FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4239.ptfa, 1059 aa vs ./tmplib.26680 library 1767958 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6550+/-0.0105; mu= -13.6343+/- 0.697 mean_var=682.4579+/-163.673, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0491 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1362 ( 1407 res) mia41047 (1407) 809 73 3.2e-13 mFLJ00274 ( 1530 res) mpf00869 (1530) 433 47 3.5e-05 mKIAA1415 ( 1665 res) mib23074 (1665) 363 42 0.0011 mKIAA0337 ( 1082 res) mbg04504 (1082) 352 41 0.0015 mFLJ00298 ( 577 res) mbg10993 ( 577) 337 39 0.0021 mKIAA4037 ( 919 res) mfj00669 ( 919) 335 39 0.0031 >>mKIAA1362 ( 1407 res) mia41047 (1407 aa) initn: 891 init1: 469 opt: 809 Z-score: 329.8 bits: 73.1 E(): 3.2e-13 Smith-Waterman score: 1088; 26.362% identity (29.015% ungapped) in 1028 aa overlap (39-1011:410-1398) 10 20 30 40 50 60 mKIAA4 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.....: .... : ..::... . :. :...: .:..::: . mFLJ00 SAEYDNTQSALTLISKVTDRANESMEQGENLQKLVHIEYSVRGQGDLLQPGREFLKEGTL 1130 1140 1150 1160 1170 1180 700 710 720 730 740 750 mKIAA4 LKLSAKNGTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFSVRARIDVDGMELKESSNLNMPRT ... .: . . :.:.:.:: ::: :. :. ... . : .:.... ..: . mFLJ00 MRVRGK--SRHPRHLFLMNDTLLYTHPQK---DGKYRLKSSLPVANMKVSRPVMDKVPYA 1190 1200 1210 1220 1230 1240 760 770 780 790 800 810 mKIAA4 FLVSGKQRSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQTLETFKLLNSTNRDDEDTPPNSPN . . . : :.: . :. .: .. .: . .: . .:.. .. . mFLJ00 LKIETPESCLTLSASSCAERDEWHYCLSRALPEDYKTQALAAFHHSVEIRERL------G 1250 1260 1270 1280 1290 820 830 840 850 860 870 mKIAA4 VDLGKRAPTPIREKEVTMCMRCQEPFNSITKRRHHCKACGHVVCGKCSEFRARLIYDNNR ..::.: :: . .. ::: : : :.: :::::.:::..:: .::. . : .:: mFLJ00 ISLGERLPTLVPVTHAMMCMNCGCDF-SLTVRRHHCHACGKIVCRNCSRNKYPLKCLKNR 1300 1310 1320 1330 1340 1350 880 890 900 mKIAA4 SNRVCTDCYVAL---HG-APGS---SP-----------------------ACSQHTPQRR .:: :. : .: .::: : . : : ... mFLJ00 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