FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1666.ptfa, 1139 aa vs ./tmplib.26680 library 1767878 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9803+/-0.00611; mu= 2.9459+/- 0.407 mean_var=205.4500+/-49.963, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 122 in 1/35 Lambda= 0.0895 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0318 ( 884 res) mbg14966 ( 884) 301 52 4e-07 mKIAA0612 ( 353 res) mbj00855 ( 353) 288 50 6.7e-07 >>mKIAA0318 ( 884 res) mbg14966 (884 aa) initn: 1007 init1: 296 opt: 301 Z-score: 220.2 bits: 52.3 E(): 4e-07 Smith-Waterman score: 1078; 32.232% identity (37.987% ungapped) in 878 aa overlap (363-1135:1-850) 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 DDLEPDSMSTPLEMRSLEAPIIPKLKLFLARSSYNPFEGPSEHCQGKLPLTAGDYVYVFG : :::::.::.:. ...:::::: :.::.: mKIAA0 RYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYG 10 20 30 400 410 420 mKIAA1 DMDEDGFYEGELVNGQRGLVPSNLVEPIS----------GSP----ILNH---------- ::::::::::::..:::::::::.:. :. :: .::: mKIAA0 DMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFIQDNESRLAGTLGSEQDQNFLNHSGISLERDSI 40 50 60 70 80 90 430 440 450 460 mKIAA1 LFLKSP--------------------DIGPTALPAGHSKVLKKG---SLLLG---EVQER : :.:: ::: ..: .. .: : :...: . mKIAA0 LHLHSPTQVDSGITDNGGGTLDVNIDDIGEDTVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPP 100 110 120 130 140 150 470 480 490 500 mKIAA1 GLCQVGR----VDSKTDMA-AESLKTK-------TEACWLGLK-----SSLEEQSFSRPL : :. ::..: :. : . .:: : :: .. : . . .. : mKIAA0 GWGTVSSYNVLVDKETRMSLALGRRTKALIEKLNTAACTYRISVQCVTSRGNSDELQCTL 160 170 180 190 200 210 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 LEAKGAFCLAPMELQLQNVTATSATITWASGSNRYPHVVYLDDEEHILTPSGVNHYTFQG : .: . .:: .:...:.: :: ..: .. : :...:..:: .. .. .: : . mKIAA0 LVGKDVV-VAPSQLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHIIFLNEEELDIVKAARYKYQFFN 220 230 240 250 260 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 LHPGTCYRVRVGVQ---LPRDLLQVLWETTSSTLTFDTPLAGPPDPPLDVLVEHHASPGV :.:. :.:.: .: .: .: : . . :.: :::: :: :: :. :. . mKIAA0 LRPNMAYKVKVLAQPHQMPWQLPLEQREKKEACVEFSTLPAGPPAPPQDVTVHAGATAAS 270 280 290 300 310 320 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 LVVSWLPVTIDSAGSSNGVQVTGYAVYVDGFKVTEVADATAGNTLLEFSQLQVPLSCQKV . ::: : .. .: :::..::::.::. : .:.:: :: .: .:. .:. : . : mKIAA0 VQVSWKPPALTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIAPTADGTAVELIRLR-SLEAKAV 330 340 350 360 370 380 690 700 710 720 730 mKIAA1 SVRTMSLYGESLDSVPAQIPEDFF---SCCPFLGAPP------FNYTDGNPFPVCHQKLV ::::.:. :::.::. : :: :.. . : . :: .. : . : : : : mKIAA0 SVRTLSVQGESMDSALAAIPPDLLVPPAPHPRTAPPPKPLASDMDTKDQHLGP--HVK-V 390 400 410 420 430 440 740 750 760 770 780 mKIAA1 QASLGAKSSPRGP--GNCGEPQAKFLEAFPEEH---P-RKHLSLSSLSSDGTNSQAQGPT . : . :: :: :. :: :. : : :. : : . . .. .. . mKIAA0 DESWEQSRSP-GPAHGHMLEP--------PDMHSAGPGRRSPSPSRILPQPQGAPVSTTV 450 460 470 480 490 790 800 810 820 830 mKIAA1 EAWKGYEKDLSFQKSPQNHKPPLLFGQSGV--------EEGHA-PHICISGSPAPGFVHL . : .: . .: :.. ::.: :.:.: :.. :. . :.. mKIAA0 AKAMAREAAQRVAESNRLEKRSLFLEQSSVGQYTNSDEEDGYASPEVKRRGTSVDDFLK- 500 510 520 530 540 550 840 850 860 870 880 890 mKIAA1 SSEIGHGKIRCW-EKPGLEKALLQNQYAPMVPPHQQGSSQCQPADFHHVFEEKEAL-CLD .::.:. : .. :.. .. : ... :. : : . . : mKIAA0 GSELGKQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALK 560 570 580 590 600 610 900 910 920 930 940 950 mKIAA1 SQGTEKPEQRKNKSQNGQRQGT---PGSKRECSVLCPAPTNKVIKMTSGSPD---QLETD :. : .. .. .:. . ::.:. .. :. .. ::: . ::: mKIAA0 ILGNSTLMGRADRMEHVSRRYSHSGGGSHRHRPAMAPS-IDEYTGRDHLSPDFYDESETD 620 630 640 650 660 670 960 970 980 990 1000 mKIAA1 ANN---PVRVFLALFDHSPLVISVNSEAAEEELAFQKGQLLRVWGSLDLHGFYHGECNGH . :.:.:.::::..::..: : .:::::: :..::...:.:. : :::.:: .. mKIAA0 PGAEELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCAR 680 690 700 710 720 730 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA1 LGKIPGHLVVEVEVGTQQTDGRWHLPAQGHLLSETQREDLEGLTNSQGSYMPQGNSRTPT :: :: ..: :... .. . : :: : .: : .: : .:.: .:: mKIAA0 LGLIPCNMVSEIHADDEEMMDQ--LLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSG-----RGHS-VPT 740 750 760 770 780 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA1 LWTPKTMVAALDYDPRDGRAGVQAKGKLVLRAGDVVTVYGPVDDKGFYYGEYGGHRGLVP . ::: :::::.. .:.....: . .::..::.: .:. :::::: .:..:::: mKIAA0 ----RRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELPFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVP 790 800 810 820 830 840 1130 mKIAA1 AHLLDDLPVHGE ...:...: mKIAA0 SNFLEEVPDDVEVHLSDAPPHYSHDPPMRSKAKRKKSVHFTP 850 860 870 880 >>mKIAA0612 ( 353 res) mbj00855 (353 aa) initn: 511 init1: 263 opt: 288 Z-score: 216.2 bits: 50.2 E(): 6.7e-07 Smith-Waterman score: 418; 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