FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1362.ptfa, 1407 aa vs ./tmplib.26680 library 1767610 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6671+/-0.00667; mu= 2.4884+/- 0.440 mean_var=271.8730+/-65.977, 0's: 0 Z-trim: 30 B-trim: 43 in 1/35 Lambda= 0.0778 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00274 ( 1530 res) mpf00869 (1530) 1550 188 9e-48 mKIAA4239 ( 1059 res) mfj24184 (1059) 809 105 7.6e-23 mKIAA0337 ( 1082 res) mbg04504 (1082) 369 56 5.6e-08 mKIAA4037 ( 919 res) mfj00669 ( 919) 331 51 9.7e-07 mKIAA0305 ( 1536 res) mbg08215 (1536) 304 49 1.1e-05 mKIAA1415 ( 1665 res) mib23074 (1665) 290 47 3.5e-05 mKIAA0294 ( 1324 res) mbg02039 (1324) 288 47 3.5e-05 mKIAA1626 ( 1241 res) mpg00117 (1241) 270 45 0.00014 mFLJ00298 ( 577 res) mbg10993 ( 577) 250 42 0.00039 mKIAA0321 ( 2548 res) mef00119 (2548) 261 44 0.00045 mKIAA1209 ( 1220 res) mbg08960 (1220) 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.:: . ..: :: : :. :. . ..: .::.:..:. .:: mKIAA0 TLKRKSGSLRRSSM-SLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDTDIIKGASQATNRETVQKAI 340 350 360 370 380 390 1160 1170 1180 1190 1200 1210 mKIAA1 SSSIEEYAKKRITFCPSRSLDEDSERKEEVSPLGAKAPIWIPDTRATMCMICTSEFTLTW : :. : mKIAA0 SRLDEDLATLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEKQALCCSLAFPPTKLE 400 410 420 430 440 450 >>mKIAA4037 ( 919 res) mfj00669 (919 aa) initn: 161 init1: 102 opt: 331 Z-score: 213.4 bits: 51.4 E(): 9.7e-07 Smith-Waterman score: 338; 23.492% identity (25.000% ungapped) in 315 aa overlap (785-1094:407-707) 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 QNSSSVEDTDASLYEVEEPYNAPDGQLQLDPRHQPCSSGTSQEGKDALHLGLSDLPSDEE ::..: . . . :. : .:. : : mKIAA4 LSTPNSNRKRRRLKETLAQLSRETDLSPFPPRKRPSAEHSLSIGS---LLDISNTP--ES 380 390 400 410 420 430 820 830 840 850 860 870 mKIAA1 VINSSDEDDVSSESSKGEPDPLEDKQDEDAGMKSKVHHIAKEIMSSEKVFVDVLKLLHID :. .. ..::.. :. :: : ..:::....:. .:..: . mKIAA4 SIHYGETPKSCAKSSRSST-PVPPKQ-------SARWQVAKELYQTESNYVNILATIIQL 440 450 460 470 480 880 890 900 910 920 930 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