# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbp08305.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1666.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1666, 1139 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7915918 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8529+/-0.000193; mu= 11.8193+/- 0.011 mean_var=96.6373+/-18.554, 0's: 26 Z-trim: 46 B-trim: 423 in 1/65 Lambda= 0.130467 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|118597348|sp|Q3V0F0.1|RIMB3_MOUSE RecName: Full (1490) 7705 1461.5 0 gi|191252808|ref|NP_001028510.2| RIMS binding prot (1606) 7705 1461.5 0 gi|34869949|ref|XP_221302.2| PREDICTED: similar to (1612) 6933 1316.2 0 gi|194043391|ref|XP_001926988.1| PREDICTED: simila (1585) 3163 606.6 3.5e-170 gi|117949600|sp|Q9UFD9.3|RIM3A_HUMAN RecName: Full (1545) 3130 600.4 2.5e-168 gi|189442460|gb|AAI67855.1| RIMS binding protein 3 (1639) 3127 599.9 3.9e-168 gi|187611433|sp|A6NJZ7.2|RIM3C_HUMAN 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