKCSEFRARLIYDNNRS 820 830 840 850 860 870 1360 1370 1380 1390 1400 1410 mFLJ00 AKVCDGCFRELKLRNGPVPGSMRERPVSMSFPLSSSRFSSGSALSSVFQSISPSTFKKQK .:: :. :. : :. .. : .... mKIAA4 NRVCTDCYVALHGAPGSSPACSQHTP------------------------------QRRR 880 890 900 1420 1430 1440 1450 1460 1470 mFLJ00 KVPSALSEVAASGEGSAISGYLSRCKSGKRRWKKLWLVIKGK---VLYTYLASEDKVAME .. . ::: :.:.: ..: ..: . 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